新方法可辨别蛋白质折叠关键因素
蛋白质折叠模式帮助其执行特定任务。作为细胞的真正“实干家”，即便是蛋白质氨基酸支架的微小改变，也会引发错误折叠并且妨碍蛋白质功能或引发疾病。 科学家试图更好地理解蛋白质折叠，以治疗错误折叠引发的疾病。但这个异常复杂的过程需要复杂算法辨别折叠机制。印度塔塔基础研究所的计算生物物理学家提出了一种辨别蛋白质折叠最关键因素的新方法。相关成果日前发表于美国物理联合会（AIP）出版集团下属《化学物理学杂志》。 蛋白质中的每个原子能折叠成3个维度，但对于出现在即便是简单蛋白质中的上百万个原子来说，理解集体折叠组合的任务会变得错综复杂。科学家考虑了影响蛋白质折叠的不同因素，包括氢键结合，并将它们整合到被称为集体变量（CVs）的通用描述中。不过，由于潜在因素很多，科学家缺少好的方法寻找恰当描述某个可行过程的CVs。 上述团队决定研究GB1蛋白质外部突出的发卡，因为现有的很多工作与之相关并且过去的CVs估测了很多潜在的折叠可能性。 论文......阅读全文
关于蛋白质的二级结构（β折叠）的简介
是蛋白质的二级结构，肽键平面折叠成锯齿状，相邻肽链主链的N-H和C=O之间形成有规则的氢键，在β-折叠中，所有的肽键都参与链间氢键的形成，氢键与β-折叠的长轴呈垂直关系。 60年代以来,球状蛋白质的晶体结构被陆续解出,发现许多蛋白质中都有β-折叠层,平行的和反平行的都有。有时候许多段肽链排列成
上海药物所蛋白质折叠计算模拟研究取得进展
在生物体系中，蛋白质通过折叠成特定的三维结构发挥功能。这种折叠过程可能受到不同因素的影响，如配体结合、聚合状态等。充分理解蛋白质折叠过程对于药物分子设计、蛋白质突变所导致致病机理的预测、深入了解细胞功能以及进化都至关重要。大规模计算机模拟有潜力从原子水平捕捉整个蛋白系统的动态过程，但是
关于蛋白质的二级结构（β折叠）的特性介绍
β－折叠(β－sheet)也是一种重复性的结构，大致可分为平行式和反平行式两种类型，它们是通过肽链间或肽段间的氢键维系。可以把它们想象为由折叠的条状纸片侧向并排而成，每条纸片可看成是一条肽链，称为β折叠股或β股(β－strand)，肽主链沿纸条形成锯齿状，处于最伸展的构象，氢键主要在股间而不是股
日本合成融合酶－能将人造氨基酸折叠成蛋白质
日前，日本理化研究所和东京大学宣布，两家机构共同合成了能将人造氨基酸正确折叠成蛋白质的融合酶。这项成果将可能带来多种拥有新功能的蛋白质，贡献于生物技术、医药等行业。 上述两家机构共同发表新闻公报说，生物体内的蛋白质由20种氨基酸根据DNA中包含的遗传信息按照一定的数量和顺序结合而成。目前，增加蛋白
青岛能源所在细胞内蛋白质折叠研究方面取得进展
蛋白质发挥功能的“原位”环境是细胞，因此在细胞内开展蛋白质的结构和动力学研究对蛋白质功能的解析至关重要。细胞内大分子的浓度可以达到300-450g/L，拥挤的细胞环境可能会影响蛋白质的折叠，进而影响其功能。但是细胞环境如何影响蛋白质折叠过程目前并不很清晰。 近日，中国科学院青岛生物能源与过程研
研究揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用
长期以来，人们普遍认为线粒体是细胞活性氧的主要来源。然而，内质网中蛋白质二硫键形成过程会产生副产物H2O2。据估算，它约占蛋白质合成过程中产生总活性氧的25%。可见，内质网来源的活性氧不容忽视。 8月3日，中国科学院生物物理研究所王磊/王志珍课题组和动物研究所刘光慧课题组合作，在《欧洲分子生物
超乎大自然“想象”，科学家发现大量未知蛋白质折叠
蛋白质结构及其折叠的空间究竟有多大？大自然是否“探索”了所有这些可能？一项开创性的研究为人们提供了新线索：日本研究人员着手揭示大自然在多大程度上探索了可能的蛋白质拓扑空间，结果发现了一系列令人震惊的前所未知的蛋白质折叠，扩大了人们的理解并揭示了“蛋白质宇宙”的深度。该研究发表在最新一期《自然·结
链折叠性质
链折叠现象对结晶聚合物的行为非常重要，因而必须仔细考察链折叠结晶的情况。首先，一般认为，在许多聚合物中，链折叠没有多大的困难。对聚合物分予模型的麦察表明，大多数聚合物分子都会折叠起来，比较容易形成一种很致密的足以嵌砌到晶体表面的折叠，但是，化学结构比较复杂的聚合物，如主链上有庞大侧基或环以及分子链为
