消减cDNA或基因组DNA文库的制备实验

一次双向消减,需要总量为 2ug 的基因组 DNA 或 cDNA。大多数分离 RNA 和基因组DNA 的方法都适用于本实验(Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒缓冲液、溶液和试剂酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸放射性化合物酚仪器、耗材热循环仪水浴箱琼脂糖凝胶电泳所需的试剂与设备实验步骤第1阶段:RNA和DNA的分离一次双向消减,需要总量为2ug的基因组DNA或cDNA。大多数分离RNA和基因组DNA的方法都适用于本实验(Sambrooketal.1989;Chomczynskiand Sacchi 1987;Farrell1993)。如果可能,尽可能使用同样的试剂和方案纯化待比较的样品。如果是基因组DNA作为初始材料,下一步为RsaⅠ 消化(本方案的第3阶段);如果是RNA作为初始材料,......阅读全文

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸放射性化合物酚仪器、耗材 热循环仪水浴箱琼脂糖凝胶电泳所需的试剂与设备实验步骤 第1阶段:RNA和DNA的分离一次双向消减,需要总量为2ug的基因组DNA或cDNA。大多数分离RNA和基因组DNA的方法都适用于本实验(Sambrooketal

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

一次双向消减,需要总量为 2ug 的基因组 DNA 或 cDNA。大多数分离 RNA 和基因组DNA 的方法都适用于本实验(Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

            试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 放射性化合物 酚 仪器、耗材

用大片段基因组-DNA-克隆直接筛选-cDNA实验

本方案使用克隆在 BAC 载体上的一段 500kb 的人基因组 DNA 连续序列,直接筛选与其互补的的 cDNA。但本方法也可适用于任意大小的基因组靶 DNA。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒扩增缓冲液DNA 聚合酶 DNaseI限制性内切核酸酶ATP链霉亲和素

用大片段基因组-DNA-克隆直接筛选-cDNA实验

            试剂、试剂盒 扩增缓冲液 DNA 聚合酶 DNaseI 限制性内切核酸酶 ATP 链霉亲和素-磁珠结合缓冲液 T4DNA 连接酶

用大片段基因组-DNA-克隆直接筛选-cDNA实验

试剂、试剂盒 扩增缓冲液DNA 聚合酶 DNaseI限制性内切核酸酶ATP链霉亲和素-磁珠结合缓冲液T4DNA 连接酶热稳定 DNA 聚合酶琼脂糖凝胶BACDNA缺口平移缓冲液杂交液平末端 cDNACot1 基因组 DNA胞浆 poly(A)+RNAdNTP 溶液DNA 分子质量标志物寡

用检测和驱动-DNA-探针进行差异杂交实验

下面 4 个探针用于差异筛选杂交。1. 检测者特异性消减探针(正向消减探针)。2. 驱动者特异性消减探针(反向消减探针)。3. 从检测者 mRNA(或检測者基因组 DNA) 直接合成的 cDNA 探针。4. 从驱动者 mRNA(或驱动者基因组 DNA) 直接合成的 cDNA 探针。本实验来源于 PC

基因工程操作技术及原理之基因克隆

1.克隆已知序列的基因根据已知基因的序列设计引物(primer),利用PCR方法克隆基因。即使不同种属之间,基因编码区序列的同源性高于非编码区的序列。在某种植物的同源基因被克隆的条件下,可先构建eDNA文库或基因组文库,然后以该基因(或部分序列)为探针来筛选目的基因的克隆。2.功能克隆根据基因的产物

基因工程操作技术及原理之基因克隆

1.克隆已知序列的基因 根据已知基因的序列设计引物(primer),利用PCR方法克隆基因。即使不同种属之间,基因编码区序列的同源性高于非编码区的序列。在某种植物的同源基因被克隆的条件下,可先构建eDNA文库或基因组文库,然后以该基因(或部分序列)为探针来筛选目的基因的克隆。 2.功能克隆 根据基

基因组是生命“蓝图”?优质DNA或需“后天培养”!

  近日,研究人员发现婴幼儿成长的早期环境可能会成为引发其成年期炎症,进而引起包括心血管疾病,糖尿病,自身免疫性疾病和痴呆在内的大多数老年疾病。  除此之外,这项研究也从另一个从前未被人们所重视的角度揭示了人类炎症形成的内在机制。  将环境暴露与炎症生物标志物联系起来为我们开启了一扇崭新的科学大门,

从鼠尾或其他小样本中制备基因组DNA

这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取 DNA。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取

从鼠尾或其他小样本中制备基因组DNA

实验方法原理 这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取 DNA。实验材料 蛋白酶 K培养的细胞鼠尾或小鼠组织试剂、试剂盒 乙醇异丙醇酚氯仿异戊醇磷酸盐缓冲溶液SNETTE仪器、耗材 Sorvall 离心机及 H1000B、SH

从鼠尾或其他小样本中制备基因组DNA

            实验方法原理 这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取 DNA。 实验材料 蛋白

消减探针的原理和应用

中文名称消减探针英文名称subtracted probe定  义经过消减杂交所构建的互补DNA探针。即将一种细胞或组织的全部信使核糖核酸(mRNA)逆转录合成单链cDNA,再与第二种细胞(不同类型或不同状态下的细胞)过量的mRNA或cDNA杂交,留下第一种细胞cDNA未被杂交的部分,制备成标记探针,

