未解析碎片离子的检索实验——方案优化

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤除了人工解析碎片离子谱外,还有两种基本检索手段用于匹配数据库中序列产生的碎片离子谱。第一种方法依靠人工解析部分谱图来鉴别某一特定系列 (b 或v) 离子的连续离子元素(例如鉴别出相互之间相差一个氨基酸残基质量的碎片离子),解析出部分序列信息,再结合以下参数:①鉴定出的系列中第一个离子的质量数;②肽段质量与最后一个离子质量之差(这两个质量数限制了此序列两端未知残基的总质量),③此完整肽段的质量,④所用蛋白水解酶的酶切持性(在 N 端 'C 端都切还是只切一端)。这五种信息组成了肽序列标签 "PST" (peptide sequence tag, PST) 。在序列数据库中可以检索出符合 PST 各元素内容的肽序列。第二种类型的碎片离子检索程序是真正的用未解析的碎片离子信息检索的程序,称为 SEQUEST。其检索手段首先是在数据库中的每个序列中寻找与实验测量肽离子质......阅读全文

海藻酸裂解酶的发酵条件优化方案

海藻酸是一种由a.L一古洛糖醛酸(G)以及其C5差向异构体p.D.甘露糖醛酸(M)组成的共多聚体。海藻酸用途广泛,在食品,饮料,造纸和印刷,生物材料及制药工业中,是不可缺少的稳定剂,胶粘剂和胶体添加剂。海藻酸酶L21,亦称为海藻酸裂解酶,依据其对富M或富G的海藻酸的不同剪切作用分EC4.2.3,聚(

实时定量PCR应用中的优化方案(二)

实践中的问题实时定量PCR已广泛地运用于分子生物学的各个领域,就目前的应用情况来看,虽然取得了很好的效果,但是其在方法学上的选择、敏感性问题、重复性问题等都一直是争论不休的,本文将就这些问题做出探讨。1. 方法的选择:研究者在实验中往往想要得到目的基因的绝对量,因为绝对定量对目的基因的表达差异有直接

体外诊断试剂超级ELISA优化方案

3 竞争抑制ELISA方法的建立3.1 抗体的酶标记及质量鉴定本试验采用改良过碘酸钠法将辣根过氧化物酶标记在抗体上[1],标记完后取上清用Sephedex G200 凝胶层析进行纯化,洗脱液为0.2mol/L pH7.4的PBS,流速为15ml/h,分步收集,每支3ml,以紫外分光光度计测A280吸

《国家科技创新基地优化整合方案》印发

科技部 财政部 国家发展改革委关于印发《国家科技创新基地优化整合方案》的通知国科发基〔2017〕250号各省、自治区、直辖市及计划单列市科技厅(委、局)、财政厅(局)、发展改革委,新疆生产建设兵团科技局、财务局、发展改革委,国务院有关部委、直属机构,各有关单位:   根据《关于深化中央财政科技计划(

我国学者在未知化学物质智能化识别方面取得进展

  在国家自然科学基金项目(批准号:22525604、22376092、U24A20512、22276090)等资助下,南京大学韦斯教授课题组与合作者在未知化学物质的结构智能识别方面取得进展。研究成果以"Pseudodata-based molecular structure generator t

岛津GCMSsolution培训笔记(二)

步骤二:单击实时分析助手栏中的调谐图标,单击调谐中的峰监测图标; 步骤三:在峰监测界面里,监视组选择水空气,单击打开灯丝,检查泄漏,检漏结束后关闭灯丝; 步骤四:单击实时分析助手栏中的调谐图标,单击调谐中的自动调谐条件图标,调谐信息窗口弹出,选默认条件并确定,选择

植物分类检索表的应用

植物分类检索表是鉴定植物的工具。检索表的编制是根据法国人拉马克(Lamardk)的二歧分类原则,把原来的一群植物选用明显而相关的形态特征分成相对应的两个分支,再把每个分支中的分类群再用相对的性状分成相对应的两个分支,依次下去,直到将所有分类群分开为止。为了便于使用,各分支按其出现的先后顺序,前边加上

ITECH半导体测试方案解析

前言全球功率半导体市场风起云涌,行业整合步伐加速。作为电力控制/节能减排核心半导体器件,功率半导体器件广泛应用于从家电、消费电子到新能源汽车、智能电网等诸多领域。随全球半导体产业洗牌大势,近年来功率半导体产业整合步伐急速提升,新能源全产业链势头正旺,IGBT等高端器件迎来需求爆发期。功率器件

