三款热门新一代测序仪的比较
生物通报道 来自英国Wellcome Trust Sanger研究院的研究人员对市场上三款热门测序仪(Ion PGM、PacBio RS、MiSeq)的性能进行了比较。该成果发表在7月24日的《BMC Genomics》上。 蓬勃发展的新一代测序(NGS)技术彻底改变了基因组学和遗传学研究。随着2011年三款新的测序平台的发布，此领域的变革步伐不断加快。这三款新平台分别为：Ion Torrent的PGM、Pacific Biosciences的RS和Illumina的MiSeq。 Ion Torrent的PGM是利用半导体技术来检测合成过程中核苷酸掺入时释放的质子。PacBio则通过单分子实时(SMRT)测序技术来实现碱基检测。而 Illumina则一直采用边合成边测序方法，之前的Genome Analyzer和HiSeq 2000是这样，MiSeq也同样，不过通量更低、周转时间快，适合小型实......阅读全文
基因组构的定义
中文名称基因组构英文名称gene organization定 义(1)单个基因的组成结构。一般包含启动子、增强子、非翻译序列、编码序列等。真核生物和原核生物的一个显著区别是前者具有内含子。(2)广义指一个完整的生物个体内基因的组织排列方式。原核和真核生物的一个显著区别是原核生物的结构基因成串分布,
基因组的定义
在分子生物学和遗传学领域，基因组是指生物体所有遗传物质的总和。这些遗传物质包括DNA或RNA（病毒RNA）。基因组包括编码DNA和非编码DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA。研究基因组的科学称为基因组学。
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫，地理分布广，感染率高，寄生于人体盲肠，导致人体慢性感染，对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
基因组所人类基因组突变研究获进展
序列变异的周期性和与TCR相关联的突变 基因突变会导致人类疾病的产生，因此研究遗传变异的产生过程和那些能够引起疾病的突变对生命科学基础研究以及人类健康是十分关键和重要的。 近日，中国科学院北京基因组研究所于军研究员带领其研究团队，在有关人类基因组中以转录为中心的突变研究方面取得新进展
移动基因组增加弧菌基因组可塑性的机制
移动基因组增加微生物物种多样性的示意图。研究团队 供图 6月27日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室研究员王晓雪团队通过研究珊瑚体内具有生态竞争的假交替单胞菌和弧菌之间的互作，揭示了一种移动基因组增加弧菌基因组可塑性，驱动弧菌遗传和表型多样化的机制。相关研究在线发表
最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图 日前，由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学
将基因组存进银行－迎接真正的基因组时代
你知道在你身上什么东西比钱更有价值，并且还是唯一的吗？答案是：你的基因组。就像你的钱一样，你的基因组也应该被尽可能安全的存储起来。而那些负责存储你基因组的机构应该对如何存储、使用以及分享它进行监管。 随着医学科学的进步，人们能够控制和管理他们的个人基因组将变得越来越重要。为
研究人员“沉默”重要的致癌基因
最近，来自北卡罗来纳大学（UNC）医学院和德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员，开发出一种新方法，阻断KRAS致癌基因——在人类癌症中最常见的一个突变基因。这项研究，由UNC医学副教授Chad Pecot带领，为攻击KRAS提供了另外一种途径，这个突变被证明是药物开发当中一个难懂而令人沮丧的
加拿大研究人员复活灭绝痘病毒
