多重序列比对及系统发生树的构建实验

实验方法原理在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。实验步骤一、用CLUSTALX软件对已知DNA序列做多序列比对。操作步骤:1. 以FASTA格式准备8个DNA序列test.seq(或txt)文件。2. 双击进入CLUSTALX程序,点FILE进入LOAD SEQUENCE,打开test.seq(或txt)文件。3. 点ALIGNMENT,在默认alignment parameters下,点击Do complete Alignment 。在新出现的窗口中点击ALIGN进行比对,这时输出两个文件(默认输出文件格式为Clustal格式):比对文件test.aln和向导树文件test.dnd。4. 点FILE进入Save sequence ......阅读全文

多重耐药菌的定义

问题一:什么叫多重耐药菌,怎样定义? 多重耐药菌是指有多重耐药性的病原菌。可以翻译成多药耐药性、多重耐药性、其定义为一种微生物对三类(比如氨基糖苷类、红霉素、B-内酰胺类)或三类以上抗生素同时耐药,而不是同一类三种。P-resisitence成为泛耐菌株,对几乎所有类抗菌素耐药。比如泛耐不动杆菌,对

什么是多重耐药菌

常见的多重耐药菌如肠杆菌科中的肺炎杆菌、大肠杆菌、阴沟杆菌、粘质沙雷菌、枸橼酸菌属、志贺菌属、沙门菌属等,以及绿脓杆菌、不动杆菌属、流感杆菌等。革兰阳性菌中有甲氧西林耐药葡萄球菌(MRS),尤以MRSA和MRSE为多;万古霉素耐药肠球菌(VRE),在重症监护室(ICU)中的发病率有明显增高;青霉素耐

攻克多重PCR之难(下篇)

  多重PCR能够在提高通量的同时节省样品降低成本,它需要耗费更多的时间和精力,同时也会给用户回报更丰富的数据。本文介绍了一些实验技巧和商业化工具,希望能帮您轻松获得好结果。   原则三、四、五:优化dNTP、MgCl2、聚合酶和盐的浓度   现在剩下的就是调整反应条件了。要一次进行这么多种反应

多重PCR法检测STEC

产志贺毒素大肠杆菌(STEC)具有很强的致病性,全球范围内由其引发的食物中毒和其他公共卫生事件呈逐年升高之势,严重威胁人类的健康。开发快速可靠的检测手段对其引发的食源性疾病的监测、控制和预防意义重大。本文结合对STEC分子生物学特征的研究,着重介绍了多重PCR检测技术在检测食品中STEC方面的

超纯水有多重要?

先进、的实验室分析方法搭配高精尖的科学仪器得出的实验结果必然是越来越。其实,要得到高质量的检测数据,实验用试剂起着决定性意义。比如超纯水就是起决定性作用的实验材料。近几年来,实验室分析技术有了很大的改进。与此同时,检测仪器设备也越来越精密、灵敏,这就要求所使用的试剂、稀释剂和水要达到很高的质量标准。

DNA微序列技术

·         Protocols for Making Drosophila Arrays (Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing, 

DNA-序列分析技术

试剂、试剂盒 琼脂糖TE 水饱和酚无水乙醇70%乙醇TEMED测序酶溴化乙锭仪器、耗材 电泳仪离心管离心机冰浴箱恒温板DNA 测序仪

序列排比额概念

中文名称序列排比英文名称sequence alignment定  义核酸或蛋白质序列的比较分析法。将序列之间的相同和不同部分排列出来,由此显示序列间的相关性或同源性程度。常借助计算机软件进行分析。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

同位序列的概念

同位序列(Homeobox)或称同源异型盒,是某些影响动物、真菌及植物发育的基因所拥有的一段DNA序列,拥有homeobox的基因称作homeobox基因,统称homeobox基因家族。同源异形盒模体在进化中广泛存在。其重要意义是通过同源异形盒探针与很多真核的基因组进行杂交而获得。在蛙,小鼠和人的D

核心序列的概念

中文名称核心序列英文名称core sequence定  义重复序列共有的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

转化序列的概念

中文名称转化序列英文名称transforming sequence定  义起变化作用的基因或序列。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)

DNA-序列分析技术

DNA序列分析技术可用于:(1)分析物种的遗传多样性;(2)鉴定新的物种;(3)用于比较基因组学。实验方法原理本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe

