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7月，最新一期的冷泉港实验手册《Cold Spring Harbor Protocols》发布。按照惯例，有两篇protocol是可以免费阅读的，其中一篇介绍了如何验证蛋白-DNA相互作用的功能重要性。这篇文章节选自《真核生物的转录调控：概念、策略与技术》一书，是由美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)的研究人员撰写的。 鉴定与感兴趣的控制区域相互作用的DNA结合蛋白已变得相当简单。然而，特定的蛋白-DNA相互作用的功能相关性还难以建立。作者介绍了一些检验这种相关性的方法。但同时强调，没有一种实验本身是结论性的。作者介绍了每种方法所获得的信息，并解释了它为什么产生了有用但不确定的结果。就所需的劳动量和获得的信息而言，每种方法差别很大。 作者写道，鉴定与控制区域相互作用的DNA结合蛋白相对简单，但要明确特定转录因子通过与确定的控制元件结合而直接调控靶基因还是一个相当困难的任务。其中涉及到鉴定重要的DNA序列元件及与......阅读全文
日前，一项发表在国际杂志Genome Research上的研究报告中，来自韦恩州立大学医学中心的研究人员通过研究首次揭示了环境暴露和遗传突变之间的相互作用如何对机体健康和诸如糖尿病等多种疾病产生明显的影响，该研究或将加速未来精准医学的研究步伐。 这项研究非常重要，因为具有不同血统的群体都共享着
来自武汉大学医学院、武汉大学人民医院以及江西赣南医学院的研究人员近日在新研究中证实KIAA0101变异体1(KIAA0101 tv1)在晚期转移性肝癌中起重要作用，通过调控p53功能促进了肝癌细胞生存。相关论文发表在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology上(最新影响因子11.665)上。
最近，英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员，开发并使用了一种新的技术，将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图，需要完成才能看到整幅图片，研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来，并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确
来自西安交通大学医学院，山东省地方病防治研究所等处的研究人员发表了文章，通过对比分析发生在同一病区的大骨节病和克山病患者外周血差异表达基因, 深入探讨了两病的病因与发病机制，指出大骨节病与克山病患者不同靶器官损伤可能是由共同和非共同的差异表达基因与环境危险因素相互作用所致。 大骨节病(
来自西安交通大学医学院，山东省地方病防治研究所等处的研究人员发表了文章，通过对比分析发生在同一病区的大骨节病和克山病患者外周血差异表达基因, 深入探讨了两病的病因与发病机制，指出大骨节病与克山病患者不同靶器官损伤可能是由共同和非共同的差异表达基因与环境危险因素相互作用所致。 大骨节病(
从一个女儿是红绿色盲来看，母亲必然是红绿色盲基因（b)的携带者，再从一个儿子是甲型血友病来看，母亲也必然是甲型血友病基因（h)的携带者。但是，这两种致病基因分别位于两条染色上。父亲是红绿色盲患者，所以有红绿色盲基因（b)。从图4－9可以看出，他们后代的女孩中，50%可能是正常的，50％
摘要 蛋白质组学是在后基因组时代出现的一个新兴的研究领域, 它的主要任务是识别鉴定细胞、组织或机体的全部蛋白质, 并分析蛋白质的功能及其模式。 因此, 揭示蛋白质组中蛋白质间的相互作用关系也是蛋白质组学的重要内容之一。 酵母双杂交技术是用来检测蛋白质间是否相互作用的一
在细胞中，DNA紧密地包裹在蛋白质周围，并以一种复杂的3D结构包装，我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤，而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组：展开呈现给细胞基因表达机器，然后再将它们卷回去。 在3D染色质结构中，一些区域被称为“拓扑关联域（TADs）
1 基因芯片技术分离目的基因生物芯片是高密度固定在固相支持介质上的生物信息分子的微列阵。列阵中每个分子的序列及位置都是已知的，并按预先设定好的顺序点阵。基因芯片是生物芯片的一种，其上固定的是核算类物质，主要用于DNA、RNA分析。分为DNA芯片和微点阵两种。分离目的基因是是指从基因组中发现或找出某个
据最新一期《细胞》杂志报道，由加拿大和美国科学家组成的一个国际研究小组，绘制出了迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱，并预测出数十个与癌症相关的新基因。该项研究成果对于理解癌症和其他疾病的形成机制，并最终开发出治疗和预防方案至关重要。 加拿大高等研究院、美国达纳法博癌
故事的主角名叫Desmond Lun，今年37岁，已经身价千万美金。其实，刚开始读大学的时候，他是奔着“码农”的路线去的，根本没有想到自己会转行研究生物——在墨尔本大学学了4年数学和计算机，他又跑到鼎鼎大名的麻省理工学院（MIT）攻读计算机方向的Phd。 然而，在2003年却出现了生物学历史上
最近，演员小沈阳的女儿沈佳润（小名洋洋）在网络曝光。不少网友看过照片后纷纷笑称：“绝对是亲生的！”原来，洋洋与爸爸小沈阳长得十分有“父女相”，尤其是一双小小的眯眯眼，如同一个模子里刻出来的 最近，演员小沈
酵母三杂交系统（yeast three-hybrid system）可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中，RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录，可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方
