深圳先进院首创CRISPR等温扩增基因检测技术
近日,中国科学院深圳先进技术研究院博士周文华等在CRISPR等温扩增基因检测技术领域取得新进展。相关工作“A CRISPR-Cas9-triggered strand displacement amplification method for ultrasensitive DNA detection”(《一种应用于核酸超敏检测的CRISPR-Cas9链取代扩增技术》)发表于国际刊物《自然-通讯》(Nat. Commun. 2018, 9, 5012)。论文共同第一作者是周文华和研究助理胡丽,通讯作者是研究员喻学锋。 核酸分子检测已被广泛应用于精准医疗、食品安全检疫、公共安全监控等多个领域。尽管基于PCR(聚合酶链式反应)的核酸检测技术被广泛用于专业检测机构,但由于该技术操作复杂、仪器昂贵、以及涉及多重变温过程,并不适用于基层检测和家庭检测。为了克服PCR技术的缺点,一类不依赖变温的检测技术,即等温扩增检测技术得到广泛关注。......阅读全文
深圳先进院首创CRISPR等温扩增基因检测技术
近日,中国科学院深圳先进技术研究院博士周文华等在CRISPR等温扩增基因检测技术领域取得新进展。相关工作“A CRISPR-Cas9-triggered strand displacement amplification method for ultrasensitive DNA detecti
核酸扩增—环介导的等温扩增法
2000年日本学者Notomi在Nucleic Acids Research(核酸研究)杂志上公开了一种新的适用于基因诊断的恒温核酸扩增技术,即环介导等温扩增技术,英文名称为“Loop-mediated isothermal amplification",受到了世卫组织、各国学者和相关政府部门的
核酸等温扩增技术有什么
环介导等温扩增技术(LAMP)。依赖于核酸序列的扩增技术(NASBA)。滚环扩增技术(RCA)。单引物等温扩增技术(SPIA)。依赖于解旋酶的等温扩增技术(HAD)。链接代扩增技术(SDA)。快速等温检测放大技术(RIDA)。切刻内切酶核酸恒温扩增技术(NEMA)。核酸等温扩增技术,无论是在实际操作
核酸等温扩增技术及其应用
据微生物学家的估计,采用培养技术,仅有约1%的细菌可以培养。在过去的一个世纪里,以聚合酶链反应(PCR)为代表的基于核酸的检测技术发展迅速,为其他病原体的精确检测诊断提供了可能。毋庸置疑,Kary Mtlllis发明的PCR技术是20世纪80年代分子生物学领域的一项革命性突破。也许他本人当时也没有想
CRISPR实验指南:如何检测CRISPR脱靶突变(一)
张锋实验室的一位研究生:Winston Yan的项目就是利用CRISPR-Cas9基因组编辑系统的一个突变来敲除调控小鼠胆固醇的基因。“最终的目的是为治疗应用铺平道路,”Yan说,他最近完成了他的研究生工作,同时也第一次遇到CRISPR脱靶效应的问题。 CRISPR能帮助研究人员快速有效地对基
新一代CRISPR技术实现SARSCoV2高灵敏度即时检测
新冠病毒检测对于控制疾病传播、及早诊断治疗具有重要意义。荧光定量PCR由于高灵敏度和特异性成为了新冠病毒检测的金标准。由于设备昂贵、操作繁琐,荧光定量PCR技术很难用于现场即时检测。近些年来,也开发出了重组酶扩增(RPA)、环介导等温扩增(LAMP)、DNA纳米传感器等快速检测方法。然而假阳性问题制
CRISPR可以做分子诊断
CRISPR-Cas系统背景回放面对噬菌体的威胁,细菌进化出了一套专门针对噬菌体或外源性遗传物质的CRISPR-Cas免疫系统。CRISPR全称为“簇状、规律间隔的、短回文重复序列”(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repe
核酸扩增荧光定量检测
如果怀疑有乙肝的情况,那么需要到医院进行专业的检查,比如做核酸扩增荧光定量检测之类的,当然核酸扩增荧光定量检测还可以测量其他方面的情况,比如测解脲脲原体,接下来我们来了解一下核酸扩增荧光定量检测的相关情况吧。核酸扩增荧光定量检测检查什么核酸方面的检查有核酸扩增荧光定量检测检查,那么核酸扩增荧光定量检
如何检测-crispr-基因敲除成功