信号序列的概念

信号序列是引导蛋白质定向转移的线性序列,通常有16-26个氨基酸残基,对所引导的蛋白质没有特异性要求。

RGD序列的定义

RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成,存在于多种细胞外基质中,可与11种整合素特异性结合,能有效地促进细胞对生物材料的粘附。

DNA序列测定技术

DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略  目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的

RGD序列的用途

该序列肽能够竞争性抑制包括纤维蛋白在内的各种粘附蛋白与血小板的结合,可达抑制血小板与纤维蛋白结合的目的,有较好的临床研究价值。

互补序列的定义

中文名称互补序列英文名称complementary sequence定  义在双链核酸中,一条多核苷酸链可与另一条多核苷酸链互补的那部分序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

转化序列的概念

中文名称转化序列英文名称transforming sequence定  义起变化作用的基因或序列。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)

DNA-序列分析技术

            实验方法原理 本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator

核酸序列分析实验

实验方法原理针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和功能位点的位置,以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中,确认一段 DNA 序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言,在重复片段频繁出现的区域里,基因编码区和调控区不太可能出现;如果某段 DNA 片段的假想产物与某个已知的蛋

什么是回文序列?

遗传学上讲的回文序列指的是双链DNA或RNA分子中的特定的核苷酸片段,该片段在其中一条链上按5'到3'读取的序列与其互补链上按相同的5'到3'读取的序列一致。回文序列的单链DNA或RNA,存在对称中心,对称中心两侧碱基关于该对称中心对称,可形成互补。故回文序列能够形成

AluI序列的定义

人基因组约有50万~70万份拷贝,AluI序列长282个核苷酸,由两个同源但略有差别的亚基组成。

SD序列的作用

SD序列的作用是与16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合,小亚基16S rRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白质合成的起始密码子。

DNA序列测定技术

DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干

烟尘采样器多重功能

烟气烟尘采样器是一种轻便,主机体积较小型的预测流速法仪器,它根据等速采样重量法采集烟道中的颗粒物,定位电解法测定烟道中的有害气体,干湿球法测定烟道中的含湿量。烟气烟尘采样器结构简单、操作维护方便、价格较低,可广泛应用于环境监测、劳动保护、工业卫生、厂矿企业等部门进行管道污染源中的颗粒物采样和有害气体

显著检验与多重检验校正

  说到显著检验,还可以从东西方文化的差异谈起。东方文明,讲究的是直觉,所以才会有道家的“道”,禅宗的“不立文字,直指人心”。总之,高深的知识只可意会,不可言传。而西方文化,先天讲究逻辑性。两千多年前,苏格拉底式的提问,就是从反复地对话推敲中,找到观念中的逻辑矛盾,从而认识真理。前者凭直觉从正面体验

什么是多重PCR核酸检测

 一般的PCR反应仅应用一对引物,通过PCR扩增对单个基因序列进行复制,主要用于单一靶标的检测。多重PCR (Multiplex PCR),是在同一PCR反应体系里加上两对或以上的引物,同时进行多个基因的扩增检测。    多重PCR反应最常见的类型是双重反应。在一定情况下,为了能够同时检测多个靶标基

多重PCR的定义和特点

1.概述:多重PCR(multiplex PCR),又称多重引物PCR或复合 ,它是在同一 反应体系里加上二对以上引物,同时扩增出多个核酸片段的 反应,其反应原理,反应试剂和操作过程与一般 相同。2.特点:①高效性,在同一PCR反应管内同时检出多种病原微生物,或对有多个型别的目的基因进行分型,特别是

质谱仪到底有多重要?

质谱仪是一类将物质粒子(原子、分子)电离成离子,通过适当电场或磁场将它们分离,并检测其强度从而进行定性、定量分析的仪器。由于质谱仪具有直接测量的本质特征,以及高分辨、高灵敏、大通量和高准确度的特性,在生命科学、材料科学、食品安全、环境监测、医疗卫生等领域具有不可替代的作用和举足轻重的地位。特别是在物

多重耐药菌基础知识

1.多重耐药菌是如何定义的?答:多重耐药菌( Multiple Drug Resistant Organism,MDRO)是指对三类或三类以上结构不同(作用机制不同)抗菌药物同时耐药(每类中一种或一种以上)的细菌。2.广泛耐药菌是如何定义的?答:广泛耐药菌( Extensive Drug Resis