β折叠的作用
能形成β折叠的氨基酸残基一般不大，而且不带同种电荷，这样有利于多肽链的伸展，如甘氨酸、丙氨酸在β折叠中出现的几率最高。免疫球蛋白有大量的β折叠层。另一种常见的蛋白质模序是α螺旋和三种不同的β转角。不属于一个模序的蛋白质一级结构部分被称之为不规则螺旋。这些部分对蛋白质的空间构象非常重要。
β折叠的结构
肽平面之间呈手风琴状折叠，股与股之间会通过氢键固定，但氢键主要在股间而不是股内。氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。β折叠层并不是平的，因为侧链的存在使得它看上去像手风琴一样波纹起伏。这样每一股会更紧密排列，氢键更容易建立。氢键的距离为7埃。在蛋白质结构中β折叠通常会用箭头表示。肽链的氮端在同侧为顺
β折叠的定义
在β折叠中，两条以上氨基酸链（肽链），或同一条肽链之间的不同部分形成平行或反平行排列，成为“股”。
β折叠的结构
肽平面之间呈手风琴状折叠，股与股之间会通过氢键固定，但氢键主要在股间而不是股内。氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。β折叠层并不是平的，因为侧链的存在使得它看上去像手风琴一样波纹起伏。（英语pleated）这样每一股会更紧密排列，氢键更容易建立。氢键的距离为7埃。在蛋白质结构中β折叠通常会用箭头表示
人工智能算法有助于快速分析蛋白质折叠结构
近日，英国《自然》杂志报道，美国哈佛大学医学院生物学家AlQuraishi开发出新型人工智能算法，能够快速分析预测蛋白质三维结构，大大提高蛋白质三维结构预测的效率，将预测时间从若干小时或几天缩短至几毫秒。 报道称，蛋白质三维结构与蛋白质功能密切相关，当前生物学界一大挑战在于如何基于氨基酸序列预测蛋
武汉病毒所揭示宿主细胞未折叠蛋白质反应重要作用
3月6日，国际学术期刊Journal of Virology（《病毒学杂志》）在线发表了中国科学院武汉病毒研究所/病毒学国家重点实验室研究员胡志红、肖庚富团队合作研究的最新成果，论文题为Quantitative proteomic analysis reveals unfolded protei
蛋白质折叠背后可以告诉我们转移性癌症的情况
Talin是一种控制细胞附着和运动的蛋白质，如果它出了故障，会导致癌细胞扩散。DCL1是一种肿瘤抑制蛋白。但科学家们还不完全了解这两种蛋白质是如何工作的，也不知道当它们没有按照应有的方式工作时会发生什么。DCL1可以与Talin相互作用，可能会干扰Talin将细胞组合在一起的能力。如果科学家们知道这
我国科研人员在单分子蛋白质折叠方面取得新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/493991.shtm
抗感染蛋白也能感知非感染细胞中的蛋白质折叠错误
多伦多大学(university of toronto)的研究人员发现了宿主细胞对抗细菌感染的免疫机制，同时发现对这一过程至关重要的一种蛋白质能够感知并对所有哺乳动物细胞中错误折叠的蛋白质做出反应，相关研究成果于近日发表在Science。 这种蛋白质被称为血红素调控抑制因子或HRI，研究人员表
链折叠的结构
链折叠，是指凯勒（Keller）提出的折叠链模型。即分子链顷向于聚集在一起形成链束，分子链规整排列的链束细而长，表面能很大，不稳定。会自发的折叠成带状结构。也有一种说法是链折叠是直接以单根分子链（而不是链束）进行的。单晶的电子衍射图研究认为分子链的方向是垂直于晶片表面，链在晶片厚度范围内来回折叠。
“阿尔法折叠3”来了
科技日报北京5月8日电 （记者张梦然）《自然》8日报道了结构生物学最新进展——阿尔法折叠3的问世。它能以高准确率预测蛋白质与其他生物分子相互作用的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互作用的能力，将拓展人们对生物过程的理解，并有望推动药物研发。阿尔法折叠于2020年问世，它和迭代版阿尔法折叠