优化和节约圆盘干燥机能源的方案

 1、热源转换。    热源转换涉及从一个热源或能源到另一个能源的转换,目的是创造经济或过程优势。有许多不同的选择需要考虑,包括从蒸汽加热系统改为燃气系统或改造为可再生能源。热源转换的优点包括干燥机清洁性的容易性,更大的操作灵活性,工厂生产的增加和更高的能源效率,从而降低能源成本。    2、圆盘干

单四级杆质谱仪的主要特点及功能介绍

单四级杆质谱仪的主要特点:  离子源设计,交叉直角喷雾,抗污染,针位置免调。  多路信号功能使一次运行能分析更多化合物。  内置调谐标样,进行全自动的调谐和质量轴校正。  采用双曲面金属可控温四极杆,2种扫描速度选择。  检测器:HED+EM,电子倍增器。 功能简介:  1、可升级的电子转移裂解模块

用质谱数据对肽段从头测序实验(三)

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤另外一种便于人工解析 CID 谱及从头测序的化学方法是对肽段的羧基实行甲酯化。这个反应使肽段每一个羧基质量增加 14u, 包括未修饰的(末端、 Asp 和 Glu上的羧基。如果肽段中没有酸性残基,同时C未端没有被修饰,那么只有 y 系列离子及其中性丢失离子会表

离子色谱仪色谱参数的优化

离子色谱仪色谱参数的优化是通过改变各种色谱参数来提高分离度、缩短分析时间和提高检测灵敏度等。一、提高分离度:1、稀释样品:若待测离子之间的浓度相差较大,而且与固定相的亲和力差异很大,提高分离度的最简单方法是稀释样品。因为若样品浓度较大,某些组分可能会出现平头峰(柱超载)或峰很宽且拖尾,覆盖某些浓度较

赛默飞世尔科技发布一个包括五个软件解决方案的新系列

赛默飞世尔科技于国际蛋白质组学大会(HUPO)上宣布发布一个包括五个软件解决方案的新系列,可提高定性和定量蛋白质组学工作流程  澳大利亚悉尼(2010年9月20日)  -全球科学服务领域的领导者赛默飞世尔科技公司,于2010年国际蛋白质组学大会(HUPO)上宣

常见的质谱扫描模式丨DDA--DIA

  Data Dependent Acquisition  DDA  1 之前已经提到,DDA可以同时获得被测代谢物的一级质谱和碎片信息,母离子的筛选主要依靠研究者预先设定的条件,如信噪比,同位素分布,离子强度,选择top-n等等。该方法由于采用了较窄的m/z(通常为~1Da)窗口进行筛选目标离子减

质谱的特征碎片

我倒觉得特征峰很难记的住,而且不是很有用。我一般关注中性丢失,比如看整体丢失是14n 还是14n-2,甚至19、35。不知道你是哪里的学生,那次我去北大做质谱,人家还给我电脑查出来的分子图,挺准的。只要你的东西很纯,一般那个电脑可以猜得很准。我估计很多比较新的仪器都有这个。

质谱的特征碎片

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GC/ID-5.0:释放GC/MS的全部潜力,让未知物的定性分析变得更简单

GC/ID 是Cerno Bioscience公司开发的一款全自动的GC/MS数据处理软件,近期即将发布最新的V5.0版本,它是唯一将谱库检索、保留指数自动校正和匹配、精确质量数、同位素丰度校正和匹配、混合物解卷积功能结合为一个整体的定性分析解决方案,为GC/MS定性分析提供了巨大的改进,这使得GC

消费锂离子电池的解析

随着消费电子进入存量竞争,消费型锂离子电池上升或趋缓。总的来说,随着全球消费类电子市场饱和,对锂离子电池需求占比会逐渐下降。上述报告预计,到2020年,消费类电子对锂离子电池需求占比将跌至30.5%。其他新兴市场需求占比则将大幅回升,特别是电动交通工具和储能市场。消费电子增速趋缓,消费型锂离子电池有

三阴性乳腺癌首个免疫方案!罗氏推出优化治疗方案!

