《Nature》RNA调节蛋白质合成的隐藏信号
RNA以A、U、C和G等基本核苷酸在细胞的蛋白质加工厂中指挥蛋白质生产。为了制造蛋白质,机器的一端先锁定在RNA上,然后扫描整条RNA,直到AUG字符串后停止扫描,AUG是将遗传密码翻译成蛋白质的开始信号。 在巡查第一个AUG位点时,蛋白质制造机器经常会遇到一个与AUG不同的字符串(如AUA),有时,蛋白质合成也会从这样的替代起始位点开始,迄今为止,蛋白质制造机器如何选择使用哪些替代位点还是一个谜。 Nature》发表了一篇最新文章回答了这个问题。 “我们发现了一种翻译事件选择机制,可以解释在非翻译区域发起的非传统起始位点问题,”凯斯西储大学医学院RNA分子生物学中心教授、文章通讯作者Eckhard Jankowsky博士说。“过去几年,我们发现,在这些区域发生的翻译现象十分普遍,但是蛋白质翻译机器如何在数百万个可能的起始位点中进行抉择?” Jankowsky课题组使用了一种名为Ded1p的酶,它是蛋白质制造机器的一......阅读全文
植物病毒RNA提取
大多植物病毒RNA为单链RNA,并且其极性与mRNA极性相同,植物病毒RNA提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。 一、材料 提纯TMV病毒液(10mg/ml)。 二、设备 冷冻台式离心机,低温真空干燥仪,电泳仪,电泳槽。 三、试剂 TE-饱和酚:氯仿(1:1),氯仿
细胞RNA含量检测
实验步骤 展开
分离植物总RNA
实验概要认识真核生物RNA的组成及分离的原理;学习RNA提取过程中抑制RNA酶活性的方法。实验原理真核生物的RNA包括rRNA、tRNA和mRNA。一个典型的真核细胞约含有10-5~10-6mg的RNA,其中80-85%为rRNA,其余15-20%主要由各种低分子量RNA组成(如tRNA、核内小分子
ISOLATION-OF-RNA-FROM-BACTEROIDS
3 g nodules (fresh or frozen in liquid N2) were ground to a powder in mortar and pestle with liquid N2. To the powder was added ice cold 0.5 M mannito
RNA编辑主要类型
①简单编辑,单碱基转变的转录后调节;②插入编辑,插入单个核苷酸或少量核苷酸的丢失,其机制是转录链的跳格;③泛编辑,插入或缺失多个尿嘧啶核苷酸或转录后插入多个胞嘧啶,其机制是编辑序列由外源反义引导RNA( gRNA)提供,gRNA在编辑体(editosome)核蛋白颗粒中与前编辑mRNA配对,鉴别作为
反义RNA技术改良
用反义RNA分子来调节基因表达时,经常会遇到的困难是反应模板的稳定性差。因此,人们正在探索如何改进反义基因的新方法,目前主要有:(1)优化反义RNA的结合。反义RNA链的长度对抑制基因的效果是重要的。双螺旋形成过程中将释放能量,RNA链越长,释放的自由能越多。从这一意义来讲,可以说长RNA作为反义R
什么是RNA作图?
中文名称RNA作图英文名称RNA mapping定 义对RNA分子在基因上的定位分析。将RNA与相应的DNA杂交后,用单链特异性核酸酶(常用的如S1核酸酶)切去不发生杂交的单链部分,用以分析RNA与相应DNA的关系,包括确定RNA的5′和3′端、外显子和内含子在DNA上的相应位置等。应用学科生物化
RNA假结的定义
RNA中的一种常见的三级结构元件。RNA的茎环结构中的环上序列与其他部位(通常是邻近部位)的序列碱基配对,形成类似“打结”形状。
什么是RNA编辑?
RNA编辑(RNA editing)是指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入、丢失或转换等现象。RNA编辑产生的“基因”可称为隐蔽基因( cryptogene),其产物的结构不能从基因组DNA序列中推导获得。早在1986年发现锥虫线粒体mRNA转录加工后,其mRNA的多个编码位置上加入或丢失尿苷酸。
真菌RNA提取实验
液氮研磨法 实验方法原理 液氮研磨可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚
RNA病毒的简介
RNA病毒(RNA virus) 也称RNA型病毒。植物病毒,除少数例外(如花椰菜花叶病毒Caulif -lower mosaic virus),几乎都是RNA病毒。RNA病毒冠状病毒直径为80~160nm,为有包膜的单股RNA病毒RNA的复制过程中,其错误修复机制的酶的活性很低很低,几乎是没有
信使RNA的降解
同一细胞内的不同mRNA具有不同的寿命(稳定性)。在细菌细胞中,单个mRNA可以存活数秒至超过一小时,但平均寿命为1至3分钟,因此,细菌mRNA的稳定性远低于真核mRNA。哺乳动物细胞mRNA的寿命从几分钟到几天不等。mRNA的稳定性越高,从该mRNA产生的蛋白质越多。 mRNA的有限寿命使细胞能够
什么是信使RNA?