一个国际研究小组公布了迄今为止最大的蛋白互作数据库资源，这将有助于解析众多疾病相关的基因如何促发疾病发生和进程的。这项研究由麻省总医院MGH和Broad研究院领衔完成，相关数据库： InWeb_InBioMap (InWeb_IM) 在线公布在11月28日Nature Methods杂志上。“现代遗
如果两位女性具有相同的遗传突变而使其患疾病如乳腺癌等的风险升高，那么为何最终只有一个人患病呢?刊登在近日的国际杂志PLoS Genetics上的一篇研究报告中，来自密歇根州立大学的研究者通过研究揭示了机体中其余的基因组如何同基因突变相互作用从而在个体中引发不同的疾病表现。 研究者Ian
在有史以来最全面的研究中，英国伦敦癌症研究所的科学家们发现了110个与乳腺癌风险增加有关的基因。 这项研究采用了一种先进的遗传学技术：Capture Hi-C分析与遗传性乳腺癌相关的DNA区域图谱，由此确定了增加女性患病风险的实际基因。 这一研究成果公布在Nature Communicati
蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科，它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中，通过对蛋白质组学的研究，对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该学科的迅速发展
蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科，它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中，通过对蛋白质组学的研究，对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该
行为是基因与环境相互作用的结果。基因的变化（如转基因，基因敲除或下调等）最终表现为与基因相关的行为变化；环境的变化（如声、光、电的刺激和药物的处理）不仅其本身可直接影响动物的行为，而且可通过对相关基因的影响而改变动物的行为。学习和记忆更是这种相关基因与环境相互作用的行为表现的一种形式。学习是一个获得
行为是基因与环境相互作用的结果。基因的变化（如转基因，基因敲除或下调等）最终表现为与基因相关的行为变化；环境的变化（如声、光、电的刺激和药物的处理）不仅其本身可直接影响动物的行为，而且可通过对相关基因的影响而改变动物的行为。学习和记忆更是这种相关基因与环境相互作用的行为表现的一种形式。学习是一个获得
寻找对常见病患病风险有重大影响的基因突变比人们预想的更加困难。美国人类遗传学学会ASHG的年会于本月召开，一些大型DNA测序研究公布了初步成果，这些项目旨在寻找一些常见病(如糖尿病或心脏病)背后的潜在突变。在这一领域有一个颇为普遍的观点，一般人群中或多或少携带着一些罕见突变，这些突变大大增加(或
最近，加州大学圣塔克鲁兹分校的分子、细胞和发育生物学副教授Jeremy Sanford发现，他一直在研究的一个蛋白质，似乎对于推动癌细胞的扩散和转移，发挥着重要的作用。这个蛋白质被称为IGF2BP3，表示“胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3”。 IGF2BP3通常活跃在胎儿组织中，在大多数
长链非编码RNA（lncRNA）在调节各种生物过程中发挥着关键和复杂的作用，包括染色质修饰，转录和转录后加工。更有趣的是，一些lncRNAs可以作为吸引miRNA的“海绵”，在转录后调控中抑制其与miRNA靶基因的相互作用。这意味着它们可以被认为是竞争内源性RNA（ceRNA）。 在这项研究中
来自布朗大学的研究人员利用一种新型计算机算法，筛选庞大的遗传数据，从中发现了几个相互作用的基因，这些基因一旦突变就会导致多种癌症的发生发展。 研究人员将这种运算方法称之为 Hotnet2，可以用于分析癌症基因组图谱（TCGA）项目中12种不同类型癌症的遗传数据。此次研究人员聚焦的是体细胞突变
ChIP技术的原理 在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起，通过超声或酶处理将染色质切为小片段后，利用抗原抗体的特异性识别反应，将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来，以富集存在组蛋白修饰或者转录调控的DNA片段，再通过多种下游检测技术（定量PCR、基因芯片、测序等）来检测此富集片
表1 蛋白质相互作用分析相关数据库及网站 网站 资源类型 网址 DIP 蛋白质相互作用http: //dip.doe-mbi.uda.edu INTERACT 蛋白质相互作用http: //bioinf.man.ac.uk/interact
精神分裂症是一种严重影响患者思维、情感和行为的常见精神疾病。精神分裂症主要症状包括：阳性性状，阴性性状，认知症状和情绪紊乱。由于病因复杂，反复发作以及大多在青壮年发病，精神分裂症严重影响患者生活，同时也给患者家属和社会带来了沉重的负担。目前精神分裂症影响了全球大约1%的人口。精神分裂症的遗传力高
人工智能（AI）可谓目前科学界的头号“网红”，从沃森（Waston）机器人不到10分钟诊断出白血病，到“阿尔法狗”击败世界排名第一的围棋选手；从战场到太空，随处都可见其身影。美国《科学》杂志在近日的报道中指出，人工智能也已渗透进科研领域，正以各种方式玩转科研。 寻找新粒子的踪迹 早在上世纪8
人工智能（AI）可谓目前科学界的头号“网红”，从沃森（Waston）机器人不到10分钟诊断出白血病，到“阿尔法狗”击败世界排名第一的围棋选手；从战场到太空，随处都可见其身影。美国《科学》杂志在近日的报道中指出，人工智能也已渗透进科研领域，正以各种方式玩转科研。 寻找新粒子的踪迹 早在上
研究人员近日鉴定出与花生过敏严重程度相关的新基因，以及这些基因在过敏反应中通过哪些方式与其他基因发生相互作用。这项成果发表在《the Journal of Allergy and Clinical Immunology》杂志上，也许有助于花生过敏的治疗。 在美国，花生过敏者占人口的1%，在儿童