代谢组学样本收集答疑解惑
样本收集是代谢组学研究的第一步,是保障代谢组学研究结果可靠性的最重要的环节之一。根据不同的研究目的该选取何种生物样本?不同种类的生物样本的规范收集流程是什么?有哪些注意事项(抗凝剂、冻融、抑菌剂等使用细节)?如何保存生物样本?可保存多久等等?这些都是代谢组学实验中小伙伴经常咨询的问题,本文将针对以上常见问题作出系列总结归纳。 一、选择什么生物样本类型开展临床代谢组学实验 代谢组学研究文献中已报道的样本类型种类繁多,如血(血清、血浆、全血)、尿、组织、粪便、细胞、脑脊液、淋巴液、唾液、羊水和胆汁等等[1]。选择何种类型的样本开展实验,取决于课题的研究目的和检测目标。无创或微创方式可采集的样本如血、唾液、尿、粪便等生物样品广泛用于临床诊断的生物标志物发现和验证,这种方式采样便于临床转化和推广。组织和细胞样品常常用于探索和解释疾病的病理机制研究。 在临床上,通过手术相对易于获得癌组织且样品量可以保障,但是,初诊患者一般是通......阅读全文
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。如
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息
J-Proteome-Res:-代谢组学应用于微囊藻毒素代谢研究
微囊藻毒素(MCLR),作为一种肝毒素,正在威胁着人类的公共卫生安全。在体内,肝脏是MCLR主要攻击的器官,然而具体代谢变化目前任然未知。近日,中国科学院水生生物研究所谢平等研究人员在与上海敏芯信息科技公司的合作下,通过对灌服MCLR的大鼠模型进行代谢组学的研究,向我们揭示了MCLR扰乱肝脏代谢
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(二)
案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现,CrPV
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(一)
在疫情逐步可控的情形下,一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示,新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,
ELISA试剂盒的样本收集与前期准备详细步骤
ELISA的样本收集与前期准备利用ELISA进行临床检验常见的样本一般包括血液(指血,静脉血),尿,粪便,脑脊液,胸腹水,前列腺液,精液,阴道分泌物等,这些样本收集的时间、方法和保存都有一定的要求。(一) 临床样本的收集1、血液样本有些生理因素,如吸烟、进食、运动、情绪波动、妊娠、体位等均可影响血液
ELISA试剂盒的样本收集与前期准备详细步骤
ELISA的样本收集与前期准备利用ELISA进行临床检验常见的样本一般包括血液(指血,静脉血),尿,粪便,脑脊液,胸腹水,前列腺液,精液,阴道分泌物等,这些样本收集的时间、方法和保存都有一定的要求。(一) 临床样本的收集1、血液样本有些生理因素,如吸烟、进食、运动、情绪波动、妊娠、体位等均可影响血液
功能代谢组学用于胶质瘤研究获进展
近日,中国科学院大连化学物理研究所与美国NIH、哈尔滨医科大学附属第一医院合作将功能代谢组学用于胶质瘤研究取得新进展:利用毛细管电泳-质谱技术,发现瘤组织中的亚牛磺酸含量显著高于癌旁对照组织中的亚牛磺酸,并且与胶质瘤分级即恶性程度呈正相关。经过分子对接计算机模拟,科研人员发现亚牛磺酸能够与α-酮
高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究
肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外,还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中,正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏,原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下,逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种
细胞衰老的溶酶体代谢组学研究的新突破
溶酶体对细胞代谢至关重要,并异质地参与各种细胞过程。测量溶酶体代谢异质性的能力对于理解它们的生理作用至关重要。 2021年6月14日,中国科学技术大学熊伟与仓春蕾共同通讯在Nature Methods 在线发表题为“Metabolomic profiling of single enlarge
代谢组学与临床医学的研究进展
人体是一个复杂的系统,存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来,人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用,而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学(
代谢组学与临床医学的研究进展
人体是一个复杂的系统,存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来,人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用,而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学(system
