万元全基因组测序在望全新分析平台登场
今年早期,ABI公司应用SOLiD 3系统领先的寡核苷酸连接和检测技术对人类基因组进行了测序,费用低于6万美元。这台新仪器的技术改进使更高的样品和数据通量成为可能,从而有望进一步降低基因组测序的费用。例如,更廉价的基因组数据有望加速疾病关联和生物标志物的发现,从而改善诊断和疾病处理,支持与个人最佳治疗方法相匹配的临床试验,并帮助普罗大众更好地了解他们的个体基因组成。 波士顿儿童医院F. M. Kirby神经生物学中心主管Michael E. Greenberg博士实验室的博士后研究员-Jesse M. Gray博士曾使用过SOLiD小分子RNA表达试剂盒以及多重技术来探究与神经细胞激活相对应的基因表达变化。他相信SOLiD技术的内在可扩展性和灵敏度是许多测序相关和标签计算应用的优越之处。 Gray博士表示:“1万美元基因组代表了测序计划中每个碱基费用的又一个显著降低。测序费用的降低将使我们在研究中能收集更多的实验时间点,进行......阅读全文
新一代测序技术(下)SOLiD-(ABI)
【摘要】 2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代
NGS测序十年记:ABI奋起直追
说起全自动测序仪,Applied Biosystems(ABI)那是绝对的领头羊,其3730旗舰测序仪在人类基因组计划中立下赫赫战功。然而,在新一代测序方面,454和Solexa抢了先机,率先推出了NGS仪器。ABI当然不会作壁上观,让客户的实验室里摆满对手的仪器。 于是,它在2006年斥资1
AB-SOLiD测序仪
AB SOLiD测序仪可以对由任何方法制成的DNA文库进行测序。AB SOLiD测序仪有一个极大的特点就 是能够将富集模板片段的微珠在芯片上进行高度可控的任意排列。AB SOLiD测序仪也是使用如图5a中所示 的微乳液PCR方法扩增模板片段的,不过,它这里使用的是直径只有1μm的小磁珠。PCR扩增反
基因组纯化之ABI篇-MagMAX核酸抽提系统
摘要: Life Technologies公司旗下的ABI推出了MagMAX™ 核酸抽提系统,致力于解决所有这些问题,同时为了便于自动化,不使用有机溶剂或者核酸沉淀试剂。该系统采用微磁珠代替滤膜,可消除滤膜核酸分离方法的常见问题,如滤膜堵塞,洗脱体积过大,抑制剂清除不彻底,以及回收率不一致等。 从
什么是高通量测序
高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要
万元全基因组测序在望-全新分析平台登场
今年早期,ABI公司应用SOLiD 3系统领先的寡核苷酸连接和检测技术对人类基因组进行了测序,费用低于6万美元。这台新仪器的技术改进使更高的样品和数据通量成为可能,从而有望进一步降低基因组测序的费用。例如,更廉价的基因组数据有望加速疾病关联和生物标志物的发现,从而改善诊断和疾病处理,支持与个人最佳治
SOLID-TUMOR-CULTURES-FOR-CHROMOSOME-ANALYSIS
I. Purpose:A. Samples of solid tumors or lymph nodes may be sent from patients with cancer. These samples should be processed directly and also set up
solid4测序仪
罗氏454、Illumina不久前分别宣布推出了新测序仪,生命科技公司当然也不甘落后。1月底,SOLiD™ 4测序系统的神秘面纱被揭开。 据生命科技公司介绍,Applied Biosystems的SOLiD 4系统目前每次运行能产生100 GB可定位的序列数据,每个基因组的测序费用降至6000
世界最先进DNA测序仪器落户张江
由上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心、国家人类基因组南方研究中心与美国生命技术公司旗下美国应用生物系统公司(ABI)共同建立的ABI SOLID示范实验室在张江日前正式投入运行,卫生部部长陈竺发来贺信。 据了解,该实验室是目前华东地区最大的高通量DNA测序实验室平台,目前拥
关于基因组高通量测序的技术发展介绍
高通量测序平台(high-throughput_genome_sequence_database) 自从2005年454 Life Sciences公司(2007年该公司被Roche正式收购)推出了454 FLX焦磷酸测序平台(454 FLX pyrosequencing platform)以
高通量测序技术SOLiD简介
目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat
高通量测序(NGS)的原理简介
高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的。目前高通量测序的主要平台代表有罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch
测序技术及测序仪器的比较
自sanger测序技术发明以来,经人类基因组计划的促进,测序技术有了跨越式的发展,以实验方法与实验仪器的改进为标志,测序技术经历了三代的发展,同时测序技术向着高通量测序,单分子测序,低价格测序的方向发展,目前测序技术已成为分子生物学实验中的重要的实验手段。本文主要简单回溯了测序技术的发展历史,介绍了
新一代高通量测序技术SOLiD简介
目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation
新一代高通量测序技术SOLiD简介
目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation
新一代测序技术的先锋SOLiD系统
2008年12月 作为上世纪生命科学领域最重要的技术发明之一,测序技术深刻地改变了我们对生命本质的理解和掌控能力。假如没有测序技术,基因序列就无法确定,酶切、克隆、反转录、cDNA、PCR、SNP、RNAi等等研究技术也就根本无从谈起,生命科学领域也不会有今日的蓬勃发展。无人不晓的GenBank;
Solidstate-physics-offers-insights-into-dielectric-properties-of-...
