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数十个测序平台技术参数盘点

1.第二代测序技术1.1 Roche 454 测序平台Roche 454(Genome Sequencer 20 System)是第一个NGS测序平台,由美国454 Life Sciences公司于2005年推出,2007年被瑞士Roche公司收购。此后Roche公司在此基础上开发了Roche GSTitanium、Roche GS FLX+、Roche GS Junior和Roche GS Junior+。Roche 454是一种基于微乳液PCR和焦磷酸测序技术的测序平台。Roche 454测序平台具有较长的测序读长和短耗时的优势,准确性高达99.9%,达到了与Sanger测序法相当的长度与准确性,并降低了测序成本。Roche 454测序主要应用领域有微生物群落多样性分析(如16s、18s、ITS扩增子测序)、复杂环境样品的宏基因组学研究、微生物基因组的从头测序、转录组测序、外显子测序、目标区域......阅读全文

数十个测序平台技术参数盘点

1.第二代测序技术1.1 Roche 454 测序平台Roche 454(Genome Sequencer 20 System)是第一个NGS测序平台,由美国454 Life Sciences公司于2005年推出,2007年被瑞士Roche公司收购。此后Roche公司在此基础上开发了Roch

盘点最新基因组测序成果

  the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者:  种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae)  基因组:~2.86 billion bp  人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年

表格盘点:全国NGS测序企业全集

  无论是个性化医疗还是“精准医学”,所有以预防疾病为宗旨的新型模式的变革和颠覆都离不开革命性的技术:二代基因测序(NGS)技术。目前在中国,究竟有哪些企业从事NGS测序相关服务呢?以下是根据不完全统计所得的数据(排名不分先后),后续还会继续完善新的公司……  从目前统计的数据来看,北京49家,上海

九大测序平台对比(二)

2.454企业: Roche推出时间: 2005年主流型号: Genome Sequencer FLX Titanium(2008年推出)样品要求: 5 μg of DNA,浓度≥300 ng/μL测序原理:焦磷酸测序在测序时,使用了一种叫做“Pico TiterPlate”(PTP)的平板,它

九大测序平台对比(三)

4.HiSeq2000企业: Illumina推出时间: 2010/1/1主流型号: Illumina HiSeq2000样品要求: 6ug/sample,无RNA、蛋白污染,无降解,OD260/OD280=1.8-2.0测序原理: 边合成边测序这种测序技术通过将基因组DNA的随机片断附着到光学透明

基因测序的云计算平台

   自二代测序的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在测序价格持续下降的情况下,中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。  传统的测序数据分析依赖于本地

九大测序平台对比(一)

1.sanger企业:Life Technology推出时间:1977年发明,1986年第一台商业化测序仪主流型号:3730XL样品要求:PCR产物:浓度≥50ng/ul 体积≥10ul;质粒:含量≥5ug;菌液:体积≥1ml。测序原理:双脱氧链终止法:Sanger法测序的原理就是,每个反应含有所有

九大测序平台对比(四)

5.Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随

九大测序平台对比(六)

8.PGM企业: Ion Torrent推出时间: 2010年主流型号: Ion Personal Genome Machine™(2010年)样品要求: 5 μg DNA,起始DNA体积不超过130μL测序原理: 半导体芯片测序该测序仪使用了一种高密度半导体小孔芯片。该芯片置于一个离子敏感层和离子

九大测序平台对比(二)

Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随机打