GenomeRes:核糖体RNA基因拷贝数变异和表达调控新发现

核糖体是细胞中最重要的细胞器之一,负责将细胞转录出来的信使RNA(messenger RNA,简称“mRNA”)翻译成蛋白质。真核生物的核糖体,主要由4种核糖体 RNA(rRNA)和80多种核糖体蛋白组成。其中,45S rRNA基因位点通过转录加工可以产生18S、5.8S和25S rRNA;而5SrRNA基因位点行使5S rRNA的转录。随后,25S、5.8S以及5S RNA结合核糖体蛋白形成核糖体大亚基,同时18S RNA与其他核糖体蛋白形成核糖体小亚基,最终组装成细胞中的“蛋白加工工厂”。 在绝大多数真核生物的基因组内,不论45S rRNA基因还是5S rRNA基因都在染色体上以多拷贝串联重复的形式存在。然而,这种高度串联重复结构存在的生物学意义目前并没有明确结论。之前,唯一一项对于45S rRNA基因拷贝数变异的大规模研究发生在人类群体中,研究表明人基因组内45S基因位点在个体间存在广泛变异,并且发现其拷贝数与众多基......阅读全文

基因表达RNA加工的机制介绍

  原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA),但真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优势。在原核生物中

新基因编辑技术“RNA桥”来了!

科学家在两项独立研究中描述了一种新的基因组编辑技术,能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,实现这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法或比现有技术更有优势,例如有望比现有技术进行更精准、有效的大规模基因组编辑,以及能介导重组而非造成需要修复的断裂。相关研究近

新基因编辑技术“RNA桥”来了!

科学家在两项独立研究中描述了一种新的基因组编辑技术,能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,实现这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法或比现有技术更有优势,例如有望比现有技术进行更精准、有效的大规模基因组编辑,以及能介导重组而非造成需要修复的断裂。相关研究近

“RNA桥”新基因编辑技术问世

RNA桥。图片来源:Visual Science本报讯 《自然》6月26日发表的两篇论文描述了一种新的基因组编辑技术,这种技术能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,这项技术有望成为这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法可能比现有技术更有优势,比如有望进行比

RNA干扰(转录后基因沉默)实验

RNA干扰             实验方法原理 1. 病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsR

基因敲除与RNA干扰的关系

20世纪80年代初,胚胎干细胞分离和体外培养的成功为基因敲除奠定了技术基础。1985年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组(homology recombination, HR)的存在为基因敲除奠定了理论基础[2]。为了编辑基因,传统的靶向特定等位基因的同源重组技术被使用,但是,这个方法在当年来说,存

RNA干扰(转录后基因沉默)实验

RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。目前主要用于(1)特异性剔除或关闭特定基因的表达 (2)探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的治疗 (3)使

核糖体蛋白的构成及作用

  构成  核糖核蛋白体蛋白质通过非共价键与核蛋白体RNA结合。  与核糖核蛋白体RNA一起成为核糖核蛋白体的两个亚基。  核糖核蛋白体蛋白质。  构成核蛋白体一部分的蛋白质。  核糖核蛋白体蛋白质通过非共价键与核蛋白体RNA结合。  与核糖核蛋白体RNA一起成为核糖核蛋白体的两个亚基。  在细菌核

中科院植物所叶绿体核糖体RNA加工分子机制研究获进展

   RNA操作是目前研究的热点之一。要实现精确的RNA操作,需要特异地识别靶向目标RNA分子并对其进行剪切。但到目前为止,这类序列特异的RNA内切酶在自然界中还没有被发现。因此,寻找一类序列特异的RNA内切酶显得尤为重要。中科院植物研究所卢从明研究组日前在相关领域取得进展,相关论文2月6日在线发表

新研究发现冠状病毒“致命弱点”

有望促进通过干扰“移码”过程而抑制病毒复制的药物的开发。据《科学》杂志13日在线发布一篇最新论文,来自瑞士苏黎世理工大学、伯尔尼大学、洛桑大学和来自爱尔兰的科克大学组成的一支研究团队找到了包括新冠病毒在内的冠状病毒的“致命弱点”。研究首次成功揭示了病毒基因组和核糖体在“移码”过程中的相互作用,发现病

新研究发现冠状病毒致命弱点

  据《科学》杂志13日在线发布的一篇最新论文,来自瑞士苏黎世理工大学、伯尔尼大学、洛桑大学和来自爱尔兰的科克大学组成的一支研究团队找到了包括新冠病毒在内的冠状病毒的“致命弱点”。研究首次成功揭示了病毒基因组和核糖体在“移码”过程中的相互作用,发现病毒对核糖体“移码”过程存在“精细控制”,这有望促进

脱氧核糖核酸DNA的转录和翻译的介绍

  基因是含有能够影响生物体表型特征的遗传信息的DNA序列。基因内的DNA碱基序列作为模板可以合成RNA分子,在大多数情况下,RNA分子被翻译成多肽,最终称为蛋白质。 将基因的核苷酸序列复制到RNA链中的过程称为转录,由RNA聚合酶催化发生。 RNA链有不同的命运:一些RNA分子实际上具有结构(例如

脱氧核糖核酸的转录和翻译

基因是含有能够影响生物体表型特征的遗传信息的DNA序列。基因内的DNA碱基序列作为模板可以合成RNA分子,在大多数情况下,RNA分子被翻译成多肽,最终称为蛋白质。 将基因的核苷酸序列复制到RNA链中的过程称为转录,由RNA聚合酶催化发生。 RNA链有不同的命运:一些RNA分子实际上具有结构(例如在核

