研究发现拟南芥表皮毛时序性发育的分子机理
3月6日,国际学术期刊The EMBO Journal 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所王佳伟研究组题为A spatiotemporally regulated transcriptional complex underlies heteroblastic development of leaf hairs in Arabidopsis thaliana 的研究论文。 动植物都由单细胞受精卵通过细胞分裂和分化发育而来。这一特性决定了生命体的生长发育具有时序性,在不同的发育阶段具有不同的形态和代谢特征。在模式植物拟南芥中,幼年期与成年期植物在发育模式、次生代谢物合成和环境响应等方面存在显著差异。研究表明miR156是调控这些性状时序性变化的关键因子。miR156在幼苗中高表达,维持植物的幼年期特征。随着植物年龄的增长,miR156含量逐渐降低,其靶标SPL类转录因子表达逐渐上升,诱发植物成年态......阅读全文
异染色质的功能
关于异染色质的功能,还未深入了解。但以下的几点是明显的。 1结构型异染色质可以加强着丝点区,使着丝粒稳定,以确保染色体分离。 2可以隔离和保护重要基因(例如NOR区的18S和28S基因),防止或减少基因突变和交换。 3促进物种分化,同源染色体可通过其异染色质区的重复序列在减数分裂时配对,这
异染色质的定义
异染色质分为结构异染色质和功能异染色质两种类型。结构异染色质是指各类细胞在整个细胞周期内处于凝集状态的染色质,多定位于着丝粒区、端粒区,含有大量高度重复顺序的脱氧核糖核酸(DNA),称为卫星DNA(satellite DNA)。功能异染色质只在一定细胞类型或在生物一定发育阶段凝集,如雌性哺乳动物
常染色质的定义
常染色质是染色质(由DNA、RNA和蛋白质组成)的一种松散聚集的形式,这种聚集方式在基因中大量存在,并且相应的片段通常处于活跃的转录当中(但并非必要,即常染色质部分不一定都是高表达的序列)。常染色质构成了细胞核基因组中表达最活跃的一部分。
常染色质的功能
常染色质区域的基因可以被转录为信使RNA。常染色质区域非折叠的结构允许基因调控蛋白和RNA聚合酶与其上的DNA序列结合,从而开启转录过程。在转录过程中,并非所有的常染色质都会被转录,但基本上非转录的部分会折叠为异染色质以保护暂时其上不用的基因。因此细胞的活性与细胞核中的常染色质数目有直接关系。常染色
什么是Y-染色质?
Y染色质又称Y小体或荧光小体。Y染色体用荧光染料染色后,呈亮暗不一的荧光带,在Y染色体长臂的远侧段呈明亮的荧光区。在问期时Y染色体长臂远侧段的强荧光特性仍然存在,经荧光染色后,呈强荧光亮点,直径为0.25—0.3um,位于细胞核内的任何部位。
染色质修饰如何调控基因表达?-中国学者提出新见解
中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心的研究人员最新发表两篇Nature Genetics文章,利用生化、分子、遗传、组学及结构生物学等研究方法,分别揭示了植物特有染色质凝缩蛋白EMF1与含BAH结构域的SHL和EBS形成BAH-EMF1复合体而介导植物基因沉默
Nature-Plants文章:精准高通量检测Rloop分布的新方法
来自清华大学生科院,清华-北大生命科学联合中心的研究人员发表了题为“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章,首次报道了精准、高效、高通量检测R-loop的方法,并利用此方法首次揭示模式植物拟南芥
植物着丝粒研究取得进展
基因组测序及解析以及新技术的广泛应用,让人们得以继续探索着丝粒和端粒等染色体上高度重复区域在生命活动中的新功能。植物着丝粒含有丰富的重复序列,如串联重复序列(Satellite)和反转座子(Retrotransposon),参与基因组空间构象和细胞分裂等重要的生物学功能。然而不同物种双着丝粒染色
研究揭示植物中DNA半甲基化稳态维持的机制
DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰,其在基因表达调控中起着重要作用。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在“胞嘧啶-鸟嘌呤”(CG)位点的胞嘧啶上。CG双链上两个胞嘧啶的甲基化状态通常一致,完全甲基化或非甲基化。这种对称的甲基化状态会在DNA复制过程中转化为不对称的“半甲基化”状态,再由DNA甲基转
科学家为模式植物拟南芥绘制“蓝图”
任何生物体的每个细胞都包含完整的遗传信息,或者说是一个生物的“蓝图”,编码所谓的DNA核苷酸构建块序列。但是植物是如何创造出各种各样的组织的呢?比如将光能转化成化学能并产生氧气的叶子,或者从土壤中吸收养分的根?答案就在各自组织细胞的蛋白质模式。科学家为模式植物拟南芥绘制“蓝图”。图片来源:Cha
概述泛素缀合酶在拟南芥中的研究
泛素缀合酶是由150-200个氨基酸组成,具有研究拟南芥中Ubc6的功能的物质。 在拟南芥中,大约有一半的E2s成员的生化特征被描述,并且有很大一部分的拟南芥E2s成员都可以在酵母细胞中找到相应的同源物。然而,在拟南芥中有三种E2s基因家族表达的蛋白并没有在芽殖酵母中找到同源物,但是却在哺乳动
拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验
试剂、试剂盒HEPES-KOH 山梨醇
拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验
试剂、试剂盒 HEPES-KOH山梨醇抗坏血酸维生素 C半胱氨酸PF-Percoll仪器、耗材 浓缩离心设备实验步骤 建议在短日照条件下培养材料以诱导营养生长,并在照光的早期收取材料以提高获得完整叶绿体的产率。所以试剂应在收集材料之前准备好,并连同其他一些设备,如离心机转头及离心管等在冰箱或冰上冷却
《科学》:乙烯能调节拟南芥根部干细胞分化