CRISPR (clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats)是一种来自细菌降解入侵的病毒 DNA 或其他外源 DNA 的免疫机制。在细菌及古细菌中,CRISPR系统共分成3类,其中Ⅰ类和Ⅲ类需要多种CRISPR相关蛋白(Ca
一种与众不同的CRISPR核酸酶
CRISPR是一种出色的基因组编辑工具,深受研究人员的欢迎。其中,大家比较熟悉的是来自化脓链球菌的Cas9(SpCas9)。不过,这并不是唯一的选择。一种新型核酸酶Cas13a(以前称为C2c2)正逐渐走进人们的视野,它具有独特的性质,进一步扩展了CRISPR工具箱。在此,我们将介绍一下Cas
CRISPR的前世今生:酸奶中的CRISPR
两年前,一个缩写为CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,规律间隔成簇短回文重复序列)的基因编辑工具横空出世,席卷了许多实验室。而在这一系统被开发的数亿年前,细菌和古细菌就利用其非常精确的对几乎每个基因组中
CRISPR的前世今生:酸奶中的CRISPR
两年前,一个缩写为CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,规律间隔成簇短回文重复序列)的基因编辑工具横空出世,席卷了许多实验室。而在这一系统被开发的数亿年前,细菌和古细菌就利用其非常精确的对几乎每个基因组中
CRISPR专家发表CRISPR/Cas9综述
CRISPR技术的确在科学界掀起了基因组编辑的狂潮。在Pubmed中快速检索“CRISPR”,目前已有1400多项结果。也相继有专家为该技术撰写了综述论文,例如:Science综述:CRISPR-Cas9系统的历史和未来;北大魏文胜最新发表CRISPR综述。 最近,来自美国加州大学伯克利分校和
CRISPR女王:她的生命被CRISPR照亮
一位多年来埋头于实验室枯燥生活的微生物学家,突然有一天由于基因编辑技术站在了聚光灯下 现年48岁的Emmanuelle Charpentier在过去二十年学术生涯中辗转去过了5个国家九所不同的研究院,“我总是不得不从零开始,亲自构建新的实验室,”她说。45岁之前Charpentier还无法雇
NatureMethods发布CRISPR新技术:CRISPRX
斯坦福大学遗传学系,药理学系的几位学者合作,开发出了一种为原位蛋白质工程重利用体细胞超突变的新技术―― CRISPR-X ,这将能帮助科学家们创建复杂的原始遗传突变文库,分析完善蛋白质工程。这一研究成果在线公布在10月31日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是斯坦福大学Micha
核酸检测:传染病原检测、食品安全检疫及致病基因筛查
高效精准的核酸检测技术在传染病原检测、食品安全检疫和致病基因筛查等许多方面具有重要的应用。基于CRISPR的基因组编辑技术极大地革新了生物医学研究。有趣的是,除了能够通过对基因组精准操控来进行功能基因组学研究,最近一些研究发现CRISPR系统的某些效应蛋白,例如Cas12a,在切割靶DNA后会受
什么酶重组等温扩增技术?
通过模拟生物体遗传物质自身扩增复制的原理,将来源于细菌,病毒和噬菌体的特定重组酶、外切酶、聚合酶等多酶体系进行改造突变并筛选其功能,通过不同的核酸扩增反应体系进行优化组合,从而获得核心的重组等温扩增体系,建立特殊扩增反应体系,在37-42℃恒温条件下,可将微量DNA/RNA的特异性区段在数分钟内扩增
环介导等温扩增技术原理
环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification),是一个比较公认的等温扩增方法,现如今等温扩增法很多,比如RCA,NASBA,RPA...如果可以,你可以参考这篇文献:Loop-mediated isothermal amplification inte
LAMP(环介导等温扩增)技术
PCR方法在人类及动植物疾病基因诊断、食品分析和环境监测等领域发挥着举足轻重的作用,其灵敏度高、特异性好,是目前最精准的基因诊断方法。然而PCR方法操作起来较复杂,对仪器和人员要求比较高,不适合基层或现场快速诊断,因此在国内的推广速度并不是很快。2000年日本学者Notomi在Nucleic Aci
Nature-Methods发布CRISPR新技术:CRISPRX
