未解析碎片离子的检索实验——方案优化
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤除了人工解析碎片离子谱外，还有两种基本检索手段用于匹配数据库中序列产生的碎片离子谱。第一种方法依靠人工解析部分谱图来鉴别某一特定系列 (b 或v) 离子的连续离子元素（例如鉴别出相互之间相差一个氨基酸残基质量的碎片离子），解析出部分序列信息，再结合以下参数：①鉴定出的系列中第一个离子的质量数；②肽段质量与最后一个离子质量之差（这两个质量数限制了此序列两端未知残基的总质量），③此完整肽段的质量，④所用蛋白水解酶的酶切持性（在 N 端 'C 端都切还是只切一端）。这五种信息组成了肽序列标签 "PST" (peptide sequence tag, PST) 。在序列数据库中可以检索出符合 PST 各元素内容的肽序列。第二种类型的碎片离子检索程序是真正的用未解析的碎片离子信息检索的程序，称为 SEQUEST。其检索手段首先是在数据库中的每个序列中寻找与实验测量肽离子质......阅读全文
未解析碎片离子的检索实验——方案优化
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤除了人工解析碎片离子谱外，还有两种基本检索手段用于匹配数据库中序列产生的碎片离子谱。第一种方法依靠人工解析部分谱图来鉴别某一特定系列 (b 或v) 离子的连续离子元素（例如鉴别出相互之间相差一个氨基酸残基质量的碎片离子），解析出部分序列信息，再结合以下参数：①
未解析碎片离子的检索实验
基本方案 方案优化 实验方法原理 实验材料 蛋白样品
未解析碎片离子的检索实验
实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 数据库同样可以检索一个单个肽段及其碎片离子的质量。肽段质量同它的碎片离子质量一起提供了非常具有鉴别力的判断标准，可用于在序列数据库中检索，包括由表达序列标签翻译的序列数据库（图 5.3) 。这一手段已被广泛用于凝胶分离蛋白质酶水斛后产生
未解析碎片离子的检索实验——基本方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤数据库同样可以检索一个单个肽段及其碎片离子的质量。肽段质量同它的碎片离子质量一起提供了非常具有鉴别力的判断标准，可用于在序列数据库中检索，包括由表达序列标签翻译的序列数据库（图 5.3) 。这一手段已被广泛用于凝胶分离蛋白质酶水斛后产生的肽段鉴定。肽段通常用上
Mass－Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁...（二）
3.3士的宁完整裂解机理LTQ Orbitrap XL的线性离子阱相比传统三维离子阱具有更高的离子容量，故具有优异的多级质谱能力，能够高效的捕获前级离子进行碎裂，并获得高灵敏度的碎片离子信息，在对士的宁母离子的采集过程中，获得了其四级有效质谱信息（MS4）。通过多级质谱解析，总结出士的宁完整裂解
Mass－Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁...（一）
Mass Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁代谢物鉴定中的应用1.引言 马钱子为马钱科植物马钱Strychnos nux-Vomical L.的干燥成熟种子, 其主要活性成分是生物碱，具有通经络、消肿痛、止痛的功效, 是中医临床常用药物。其中主要有效成分士的宁（strych
肽质量检索实验_其他方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤用肽质量数据鉴定蛋白质所控制的实验参数中，最具决定性的参数是肽质量测量的精确度 。质量精确度越高，结果判定越可信。另一决定性参数是所用酶（或化学试剂）的专一性。酶越纯，专一性胞高，检索结果可信。常用的酶是胰蛋内酶。但是要注意的是，即便是高纯度的胰蛋白酶也会在非
肽质量检索实验_基本方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念：(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的，通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被实验中所用水解试剂水
核酸序列的检索实验
实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法；熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义；了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义；熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存；实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608
肽质量检索实验
基本方案 其他方案 实验方法原理 实验材料 蛋白样品
肽质量检索实验
实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念：(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的，通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被
探索新污染物监测新境界丨高分辨质谱进阶攻略
随着《重点管控新污染物清单（2023版）》的全面实施，新污染物监测的重要性逐渐凸显，引发了社会各界的广泛关注。在当前的实验室环境中，LC/MS检测方案以其稳定可靠的性能，特别是三重四极杆液质检测技术的广泛应用，已成为新污染物检测的主流方式。然而随着检测需求的不断提升，我们面临着新的挑战：如何在常规检
用质谱数据对肽段从头测序实验
方案一 方案二 方案三 实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALD
超级ELISA优化方案
