《Nature》RNA调节蛋白质合成的隐藏信号

RNA以A、U、C和G等基本核苷酸在细胞的蛋白质加工厂中指挥蛋白质生产。为了制造蛋白质,机器的一端先锁定在RNA上,然后扫描整条RNA,直到AUG字符串后停止扫描,AUG是将遗传密码翻译成蛋白质的开始信号。 在巡查第一个AUG位点时,蛋白质制造机器经常会遇到一个与AUG不同的字符串(如AUA),有时,蛋白质合成也会从这样的替代起始位点开始,迄今为止,蛋白质制造机器如何选择使用哪些替代位点还是一个谜。 Nature》发表了一篇最新文章回答了这个问题。 “我们发现了一种翻译事件选择机制,可以解释在非翻译区域发起的非传统起始位点问题,”凯斯西储大学医学院RNA分子生物学中心教授、文章通讯作者Eckhard Jankowsky博士说。“过去几年,我们发现,在这些区域发生的翻译现象十分普遍,但是蛋白质翻译机器如何在数百万个可能的起始位点中进行抉择?” Jankowsky课题组使用了一种名为Ded1p的酶,它是蛋白质制造机器的一......阅读全文

Arabidopsis-RNA-extraction-protocol

1-2 g fresh material, freezer-dried, ground with 0.2g sand (if necessary), and then homogenized with 10ml RNA extraction buffer (see below). Spi

ISOLATION-OF-RNA-FROM-BACTEROIDS

3 g nodules (fresh or frozen in liquid N2) were ground to a powder in mortar and pestle with liquid N2. To the powder was added ice cold 0.5 M mannit

RNA-大量转录合成

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿异内醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5X 转录缓冲液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 异戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸铵 无水乙醇 乙醇实验

RNA重组的结构

中文名称RNA重组英文名称RNA recombination定  义RNA分子内或分子间发生的共价重新组合。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

细胞RNA含量检测

细胞RNA含量检测             实验步骤        

RNA沉默的作用

植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉

分离纯化总RNA

1)      用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取纯化组织和细胞中的RNA1.      选取从组织细胞或细胞中提取RNA的适宜方法组织a.       分离组织并立即置于液氮中。b.      将约100 mg冰冻组织含液氮的研钵中,用研棒研磨。研磨过程中可加入液氮使组织保持冰冻状态。c.       

细菌RNA制备实验

革兰氏阴性细菌中提取 革兰氏阳性细菌中提取             实验材料 RNA 试

RNA-polymerase-III-transcription

Unlike the RNA polymerase II that transcribes a large variety of genes that encode proteins, RNA polymerase III transcribes only a limited number of g

转运RNA的定义

大多数tRNA由七十几至九十几个核苷酸折叠形成的三叶草形短链组成,相对分子质量为25000〜30000,沉降常数约为4S。旧称联接RNA、可溶性RNA等。主要作用是携带氨基酸进入核糖体,在mRNA指导下合成蛋白质,即以mRNA为模板,将其中具有密码意义的核苷酸顺序翻译成蛋白质中的氨基酸顺序。tRNA

互补RNA的功能

中文名称互补RNA英文名称complementary RNA定  义能与另一条核酸(DNA或RNA)链互补的RNA分子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

转运RNA的定义

  大多数tRNA由七十几至九十几个核苷酸组成,参与蛋白质的合成。分子量为25000~30000,沉降常数约为4S(个别tRNA的沉降常数为3S,含63个核苷酸)。曾用名有联接RNA、可溶性RNA、pH5RNA等。一种tRNA只能携带一种氨基酸,如丙氨酸tRNA只携带丙氨酸,但一种氨基酸可被不止一种

细胞RNA含量检测

实验步骤展开

卫星RNA的加工

在具侵染性小分子RNAs的复制机制中,RNA的加工最令学者们兴趣,即是在多聚体形式与相关的线状和环状单体之间的切割与连接过程。1986年有学者发现烟草环斑病毒ToRSV与卫星RNA 正链二聚体在接点处自我切割,产生具有感染性的线状单休。随后,又发现包含有ASBV的正链与负链的二聚体的体外转录休能够在

