RACE技术扩增构建全长cDNA文库
实验概要利用RACE(利用PCR技术快速扩增全长mRNA)技术构建全长cDNA文库是传统C库构建技术的改进。本实验即是利用寡核苷酸帽法,进行全长C库的构建,从而掌握RACE技术的原理与基本操作方法。实验原理其原理是利用真核mRNA的3’poly(A)和5’帽子结构作为标签,用通用引物识别并配对标签序列,PCR扩增后克隆PCR产物,从而构建出全长并有正确阅读框架的C库。RACE技术最早是cDNA水平上加接头,以扩增未知5’序列。而随着技术的进展,目前RACE技术已发展到直接以mRNA为模板进行操作,这就保证了全长cDNA的克隆,为研究5’和3’非编码区及启动子提供了条件。RACE分3’RACE和5’RACE。3’RACE原理如图1。其用带olig(dt)和特异酶切位点的序列为3’引物;用特异序列为5’引物,经RT-PCR后,扩增出3’全长序列,利用特异酶切位点,插入载体。 5’RACE分两种,其一为SMART(Mechanism ......阅读全文
用经典-RACE-扩増-3末端-cDNA-实验
试剂、试剂盒 dNTP 溶液 二硫苏糖醇 TE 反转录缓冲液 RNA 酶 H RNasin SuperScriptⅡ逆转录酶
仅扩增全长cDNA末端的高级RACE方法
为了获得全长的cDNA 5’及3’末端序列,许多研究人员使用了称之为cDNA末端快速扩增,或RACE的方法。传统的RACE方法得到的PCR产物含有全长及断裂的cDNA产物。GeneRacer™试剂盒确保您只得到含有全长cDNA末端的完整序列,是您得到更高效的结果并节省您的时间GeneRacer™
用经典-RACE-扩増-3末端-cDNA-实验
试剂、试剂盒 dNTP 溶液二硫苏糖醇TE反转录缓冲液RNA 酶 HRNasinSuperScriptⅡ逆转录酶poly(A)+RNA 或总 RNAQT 引物Hercules Hot-Start 聚合酶仪器、耗材 水浴或加热仪热循环仪实验步骤 试剂可以从多数大供应商那里买到该过程所需要的材料与合适的
用经典-RACE-扩増-3末端-cDNA-实验
试剂、试剂盒dNTP 溶液二硫苏糖醇TE反转录缓冲液RNA 酶 HRNasinSuperScriptⅡ逆转录酶poly(A)+RNA 或总 RNAQT 引物Hercules Hot-Start 聚合酶仪器、耗材水浴或加热仪热循环仪实验步骤试剂可以从多数大供应商那里买到该过程所需要的材料与合适的 5X
用经典-RACE-扩增-cDNA-的5’末端实验
试剂、试剂盒 GSP-RT 引物poly(A)+RNA 或总 RNA反转录缓冲液 RNA 酶 HRNasinSuperScriptII 逆转录酶dNTP 溶液DTTTECoCl2dATP 溶液脱氧核苷酸末端转移酶加尾缓冲液 HerculesHot-Start 聚合酶HerculesHot
PCR仪为什么得不到RACE产物?
*加入Hela对照 *低质量的RNA模板 *逆转录失败,SSII和SSIII非常适用于长模板cDNA的合成 *目的基因丰度太低,可以通过提高PCR的循环次数来解决,建议使用巢式PCR *目的基因没有表达,可以通过使用两条GSPs来分析cDNA中是否含有目的基因 *目的基因太长而不适合进
用经典-RACE-扩增-cDNA-的5’末端实验
这一实验方案分为 3 个阶段。 第 1 阶段:反转录产生 cDNA 模板 ;第 2 阶段:在第一链 cDNA 产物末端加 poly(A) 尾 ;第 3 阶段:扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒GSP-RT 引物poly(A)+RNA 或总 RNA反转录缓
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 仪器、耗材 特殊设备
RACE技术在基因工程抗体中的应用
前言20世纪80年代后期,随着分子生物学的迅速发展,使得人们可以通过基因工程技术对天然的分子进行人为的改造,这为抗体药物带来了新的突破点和希望。了解和阐明抗体分子的结构及功能,为人类疾病诊断及治疗提供了新的推动力。基因工程抗体 为了解决传统的鼠源性单抗存在的弊端,对鼠源性单抗进行改进以及人源化单抗的
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端
这一实验方案分为 6 个阶段。第 1 阶段:降解 RNA 的去磷酸化; 第 2 阶段:完整 RNA 去帽; 第 3 阶段:RNA 寡核苷酸的制备; 第 4 阶段:RNA 寡核苷酸与细胞 RNA 的连接; 第 5 阶段:反转录; 第 6 阶段:扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康
PCR仪得不到全长的5’RACE-PCR产物
*CIP反应后的RNA降解产生了新的带有5’磷酸的断裂模板,可以同GeneRacer RNA Oligo连接。一定要小心操作,保证RNA无降解。 *CIP脱磷酸不完全,可以增加反应中CIP的量或减少RNA的量。 *PCR产生了杂带,并不是真正的连接产物,可以使用上述建议优化PCR。
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端(二)
第 3 阶段:RNA 寡核苷酸的制备选择离 T7 或 T3RNA 聚合酶作用位点下游约 lOObp 处可以线性化的质粒 [见图 25-3(b)]。因为来自多克隆位点回文序列的引物用于 PCR 效果不好,因此比较理想的是用在多克隆位点克隆进某个插入片段的质粒。一个已经验证过的质粒是 pBS-S
