NaturePlants文章:精准高通量检测Rloop分布的新方法

来自清华大学生科院,清华-北大生命科学联合中心的研究人员发表了题为“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章,首次报道了精准、高效、高通量检测R-loop的方法,并利用此方法首次揭示模式植物拟南芥基因组中R-loop的分布特征。 这一研究成果公布在Nature Plants杂志上,文章的通讯作者为清华大学生科院孙前文和杨雪瑞,第一作者为徐炜博士。Nature Plants杂志专门邀请加州大学戴维斯分校Frederic Chedin教授为本研究撰写评论文章,彰显此项研究在领域内的重要性。Metaplot分析显示拟南芥基因组中既存在正义R-loops(sense R-loops,由基因自身转录本与其模板链形成的R-loop),也存在反义R-loop(antisense R-loops,大多是由基因的反义转录本在正义链转录起始位点......阅读全文

Nature-Plants文章:精准高通量检测Rloop分布的新方法

  来自清华大学生科院,清华-北大生命科学联合中心的研究人员发表了题为“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章,首次报道了精准、高效、高通量检测R-loop的方法,并利用此方法首次揭示模式植物拟南芥

Rloop检测:一种更精确高效的方法

  R-loop是一种特殊的染色体结构,由一条RNA:DNA杂合链和一条单链DNA所组成。目前越来越多的证据发现这种独特的染色质结构在原核和真核生物中普遍存在,在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等。  R-loop的异常导致多种人类疾病的发

Cell-Reports-|-一种更精确高效检测Rloop的方法

  R-loop是生物体在转录过程中形成的特殊的三链核酸结构,转录过程中新合成的RNA链与模板DNA链互补配对,形成的DNA:RNA杂合双链与非模板DNA链一起被称为R-loop【1】。R-loop在生物体内普遍存在,并参与了许多生物学过程,例如转录过程、DNA复制、基因组不稳定性以及染色体重排等【

研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制

  R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高

利用ssDRIPseqRNA揭示甲基化调控Rloop形成及转录终止机制

  R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高

R环(Rloop)的结构特点

R环(R-loop),是指当某些基因转录形成mRNA分子难与模版链分离时,会形成RNA-DNA杂交体,这时非模板链与RNA-DNA杂交体共同构成r环结构。

高通量的转录因子活性检测

  转录因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表达过程中发挥着重要作用,或调节基因表达的强度,或控制目的基因的时空特异性表达,或应答外界刺激和环境胁迫。近年来,随着干细胞研究的不断升温,人们对转录因子的兴趣也日益浓厚。同一个基因组,为何最终分化成不

高通量检测的优化网络讲座

IDEX Health & Science 很高兴为您带来网络讲座有关: (时间:2010年7月1日 北京时间凌晨02:00 时长:60分钟 演讲语言:英语) 高通量检测的优化 主题:花费更少、效率更高的分析检测技术 名额有限! 该网络讲座将讨论: • 在改善和优化检测方法时

高通量检测:痕量毒品瞬间毕露

  小型化SPRi原型机   新闻背景   当前,我国已由毒品过境为主转变为过境与国内消费并存,2008年我国在册吸毒人数累计已达112.67万人。近年来,设计型毒品也在不断出现,对毒品检测鉴定提出了更高要求。然而国内对毒品及代谢物的快速分析,主要利用进口的免疫试剂盒,此方法干扰因素多,经常出现

高通量农药残留检测仪简介

高通量农药残留检测仪(прибор для обнаружения остатков пестицидов )-高通量農藥殘留檢測儀拥有24个检测通道,可以同时测试多个样品,循环检测,即放即检,每个样品由程序控制分别独立工作,不会互相干扰。农产品农药残留检测关于保证农产品安全以及顾客的健康安全具有重

高通量农药残留检测仪介绍

  农药残留现在已经造成比较严重的社会影响,不光对人的身体健康有比较大的伤害,还对农产品的出口也造成严重的影响和掣肘,因为国际社会对农药残留的检查和标准非常严格,我们有不少农产品因为农药残留超标的问题已经被阻拦,对农业生产的经济影响是很大的,所以需要对农药残留的问题重视起来,加强对农药残留的检测,保

感染病原高通量基因检测意义

高通量基因测序检查技术优点,能对临床上未知病原体筛查,避免临床上对许多疾病的未知因素检查效果,以及未知...

新技术RChIP特异性识别Rloop并绘制细胞内全基因组图谱。

  最新论文研发出了一种新技术R-ChIP,可特异性识别体内形成的R-loop,通过富集和文库的建立与测序,即可绘制细胞内R-loop的全基因组图谱。   当由转录产生的RNA与模板DNA通过碱基互补配对形成杂合链时,另外一条非模板DNA链将处于单链状态,由此形成的三链核酸结构称为R-loop。R-

北京基因组所揭示共转录m6A修饰建立机制及功能

4月2日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)任捷团队和杨运桂团队,在《分子细胞》(Molecular Cell)上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription

种子萌发率高通量检测与活力评估

种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和(发芽和出苗期间的活性水平与行为),是种子品质的重要指标,具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。种子萌发实验无疑是最为直接有效的种子活力检测方法。但一般的传统方法需要人工计数来测量

生物高通量检测分析服务网络

  近日,由中国科学院科技服务网络计划(STS计划)项目支持,中科院青岛生物能源与过程研究所、北京生命科学研究院、天津工业生物技术研究所、微生物研究所共同承担的“生物高通量检测分析服务网络”项目结题验收。   经过5年的实施,该项目研制出了单细胞拉曼分选仪工程化样机(RACS-Mini),开发了单

如何用FFPE组织样品进行高通量检测?