卫星RNA的重组

在一些动物病毒中,存在着基因组之间的重组现象。发生重组的RNA可能具有同源性,也可能没有同源性。前一种情况下,交换重组的RNA发生在两者之中的相同位置而不会改变通读框架ORF;后一种情况下,交换重组的位置不确定,因而会影响到ORF。在植物病毒中,仅证明雀麦花叶病毒BMV存在着RNA基因组重组现象。T

RNA干扰的定义

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。

RNA探针的概念

RNA探针是一类很有前途的核酸探针,由于RNA是单链分子,所以它与靶序列的杂交反应效率极高。早期采用的RNA探针是细胞mRNA探针和病毒RNA探针,这些RNA是在细胞基因转录或病毒复制过程中得到标记的,标记效率往往不高,且受到多种因素的制约。

RNA靶向的定义

中文名称RNA靶向英文名称RNA targeting定  义(1)针对RNA分子设计的一种定向作用技术。包括一些小分子化合物(如抗生素)、反义核酸、反式作用核酶、适配体、干扰小RNA等的应用。(2)由于RNA分子本身具有较大的柔性,能专一地与RNA、DNA和蛋白质相互作用,而成为一种特异的靶向试剂。

RNA沉默的分类

植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类:以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS);以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(trans

RNA干扰主体实验

siRNA表达载体构建好后,即可进行RNA干扰主体实验。RNA干扰主体实验的重点在于:成功将siRNA表达载体导入目的细胞如果目的细胞的质粒转染效率较低(低于70%),则应采用腺病毒或慢病毒载体,利用病毒载体的高感染率、高表达特性,更好地开展RNA干扰主体实验。设置好分组和对照按照nature的标准

3.5-RNA-反转录

利用 RNA 模板通过反转录获得 DNA,进而复制和感染细胞实验材料poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTT

病毒RNA提取实验

TE-饱和酚/氯仿提取法             实验方法原理 大多植物病毒RNA 为单链RNA ,并且其极性与mRNA 极性相同,植物病毒RNA 提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获

总RNA提取实验

            实验方法原理 一些公司推出的总RNA 提取试剂盒,可以用来制备高质量的可用于建库的RNA 。该总RNA 纯化系统采用两种著名的RNA 酶抑制剂,异硫氰酸弧(GTC)和β-巯基乙醇,加上整个操作都在冰浴下进行,这样就能显著降低RNA 的

微RNA的概念

微RNA(microRNAs;miRNA,又译小分子RNA)是真核生物中广泛存在的一种长约21到23个核苷酸的RNA分子,可调节其他基因的表达。miRNA来自一些从DNA转录而来,但无法进一步转译成蛋白质的RNA(属于非编码RNA)。miRNA通过与靶信使核糖核酸(mRNA)特异结合,从而抑制转录后

细胞RNA含量检测

实验步骤             展开

间隔RNA的概念

中文名称间隔RNA英文名称spacer RNA定  义初级转录物中由基因间序列编码产生的RNA序列。如哺乳动物核糖体核糖核酸(rRNA)的初级转录物位于18S rRNA和28S rRNA间的一段序列,这些序列不出现在成熟的rRNA中。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

RNA干扰的简介

  RNAi研究取得了突破性进展,被《Science》杂志评为2001年的十大科学进展之一,并名列2002年十大科学进展之首。由于使用RNAi技术可以特异性剔除或关闭特定基因的表达,所以该技术已被广泛用于探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的基因治疗领域。

TRIzol-RNA提取方法

(一)试剂准备1.TRIzol试剂。2.氯仿3.异丙醇4.75%乙醇(DEPC H2O配制)5.DEPC H2O(二)操作步骤1. 样品处理:(1)培养细胞:收获细胞1-5×107,移入1.5ml离心管中,加入1ml Trizol,混匀,室温静置5min。(2)组织:取50-100mg组织(新鲜或-

RNA干扰制备方法

化学合成许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高,定制周期长,特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高,为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了,比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。最适用于:已经找到最有效的siRNA的情况

RNA干扰功能特点

1.高效性:Elbashir等在研究中发现分别为25 nmol/L与100 nmol/L的起始双链RNA产生的结果是一样的,只是高浓度起始的更有效些。将双链RNA浓度降低到1.5 nmol/L时产生的基因沉默效果变化不大,只有当浓度降低到0.05 nmol/L时,沉默的效果才消失。Holen等也证实