DNA甲基化与拟南芥的免疫力
DNA甲基化有助于拟南芥的免疫力，它动态调控了某些基因的表达，让植物能够抵御细菌感染。近日，一篇在线发表于《PNAS》上的文章阐述了以上研究成果。 美国加州索尔克生物学研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人员利用MethylC测序鉴定了暴露在致病或无害的丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)菌株下的拟南芥植物。他们还对经水杨酸处理的植物开展了全基因组范围的单碱基甲基化图谱分析。水杨酸是一种酚类激素，参与植物对病原体的抵御。 研究结果发现，在面对每种应激原时，植物基因组出现差异甲基化。例如，当植物被致病菌感染或用水杨酸处理时，研究小组在植物防御基因附近发现了差异甲基化的位点，往往低于平常的甲基化。水杨酸激素也会导致一些转座子序列的甲基化改变。 过去的研究表明，拟南芥中的DNA甲基化有助于关键的发育和/或细胞类型特化过程，包括稳定的......阅读全文
DNA甲基化与拟南芥的免疫力
DNA甲基化有助于拟南芥的免疫力，它动态调控了某些基因的表达，让植物能够抵御细菌感染。近日，一篇在线发表于《PNAS》上的文章阐述了以上研究成果。 美国加州索尔克生物学研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人员利用MethylC测序鉴
“RNA－甲基化”研究汇总——拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上频频亮相，并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者，许多学者将它作为研究对象，并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合，证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育
PNAS热点文章：表观基因组可因环境而改变
长期以来，人们普遍认为作为有机体发育关键步骤的甲基化只是静态地DNA修饰，不会随环境条件变化而改变。Salk生物研究所的研究人员发现，处于逆境下植物的DNA甲基化模式会发生变化，从而改变对基因的调控。 科学家发现植物遭遇致病菌后，其表观遗传学密码会发生广泛的大量改
著名学者朱健康院士Cell－Research发表表观遗传学研究成果
生物通报道：转座子通常是通过表观遗传学机制（包括DNA甲基化）保持沉默的。12月9日，在《Cell Research》杂志上发表的一项研究中，来自中科院上海生命科学研究院、美国普渡大学以及中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员，在拟南芥中将一对Harbinger转座子衍生蛋白（HDPs）——HD
拟南芥RNA核糖甲基化修饰研究方面获进展
3月30日，中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组、北京大学现代农学院博士王玉秋和中科院遗传与发育研究所研究员李家洋课题组合作在Nucleic Acids Research上发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
揭示DNA甲基化与基因沉默的关系
DNA 甲基化与真核基因和转座子的转录抑制有关，但基因沉默的下游机制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen团队在Science 在线发表题为“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
云序生物最新“RNA－甲基化”研究汇总拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上频频亮相，并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者，许多学者将它作为研究对象，并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合，证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期，
云序生物最新“RNA－甲基化”研究汇总拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上频频亮相，并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者，许多学者将它作为研究对象，并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合，证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期，
上海生科院揭示拟南芥DNA主动去甲基化调控新机制
12月9日，《细胞研究》（Cell Research）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase c
研究发现去甲基化酶REF6是基因组中靶向的重要因素
核小体是真核生物染色质的基本单位，由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白翻译后共价修饰是表观遗传调控的重要方式之一，通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态，在动植物细胞命运决定以及生长发育中发挥重要的调控作用。基因
朱健康院士PNAS发布表观遗传新成果
来自中国科学院上海植物逆境生物学研究中心、美国普渡大学的研究人员证实，在拟南芥杂交种中甲基化互作需要RNA介导的DNA甲基化（RdDM），并受到遗传变异的影响。 中国科学院上海植物逆境生物学研究中心主任朱健康（Jian-Kang Zhu）是这篇论文的通讯作者。朱教授是植物抗逆生物学领域世界级领
拟南芥转化
实验概要本实验以拟南芥为试材介绍了转化及筛选的过程。主要试剂1. 渗透培养基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH调至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%琼脂PNS或水溶液2. 筛选培
揭示富含GC区域的一类非CG甲基化
DNA胞嘧啶甲基化是一个重要的DNA修饰，植物中DNA甲基化可调节基因和转座子的表达。通常甲基化水平与基因表达负相关，在植物中的DNA甲基化发生在CG、CHG和CHH区域。然而，在非CG区域的DNA甲基化不仅在植物中广泛存在，并且在哺乳动物组织中也大量存在，如大脑和多能细胞等。 结构和功能不同
