YAC克隆的分析实验——制备YACDNA进行Southern印迹分析

实验材料酵母菌试剂、试剂盒AHCSCESCEMTris·ClEDTATE乙酸甲RNase A异丙醇NaCl仪器、耗材培养箱离心管转子实验步骤1. 接种一个红色的含YAC克隆的酵母菌落于盛有20 ml AHC培养基的250 ml 三角烧瓶中,在旋转摇床上30℃ 250 r/min 振荡培养24 h。 2. 扩大培养:取1ml 由步骤1获得的粉红色菌悬液接种于盛有100 ml AHC培养基的 1 000 ml三角烧瓶中,于30℃ 250 r/min摇床培养24 h。3. 将菌悬液移入2个50 ml 的锥形离心管中,于2 000 g 离心5 min,弃上清,共用5 ml SCE缓冲液重悬菌体,并合并到一个试管中。4. 加1 ml SCEM缓冲液,在旋转摇床中37℃ 100 r/min 轻摇晃混匀。5. 于4℃ 2 000 g 离心弃上清,菌体用5 ml Tris/E......阅读全文

YAC克隆的分析实验——制备YAC-DNA进行Southern印迹分析

实验材料酵母菌试剂、试剂盒AHCSCESCEMTris·ClEDTATE乙酸甲RNase A异丙醇NaCl仪器、耗材培养箱离心管转子实验步骤1.  接种一个红色的含YAC克隆的酵母菌落于盛有20 ml AHC培养基的250 ml 三角烧瓶中,在旋转摇床上30℃ 250 r/min 振荡培养24 h。

YAC实验——YAC文库筛选

实验步骤1.  YAC中心实验室用于筛选文库的方法进展很快。2.  将一块或多块微量滴定板微孔中的YAC克隆转印到尼龙膜上,用单拷贝探针进行杂交,就可以筛选YAC文库了。3.  然而,由 于杂交实验的信噪比较低以及制备所有的转印尼龙膜所需的花费巨大,绝大多数实验室已采用PCR方法来筛选文库。4.  

YAC实验——YAC文库构建

YAC带有天然染色体所有的功能元件,包括一个着丝粒,一个DNA复制起点,两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA,这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色体步移中每次允许更大的步移距离,同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。实验步骤1.  尽管当插入片段大于10

YAC实验

1.  尽管当插入片段大于100 kb 时,YAC克隆是可供选择的基因组DNA大片段克隆方法之一,但该系统的一些特性使之很难被迅速采纳为常规克隆手段。2.  在复杂的酿酒酵母菌的基因组中,通常所用的YAC只是一个单拷贝。3.  因此在YAC文库中鉴定一个克隆,其信噪比较之在λ噬菌体载体或粘粒载体文库

YAC实验

YAC文库构建 YAC文库筛选             实验步骤 1.  尽管当插入片段大于100 kb 时,YAC克隆是

Easy-YAC-Preparation-Method

YAC TRANSFORMATION OF C. ELEGANS USING TOTAL YEAST GENOMIC DNA[This method is described in The Worm Breeder's Gazette (1997) A. Davies and J. Shaw

YAC克隆的分析实验

基本方案 制备YAC DNA进行Southern印迹分析             实验材料 酵母菌

YAC克隆的分析实验

实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 AHCYPD甘油仪器、耗材 培养箱冷冻管实验步骤 1.  用接种棒将含重组载体pYAC的AB1380菌株划线接种在AHC平板上,倒扣平板于30℃培养,直至长出1~3 mm 大小的红色菌落为止。2.  短期保存:用Parafilm膜将平板周围封起来,于4℃可保存4~6周。

YAC克隆的分析实验——基本方案

YAC带有天然染色体所有的功能元件,包括一个着丝粒,一个DNA复制起点,两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA,这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色体步移中每次允许更大的步移距离,同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。实验材料酵母菌试剂、试剂盒AHCYPD

