Cell子刊:单分子噬菌体感染
加州理工学院的研究人员首次观察到了单个病毒通过导入自身DNA感染单个细菌的过程,并且对DNA转移速度进行了检测。通过研究噬菌体感染细菌的过程,研究人员发现决定噬菌体DNA转移速度的是宿主细胞而非病毒遗传物质的量。该文章发表在Current Biology杂志的网站上。 “我们的实验能够观察单个病毒感染单个细菌的过程,”该研究的主要研究者,加州理工学院的生物物理学和生物学教授Rob Phillips说,“此前都是对大量的噬菌体和细胞进行研究而测得的感染速率,而用我们的方法可以实际观察到单个病毒排出DNA的过程。” 1952年在著名的Hershey-Chase实验中,冷泉港卡内基研究所的Alfred Hershey和Martha Chase利用噬菌体证明了细胞中的遗传物质是DNA而不是蛋白质。噬菌体能通过包裹在蛋白质外壳内的DNA感染细菌。Hershey 和Chase对噬菌体的硫元素(只存在于蛋白外壳......阅读全文
噬菌体蛋白质的结构
无尾部结构的二十面体:这种噬菌体为一个二十面体,外表由规律排列的蛋白亚单位——衣壳组成,核酸则被包裹在内部。有尾部结构的二十面体:这种噬菌体除了一个二十面体的头部外,还有由一个中空的针状结构及外鞘组成的尾部,以及尾丝和尾针组成的基部。线状体:这种噬菌体呈线状,没有明显的头部结构,而是由壳粒组成的盘旋
细菌噬菌体蛋白质结构介绍
无尾部结构的二十面体:这种噬菌体为一个二十面体,外表由规律排列的蛋白亚单位——衣壳组成,核酸则被包裹在内部。 有尾部结构的二十面体:这种噬菌体除了一个二十面体的头部外,还有由一个中空的针状结构及外鞘组成的尾部,以及尾丝和尾针组成的基部。 线状体:这种噬菌体呈线状,没有明显的头部结构,而是由壳
噬菌体的蛋白质结构介绍
无尾部结构的二十面体:这种噬菌体为一个二十面体,外表由规律排列的蛋白亚单位——衣壳组成,核酸则被包裹在内部。 有尾部结构的二十面体:这种噬菌体除了一个二十面体的头部外,还有由一个中空的针状结构及外鞘组成的尾部,以及尾丝和尾针组成的基部。 线状体:这种噬菌体呈线状,没有明显的头部结构,而是由壳
概述RNA噬菌体的基因组结构和功能
研究最清楚的大肠杆菌RNA噬菌体是MS2,R17,f2和Qβ。它们的基因组小,只有3600到4200个核苷酸,包含四个基因。MS2.R17和f2具有几乎一样的基因组结构。在四个基因中有两个基因编码噬菌体的结构蛋白:一个是A蛋白的基因,长1178个核苷酸。A蛋白(称为成熟蛋白)的功能是使噬菌体能识
λ噬菌体臂与外源基因组DNA片段的连接实验
当 λ 噬菌体臂与外源基因组 DNA 片段相连时,必须考虑到两个参数:噬菌体臂与潜在插入片段的摩尔比,以及在反应混合物中各类 DNA 的浓度。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理当 λ 噬菌体臂与外源基因组 DNA 片段相连时,必须考虑到两个参数:噬菌体臂与潜在插入片段的摩尔
λ噬菌体臂与外源基因组DNA片段的连接实验
实验方法原理 当 λ 噬菌体臂与外源基因组 DNA 片段相连时,必须考虑到两个参数:噬菌体臂与潜在插入片段的摩尔比,以及在反应混合物中各类 DNA 的浓度。实验材料 噬菌体 T4 DNA 连接酶基因组 DNAλ 噬菌体包装混合物λ 噬菌体臂 DNA试剂、试剂盒 ATPSM 和 SM+ 明胶仪器、耗材
λ噬菌体臂与外源基因组DNA片段的连接实验
实验方法原理 当 λ 噬菌体臂与外源基因组 DNA 片段相连时,必须考虑到两个参数:噬菌体臂与潜在插入片段的摩尔比,以及在反应混合物中各类 DNA 的浓度。 实验材料
噬菌体竟然可以保护自身基因组免受CRISPR核酸酶切割
细菌和感染它们的病毒正在进行一场与生命本身一样古老的分子军备竞赛。进化为细菌配备了一系列可靶向并破坏病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系统。但是,杀死细菌的病毒(也称为噬菌体)已设计出了它们自己的工具来帮助它们战胜这些最强大的细菌防御。 如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山
Nature首次揭示噬菌体保护自身基因组免受CRISPR核酸酶切割