RNAi产生的基因沉默与生物学功能
RNAi所产生的基因沉默具有如下特点：1)高效性。 Elbashir等在研究中发现分别为25 nmol/L与100 nmol/L的起始双链RNA产生的结果是一样的，只是高浓度起始的更有效些。将双链RNA浓度降低到1.5 nmol/L时产生的基因沉默效果变化不大，只有当浓度降低到0.05 nm
研究揭示拟南芥组蛋白去甲基化酶JMJ13的结构功能
3月21日，《自然-通讯》（Nature Communications）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心杜嘉木研究组、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组和河北师范大学孙大业研究组合作完成的题为The Arabidopsis H3
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的，近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析，从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
Cell－Research：一类全新植物异染色质蛋白
研究人员发现一类植物特有的新型组蛋白甲基化阅读器ADCP1，并确定其为动物HP1（Heterochromatin Protein 1，异染色质蛋白1）功能同源蛋白，揭示出其在植物异染色质维持和转座子元件沉默中的作用，彰显了不同生命界中表观机制的复杂性和保守性。 2018年11月13日，清华-北
朱健康院士PLOS发表植物学新研究
2015年1月8日，中科院上海生命科学研究院朱健康课题组，在国际著名学术期刊《PLOS Genetics》发表一项最新研究成果，题为“An AP Endonuclease Functions in Active DNA Dimethylation and Gene Imprinting in A
植物所在植物转座子进化方面取得进展
转座子（Transposable elements，TEs）是较多生物基因组中主要的组成部分（在玉米中可达到80%以上）。与单碱基变异相比，转座子序列长、突变速率快，可更快速地产生大效应的突变。转座子能够通过多种机制影响基因的功能和生物的表型。尽管已有较多关于转座子的研究，但尚不清楚转座子对生物
拟南芥的培养
实验概要本实验方法就拟南芥的培养技术进行了简单介绍。主要试剂1. PNS营养液:每升含2.5m1 1M磷酸缓冲液(pH5.5)5ml 1M KN03，2m1 1M MgSO4.7H20，2m1 1M Ca(N03)a.4H20，2.5m1 20mM Fe.EDTA，1 ml MS微量兀素。2. 人
拟南芥的转化
实验概要本实验采用花浸泡法利用农杆菌介导将目的基因转入拟南芥。主要试剂YEB液体培养基，LB培养基，0.1 M CaCl2，0.05 M MgSO4，花浸泡缓冲液(0.5XMS，5%蔗糖，0. 03%Silwet L-77 )，Rif，Kan主要设备摇床，离心机，培养钵，温室，托盘，塑料薄膜实验材料
转座子及转座子标签法克隆基因的改进
1 转座子及转座子标签法克隆基因基因标签法克隆植物组织中的基因是较为常用的一种方法，T-DNA和转座子均可作为基因标签。转座子最早由美国的细胞遗传学家Mc-clintock在玉米中发现，它是指基因组中一段特定DNA片段，能在转位酶的作用下从基因组的一个位点转移到另一个位点。转座子不仅能在本基因组中转
朱健康院士Cell－Research发布表观遗传新发现
来自中国科学院上海植物逆境生物学研究中心、美国普渡大学的研究人员，在拟南芥中揭示出了Dicer非依赖性的RNA介导的DNA甲基化机制（RdDM）。这一重要的研究发现发布在12月8日的《细胞研究》（Cell Research）杂志上。 中国科学院上海植物逆境生物学研究中心主任朱健康（Jian-K
研究首次揭示DNA主动去甲基化可靶向病毒基因
βC1在体外和体内增强DME活性。中国农科院植保所供图 近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队联合清华大学生命科学学院，首次发现植物病毒可以利用植物的DNA主动去甲基化机制来逃逸植物的防御反应，相关研究结果在线发表于《自然—通讯》（Nature Communicati
上海生科院发现植物去甲基化调控的新机制
2月12日，国际权威学术期刊《分子细胞》（Molecular Cell）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组的研究论文The Methyl-CpG-Binding Protein MBD7 Facilitates Active DNA Demethylat
上海生科院揭示等位遗传调控机制
5月14日，国际学术期刊Cell Reports在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Involvement of multiple gene silencing pathways in a paramutation-like phenomenon in A
报道转座子的定义
中文名称报道转座子英文名称reporter transposon定 义在转座子处插入报道基因，如某种抗性基因和酶基因等，作为这段序列是否发生转座的标记。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
报道转座子的定义
中文名称报道转座子英文名称reporter transposon定 义在转座子处插入报道基因,如某种抗性基因和酶基因等,作为这段序列是否发生转座的标记。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
RNA干扰RNAi的生物特性
RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关① 发现蠕虫mut-7 基因参与RNAi 并且与转座子的转座抑制有关；② 在果蝇中，参与RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失，同时提高了反转录转座子活性。RNAi抵御病毒感染在拟南
RNAi的生物特性
RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关① 发现蠕虫mut-7 基因参与RNAi 并且与转座子的转座抑制有关；② 在果蝇中，参与RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失，同时提高了反转录转座子活性。RNAi抵御病毒感染在拟南