乙烯是一种能够催熟果实的气态植物激素。在最新一期的《科学》杂志上,由瑞典、法国、英国的研究人员联合发表的文章报告说,他们发现乙烯还能够调节拟南芥根部的干细胞分化。 已经知道,多细胞生物的构建依赖于能兼顾自我更新和产生分化的子细胞的特殊细胞——干细胞。在这项新的研究中,研究人员证实对植物生长很重要的气
转基因拟南芥研究能提高作物生长速度
加拿大圭尔夫大学研究人员发现,在一种叫做拟南芥(Arabidopsis)的小花植物中插入一种特殊的玉米酶,会使其生长速度加倍,种子产量达到原来的4倍。 这一发现有望提高油菜籽、大豆等重要油料作物和生物燃料作物亚麻荠的产量,也会捕获更多大气二氧化碳,有可能给食用作物和生物燃料种植带来变革。
拟南芥种子休眠机制最新研究进展
近日,中科院植物研究所研究员刘永秀团队发现拟南芥转录后调控的重要分子机器pre-mRNA 3'末端加工复合体参与种子休眠调控。相关研究成果发表于《植物杂志》。种子休眠是指完整有活力的种子在适宜环境条件下仍不能萌发的生物学特性,受环境和遗传因素影响,是典型的多基因调控的复杂数量性状。目前已发现
拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验
试剂、试剂盒HEPES-KOH山梨醇抗坏血酸维生素 C半胱氨酸PF-Percoll仪器、耗材浓缩离心设备实验步骤建议在短日照条件下培养材料以诱导营养生长,并在照光的早期收取材料以提高获得完整叶绿体的产率。所以试剂应在收集材料之前准备好,并连同其他一些设备,如离心机转头及离心管等在冰箱或冰上冷却至 0
拟南芥突变体纯合植株的获得
实验概要本实验利用农杆菌转化侵染野生型拟南芥获得变体纯合植株。实验材料拟南芥(Arabidopsis thaliana, Col-0),培养条件,长日照为16h光照/8h黑暗,22oC;短日照为8h光照/16h黑暗,22oC。实验步骤1. 拟南芥基因组的小量提取 1) 取0.2 g拟南芥叶片,
上海生科院解析真核生物基因表达调控的新机制
2月29日,Nature Plants 杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心何跃辉课题组(植物环境表观遗传学实验室)题为Coupling of histone methylation and RNA processing by the nuclear mRNA Cap
重要作物染色质三维构象新特征成功解析
山东农业大学李平华课题组和香港中文大学钟思林课题组的合作研究团队,日前在重要作物大基因组染色质研究领域获得重大突破。近日,国际学术期刊《分子植物》发表了该项研究成果论文。 该团队利用最新的高通量染色体构象捕获技术,通过对玉米、番茄、高粱、水稻和小米等主要作物的染色质空间结构进行研究,成功揭示了
研究发现去甲基化酶REF6是基因组中靶向的重要因素
核小体是真核生物染色质的基本单位,由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白翻译后共价修饰是表观遗传调控的重要方式之一,通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态,在动植物细胞命运决定以及生长发育中发挥重要的调控作用。基因
研究揭示染色质修饰调控植物基因表达新机制
8月6日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室何跃辉研究组(与刘仁义研究组合作)和杜嘉木研究组(与美国威斯康辛大学钟雪花研究组合作)在《自然-遗传学》背靠背分别发表题为Polycomb-mediated gene silencin
常染色质的结构特点
常染色质的结构类似于未折叠的一串珠子中间被一根细绳穿过,这其中的珠子代表核小体结构。每个核小体由八个蛋白质单体组成,这些蛋白质叫做组蛋白,每个组蛋白单体周围有147个碱基对长度的双链DNA环绕;在常染色质中,DNA在组蛋白上的包裹是较为松散的,从而其上的原始DNA序列是暴露在外可被读取的。每一个处于
凝聚染色质的概念
中文名称凝聚染色质英文名称condensed chromatin定 义处于凝缩状态的染色质。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)
间期染色质的主要类型
间期染色质按其形态特征、活性状态和染色性能区分为两种类型:常染色质和异染色质。按功能状态的不同可将染色质分为活性染色质和非活性染色质。
间期染色质的基本介绍
在细胞不分裂的间期,存在两种类型的染色质:常染色质,由具有活性的 DNA 组成; 异染色质,主要由无活性的 DNA 组成,似乎在染色体阶段起到结构性作用。异染色质可进一步区分为两种类型: 组成型异染色质,位于着丝粒周围,通常包含重复序列,从未表达;兼性异染色质,有时表达。
关于异染色质的定义
异染色质分为结构异染色质和功能异染色质两种类型。结构异染色质是指各类细胞在整个细胞周期内处于凝集状态的染色质,多定位于着丝粒区、端粒区,含有大量高度重复顺序的脱氧核糖核酸(DNA),称为卫星DNA(satellite DNA)。功能异染色质只在一定细胞类型或在生物一定发育阶段凝集,如雌性哺乳动物
常染色质的结构介绍
常染色质的结构类似于未折叠的一串珠子中间被一根细绳穿过,这其中的珠子代表核小体结构。每个核小体由八个蛋白质单体组成,这些蛋白质叫做组蛋白,每个组蛋白单体周围有147个碱基对长度的双链DNA环绕;在常染色质中,DNA在组蛋白上的包裹是较为松散的,从而其上的原始DNA序列是暴露在外可被读取的。每一个处于
凝聚染色质的定义
中文名称凝聚染色质英文名称condensed chromatin定 义处于凝缩状态的染色质。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)
染色质免疫共沉淀(ChIP)
染色质免疫共沉淀实验方法原理在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的prore