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反CRISPR噬菌体合作克服CRISPRCas免疫

英国埃克塞特大学的研究人员发现,一种被称为噬菌体的病毒在面对迎面而来的攻击时,首先削弱细菌的防御力,然后再杀死细菌。 这一发现是一个关键性突破,它将有助于改善噬菌体疗法,治疗危机生命的细菌感染。 细菌有防御系统,例如众所周知的CRISPR-Cas,以保护自身免受病毒侵袭。像军备竞赛一样,噬菌体也装备了“反CRISPR”分子,以便中和来自细菌的防御。 埃克塞特大学的研究表明,单个病毒粒子是不能完全抵消CRISPR-Cas系统的,但是,如果有足够多的病毒粒子,这种“团队合作”可以让它们克服防御机制,迅速在细菌种群中建立感染。 “道高一尺魔高一丈,足够多的病毒粒子是它们的攻击利器,”文章一作Mariann Landsberger博士说。“显然,病毒数量低于这个‘临界点’的话,就会导致入侵者噬菌体被细菌歼灭。” 相反,噬菌体数量如果超过“临界点”,它们就会通过同时或顺序感染与细菌结合。“关于‘临界点’的一种解释是,两个具有......阅读全文

NSMB背靠背丨黄志伟 揭示其抑制type V型Cas12a活性的新机制

  CRISPR-Cas适应性免疫系统为细菌和古细菌对抗噬菌体和质粒入侵提供了核酸序列特异性的防御机制【1】。CRISPR-Cas系统分为6个亚型,其中II型CRISPR-Cas9和V 型CRISPR-Cas12a(Cpf1)系统被广泛应用于基因组编辑和多种多样的生物技术应用【2,3】。在噬菌体感染

哈工大最新发表Nature文章 再次解析CRISPR作用机制

  来自哈尔滨工业大学生命科学与技术学院的研究人员发表了题为“Structural basis of CRISPR–SpyCas9 inhibition by an anti-CRISPR protein”的文章,揭示了Anti-CRISPR 蛋白AcrIIA4抑制SpyCas9活性的分子机制。  

哈工大Nature:揭示Anti-CRISPR蛋白抑制SpyCas9活性的分子机制

  4月28日,哈尔滨工业大学生命学院黄志伟教授课题组在《自然》(《Nature》)在线发表了题目为《Anti-CRISPR蛋白抑制CRISPR-SpyCas9活性的分子机制》(Structural basis of CRISPR-SpyCas9 inhibition by an anti-CRIS

与CRISPR/Cas系统相爱相杀的抗CRISPR蛋白研究最新进展 一

CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种免疫系统,被用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。在CRISPR/Cas系统中,CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindr

噬菌体竟然可以保护自身基因组免受CRISPR核酸酶切割

  细菌和感染它们的病毒正在进行一场与生命本身一样古老的分子军备竞赛。进化为细菌配备了一系列可靶向并破坏病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系统。但是,杀死细菌的病毒(也称为噬菌体)已设计出了它们自己的工具来帮助它们战胜这些最强大的细菌防御。  如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山

Nature首次揭示噬菌体保护自身基因组免受CRISPR核酸酶切割

  细菌和感染它们的病毒正在进行一场与生命本身一样古老的分子军备竞赛。进化为细菌配备了一系列可靶向并破坏病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系统。但是,杀死细菌的病毒(也称为噬菌体)已设计出了它们自己的工具来帮助它们战胜这些最强大的细菌防御。  如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山

新发现!Cell:噬菌体抱团抑制细菌CRISPR免疫系统

   在2018年7月19日同时在线发表在Cell期刊上的两篇论文中,来自两个研究团队的研究人员提供了当入侵含有CRISPR的细菌时,噬菌体彼此间进行合作的证据。他们发现为了压制CRISPR的破坏,噬菌体通过联合起来快速地感染细菌来加以适应,而且有时一个噬菌体还会为此作为引火噬菌体(primer p

张锋发表Science杂志CRISPR新综述

  新一期(8月5日)的《科学》(Science)杂志发表了一篇题为“Diverse evolutionary roots and mechanistic variations of the CRISPR-Cas systems”的综述文章。瓦赫宁根大学微生物学家John van der Oos是这

与CRISPR/Cas系统相爱相杀的抗CRISPR蛋白研究最新进展 二

利用一种被称作冷冻电镜的高分辨率成像技术,这些研究人员发现了CRISPR系统和抗CRISPR蛋白的三个重要的方面。首先,他们准确地观察这种CRISPR监视复合物如何识别病毒遗传物质以便发现它应当在何处发起攻击。这种监视复合物中的蛋白像握手那样缠绕在细菌crRNA的周围,让这种crRNA的特定片段暴露

Nature:CRISPR-Cas也有天敌!

  近日,来自加拿大多伦多大学的研究人员在著名国际学术期刊Nature上发表了一项最新研究进展,他们在这项研究中首次发现了噬菌体合成的用以抑制细菌体内CRISPR-CAS系统的蛋白质。  细菌与感染细菌的病毒(噬菌体)之间的生存之战导致了许多细菌的防御系统得到进化,同时噬菌体也针对这些系统进化出了新

Natureasia聚焦:CRISPR/Cas研究进展Top20

  CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种后天免疫系统,其以消灭外来的质体或者噬菌体并在自身基因组中留下外来基因片段作为“记忆”。  CRISPR/Cas系统全名为常间回文重复序列丛集/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统(clustered regularly inte

生物物理所揭示噬菌体防御CRISPR-SpyCas9的分子机制

  2018年12月31日,《分子细胞》(Molecular Cell)杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组在CRISPR-Cas系统研究中取得的最新进展。标题为Phage AcrIIA2 DNA Mimicry: Structural Basis of the CRISPR and