Solid-state physics offers insights into dielectric properties of biomaterialsA team of Russian, Czech and German researchers gained a new perspecti
关于全基因组测序的应用介绍
全基因组测序的应用:通过生物信息手段,分析不同个体基因组间的结构差异,同时完成SNP及基因组结构注释。 DNA突变可诱发癌症。吸烟过程中所释放的>60种致癌化学物质可与DNA结合并对DNA链上的鸟嘌呤和腺嘌呤进行化学修饰从而产生大的加合物,该加合物改变了DNA双螺旋的结构,如果不被核苷酸剪切修复
高通量测序发展史
人类基因组计划(human genome project, HGP) 在介绍高通量测序发展之前,需要先为大家介绍一个人类发展史上的一项重要创举——人类基因组计划(human genome project, HGP)。HGP的完成对测序技术的推动作用意义重大。 HGP是由美国科学家于1985年率先
什么是基因二代测序
第二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。第二代测序技术的核心思想是边合成边测序(Sequencing by Synthesis),即通过捕捉新合成的末端的标
适合每个实验室的新一代测序系统SOLiD-5500
【摘要】基于三十年的测序经验,并由经过验证的连接型测序的准确性所支持,全新的5500 SOLiD™ 系统为每个实验室提供了一个强大、实惠的新一代测序平台。5500 SOLiD™ 系统为分析一个或多个样品提供了一种非常准确且经济有效的解决方案,让您灵活选择优化周转时间或通量。 也许您正在寻找一项新一
高通量测序分的原理
对DNA分子进行序列测定。1.对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。2.根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S
新一代SOLiD™-5500xl给力转化研究
2010年12月17日 来源:ABI【摘要】全新的5500xl SOLiD™ 系统利用两块灵活的FlowChip、内置质量对照、直观的用户流程和项目可扩展性确保了最佳的产量。有了5500xl SOLiD™ 系统,您就能够以前所未有的速度探索稀有遗传事件或亚群体的体细胞突变。 测序市场真是日新月
高通量测序技术应用发展现状
根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(MassivelyParallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony Sequencing)、454焦磷酸测序(454 pyrosequencing)、Illumina
SYBRGreen-QPCR-in-the-ABI-7700
MaterialsROX Passive Reference Dye 25 µM, 50x (Invitrogen, Cat. No. 12223-012)SYBR Green I, "10,000x" concentrate (Molecular Probes, Cat. No. S7563)Su
第二代测序技术:高速发展的高通量测序技术
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测
基因测序的操作设备
过长的测序周期以及上万美元的仪器成本,成了阻碍基因测序进入寻常百姓家的障碍。而运用新技术的基因测序仪大大降低了基因组测序的门槛,使得更多研究人员能够使用这项技术开发多种应用。 总部位于美国加州的生命技术公司(Life Technologies),最近正在中国推出台式基因测序仪Ion Proto
基因测序操作设备
过长的测序周期以及上万美元的仪器成本,成了阻碍基因测序进入寻常百姓家的障碍。而运用新技术的基因测序仪大大降低了基因组测序的门槛,使得更多研究人员能够使用这项技术开发多种应用。 总部位于美国加州的生命技术公司(Life Technologies),最近正在中国推出台式基因测序仪Ion Proto
关于新型基因检测技术—基因测序的操作设备介绍
过长的测序周期以及上万美元的仪器成本,成了阻碍基因测序进入寻常百姓家的障碍。而运用新技术的基因测序仪大大降低了基因组测序的门槛,使得更多研究人员能够使用这项技术开发多种应用。 总部位于美国加州的生命技术公司(Life Technologies),最近正在中国推出台式基因测序仪Ion Proto
数十个测序平台技术参数盘点
1.第二代测序技术1.1 Roche 454 测序平台Roche 454(Genome Sequencer 20 System)是第一个NGS测序平台,由美国454 Life Sciences公司于2005年推出,2007年被瑞士Roche公司收购。此后Roche公司在此基础上开发了Roch