  罗氏(Roche)控股的日本药企中外制药(Chugai Pharma)近日宣布,在日本推出PD-L1肿瘤免疫疗法Tecentriq(atezolizumab)的840mg静脉制剂。Tecentriq 840mg剂量规格将提供一种优化的方案,每两周一次给药,治疗PD-L1阳性不可切除性或复发性三阴

离子对色谱法测定实验中遇到的问题解析

  (1)流动相控制pH需更加严格(±0.1个单位或者更高)  (2)添加离子对试剂的检测建议使用210nm以上  (3)添加离子对试剂的流动相平衡较慢  因离子对试剂在色谱柱的吸附和解析附过程非常缓慢,通常新的流动相需要进行几个小时的冲洗才能够达到完全平衡,有条件的可以进行过夜平衡12小时以上,否

低分辨质谱分子式识别软件——MassWorks-V-6.0-发布!

  Cerno Biosciense公司发布新版本V6.0的MassWorks软件。  Cerno Bioscience宣布发布了其创新质谱校准和分析软件 MassWorks 6.0 版的首批产品。该软件拥有许多的新功能和改进,扩展了软件的多功能性,包括支持 Agilent OpenLab 数据(版

分享一些关于线性离子阱质谱仪的使用功能

 线性离子阱质谱仪是利用离子阱作为分析器的质谱仪,由一个双曲面截面的环形电极和上下一对端电极构成。   利用离子阱作为分析器的质谱仪称为线性离子阱质谱仪。使用多的是由高频率电场进行离子封闭的保罗阱(Paul trap)。由一个双曲面截面的环形电极和上下一对端电极构成。封闭在真空池内的离子,通过高频电

珀金埃尔默的固相萃取优化方案

固相萃取(Solid Phase Extraction,简称SPE)是从八十年代中期开始发展起来的一项样品前处理技术。由液固萃取和液相色谱技术相结合发展而来。主要用于样品的分离,纯化和富集。主要目的在于降低样品基质干扰,提高检测灵敏度。SPE技术基于液-固相色谱理论,采用选择性吸附、选择性洗脱的方式

实验室冰箱的节能优化

能量不仅仅在日常生活里是一种昂贵的消费品,在实验室中如何最佳地利用能量也是非常重要的。例如实验室的冰箱必须保持精确和稳定的温度条件,以便保护所储存的样品,另外,能量也应该尽可能地加以有效利用,这也是我们研发新一代低温冰箱时关注的重点。 实验室的节能工作往往要比日常生活的情况复杂得多。如果说在日常

Agilent单四级杆质谱仪的主要特点与功能简介

 Agilent单四级杆拥有不同性能级别的配置选择,是一款非常灵活的分析平台,可从基础配置到高级高灵敏度配置进行升级,以便在需要时提升性能,随时准备适应法规中的不断变化。单四极杆旨在满足分析需求不断发展的的常规实验室,可延长运行时间并具有的稳定性,限度地提高样品通量,同时提供易于使用的常规智能工具,

如何去除细胞碎片

  一般情况下,可以采用3000-5000转/分,离心5分钟,可使细胞碎片沉淀下来,取上清液即可。

江苏省公安厅物证鉴定中心高分辨液质检测苯二氮卓类药

  分析测试百科网讯 苯二氮卓类如安定、三唑仑、氯硝安定、艾司唑仑、阿普唑仑、咪达唑仑等药物,都具有镇静、催眠和抗焦虑作用,常用作失眠、焦虑、惊厥、癫痫等病症以及手术前的辅助用药,一直作为处方药进行管理使用,不得在普通药店售卖,并且其中三唑仑作为国家一类管制药物,被严格限制乱用。犯罪分子从网上购买所

疫苗生产降血清细胞培养工艺优化方案

随着国家药品监督管理部门对药品生产监管力度越来越大,生物制药和疫苗生产企业对产品安全性管理要求越来越高,在疫苗生产过程中采用无动物源成份的原辅料是日益增长的要求趋势,但目前,绝大部分疫苗生产还离不开细胞培养过程中血清成份的添加,但使用血清,必须面对血清带来的系列问题和缺点: 1.批间差较大:每批血清

艾滋抗病毒治疗“中国方案”获优化

   北京协和医院感染内科李太生教授等一项研究发现,一线抗艾药“依非韦伦”副反应发生与其血液中浓度密切相关,艾滋病患者尤其是体重低于60公斤者服用依非韦伦时剂量减掉1/3更为安全。相关论文近日发表在知名学术期刊《艾滋病医学》上。   “依非韦伦”是世界卫生组织推荐的艾滋病抗病毒治疗一线用药,