细菌和感染它们的病毒正在进行一场与生命本身一样古老的分子军备竞赛。进化为细菌配备了一系列可靶向并破坏病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系统。但是,杀死细菌的病毒(也称为噬菌体)已设计出了它们自己的工具来帮助它们战胜这些最强大的细菌防御。 如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山
λ噬菌体的局限性λ噬菌体
实验方法原理 本实验以含原λ噬菌体和缺陷噬菌体λdg的双重溶原菌gal+作为供体,经紫外线诱导后,获取能转导半乳糖发酵基因的高频转导噬菌体裂解液,然后让这些转导噬菌体将gal+基因转移到受体菌gal-中去。实验材料 供体菌 : Escherichia coli K12 F2 gal + (带有原噬菌
有史以来最大噬菌体被发现了
病毒感染细菌,就像流感病毒感染人类一样。 据加州大学伯克利分校的科学家们领导的一项最新研究显示,在人体肠道中发现了一些所谓的最大噬菌体,它们周期性地破坏细菌,就像季节性流感爆发使人体处于低谷一样。 这些“巨噬菌体”的基因组比普通噬菌体大10倍,比人类先前发现的任何噬菌体大两倍,它们只存在于食
辅助噬菌体的功能和特性
辅助噬菌体编码产生另一些噬菌体所不能产生的重要蛋白质,使另一些噬菌体得以生长和繁殖。噬菌体具有病毒的一些特性:个体微小。噬菌体基因组含有许多个基因,但所有已知的噬菌体都是细菌细胞中利用细菌的核糖体、蛋白质合成时所需的各种因子、各种氨基酸和能量产生系统来实现其自身的生长和增殖。一旦离开了宿主细胞,噬菌
基因克隆(gene-clone)的几种常用方法介绍2
其基本原理是:用一个在种源上相近的基因组将靶基因组中所有共同的基因掩盖起来,而只暴露出特异的基因,在整个反应中只有特异基因能被扩增。其操作程序为:(1)用同一限制性内切酶(一般用Bam HI,Bgl II或Hind III)同时处理靶基因组和掩盖基因组DNA,其中掩盖基因组DNA的量至少要2
M13、T7和T4噬菌体系列的区别
M13丝状噬菌体一直是最流行的选择,广泛用于各种类型的研究。病毒外壳由五个不同的衣壳蛋白组成,包括一个主要衣壳pVIII(2,700拷贝)和四个次要衣壳(一端是pIII和pVI,另一端是pVII和pIX)。与T4和T7不同的是,M13是溶原性噬菌体,它在周质中组装,在不裂解宿主的情况下从细菌膜中分泌
病毒和噬菌体载体的基本介绍
病毒主要有DNA(或RNA)和外壳蛋白组成,经包装后成为病毒颗粒。通过感染,病毒颗粒进入宿主细胞,利用宿主细胞的合成系统进行DNA(或RNA)复制和壳蛋白的合成,实现病毒颗粒的增殖。把感染细菌的病毒专门称为噬菌体,由此构建的克隆载体则称为噬菌体克隆载体。 噬菌体作为载体,可插入长10~20kb
关于叶绿体DNA的介绍
chloroplast DNA(cpDNA),存在于叶绿体内的DNA。高等植物叶绿体的DNA为双链共价闭合环状分子,其长度随生物种类而不同,其大小在120kb到217kb之间,相当于噬菌体基因组的大小,例如,T4噬菌体的基因组约165kb。叶绿体DNA不含5-甲基胞嘧啶,这是鉴定cpDNA及其纯
叶绿体DNA的基本介绍
chloroplast DNA(cpDNA),存在于叶绿体内的DNA。高等植物叶绿体的DNA为双链共价闭合环状分子,其长度随生物种类而不同,其大小在120kb到217kb之间,相当于噬菌体基因组的大小,例如,T4噬菌体的基因组约165kb。叶绿体DNA不含5-甲基胞嘧啶,这是鉴定cpDNA及其纯
细胞化学基础叶绿体DNA
chloroplast DNA(cpDNA),存在于叶绿体内的DNA。高等植物叶绿体的DNA为双链共价闭合环状分子,其长度随生物种类而不同,其大小在120kb到217kb之间,相当于噬菌体基因组的大小,例如,T4噬菌体的基因组约165kb。叶绿体DNA不含5-甲基胞嘧啶,这是鉴定cpDNA及其纯度的
关于M13噬菌体的基本信息介绍
M13噬菌体是一种丝状噬菌体,内有一个环状单链DNA分子,长6407个核苷酸,含DNA复制和噬菌体增殖所需的遗传信息。M13DNA的复制起始位点定位在基因间隔区内。但是基因间隔区的有些核苷酸序列即使发生突变、缺失或插入外源DNA片段,也不会影响M13DNA的复制,这为M13DNA构建克隆载体提供