布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略
摘要 * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征; * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像; * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan s
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan speed≤3
地质学家获批在美大峡谷收集岩石样本
科罗拉多大峡谷 图片来源:Zubair Khan 近日,有媒体报道称,地质学家Andrew Snelling将获得在美国大峡谷国家公园中收集岩石样本的许可。而且,在美国国家公园管理局(NPS)同意委派有经验职员帮助其精确定位样本位置和确定合适采集方法后,Snelling决定放弃对其的起诉。
鱼胃抑素(GIP)ELISA试剂盒液体样本的收集
1、血清:用无菌管收集,室温血液自然凝固 10-20 分钟,2-8℃条件离心 20 分钟左右(2000-3000 转/分),仔细收集上清,保存过程中如出现沉淀,应再次离心。2、血浆:应根据标本的要求选择 EDTA、肝素钠或柠檬酸钠作为抗凝剂,混合 10-20 分钟后,2-8℃条件离心 20 分钟左右
代谢组学在中药动态代谢和相互作用过程研究中的应用
贾伟教授团队近年来建立了基于代谢组学策略的药物动力学新方法,在分子水平上刻画包括复方中药和天然产物在内的多成分药物(Multi-component Agents)在体内的整体、动态的代谢和相互作用过程。最近该团队与上海中医药大学刘平教授团队合作,采用高通量代谢组学平台以及所建立的多组分药物生物
代谢组学在中药动态代谢和相互作用过程研究中的应用
贾伟教授团队近年来建立了基于代谢组学策略的药物动力学新方法,在分子水平上刻画包括复方中药和天然产物在内的多成分药物(Multi-component Agents)在体内的整体、动态的代谢和相互作用过程。最近该团队与上海中医药大学刘平教授团队合作,采用高通量代谢组学平台以及所建立的多组分药物生
代谢组学在中药动态代谢和相互作用过程研究中的应用
贾伟教授团队近年来建立了基于代谢组学策略的药物动力学新方法,在分子水平上刻画包括复方中药和天然产物在内的多成分药物(Multi-component Agents)在体内的整体、动态的代谢和相互作用过程。最近该团队与上海中医药大学刘平教授团队合作,采用高通量代谢组学平台以及所建立的多组分药物生物
代谢组学在口腔医学研究中的应用现状
代谢组是指生物体内源性代谢物质的动态整体,代谢组学是研究代谢组的一门学科,研究对象多为相对分子质量在1000以内的小分子物质。代谢组学研究目的是通过检测代谢物水平的整体和动态变化,提取相关的生物代谢标志物群体或标志物簇,在此基础上寻找所受影响的相关代谢途径,确立代谢网络调控机制。目前,代谢组学已
聚焦科研热点,透视特色技术丨靶向代谢组学研究
本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理
如何根据收集好的样本来选择合适的ELISA试剂盒?
暑期收集了一批样本,准备近期订购试剂盒做实验,但是不知道应该选择多大包装规格的elisa试剂盒。一份样品至少要几个孔?是否要设对照孔,空白孔之类的吗?问题一:其实ELISA试剂盒包装规格的大小取决于试剂盒里面酶标板的规格大小,常见的有96T(12孔乘以8条)跟48T(12孔乘以4条)两种。问题二、科
聚焦科研热点,透视特色技术丨非靶向代谢组学研究
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CASMS分论坛:代谢组学方法与应用研究进展
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在11日“Metabolomics Methods and Applications”分论坛中,来自福瑞德·哈金森癌症研究中心 Daniel Rafte
植物表型分析技术快讯—西红柿表型与代谢组学研究案例
植物源蛋白水解物(PHs)是一类重要的生长刺激素,影响植物表型组及代谢组特征,进而促进植物生长和作物产量,尤其在缺水、盐胁迫、重金属等逆境条件下,这种促进作用更加突出。PSI植物表型组学研究中心首席科学家Klara Panzarova等,利用PlantScreen高通量表型分析平台,就一种PH对
大化所动物所在代谢组学研究中取得新进展
近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的研究组(1808组)利用其构建的代谢组学技术平台取得重要科研成果。他们与中科院动物研究所康乐院士研究组合作,首次发现了肉碱类代谢物在飞蝗两型转变过程中的关键调控作用。相关论文已在线发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上(doi
代谢组学在帕金森疾病研究的一个例子
2015年10月17日,第二届全国质谱分析学术报告会在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕,在5位院士的精彩报告后,多位学者做了高水平的大会报告。 香港浸会大学蔡宗苇教授:代谢组学在帕金森疾病研究的一个例子 香港浸会大学蔡宗苇教授做题为《代谢组学在帕金森疾病研究的一个例子》的报告。