1.1 抗体的酶标记及质量鉴定本试验采用改良过碘酸钠法将辣根过氧化物酶标记在抗体上[1]，标记完后取上清用Sephedex G200 凝胶层析进行纯化，洗脱液为0.2mol/L pH7.4的PBS，流速为15ml/h，分步收集，每支3ml，以紫外分光光度计测A280吸光度值，以洗脱检验地带网体积为横
实验室分析仪器质谱分析词汇－碎片离子
碎片离子是由母体分子离子发生碎裂产生。解离出的所有碎片的质量数之和等于母离子的质量数,在指定的条件下,以可预测的方式,断裂相同的内键,分子碎裂方式是可以预测的(碎片离子相同,其相对丰度也相同)。也可参见从具体MRM试验得到的产物(子代)离子。
质谱中常见的碎片离子数据表
质谱中常见的碎片离子数据表包括以下内容：1. 碳氢离子：碳氢离子是最常见的离子碎片，通常用作分子离子的碎片离子。常见的碳氢离子包括M+1、M+2、M+3、M+4等。2. 碳氧离子：碳氧离子是分子中含有羧基和醛基时产生的离子碎片。常见的碳氧离子包括M-1、M-15、M-29等。3. 氮碳离子：氮碳离子
优化壳聚糖絮凝剂处理废水实验方案的建议
优化壳聚糖絮凝剂处理废水实验方案的建议：增加对照实验：除了使用壳聚糖絮凝剂处理废水外，设置空白对照（不添加任何絮凝剂）和使用其他常见絮凝剂处理的对照实验组，以便更直观地比较壳聚糖的处理效果。拓展研究因素：除了壳聚糖投加量、废水 pH 值、搅拌速度和时间外，可以考虑研究壳聚糖的分子量、脱乙酰度、废水温
优化壳聚糖絮凝剂处理废水实验方案的建议
优化壳聚糖絮凝剂处理废水实验方案的建议：增加对照实验：除了使用壳聚糖絮凝剂处理废水外，设置空白对照（不添加任何絮凝剂）和使用其他常见絮凝剂处理的对照实验组，以便更直观地比较壳聚糖的处理效果。拓展研究因素：除了壳聚糖投加量、废水 pH 值、搅拌速度和时间外，可以考虑研究壳聚糖的分子量、脱乙酰度、废水温
Cerno发布新型Rx平台－加速MassWorks普及应用
苹果公司的IOS、谷歌的Android、腾讯的微信，都是我们熟知的平台，它们可以更好地接入和调用第三方的工具，并加速实现各种基于平台的应用。MassWorks软件具有独特的精确质量和谱图准确度校正方法，使人们在使用单四极杆质谱时，也可获得被国际期刊认可的精确质量和元素组成，准确地进行化合物鉴定；
离子交换层析实验——基本方案
离子交换层析（Ion Exchange Chromatography简称为IEC）是以离子交换剂为固定相，依据流动相中的组分离子与交换剂上的平衡离子进行可逆交换时的结合力大小的差别而进行分离的一种层析方法。实验材料蛋白质试剂、试剂盒离子交换缓冲液仪器、耗材离子交换层析柱梯度混合器电导表实验步骤1.
线性离子阱质谱仪在应用上主要分为以下五点
线性离子阱质谱仪是高通量分析的工具。结合多种解离技术，包括脉冲碰撞解离(PQD)和电子转移解离(ETD)，LTQ XL提供丰富的结构信息。广泛应用于蛋白质组学、代谢物鉴定、药物研发定量分析、法医和临床分析等领域。 线性离子阱质谱仪功能简介： 1、可升级的电子转移裂解(ETD)模块可以提供传统
线性离子阱多种解离技术对阿德福韦酯杂质谱的全（二）
结果与讨论 I. 全扫—Top5 HCD dd MS/MS 与“FISh”ADP 杂质谱分析流程由两次连续的LCMS实验构成。分析目标是为杂质鉴定和结构解析收集尽可能多的信息。第一个 MS 实验包括全扫描和后续的 Top5 HCD 数据依赖MS/MS 扫描（图1）。 接下来，数据通过MassFr
用质谱数据对肽段从头测序实验（一）
实验方法原理单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱，但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生，由 C 未端或N未端断
用质谱数据对肽段从头测序实验
实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱，但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生，由 C 未端或N未端
上海优化应急方案启动条件
距离今年上海市入秋后首次空气重度污染仅一周时间，11月15日，上海又遭遇严重雾霾侵袭，上海环境官方微博发布空气质量重度污染预警，宣布全市启动环境空气质量重污染应急方案，这是自方案出台后第二次启动。 值得注意的是，11月15日上海启动环境空气质量重污染应急方案时，往前追溯12小时内的全市AQ
如何通过实验优化阳离子型和阴离子型絮凝剂的混合比例？
以下是通过实验优化阳离子型和阴离子型絮凝剂混合比例的一般步骤：准备实验材料和设备不同型号和规格的阳离子型和阴离子型絮凝剂。待处理的废水样品。搅拌器、量筒、移液管、计时器等实验器具。检测水质指标的仪器，如浊度仪、COD 测定仪等。设计实验方案确定要测试的混合比例范围，例如从 1:9 到 9:1 ，可以
实时定量PCR应用中的优化方案
聚合酶链式反应（polymerase chain reaction, PCR）自诞生之日起就决定了它不仅是一种高敏感、高特异的检测核酸分子的定性方法，而且也是一个能对核酸分子进行精确定量的有力工具[1]。随着分子生物学技术研究的不断进展，定量PCR技术取得了突飞猛进的发展，不仅建立了一系列的方法，
计算机辅助鉴定药物代谢产物
随着分析仪器的发展，单个代谢样品中即可检测到成千甚至上万个化合物，如此庞大的数据亟需无监督的自动化鉴定过程。计算机的引入有效解决了大数据处理难题，同时加速了无标准谱图化合物的解析过程，在一定程度上实现了药物代谢产物的自动化鉴定。计算机辅助鉴定方法多种多样，根据其工作原理，现分为化学结构数据库基础上的
线性离子阱质谱仪的使用功能简介
线性离子阱质谱仪的功能简介： 1、可升级的电子转移裂解（ETD)模块可以提供传统裂解方法无法得到的蛋白质翻译后修饰信息； 2、脉冲碰撞能量诱导解离（PQD)功能可以提供低质量端碎片离子信息； 3、高选择MS/MS分析给谱图在数据库和谱库检索更好的匹配，提高了结构确证的可靠性。另外快速极性切换，
薄膜蒸发器的优化设计方案!
薄膜蒸发器作为一种新型高效的蒸发设备，其广泛应用为工业生产带来了巨大的经济效益，在真空薄膜蒸发器的设计中，传热部分的计算关系到整个蒸发器产出高质量产品的重要依据，杭州安研经过多年不断研发优化薄膜蒸发器设计，总结出以下优化设计方案。一、蒸发概述蒸发是重要的化工单元操作之一，蒸发操作是用加热的方法，在沸