数十个测序平台技术参数盘点
1.第二代测序技术1.1 Roche 454 测序平台Roche 454（Genome Sequencer 20 System）是第一个NGS测序平台，由美国454 Life Sciences公司于2005年推出，2007年被瑞士Roche公司收购。此后Roche公司在此基础上开发了Roche GSTitanium、Roche GS FLX+、Roche GS Junior和Roche GS Junior+。Roche 454是一种基于微乳液PCR和焦磷酸测序技术的测序平台。Roche 454测序平台具有较长的测序读长和短耗时的优势，准确性高达99.9%，达到了与Sanger测序法相当的长度与准确性，并降低了测序成本。Roche 454测序主要应用领域有微生物群落多样性分析（如16s、18s、ITS扩增子测序）、复杂环境样品的宏基因组学研究、微生物基因组的从头测序、转录组测序、外显子测序、目标区域......阅读全文
数十个测序平台技术参数盘点
1.第二代测序技术1.1 Roche 454 测序平台Roche 454（Genome Sequencer 20 System）是第一个NGS测序平台，由美国454 Life Sciences公司于2005年推出，2007年被瑞士Roche公司收购。此后Roche公司在此基础上开发了Roch
表格盘点：全国NGS测序企业全集
无论是个性化医疗还是“精准医学”，所有以预防疾病为宗旨的新型模式的变革和颠覆都离不开革命性的技术：二代基因测序（NGS）技术。目前在中国，究竟有哪些企业从事NGS测序相关服务呢？以下是根据不完全统计所得的数据（排名不分先后），后续还会继续完善新的公司…… 从目前统计的数据来看，北京49家，上海
盘点最新基因组测序成果
the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者： 种属：非洲腔棘鱼（Latimeria chalumnae） 基因组：~2.86 billion bp 人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝，直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年
盘点基因组测序的最新成果
近日，the scientist杂志发表文章盘点了最近发布的几项基因组测序成果，一起来看看吧。 昏睡病传播者 种属：采采蝇(Glossina morsitans morsitans) 基因组：360 million bp 国际舌蝇基因组计划(International G
最新基因组测序成果盘点
近来，各大杂志上陆续发表了不少重要的基因组测序成果。the scientist杂志对此进行了盘点，以飨读者。 种属：野鸭，绿头鸭(Anas platyrhynchos) 基因组：约13 billion bp 鸭子是几乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前，研究人员测
基因测序领域之成果、政策大盘点
1. 利用CRISPR/Cas9进行NGS建库和细菌克隆。 (NGS建库新方法)Cas9本质上是一种核酸酶，虽然科学家发现Cas9在真核细胞的基因靶向和编辑中具有重要作用，但是新的研究也在将Cas9用于体外和微生物细胞中来剪切DNA。3月份，加州大学旧金山分校(UCSF)Joe DeRisi领导
基因测序的云计算平台
自二代测序的技术问世以来，就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展，二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中，上游做检测，中游做分析，下游做应用。在测序价格持续下降的情况下，中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。 传统的测序数据分析依赖于本地
九大测序平台对比（二）
Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer（2008年推出）样品要求: 1-3 μg，起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随机打
九大测序平台对比（三）
4.HiSeq2000企业: Illumina推出时间: 2010/1/1主流型号: Illumina HiSeq2000样品要求: 6ug/sample,无RNA、蛋白污染，无降解，OD260/OD280=1.8-2.0测序原理: 边合成边测序这种测序技术通过将基因组DNA的随机片断附着到光学透明
九大测序平台对比（一）
1.sanger企业：Life Technology推出时间：1977年发明，1986年第一台商业化测序仪主流型号：3730XL样品要求：PCR产物：浓度≥50ng/ul 体积≥10ul；质粒：含量≥5ug；菌液：体积≥1ml。测序原理:双脱氧链终止法：Sanger法测序的原理就是，每个反应含有所有
九大测序平台对比（二）
2.454企业: Roche推出时间: 2005年主流型号: Genome Sequencer FLX Titanium（2008年推出）样品要求: 5 μg of DNA，浓度≥300 ng/μL测序原理：焦磷酸测序在测序时，使用了一种叫做“Pico TiterPlate”（PTP）的平板，它
九大测序平台对比（一）
1.Sanger2.4543.Solid 4.HiSeq20005.Helicos6.DNA Nanoball array7.The PacBio RS system8.PGM9.MiSeq sanger企业：Life Technology推出时间：1977年发明，1986年第一台商业化测序仪主流
九大测序平台对比（四）
5.Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer（2008年推出）样品要求: 1-3 μg，起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随
九大测序平台对比（五）