福尔马林固定石蜡包埋的方法处理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded,FFPE)的样品代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料,如何从这些样品中挖掘出有效的信息呢?上海伯豪生物技术有限公司针对FFPE样品的高通量分析,建立了整套的SOP 标准解决方案,帮助广

SpectraScan高通量作物果实品质检测方案

我国幅员辽阔,自然环境的巨大差异造就了丰富的生物多样性,不同地域生长的经济作物品种繁多,果实五花八门,品质良莠不齐。而果实品质的好坏直接影响膳食营养及食品安全,与人类健康密切相关,也是衡量作物经济效益的重要因素。因此,作物果实品质的快速、批量分析评价对于衡量作物经济效益,规避经济损失、优化栽培品种及

高通量筛选的FLIPR荧光检测法介绍

  近年来,光学测定技术在美、英两国研究人员在高通量筛选检测中,努力进行了光学测定方法的研究,建立了大量的非同位素标记测定法,如用分光光度检测法筛选蛋白酪氨酸激酶抑制剂、组织纤溶酶原激活剂等,均获得成功。  放射性检测技术美国学者GanieSM在高通量药物筛选研究中,应用放射性测定法,特别是亲和闪烁

如何用FFPE组织样品进行高通量检测?

  福尔马林固定石蜡包埋的方法处理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded,FFPE)的样品代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料,如何从这些样品中挖掘出有效的信息呢?上海伯豪生物技术有限公司针对FFPE样品的高通量分析,建立了整套的SOP 标准解决方案,帮助广大科

高通量基因分型检测平台及其应用案例

Agripheno™高通量基因分型检测平台包括高通量Oktopure DNA提取仪、Nexar®模块化内联液体处理与分析系统、Soellex®高通量PCR水浴热循环系统和Araya®内联荧光检测系统。Oktopure DNA提取仪采用磁珠的方法提取DNA,通量达到800个样本/3小时。同时,适用于多

关于高通量筛选的AlphaScreen检测法分析介绍

  高通量筛选的AlphaScreen assay应用广泛且拥有众多优点,更优化药物筛检试验的效果。其操作硬体之限制,导致这实验方法虽然已研发数年,大多数研究人员并未知晓或广泛应用它。  化学生物学研究项目的研究重点是在我们的平台上执行的筛选与蛋白质相互作用的高通量检测。为了这个目的,我们采用Alp

我所发展人乳寡糖高通量定量检测方法

 近日,我所病毒侵染机制研究组(2806组)闫竞宇副研究员团队与中国疾病预防控制中心营养所赖建强研究员团队合作,在人乳寡糖高通量绝对定量方法研究方面取得新进展。   母乳作为新生儿唯一的天然营养来源,在为婴幼儿提供必需营养物质的同时,也在完善其免疫系统、促进生长发育等方面发挥重要作用。人乳寡糖是一类

全球首个饲料中霉菌毒素高通量检测标准发布

  近日,由中国农业科学院农业质量标准与检测技术研究所饲料质量安全检测与评价创新团队首席苏晓鸥研究员主持制定的农业行业标准《饲料中37种霉菌毒素的测定液相色谱串联质谱法》发布,并将于2021年4月1日起实施。该标准检测方法成功研发,扩大了我国饲料及畜产品中霉菌毒素监测范围,提升了发现风险的能力。

高通量细胞筛选库模拟病人检测抗癌药物

  记者从中科院了解到,近期中科院强磁场科学中心已建成目前世界上规模最大的基于癌症激酶靶点的高通量细胞筛选库,填补了国内新药创制领域此类检测体系的空白,将为抗肿瘤新药研发提供有力支撑。  中科院强磁场科学中心刘青松药物学团队以小鼠细胞为原始模板,采用基因工程的手段,针对目前临床常见的癌症相关激酶靶点

Nature-Methods发布高通量细胞脂质检测新工具

  脂类,是一种复杂的物质,除了主要成分脂肪酸还包括许多其他成分。在生命体中,脂质构成细胞壁,储存能量,在必要时释放能量,并在细胞信号转导中起重要作用。有关脂类的很多知识都还没有答案,用质谱测绘大量样本的高通量脂质分子结构检测方法研究还处于初级探索阶段。  越来越多证据表明,脂质成分变化在癌症、脂肪

高通量疫苗、兽药研发及兽药残留检测公共平台

  前言:本文摘选自《××农业大学高通量疫苗、兽药研发及农药残留检测公共平台的认证报告》,分为上下两篇。该系列分为高通量疫苗研发技术简介,兽药研发及农药残留检测技术简介,高通量疫苗及、兽药研发及农药残留检测公共平台共三期,希望对广大动物科学研究者有所帮助。  【平台简介】  高通量疫苗、兽药研发及兽

钟声教授团队开发高通量蛋白互作检测技术

  通过深入了解基因组产物形成的相互作用网络,人类基因组注释功能得以飞速发展。随着技术的进步,我们已经实现了DNA-DNA、蛋白质 -DNA、RNA-DNA和RNA-RNA相互作用的全基因组映射图谱。但完成人类蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的全基因组映射图谱仍然是一项艰巨任务。  目前,大规模PP

高通量测序

  高通量测序技术又称“下一代”测序技术,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序包括:大规模平行签名测序、聚合酶克隆、454焦磷酸测序、离子半导体测序和DNA 纳米球测序等技术。  高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DN

Waters推出高通量快速筛查检测系统解决方案

  目前对于目标化合物的定量检测,国内外的食品法规均是采用三重四极串联质谱。三重四极串联质谱不仅具有多样性的功能和先进的定量分析能力,而且在灵敏度和选择性方面也非常出色,但是它只能检测设定的目标化合物,对非目标化合物的检测和未知物的定性分析则不能完全胜任,并且无法对样品进行筛查检测存档。此外,随着法