Lambda噬菌体
· Lambda DNA Preparation (Stanford DNA Sequence & Technology Center)Detailed protocol for lambda DNA preparation with recipes· Isolati
PNAS:特殊蛋白质可控制机体“基因组卫士”
近日,发表在国际杂志PNAS上的一篇研究报告中,来自蒙特利尔临床研究学院的科学家通过研究鉴别出了免疫反应已知机制的一种新的作用亮点,研究人员发现了一种新型特殊蛋白,其可以控制“基因组卫士”—p53肿瘤抑制蛋白的活性。 文章中,研究者对T细胞和B细胞的发育也进行了深入研究,这两种细胞均是保护机体
T4噬菌体的化学组成介绍
T4噬菌体是大肠杆菌的一种烈性噬菌体,呈蝌蚪形,其DNA为线形双链结构,含1.66×106bp核苷酸。在T4噬菌体基因组约200个编码蛋白质的基因中,有135个是已知的(其中的82个是代谢相关基因,53个是装配基因),其余近70个基因的功能未知。T4噬菌体基因组DNA中没有胞嘧啶核苷酸(C),而
现有技术水平蛋白质水平上研究基因功能的技术有哪些
随着分子生物学技术的开展,对生物基因组中包含的全部基因及其所翻译的蛋白质的功用加以解读和描绘,特别是大量未知基因的功用及其相应蛋白质产物的功用停止研讨成了基因工程研讨的热点方向。而在蛋白质程度上定量、动态、整体性研讨生物体的蛋白质组学,将在后基因组时期大大促进我们对基因功用的了解。酵母双杂交实验
Cell子刊:单分子噬菌体感染
加州理工学院的研究人员首次观察到了单个病毒通过导入自身DNA感染单个细菌的过程,并且对DNA转移速度进行了检测。通过研究噬菌体感染细菌的过程,研究人员发现决定噬菌体DNA转移速度的是宿主细胞而非病毒遗传物质的量。该文章发表在Current Biology杂志的网站上。 “我们的实验能够
通过噬菌体ELISA鉴定得到的噬菌体克隆
经过3~4轮的筛选后,应该能够富集到能与受体特异性结合的噬菌体群体。通常而言,在后几轮的筛选中,每次获得的噬菌体总量都会增加,但是单就这个现象并不一定能说明已经筛选到了受体特异性结合的肽段。能与靶分子非特异性结合或者能与筛选基质的噬菌体克隆也会造成这一现象。噬菌体ELISA可以说是最灵敏的鉴定所获取
什么是噬菌体表面显示技术
噬菌体表面显示技术就是噬菌体展示技术,是将基因表达的产物和亲和选择相结合的的技术,起基本原理是将编码“诱饵”蛋白的DNA片段插入噬菌体基因组,并使之与噬菌体外壳蛋白编码基因相融合。该重组噬菌体侵染宿主细菌后,复制形成大量带有杂合外壳蛋白的噬菌体颗粒,直接用于捕获靶蛋白库中与"诱饵'蛋白相互作
λ-噬菌体末端酶的基本信息
中文名称λ 噬菌体末端酶英文名称λ phage terminase定 义λ噬菌体编码的末端酶。能识别结合λDNA连环体中的cos序列,结合后特异性地切割DNA形成12个碱基的黏性末端。此酶还有识别蛋白质衣壳前体和ATP酶的功能,水解ATP提供能量。将切割后所形成的酶-DNA二元复合体运送到蛋白质衣
λ-噬菌体末端酶的基本信息
中文名称λ 噬菌体末端酶英文名称λ phage terminase定 义λ噬菌体编码的末端酶。能识别结合λDNA连环体中的cos序列,结合后特异性地切割DNA形成12个碱基的黏性末端。此酶还有识别蛋白质衣壳前体和ATP酶的功能,水解ATP提供能量。将切割后所形成的酶-DNA二元复合体运送到蛋白质衣
Nature:以彼之道,还施彼身!揭开病毒对抗细菌CRISPR免疫系统的全新方式
噬菌体(Phage)和其他可移动遗传元件(MGE)对细菌施加了巨大的选择压力,作为回应,细菌也发展出了广泛的防御机制。其中最我们熟知的就是——CRISPR-Cas系统,这是一组在细菌中广泛存在的RNA引导的适应性免疫系统。 CRISPR-Cas系统的特异性和可编程性导致了基因组编辑、分子诊断等
关于吞噬体的基本介绍
噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称,因部分能引起宿主菌的裂解,故称为噬菌体。本世纪初在葡萄球菌和志贺菌中首先发现。作为病毒的一种,噬菌体具有病毒的一些特性:个体微小;不具有完整细胞结构;只含有单一核酸。可视为一种“捕食”