消减杂交的方法和应用介绍

中文名称消减杂交英文名称subtracting hybridization定  义利用不同组织、细胞或不同状态下组织、细胞基因表达的差异性,并结合核酸杂交建立的克隆差异表达基因的技术。一般是将一种细胞的互补DNA(cDNA)或信使核糖核酸(mRNA)与第二种细胞cDNA或mRNA相互杂交,其不被杂交

消减杂交的定义

利用不同组织、细胞或不同状态下组织、细胞基因表达的差异性,并结合核酸杂交建立的克隆差异表达基因的技术。一般是将一种细胞的互补DNA(cDNA)或信使核糖核酸(mRNA)与第二种细胞cDNA或mRNA相互杂交,其不被杂交的部分就代表了两种细胞基因表达的差异,可用于差异表达基因的克隆。差示筛选、消减探针

基因表达轮廓(gene-expressed-profile)技术1

基因表达谱或基因表达轮廓(gene expressed profile)技术就是利用mRNA提取、cDNA合成、酶切、连接、PCR及分子杂交等分子生物学基础操作技术,将某一生物材料在某一特定阶段表达的基因全部展示出来,通过测序及与数据库比较或通过目标和对照样品中所表达基因的比较,可以找出特异表达

阻抑消减杂交的方法和应用介绍

中文名称阻抑消减杂交英文名称suppressive subtraction hybridization;SSH定  义将阻抑性聚合酶链反应与消减杂交相结合的实验方法,能有效地扩增低丰度的差异基因表达序列。一般是将目标互补DNA(cDNA)5′端分别加上两种人工接头,用过量的驱动DNA进行两次杂交,得

消减杂交实验

试剂、试剂盒 稀释缓冲液杂交缓冲储存液基三乙基溴化铵矿物油核酸和寡核苷酸仪器、耗材 热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂稀释缓冲液(20 mmol/L HEPES>HCl、pH8.3,50 mmol/LNaCl,0.2 mmol/L EDTA)4X 杂交缓冲储存液:4mol/L NaC

消减杂交实验

试剂、试剂盒稀释缓冲液杂交缓冲储存液基三乙基溴化铵矿物油核酸和寡核苷酸仪器、耗材热循环仪实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂稀释缓冲液(20 mmol/L HEPES>HCl、pH8.3,50 mmol/LNaCl,0.2 mmol/L EDTA)4X 杂交缓冲储存液:4mol/L NaCl,2

消减杂交实验

消减杂交实验             试剂、试剂盒 稀释缓冲液 杂交缓冲储存液 基三乙基溴化铵 矿

简化抑制消减杂交(SSH)法寻找差异表达基因

  无论是从一个胚胎细胞分化为不同的组织器官,或者是从正常的组织突变为肿瘤组织,都可能涉及在同一基因组背景下不同基因的差异性表达。寻找差异表达的基因就有可能揭示细胞分化的机制或者肿瘤的成因,因而也就成为一项热门的技术。    寻找差异表达的基因有不少方法,抑制消减杂交(SSH)是比较有效的一种方法。

寻找差异表达基因方法——简化SSH法

 无论是从一个胚胎细胞分化为不同的组织器官,或者是从正常的组织突变为肿瘤组织,都可能涉及在同一基因组背景下不同基因的差异性表达。寻找差异表达的基因就有可能揭示细胞分化的机制或者肿瘤的成因,因而也就成为一项热门的技术。    寻找差异表达的基因有不少方法,抑制消减杂交(SSH)是比较有效的一种方法

DNA提取方法洗涤-DNA(或-RNA)

当裂解物通过硅胶膜进行离心分离,现在所提取的 DNA 或 RNA 应该与柱子结合,杂质、细胞蛋白和多糖应该已经通过了。 但是,膜仍然被残留的细胞蛋白质和盐弄脏。如果样品来自植物,仍然会有多糖,也许一些色素留在膜上,或者如果样品是血液,膜可能会被染成棕色或黄色。洗涤步骤用于去除这些杂质。通常有两次洗涤

基因组文库和cDNA文库的构建及筛选

刘芝华 中国医学科学院肿瘤研究所  分子肿瘤学国家重点实验室 概念: 基因组文库是含有某种生物体全部基因的随机片段的重组DNA克隆群体;cDNA文库是指含有所有重组cDNA的克隆群体。   基因组文库:来源于基因组DNA,反映基因组的全部信息,用于基因组物理图谱的构建,基因组序列分析,基因在染色体上

用Nanodrop测量cDNA-,是选择DNA浓度测量吗

如果你的测量仪器上有cDNA选项最好,没有的话就选DNA,OD值和cDNA浓度是有转换公式的,你可以根据测量的OD值自己算。做PCR的话影响因素很多,你可以做个模版浓度梯度,试试多大浓度扩增效果最好。

消减杂交的概念和意义

消减杂交(subtractive hybridization,扣除杂交) 是指利用不同组织、细胞或不同状态下组织、细胞基因表达的差异性,并结合核酸杂交建立的克隆差异表达基因的技术。是差别杂交的改进,用过量的参照细胞的mRNA 或CDNA 与目的细胞的CDNA 或mRNA (目的序列) 杂交,形成的R

基因组DNA的提取

第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,

基因组DNA的提取

基因组DNA的提取概 述   基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分

基因组DNA的定义

中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定  义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)