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端(一)
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸仪器、耗材 特殊设备实验步骤 第 1 阶段:降解 RNA 的去磷酸化一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂乙酸钠,3mol/L,pH5.2乙醇二硫苏糖醇(DTT)(0.1mol/L)苯酚/氯仿(1:1,体积比)2. 酶和酶缓冲液磷酸酶缓冲液,10X
PCR实验操作常见问题及解决方法(二)
二、Generacer如何针对Generacer试剂盒设计基因特异性引物(GSP)?使用5’或3’RACE试剂都需要至少一条基因特异性引物,您在设计引物时需要注意以下几点要求:*50-70%的GC含量,以提高引物熔点(Tm)*23-28个碱基长度,以提高引物特异性*降低3’端GC含量,将引物非特异性
RTPCR实验方法总结大全
生物谷: RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓
RTPCR实验方法大全
RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2 浓度、退
RTPCR实验方法大全(抽提RNA,RT,PCR)1
RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓度、退火温
RTPCR实验方法总结(1)
RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求: 1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓度、
RTPCR实验方法总结
RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓度、退火
RTPCR实验方法总结大全
生物谷: RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2
基因cloning经验指南
我们克隆基因的时候,往往可以通过一些途径(如pcr,EST库或者文库筛选)得到基因的部分片段。然后通过3'race 和 5'race 方法往两端延伸。有时会出现无法延伸的状况,如果你超作没有失误的话,这时候很有可能是你模板GC含量过高的缘故,普通pcr 是没有办法延伸的,可以用扩高g
地尔硫卓在心房颤动心室率控制的应用现状
心房颤动(房颤)临床常见的慢性或反复发作性快速心律失常之一。目前房颤治疗主要存在2种策略:即节律控制和室率控制。目前长期维持窦性心律的手段仍然有限,故心室率控制仍然是目前房颤治疗的最主要策略之一。 目前,关于理想的心律控制指标还存在争议。根据2006年AHA/ACC/Esc指南,主
cDNA末端快速扩增技术的定义
⑴.5’ RACE-PCR:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以连有SMART寡核营酸序列通 用接头引物的Oligo(dT)30MN作为锁定引物反转录合成标准第一链cDNA。然后用一个基因特异引物GSP2 (gene specific primer,GSP)作为上游引物
Rh系统命名遗传
Rh系统的命名及遗传:有Fisher-Race、Wiener、Rosenfield3种命名法。Fish-er-Race命名法又称CDE命名法,这种学说认为Rh遗传基因位于第1号染色体的短臂上,Rh血型有3个紧密相连的基因位点,每一位点有一对等位基因(D和d,C和c、E和e),这3个基因是以一个复合
PCR仪常见问题及回答
PCR仪常见问题及回答1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*zui常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是R
PCR仪常见问题及回答
1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*最常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*与反
PCR仪常见问题及回答
1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*zui常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*
PCR实验操作常见问题及解决方法
1. cDNA产量的很低可能的原因:*RNA模板质量低*对mRNA浓度估计过高*反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足*同位素磷32过期*反应体积过大,不应超过50μl2. 扩增产物在电泳分析时没有条带或条带很浅*最常见的原因在于您的反应体系是PCR的反应体系而不是RT-PCR的反应体系*与反
什么是锚定引物
锚定引物是在扩未知序列(RACE或genome walking)时,与未知序列一侧结合的引物,基本都是试剂盒里自带的
cDNA末端快速扩增技术的定义
定义:cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends, RACE)是一种基于PCR从低丰度的转录本中快速扩增cDNA的5'和3’末端的有效方法。