CRISPR技术的前景因免疫反应而蒙上阴影

  通过基因组编辑来纠正异常,这个概念似乎简单明了。几十年来,科学家也一直尝试用基因编辑来开展治疗,获得了不同程度的成功。最大的障碍来自基因导入系统,它往往使用病毒,具有一定的风险。图片来源于网络  2013年,研究人员首次利用CRISPR-Cas9系统来编辑哺乳动物细胞的基因组,对编辑发生的位置有

微生物所噬菌体抑制细菌CRISPR-Cas系统机制研究中获进展

  原核生物通过一系列的防御系统来抵抗噬菌体等寄生生物的攻击。与真核生物的免疫系统类似,原核生物的防御系统也可以分为天然免疫系统和获得性免疫系统。天然免疫系统又包括限制性修饰(Restriction-Modification, R-M)系统、DNA干扰、毒素-抗毒素系统等,是非特异性的防御措施;而获

Nature: 同其它细菌共进化可保条件病原菌自身毒力

  近日,英国埃克塞特大学的研究人员在Nature上发表了题为“Bacterial biodiversity drives the evolution of CRISPR-based phage resistance”的文章,在自然环境中进化的细菌可能对噬菌体治疗具有抵抗力,而不会丧失其毒性。  据

Nature: 同其它细菌共进化可保条件病原菌自身毒力

  近日,英国埃克塞特大学的研究人员在Nature上发表了题为“Bacterial biodiversity drives the evolution of CRISPR-based phage resistance”的文章,在自然环境中进化的细菌可能对噬菌体治疗具有抵抗力,而不会丧失其毒性。  据

体积是CRISPR-Cas9的一半的新型基因编辑工具-CasΦ

  基因编辑(gene editing),又称基因组编辑(genome editing)或基因组工程(genome engineering),是一种新兴的比较精确的能对生物体基因组特定目标基因进行修饰的一种基因工程技术。基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行定点“编辑”,实现对特定DNA片段的修饰。

CRISPR女神创办公司放“大招”

  CRISPR的火热及其在临床上应用的美好愿景,令这一技术相关的公司不断涌现,除了张锋等人创办的Editas Medicine,Emmanuelle Charpentier等人的ERS Genomics,另外一位CRISPR先驱Jennifer Doudna也创办了自家公司:Caribou Bio

将CRISPR-Cas系统用于抗菌“基因疗法”

  CRISPR于1987年出现于日本,当时的研究人员报告称,他们在大肠杆菌基因组中发现了一种不寻常的结构,其中包含一系列重复片段,中间以独特的间隔序列隔开。后来的研究表明,间隔序列对应了感染细菌细胞的噬菌体的序列。在一些原核生物和古生物中,CRISPR和CRISPR相关蛋白(Cas)作为一种适应性

2020年CRISPR/Cas最新研究进展

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。图片

中科院Cell发表CRISPR-Cas研究新成果

  来自中科院生物物理研究所的研究人员,在新研究中揭示出了CRISPR-Cas系统依赖于PAM获取间隔序列(spacer)的结构基础及机制。这项重要的研究工作在线发布于10月15日的《细胞》(Cell)杂志上。  论文的通讯作者是中科院生物物理研究所的王艳丽(Yanli Wang)研究员,其主要研究

中科院Cell发表CRISPR-Cas研究新成果

  来自中科院生物物理研究所的研究人员,在新研究中揭示出了CRISPR-Cas系统依赖于PAM获取间隔序列(spacer)的结构基础及机制。这项重要的研究工作在线发布于10月15日的《细胞》(Cell)杂志上。  论文的通讯作者是中科院生物物理研究所的王艳丽(Yanli Wang)研究员,其主要研究

浙江大学Nature子刊聚焦CRISPR–Cas的抑制系统

  来自浙江大学生命科学研究院的研究人员揭示出了,噬菌体蛋白AcrF3抑制Cas3的结构基础。他们的研究结果发布在7月25日的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。  浙江大学生命科学研究院的朱永群(Yongqun Zh

生物谷7月份结构生物学研究进展一览

  1. Cell:中科院生物物理所王艳丽/章新政课题组从结构上揭示Cas13a切割RNA机制  doi:10.1016/j.cell.2017.06.050  CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种免疫系统,被用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。在CR

中科院生物物理所:从结构上揭示Cas13a切割RNA机制

  CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种免疫系统,被用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。在CRISPR/Cas系统中,CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindr

CRISPR/Cas9应用近期重大进展

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。  

一文盘点12月CRISPR/Cas最新研究进展

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。  

基因编辑进展梳理 Part I CRISPR系统拓展及机制研究篇

  基因编辑技术是指对目标基因进行编辑,实现对特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因编辑技术问世以来,取得了一系列重大突破,并相继在2012、2013、2015和2017年被Science杂志评为十大科学进展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作简便和成本低廉等优势受到了众多

基因编辑进展梳理 Part I CRISPR系统拓展及机制研究篇

  基因编辑技术是指对目标基因进行编辑,实现对特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因编辑技术问世以来,取得了一系列重大突破,并相继在2012、2013、2015和2017年被Science杂志评为十大科学进展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作简便和成本低廉等优势受到了众多

科学家揭示细菌对外源DNA的适应性免疫响应机制

  近期,中国科学院生物物理研究所高璞课题组与美国Sloan研究所Patel课题组合作,揭示了两类新型CRISPR-Cas系统(Type V-A Cpf1及Type V-B C2c1)响应外源DNA的作用机制,相关研究论文分别发表于2016年8月的《细胞研究》(Cell Research)杂志和12