信使RNA的真核生物的相关介绍

  一、核糖体RNA:基因拷贝数多,在几十到几千之间。基因成簇排列在一起,由RNA聚合酶I转录生成一个较长的前体,哺乳动物为45S。核仁是rRNA合成与核糖体亚基生物合成的场所。RNA酶III等核酸内切酶在加工中起重要作用。5SRNA基因也是成簇排列的,由RNA聚合酶III转录,经加工参与构成大亚基

mRNA如何变成RNA

1、mRNA携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA。 信使RNA从脱氧核糖核酸(DNA)转录合成的带有遗传信息的一类单链核糖核酸(RNA)。它在核糖体上作为蛋白质合成的模板,决定肽链的氨基酸排列顺序。2、cDNA就是相对于mRNA而言的单链DNA。能与rna配对的单链dna3、内含子:基因包含

RPL5基因的结构特点和主要作用

核糖体是催化蛋白质合成的细胞器,由一个小的40s亚基和一个大的60s亚基组成。这些亚基由四种RNA和大约80种结构上不同的蛋白质组成。这个基因编码核糖体蛋白L18P家族的一个成员和60S亚单位的组成部分。编码蛋白与5srrna结合形成一个稳定的复合物,称为5srrna核蛋白颗粒(rnp),这是将非核

RPL5基因突变因子与药物介绍

核糖体是催化蛋白质合成的细胞器,由一个小的40s亚基和一个大的60s亚基组成。这些亚基由四种RNA和大约80种结构上不同的蛋白质组成。这个基因编码核糖体蛋白L18P家族的一个成员和60S亚单位的组成部分。编码蛋白与5srrna结合形成一个稳定的复合物,称为5srrna核蛋白颗粒(rnp),这是将非核

RPL5基因编码的功能和结构描述

核糖体是催化蛋白质合成的细胞器,由一个小的40s亚基和一个大的60s亚基组成。这些亚基由四种RNA和大约80种结构上不同的蛋白质组成。这个基因编码核糖体蛋白L18P家族的一个成员和60S亚单位的组成部分。编码蛋白与5srrna结合形成一个稳定的复合物,称为5srrna核蛋白颗粒(rnp),这是将非核

NCB:李鑫组揭示核糖体介导piRNA的形成

  piRNA (PIWI-Interacting RNA) 是一类与PIWI蛋白相互作用的非编码小RNA,其长度在24—35nt左右,主要存在于动物的生殖细胞中。piRNA与PIWI蛋白结合形成PIWI/piRNA分子机器,其主要作用之一是沉默减数分裂过程中被激活的转座子(Transposon)—

苏大核糖体新生可能作为新冠及其他疾病治疗的新靶点

  近日,苏州大学李杨欣教授团队在Signal Transduction and Targeted Therapy杂志上发表了一篇题为 “Ribosome biogenesis in disease: new players and therapeutic targets” 的综述文章。  核糖体,

Science突破:实时追踪RNA

  第一次,研究人员在单分子水平上实时观测了转录过程中的RNA折叠。他们是如何做到的?他们又从中获悉了什么?   在一个隔音、温度恒定、振动控制的地下实验室,斯坦福大学的研究人员实时观察了RNA的转录,注视着RNA新生单链变长――一个核苷酸一个核苷酸 ――并折叠形成一个调控核糖体开关(regu

Nature子刊:定位人类基因组的非常规翻译

  蛋白质翻译一直是科学家们重点研究的生物学过程。目前人们对翻译过程的常规机制已经有所了解,不过实际上蛋白的合成方式并不只有一种。   Arizona州立大学的研究人员,首次在全基因组范围内研究了不依赖帽子结构的翻译机制,鉴定了在这一机制中作为翻译增强元件(TEE)的mRNA序列,这些序列位于编码

RPS7基因编码的功能和结构描述

核糖体是催化蛋白质合成的细胞器,由一个小的40s亚基和一个大的60s亚基组成。这些亚基由4种RNA和大约80种结构上不同的蛋白质组成。这个基因编码一个核糖体蛋白,它是40S亚单位的一个组成部分该蛋白属于核糖体蛋白s7e家族。它位于细胞质中。作为编码核糖体蛋白的典型基因,有多个经过处理的假基因散布在基

RNA剪接和基因沉默之间的联系

为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的

RNA剪接和基因沉默之间的联系

为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的

赛尔基因口服RNA药物显示疗效

  今天赛尔基因宣布其口服RNA药物mongersen(GED0301)在一个克罗恩症临床1b试验中显示疗效。这个临床试验中有63名中重度克罗恩患者参与,三组病人使用每日160毫克mongersen(12周mongersen,8周mongersen+4周安慰剂,4周mongersen+8周安慰剂)。

RNA剪接和基因沉默之间的联系

为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的

分子遗传学词汇转移RNA基因

中文名称:转移RNA基因英文名称:transfer RNA gene;tRNA gene定  义:转录后可产生tRNA的基因。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

广州生物院在抑制宫颈癌细胞增殖机理方面取得新进展

  CCCTC结合因子(下简称CTCF)是含有11个高度保守的锌指结构蛋白,具有多种生物学功能,包括启动子的激活与抑制、基因印记、基因沉默与绝缘、X染色体的失活等。已有研究发现,CTCF可以抑制c-Myc基因的表达,在细胞生长与增殖、系统发生以及肿瘤发生等方面都有着重要的作用。   最近,中科院广

RNA实验方案和应用(一)

RNA是具有多种不同的功能的生物大分子。信使RNA(mRNA)是DNA转录得到的,用做蛋白质合成的模板。蛋白质的合成是由核糖体完成的,核糖体由核糖体RNA(rRNA)和蛋白质组成。用于蛋白合成的氨基酸,是通过转运RNA(tRNA)输送到核糖体上的。RNA分子也是参与RNA转运过程的核糖蛋白的一部分。