酵母人工染色体的结构组成和对应的作用

在 YAC载体中最常用的是 pYAC4 。由于酵母的染色体是线状的,因此其在工作状态也是线状的。但是,为了方便制备YAC载体, YAC 载体以环状的方式存在,并增加了普通大肠杆菌质粒载体的复制元件和选择标记,以便保存和增殖。复制元件YAC 载体的复制元件是其核心组成成分,其在酵母中复制的必需元件包括

酵母人工染色体标记基因的介绍

  在 YAC载体中最常用的是 pYAC4 。由于酵母的染色体是线状的,因此其在工作状态也是线状的。但是,为了方便制备YAC载体, YAC 载体以环状的方式存在,并增加了普通大肠杆菌质粒载体的复制元件和选择标记,以便保存和增殖。  1、复制元件  YAC 载体的复制元件是其核心组成成分,其在酵母中复

用杂交的方法筛选大片段插入的文库实验

由于原代的转化子只能产生数目有限的滤膜,因而随机铺板不适合滤膜的制备以及 YAC、BAC 和 PAC 文库的保存,而且由于克隆增殖率存在差别,因而无论是哪一种扩增形式都会将偏差带人文库中去。因此,原代的转化子应加入微孔板中,放置于-8℃ 保存。这使得制造分配用的文库拷贝变得简单易行,而且使组

用杂交的方法筛选大片段插入的文库实验

实验步骤由于原代的转化子只能产生数目有限的滤膜,因而随机铺板不适合滤膜的制备以及 YAC、BAC 和 PAC 文库的保存,而且由于克隆增殖率存在差别,因而无论是哪一种扩增形式都会将偏差带人文库中去。因此,原代的转化子应加入微孔板中,放置于-8℃ 保存。这使得制造分配用的文库拷贝变得简单易行,而且使组

酵母人工染色体

·         Easy YAC Preparation Method (Andrew Davies,Shaw lab)·         Screening YAC libraries (Donis Keller Lab)This is a method for screening YAC l

荧光原位杂交及其在人类基因组研究中的应用(三)

3.FISH在人类基因组研究中的应用   FISH作为确定基因片段在染色体上位置最直接的方法,在人类基因组研究中的应用日益广泛深入。所研究的基因片段通常克隆在质粒,phage,cosmid核YAC中,可以用FISH技术知道其在分带染色体上的位置,也可以以次手段进行某种遗传病的诊断。3. 1 SCP(

简述酵母人工染色体的工作原理

  YAC 载体主要是用来构建大片段 DNA 文库,特别用来构建高等真核生物的基因组文库,并不用作常规的基因克隆。图3-26是 pYAC4 的遗传结构图,当用BamHⅠ切割成线状后,就形成了一个微型酵母染色体,包含染色体复制的必要顺式元件,如自主复制序列、着丝粒和位于两端的端粒。这些元件在酵母菌中可

酵母人工染色体的工作原理

YAC 载体主要是用来构建大片段 DNA 文库,特别用来构建高等真核生物的基因组文库,并不用作常规的基因克隆。图3-26是 pYAC4 的遗传结构图,当用BamHⅠ切割成线状后,就形成了一个微型酵母染色体,包含染色体复制的必要顺式元件,如自主复制序列、着丝粒和位于两端的端粒。这些元件在酵母菌中可以驱

酵母人工染色体的工作原理

YAC 载体主要是用来构建大片段 DNA 文库,特别用来构建高等真核生物的基因组文库,并不用作常规的基因克隆。当用BamHⅠ切割成线状后,就形成了一个微型酵母染色体,包含染色体复制的必要顺式元件,如自主复制序列、着丝粒和位于两端的端粒。这些元件在酵母菌中可以驱动染色体的复制和分配,从而决定这个微型染

酿酒酵母的生长及其DNA的制备

用这一方法制备的 DNA 适用于琼脂糖凝胶电泳、Southern 印迹、亚克隆、基因组文库构建、PCR 或其他不需要完整的高分子质量 DNA 的方法。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理用这一方法制备的 DNA 适用于琼脂糖凝胶电泳、Southern 印迹、亚克隆、基因组文库