7.The PacBio RS system企业: Pacific Biosciences推出时间: 2010年2月开始早期试用主流型号: PacBio RS样品要求: 1kb以下500ng，纯化的基因组 DNA, BACs, cDNA 文库 或PCR 产物测序原理: 边合成边测序，single m
九大测序平台对比（六）
8.PGM企业: Ion Torrent推出时间: 2010年主流型号: Ion Personal Genome Machine™（2010年）样品要求: 5 μg DNA，起始DNA体积不超过130μL测序原理: 半导体芯片测序该测序仪使用了一种高密度半导体小孔芯片。该芯片置于一个离子敏感层和离子
盘点食品界中渐渐崛起的基因测序
2015年可谓是基因测序的元年，自精准医疗概念提出以来，基因测序在我国曾几度被央视报道。随着人类基因组计划的完成，基因测序技术不断提高，价格也不断降低，人类完成各种基因组测序成为了可能。无论在医疗行业还是在农业等领域，基因测序技术均大放光彩，殊不知，近年来基因测序在食品行业也渐渐崛起。本文综述了
The－scientists盘点最热门的基因组测序
The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，以飨读者。 一种新病毒 种属：果蝠疱疹病毒（FBAHV1） 基因组：149,459bp 日本北海道大学的研究团队测序了一种新病毒的基因组序列，并将结果发表在六月十八日的Journal of Virology杂志上。
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
－盘点最热门的基因组测序新成果
The scientist杂志盘点了近期各大杂志上最热门的基因组测序成果，让我们看看科学家们又从测序中获得了什么新知识吧。 种属：家猫（Felis catus） 基因组：3.1 billion bp 家猫会患上白血病也会受到免疫缺陷病毒的感染。为了更好的理解相关疾病，一个跨国科研团队测序了
盘点近期最热门的基因组测序成果
The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，包括碎米荠、远东豹、中国甘草、光肩星天牛和黑花蝇。 种属：碎米荠（Cardamine hirsuta） 基因组大小：1亿9800万个碱基对 上个月（10月31日），欧洲的研究人员在《Nature Plants》上发表
【盘点】单细胞测序研究进展一览
细胞是生物学的基本单位，近年来研究人员正努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。而应用而生的就是单细胞测序技术，该技术是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。而随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并对逐个细胞进行序列比较已经开始
【盘点】单细胞测序研究进展一览
细胞是生物学的基本单位，近年来研究人员正努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。而应用而生的就是单细胞测序技术，该技术是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。而随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并对逐个细胞进行序列
盘点：全球十大顶尖基因测序公司
新一代测序（NGS）的市场规模到底有多大？据BCC Research统计，到2022年NGS市场将达到105亿美元。MarketsandMarkets则更加乐观一些，估计届时将达到124.5亿美元。不过BIS Research的预测较为保守，认为市场增长速度将相对缓慢一些，预计2024年达到11
测序平台多样化成为发展障碍
2016年1月12日，奥巴马提出了癌症“登月计划”，将精准医疗、个性化医学或癌症医学推向了另一高度。事实上，精准医疗是一个美好的愿景：即能详细读取肿瘤患者的缺陷，并开发出靶向缺陷的新一代药物，医生给患者最有效的治疗方案。使用新型靶向药物如厄洛替尼（erlotinib）和西妥昔单抗（cetuximab
llumina高通量测序平台的应用（一）
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了
llumina高通量测序平台的应用（二）
3、可逆化学阻断技术测序 利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理，加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”，因为3’羟基末端带有可化学切割的部分，每个循环它只容许掺入单个碱基。去除其他多余的dNTP后，用激光扫描
不同平台的二代测序技术
二代测序技术基于大规模平行测序技术（massive parallel analysis，MPS），它能同时完成测序模板互补链的合成和序列数据的获取。主要可以分成Roche 454焦磷酸测序、Illumina Solexa合成测序和ABI SOLiD连接法测序。 （1）Roche 454焦磷酸测
小个头大内涵的单细胞测序研究盘点
近几年来，基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展，其成果有望为一些重要的生物学问题提供新的解决方案。测序君盘点了2015年的单细胞测序研究成果，供大家查阅。《Science》：瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们的单细胞测序研究。该研究生成了有关皮质细胞类型以及细胞内活化基因的详细图谱。研究小组利
SOLiD－5500新一代测序仪性能大盘点
2010年12月16日 生命科技公司（Life Technogy Inc.），宣布推出的SOLiD™ 5500和SOLiD™ 5500xl新一代测序仪。 上海伯豪生物技术有限公司作为ABI公司服务供商，将在2011年利用SOLiD™ 5500xl为广大科研工作者提供更为全面的新一代测序服务解决