天花可谓是历史上最致命的疾病之一。为了消灭这种疾病，人类花费了几十年的时间，投入了数十亿美元。然而，一个小型科学团队仅用半年时间和10万美元就可能让这个“幽灵病毒”重返人间，而且并不需要多么特殊的新知识。 这是一组加拿大研究人员在一个不同寻常且尚未发表的实验中得出的结论。加拿大阿尔伯塔大学病
研究人员揭示氢化钡固氮反应机制
近日，中科院大连化学物理研究所研究员陈萍、研究员郭建平团队和丹麦技术大学教授Tejs Vegge团队合作，通过实验设计与理论计算相结合, 揭示了非过渡金属基氢化钡（BaH2）固氮及加氢产氨过程的反应机理。相关成果发表在《德国应用化学》。氨是基础化工原料之一，是合成氮肥以及几乎所有重要含氮化学品的氮源
日研究人员成功消灭肿瘤干细胞
新华社东京3月19日电：日本一个研究小组发现，对肿瘤干细胞进行基因操作可以使化疗药物更易发挥作用，杀死癌细胞。这一发现或促进开发出根治癌症的治疗方法。 肿瘤干细胞被认为在体内处于几乎不增殖的“休眠状态”。化疗药物虽能遏制肿瘤细胞增殖，但对干细胞却难以发挥作用。即使化疗后肿瘤看起来
研究人员开发出可变色离子皮肤
人体皮肤通常可以对触觉信号的强度与位置同时产生准确的感知。而模拟人体皮肤结构与功能的柔性电子皮肤，其对压力位置的感知通常依赖于高密度传感阵列的制备，包括后端数据处理以及显示装置的集成。目前，在电子皮肤上实现压力可视化的策略通常包括压力驱动的发光与变色，这种方法可实现高空间分辨率，但像素化阵列设计对加
为存数据－研究人员给细菌编程
“Hello World！”是许多程序员的第一行代码，但你见过从活的生物体内读出的“Hello World！”吗？哥伦比亚大学的一个研究小组做到了，他们把数据写入活细菌的DNA，相关研究11日发表在《自然-生物化学》上。 对数据存储而言，DNA在许多方面都很有吸引力。比如，相较于目前结构最紧凑
研究人员发现动物“再生记忆”可被改写
台湾研究人员陈振辉及其研究团队日前公布的最新研究成果发现，经由调控特定基因的活性，可以改写动物的“再生记忆”。 该项研究发现，当“再生记忆”受到影响后，斑马鱼再生的新尾鳍可以出现不同的大小和形状。这是科学家首次证实“再生记忆”可以被改写。此研究已于11月27日刊登于国际期刊《当代生物学》。
研究人员实现安全开关血脑屏障
《自然—通讯》近日发表的一项一期临床试验，用无创、可逆的方式打开了5名阿尔茨海默氏症患者的血脑屏障。研究的结果显示，这个操作流程很安全，但对聚焦超声改善阿尔茨海默氏症临床症状的功效尚无定论。 阿尔茨海默氏症俗称老年痴呆症，以大脑认知功能进行性丧失为特征。根据国际阿尔茨海默氏症协会统计，目前全球
德研究人员发明能防止蛀牙糖果
牙科医生总是警告我们吃太多糖果会导致蛀牙，但也许我们以后再也不用担心这么多了。据美国猎奇网站"odditycentral.com"12月11日报道，近日，德国柏林的生物技术公司"OrganoBalance"的研究人员发明了一种能防止蛀牙的特殊糖果。 研究人员指出，糖果本身不会导致蛀牙，真正
澳洲研究人员：孩子吃得咸更易发胖
澳洲研究人员发现，日常饮食摄入盐分多的孩子容易超重或肥胖。迪金大学研究小组收集666名4至12岁儿童全天的尿液，以此来精确测量他们一天的盐分摄入。结果发现，70％的调查对象一天摄入的盐超过建议摄入量4至5克，使得整体一天的食盐平均摄入量达到6克。 研究人员在由《英国营养学杂志》发表的论文中
多国研究人员欲从地幔取岩石
一组研究人员4月17日从哥斯达黎加沿岸出发，继续在太平洋底部地壳层钻洞，打算从地幔层取出岩石样本，以研究海洋与气候变化间的关系。 这一小组共30人，分别来自英国、法国等，乘坐一艘大约140米长的船，在哥斯达黎加沿岸海域着手钻洞。钻洞工作始于2002年，这是他们第四次作业。
日本研究人员首次成功测算宇宙亮度
日本东京大学和名古屋大学联合研究小组日前发表公报称，他们在世界上首次成功测算出宇宙空间平均亮度。 公报指出，在银河系外观看宇宙空间的时候，其亮度相当于“在漆黑的东京迪斯尼乐园（约50万平方米）中点亮3根蜡烛”。 站在地球观测宇宙亮度的难度在于干扰太多。由于太阳光等影响，在地球上观测
研究人员分离出抗埃博拉抗体