反向PCR的原理

反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,因此又可称为染色体缓移或染色体步移。这时选择的引物虽然与核心DNA区两末端序列互补,但两引物3’端是相互反向的。扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA,然后用DNA连接酶连接成一个环状DNA分子,通过反向PCR扩增引物的上游片段和下游片段;现

反向PCR的原理

反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,因此又可称为染色体缓移或染色体步移。这时选择的引物虽然与核心DNA区两末端序列互补,但两引物3’端是相互反向的。扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA,然后用DNA连接酶连接成一个环状DNA分子,通过反向PCR扩增引物的上游片段和下游片段;现

反向PCR的原理

反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,因此又可称为染色体缓移或染色体步移。这时选择的引物虽然与核心DNA区两末端序列互补,但两引物3’端是相互反向的。扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA,然后用DNA连接酶连接成一个环状DNA分子,通过反向PCR扩增引物的上游片段和下游片段;现

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体3

在作为载体时,这些噬菌体有一个很大的优点,即克隆到M13mp载体的外源DNA片段(双链),在子代噬菌体便成为了单链形式。故应用M13mp进行克隆,可方便地分离到大量含有外源DNA某一单链的DNA分子。这种单链DNA可在下列工作中作模板:①主要用作双脱氧链终止法进行DNA序列测定的模板;②制备仅有一条

反向pcr的原理

反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,因此又可称为染色体缓移或染色体步移。这时选择的引物虽然与核心DNA区两末端序列互补,但两引物3’端是相互反向的。扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA,然后用DNA连接酶连接成一个环状DNA分子,通过反向PCR扩增引物的上游片段和下游片段;现

反向聚合酶链反应技术

 我们描述一种大聚合酶链反应(PCR)应用的方法,使在已知序列的核心区边侧的未知 DNA成几何级数扩增。用适当的限制性内切裂解含核心区的DNA,以产生适合于PCR扩 增大小的片段,然后片段的末端再连接形成环状分子。PCR的引物同源于环上核心区 的末端序列,但其方向性,使链的延长经过环上的未知区而不是

PCR技术(十四):反向PCR

描述一种大聚合酶链反应(PCR)应用的方法,使在已知序列的核心区边侧的未知 DNA成几何级数扩增。用适当的限制性内切裂解含核心区的DNA,以产生适合于PCR扩 增大小的片段,然后片段的末端再连接形成环状分子。PCR的引物同源于环上核心区 的末端序列,但其方向性,使链的延长经过环上的未知区而不是分开引

物理图的实验技术介绍

凝胶电泳这是分离高分子量DNA的一种电泳技术,使DNA分子处在两个相互垂直、交替更换的电场中移动,把分子量不同的DNA片段分开,可分辨50kb至200kb的DNA分子。YAC克隆YAC是由质粒pBR322、酵母的着丝粒、四膜虫rDNA的端粒、酵母的自主复制序列(ARS)以及一些选择标记基因构成。呈环

NK细胞活性测定:同位素法原理和实验步骤

一、原理 将用同位素3H-TdR标记的靶细胞与淋巴细胞共同培养时,靶细胞可被NK细胞杀伤。同位素便从被杀伤的靶细胞中释放出来,其释放的量与NK细胞活性成正比。通过测定靶细胞3H-TdR的释放率即可反应NK细胞的活性。 二、仪器和材料 液体闪烁仪、多头细胞取集器、二氧化碳培养箱、3H-TdR、RPMI

酿酒酵母的生长及其DNA的制备

            实验方法原理 用这一方法制备的 DNA 适用于琼脂糖凝胶电泳、Southern 印迹、亚克隆、基因组文库构建、PCR 或其他不需要完整的高分子质量 DNA 的方法。 实验材料

酿酒酵母的生长及其DNA的制备

 实验方法原理 用这一方法制备的 DNA 适用于琼脂糖凝胶电泳、Southern 印迹、亚克隆、基因组文库构建、PCR 或其他不需要完整的高分子质量 DNA 的方法。实验材料 YAC 克隆的酵母菌落试剂、试剂盒 醋酸铵乙醇酚氯仿TETriton SDS 溶液仪器、耗材 YPD 培养基Sorvall