折叠酶的结构
LIFs的结构由三部分组成N-末端跨膜疏水结构域，中间一段富含脯氨酸和丙氨酸的高度可变的中间铰链区与C-末端催化结构域。LIFs通过N-末端的疏水跨膜结构域锚定在内膜上，使Q-末端的活性结构域游离于周质中。N-末端的疏水跨膜结构域对其折叠活性没有影响，主要是负责将LIFs锚定在内膜上，防止其与脂肪酶
折叠基因检测作用
通过基因检测，可向人们提供个性化健康指导服务、个性化用药指导服务和个性化体检指导服务。就可以在疾病发生之前的几年、甚至几十年进行准确的预防，而不是盲目的保健；人们可以通过调整膳食营养、改变生活方式、增加体检频度、接受早期诊治等多种方法，有效地规避疾病发生的环境因素。基因检测不仅能提前告诉我们有多高的
折叠酶的作用
目前研究最为广泛的是脂肪酶特异折叠酶（lipase specific foldase,LIFs），此类酶多存在于革兰氏阴性菌中辅助相应的脂肪酶进行二级结构的折叠，通过降低折叠过程中的能障与构象改变为靶蛋白的正确折叠提供必要的空间立体信息而帮助其活性构象的形成。研究证明，脂肪酶在无LIFs存在下可进行
β折叠的主要作用
能形成β折叠的氨基酸残基一般不大，而且不带同种电荷，这样有利于多肽链的伸展，如甘氨酸、丙氨酸在β折叠中出现的几率最高。免疫球蛋白有大量的β折叠层。另一种常见的蛋白质模序是α螺旋和三种不同的β转角。不属于一个模序的蛋白质一级结构部分被称之为不规则螺旋。这些部分对蛋白质的空间构象非常重要。
β折叠的结构特点
在β折叠中，两条以上氨基酸链（肽链），或同一条肽链之间的不同部分形成平行或反平行排列，成为“股”。
重折叠的定义
中文名称重折叠英文名称refolding定 义解折叠或错折叠的结构，重新变成有活性的立体结构的过程。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），总论（二级学科）
中国科学家揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用
8月3日，中国科学院生物物理研究所王磊、王志珍课题组和中国科学院动物研究所刘光慧课题组合作，在国际学术期刊《欧洲分子生物学组织报告》（EMBO Reports）发表封面文章，揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用。 长期以来，人们普遍认为线粒体是细胞活性氧的主要来源。然而，内质网中蛋白质二硫键
中国科学家揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用
我国西部地区最大抽水蓄能电站开工建设。 我国西部地区最大的抽水蓄能电站——青海哇让抽水蓄能电站于8月6日正式开工建设。 据介绍，哇让抽水蓄能电站位于青海省海南藏族自治州贵南县境内，临近海南州戈壁新能源基地，总投资159.4亿元。该电站利用黄河干流上的拉西瓦水库作为下水库，安装8台35万千瓦可
中国科学家揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506109.shtm8月3日，中国科学院生物物理研究所王磊、王志珍课题组和中国科学院动物研究所刘光慧课题组合作，在国际学术期刊《欧洲分子生物学组织报告》（EMBO Reports）发表封面文章，揭示蛋白质
“阿尔法折叠3”来了，极大提升对蛋白质—分子结构的预测能力
阿尔法折叠3通过准确预测蛋白质、DNA的结构以及它们如何相互作用，改变对生物世界和药物发现的理解。图片来源：深度思维/Isomorphic Labs《自然》8日报道了结构生物学最新进展——阿尔法折叠3的问世。它能以高准确率预测蛋白质与其他生物分子相互作用的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相
细胞化学基础β折叠链
在β折叠中，两条以上氨基酸链（肽链），或同一条肽链之间的不同部分形成平行或反平行排列，成为“股”。