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未解析碎片离子的检索实验——方案优化

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤除了人工解析碎片离子谱外,还有两种基本检索手段用于匹配数据库中序列产生的碎片离子谱。第一种方法依靠人工解析部分谱图来鉴别某一特定系列 (b 或v) 离子的连续离子元素(例如鉴别出相互之间相差一个氨基酸残基质量的碎片离子),解析出部分序列信息,再结合以下参数:①鉴定出的系列中第一个离子的质量数;②肽段质量与最后一个离子质量之差(这两个质量数限制了此序列两端未知残基的总质量),③此完整肽段的质量,④所用蛋白水解酶的酶切持性(在 N 端 'C 端都切还是只切一端)。这五种信息组成了肽序列标签 "PST" (peptide sequence tag, PST) 。在序列数据库中可以检索出符合 PST 各元素内容的肽序列。第二种类型的碎片离子检索程序是真正的用未解析的碎片离子信息检索的程序,称为 SEQUEST。其检索手段首先是在数据库中的每个序列中寻找与实验测量肽离子质......阅读全文

未解析碎片离子的检索实验

基本方案 方案优化             实验方法原理 实验材料

赛默飞世尔科技发布一个包括五个软件解决方案的新系列

赛默飞世尔科技于国际蛋白质组学大会(HUPO)上宣布发布一个包括五个软件解决方案的新系列,可提高定性和定量蛋白质组学工作流程  澳大利亚悉尼(2010年9月20日)  -全球科学服务领域的领导者赛默飞世尔科技公司,于2010年国际蛋白质组学大会(HU

2018中国质谱大会生命科学与医学集锦

  分析测试百科网讯 2018年11月24日-26日,2018年中国质谱学术大会在广州东方宾馆盛大召开。本次大会包括一个报告主论坛,21个主题分论坛,共300余场演讲报告。在“生命科学与医学”分论坛上,数十位业内专家学者带来精彩的演讲报告,吸引参会人员驻足聆听。分析测试百科网作为本次活动的合作媒体,