信使RNA,中文译名“信使核糖核酸”,是由DNA的一条链作为模板转录而来的、携带遗传信息能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。
RNA重组的结构
中文名称RNA重组英文名称RNA recombination定 义RNA分子内或分子间发生的共价重新组合。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
3.5-RNA-反转录
利用 RNA 模板通过反转录获得 DNA,进而复制和感染细胞实验材料poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTT
卫星RNA的重组
在一些动物病毒中,存在着基因组之间的重组现象。发生重组的RNA可能具有同源性,也可能没有同源性。前一种情况下,交换重组的RNA发生在两者之中的相同位置而不会改变通读框架ORF;后一种情况下,交换重组的位置不确定,因而会影响到ORF。在植物病毒中,仅证明雀麦花叶病毒BMV存在着RNA基因组重组现象。T
RNA干扰制备方法
化学合成许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高,定制周期长,特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高,为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了,比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。最适用于:已经找到最有效的siRNA的情况
RNA探针的概念
RNA探针是一类很有前途的核酸探针,由于RNA是单链分子,所以它与靶序列的杂交反应效率极高。早期采用的RNA探针是细胞mRNA探针和病毒RNA探针,这些RNA是在细胞基因转录或病毒复制过程中得到标记的,标记效率往往不高,且受到多种因素的制约。
RNA定位的功能
中文名称RNA定位英文名称RNA localization定 义RNA特异定位在细胞不同区域的过程。尤其是信使核糖核酸(mRNA)的定位对生长和发育是重要的。细胞质中RNA定位起始于细胞核,在核中被特异RNA结合蛋白识别,生成核糖核蛋白复合体,然后输出到细胞质。应用学科生物化学与分子生物学(一级学
总RNA提取实验
实验方法原理 一些公司推出的总RNA 提取试剂盒,可以用来制备高质量的可用于建库的RNA 。该总RNA 纯化系统采用两种著名的RNA 酶抑制剂,异硫氰酸弧(GTC)和β-巯基乙醇,加上整个操作都在冰浴下进行,这样就能显著降低RNA 的
RNA干扰的特点
1.高效性:Elbashir等在研究中发现分别为25 nmol/L与100 nmol/L的起始双链RNA产生的结果是一样的,只是高浓度起始的更有效些。将双链RNA浓度降低到1.5 nmol/L时产生的基因沉默效果变化不大,只有当浓度降低到0.05 nmol/L时,沉默的效果才消失。Holen等也证实
RNA的自我复制
进一步的研究还发现一些RNA病毒如R17、f2、MS2等,可以以RNA为模板直接复制新的RNA。这些病毒都属于最简单的类型。例如,MS2的RNA只含有大约350个核苷酸,仅编码三种蛋白质:外壳蛋白,附着蛋白(attachment protein,其功能主要是使病毒能附着于寄主细胞并进入其内部)、RN
mRNA如何变成RNA
1、mRNA携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA。 信使RNA从脱氧核糖核酸(DNA)转录合成的带有遗传信息的一类单链核糖核酸(RNA)。它在核糖体上作为蛋白质合成的模板,决定肽链的氨基酸排列顺序。2、cDNA就是相对于mRNA而言的单链DNA。能与rna配对的单链dna3、内含子:基因包含
RNA转运的概念
中文名称RNA转运英文名称RNA transport定 义RNA分子从一个细胞区室或区域移动到另一个细胞区室或区域的过程。各类不同RNA(如信使RNA、核小RNA、核糖体RNA和转移RNA)的转运遵循不同的机制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
RNA-沉默的概念
RNA 沉默(RNA silencing)或基因沉默(gene silencing)是广泛存在于植物、动物、线虫和真菌等真核生中的一种高度保守的、序列特异的 RNA 降解机制. RNA 沉默对于调控发育、维持基因组的稳定性以响应生物和非生物胁迫等具有重要作用.
RNA时代:初级读物
自从二十世纪五十年代核酸研究出现在科学领域之后,DNA一直是其中的重点。除了核糖体RNA(rRNA)和转移RNA(tRNA)等之外,RNA在很大程度上被认为仅是非常重要的DNA和它的蛋白产物之间的信使。确实,它被赋予了这个名字! 美国斯坦福大学生化学家Julia Salzman说,“DNA被认
反义RNA稳定方法
[1]反义RNA3'端带有茎环结构或类似ρ-不依赖性终止子结构时,可以稳定RNA分子;[2]Gorski等还发现在T4噬菌体的基因32mRNA的5'端上游的茎环结构及其附近的序列亦可稳定RNA分子。所以在设计反义RNA基因时,最好将产生3'及5'端这种二级结构的序列克
RNA抽提经验
对大部分实验人员来说,RNA 抽提比基因组 DNA 抽提要困难得多。事实上,现有的 RNA 抽提方法/试剂,如果用于从培养细胞中抽提 RNA,比抽提基因组 DNA 更方便,成功率也更高。那为什么同样的方法用于组织 RNA 的抽提,总会碰到问题呢? 组织 RNA 抽提失败的两大现象是: RNA 降
全血RNA提取
摘要: RNA提取应该说已经成为了一种常见的分子生物学操作步骤了,但是不少科研人员仍然烦恼着如何寻找一种最好的方法,或者找到一种适合于特殊用途方法。比如说传统的血液标本表达谱芯片实验需要先把有核细胞从全血中分离出来,加白细胞分离液、离心等步骤,比较繁琐,如果能进行全血的提取,那就再好不过。RNA提取
RNA沉默的作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