斯坦福大学遗传学系,药理学系的几位学者合作,开发出了一种为原位蛋白质工程重利用体细胞超突变的新技术—— CRISPR-X ,这将能帮助科学家们创建复杂的原始遗传突变文库,分析完善蛋白质工程。 这一研究成果在线公布在10月31日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是斯坦福大学Mi
张锋团队带来CRISPR重磅新应用核酸检测灵敏度可达单分子
今日,知名华人科学家张锋教授与同事在《科学》杂志上发表论文,介绍了一种全新的CRISPR应用工具,用以检测核酸。这一工具能快速检测RNA或DNA分子,灵敏度甚至有望检测出单个核酸。这一重磅研究对于科研与全球公共卫生有着极大的影响。 早在2010年,科学家们就意识到,CRISPR平台也许能被用来
上海应物所等发表核酸等温扩增技术研究综述论文
近期,中国科学院上海应用物理研究所研究员樊春海与西安交通大学生命学院教授赵永席应邀在《化学评论》(Chemical Reviews)发表了关于核酸等温扩增技术的综述论文:Isothermal Amplification of Nucleic Acids(Chem. Rev., 2015, 115
CRISPR/Cas9抗体—CRISPR/Cas9研究
能够方便而精确的对DNA和核苷酸序列进行编辑,是科研工作者们长期以来的梦想。CRISPR/Cas9系统的诞生和成熟标志这这一梦想逐渐变为现实。CRISPR/Cas9系统,作为第三代基因编辑技术,它的本质其实是细菌中一种对付诸如病毒等外来DNA的防御系统。此系统的工作原理是 成簇的、规律间隔的短回
Cell:重磅!揭示抗CRISPR蛋白阻断CRISPR系统机制
想象一下细菌和病毒一直处于军备竞赛之中。对很多细菌而言,一种抵抗病毒感染的防御线是一种复杂的RNA引导的“免疫系统”,即CRISPR-Cas。这个免疫系统的核心是一种识别病毒DNA和触发它破坏的监视复合物。然而,病毒能够反击,利用抗CRISPR蛋白让这种监视复合物不能够发挥功能。但是,在此之前,
CRISPR先驱Nature解析新一代CRISPR系统
在4月20日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究论文中,科学家们描绘了一种新型细菌CRISPR-Cpf1系统的分子细节,这为实现其他的基因编辑应用,如平行靶向多个基因打开了可能的途径。 领导这一研究的任职于德国马克思普朗克感染生物学研究所和瑞典于默奥大学的Emmanuelle Charp
反CRISPR噬菌体合作克服CRISPRCas免疫
英国埃克塞特大学的研究人员发现,一种被称为噬菌体的病毒在面对迎面而来的攻击时,首先削弱细菌的防御力,然后再杀死细菌。 这一发现是一个关键性突破,它将有助于改善噬菌体疗法,治疗危机生命的细菌感染。 细菌有防御系统,例如众所周知的CRISPR-Cas,以保护自身免受病毒侵袭。像军备竞赛一样,噬菌
等温扩增到底行不行?
最近又看到一些同行写的关于等温扩增的文章。不禁想起几年前看到的RPA技术介绍。当时第一次看到这个技术的时候,简直可以用“震惊”、“惊艳”来形容。扩增速度真快啊,十几分钟就能出结果,比现在吭哧吭哧做PCR岂不是方便多了!可是几年过去了,似乎也没看到基于RPA技术的临床产品上市。说真的是有点失望的。就像
等温扩增,存在“假阳性”的Bug?
等温扩增技术作为一种核酸分子诊断技术,从诞生之日起就不断受到研究者的青睐,但也少不了质疑,甚至摒弃。引起这种截然相反的态度的原因在于等温扩增技术自身所存在的缺陷。而最为突出的一点是,在建立方法或者实际样本检测的过程中,等温扩增技术引起假阳性结果的概率相对较高,使得其实际应用范围变窄,未能真正显示出其
等温扩增技术的原理及应用
等温扩增技术(isothermal amplification technology,ITA)是近年来发展起来的基于恒温扩增的新型核酸扩增技术,主要包括环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)[1]、交叉引物扩增(crossing pr
核酸扩增检测仪临床应用
1.聚合酶链反应 可用于检测由基因点突变、获得启动子、基因易位、重排、扩增等导致的癌基因的异常激活、抑癌基因的失活及检测外源性肿瘤病毒。此外,检测致癌基因的表达水平对选择化疗方案也具有一定的指导意义。 2.聚合酶链反应直接测序 从最直观的核酸序列水平研究癌基因突变,为肿瘤的早期诊断及基因治