中科院广州生物医药与健康研究院和广州医科大学联合共建的呼吸疾病国家重点实验室，与清华大学等单位合作，通过单细胞克隆等技术，成功从猕猴体内分离出我国首例抗埃博拉病毒感染的高效单克隆中和抗体。相关研究5月17日在线发表于《科学报告》。 遏制埃博拉等新发再发传染性疾病的暴发和流行，有赖于高效、可及的
研究人员破译结皮绿藻基因密码
在沙漠和旱地中，有一种神奇的生物土壤结皮被称为“沙漠皮肤”，其在维持土壤健康、减少侵蚀、促进养分循环等方面发挥重要作用。绿藻（特指片球藻属绿藻）就是土壤结皮中的重要成员之一，因其能适应各种极端环境如冰川、火山等处的土壤，并在压力下展现卓越的脂质积累能力而引发关注。尽管结皮绿藻具有重要的生态和生物
日本研究人员成功消灭肿瘤干细胞
日本一个研究小组发现，对肿瘤干细胞进行基因操作可以使化疗药物更易发挥作用，杀死癌细胞。这一发现或促进开发出根治癌症的治疗方法。 肿瘤干细胞被认为在体内处于几乎不增殖的“休眠状态”。化疗药物虽能遏制肿瘤细胞增殖，但对干细胞却难以发挥作用。即使化疗后肿瘤看起来已经消失，但只要残留少量
研究人员发现学数学可损伤大脑
据国外媒体报道，一项研究显示，害怕数学可激活和生理痛有关的大脑区域。美国芝加哥大学研究人员伊恩-里昂斯和西恩-贝洛克在《公共科学图书馆-综合》杂志上撰文说，一个人对一项数学任务的焦虑越高，和检测内脏威胁有关的大脑区域就越活跃。 这些研究报告的作者说，以前的研究显示，社会排斥或创伤性精神崩溃
美疫苗研究人员因诈骗被判入狱
很少有科学家因科研不端行为而入狱。不过，美国爱荷华州立大学前生物医学专家Dong-Pyou Han日前因捏造和篡改艾滋病疫苗试验中的数据而被判入狱57个月。他还被处以720万美元的罚金，并将在离开监狱后接受3年的监外看管。 Han的案件因吸引了一位颇具权威的美国参议员的注意而比大多数案件更加引
意大利研究人员证明迷迭香具有抗癌活性
意大利比萨大学的一项研究发现，芳香族植物迷迭香具有抗癌活性，可被用作抗癌治疗的佐剂。这项研究成果于2016年5月发表在国际期刊《生物化学和细胞生物学》上。 迷迭香是地中海饮食中经常用到的一种烹饪用植物。比萨大学的研究人员发现，迷迭香中含有的化合物成分鼠尾草酚，能重新激活蛋白质P53，而P53
美研究人员利用细菌降低汞污染
人类活动造成的汞污染无处不在，而汞对水资源的污染尤为严重。美国研究人员最近找到一种细菌，它所合成的酶可降低汞对环境的污染。 美国田纳西大学的研究人员发布公报说，他们在研究中发现，汞对靠近食物链底端的生物，如鱼及水生贝类的污染相当严重，并通过它们最终对人类健康造成影响，但有些细菌具有破坏这一
研究人员克隆出建兰开花整合基因
记者日前从中科院华南植物园获悉，该园科研人员完成的“建兰开花整合基因—CeFT基因及其应用”获国家发明ZL授权。该发明为通过基因工程改良植物生长进程、调控植物花期提供了一种有效的技术手段，具有广泛的应用前景和极大的经济价值。 据介绍，建兰是兰科兰属中的小花型地生种，为我国传统名花之一，具有
研究人员发现癌细胞的生存机制
由来自伦敦克里克研究所和耶路撒冷希伯来大学的科学家领导的国际研究揭示了癌细胞中的存活机制，即使在侵略性治疗之后，该疾病也能够再次爆发。在Science（LINK）上发表的论文中，研究人员描述了癌症肿瘤细胞成为可以维持长期生长的癌症干细胞的机制。 当癌症发展时，产生的细胞在它们的生物学性质上不均
美国研究人员发明新型超薄光学透镜
据美国航空航天局（NASA）官网8月31日报道，NASA喷气推进实验室（JPL）与加州理工学院研究人员合作开发了一种超薄光学透镜，通过“元表面”（metasurface）技术实现对光路的控制，可应用于先进显微镜、显示器材、传感器、摄像机等多种仪器，使光学系统集成度大大提高，并使透镜制造方式产生革
研究人员用手机数据追踪疟疾传播
新华社北京10月15日电 一个国际研究团队日前报告说，他们通过分析所收集的数据成功对肯尼亚部分地区的疟疾传播趋势进行跟踪观测，这种新的分析方法有望提高对这类疾病疫情的监控效率。 据美国科学促进会主办的EurekAlert网站介绍，来自卡耐基梅隆大学等机构的研究人员在2008年6月~20