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新研究在番茄基因组库中添加近5000个基因

现在,来自农业研究局(ARS)和Boyce Thompson研究所(BTI)的科学家们在刚刚发表的《Nature Genetics》一文中,重点讨论了这个问题。 位于纽约伊萨卡的ARS植物、土壤和营养研究实验室的分子生物学家James Giovannoni和BTI生物信息学科学家Zhangjun Fei完成了栽培番茄及其野生亲缘植物的泛基因组(pan-genome)构建,绘制了近5000个以前未记录的基因。 基因组是生物体基因及其功能的生物学图谱。但是一个基因组通常代表一个单一的品种,然后作为其他物种的参考基因组。这个泛基因组包含了725个不同栽培和近缘野生番茄的所有基因,并提示有4873个基因在原始参考基因组中缺失。 虽然栽培番茄有广泛的物理和代谢变异,但在其驯化和育种过程中存在着几个严重的瓶颈。这意味着今天的番茄遗传基础很窄。泛基因组有助于确定哪些超出参考范围的附加基因可用于作物育种和改良。 在现代,育种家主要关......阅读全文

转基因的焦虑:“天使”与“魔鬼”之争

  自从上世纪80年代末,科学家们将十多年来的分子生物学研究成果运用到生物新物种的培育上以来,对转基因技术的争论就已开始,并且从未停止。 2012年9月19日,法国凯恩大学塞拉利尼教授发表论文,称用转基因玉米NK603进行大鼠两年饲喂研究,引起大鼠产生肿瘤,此消息一经发出便引起广泛关注,使转基因

关于2011年度教育部科学技术研究重点项目立项通知

教技司[2011]95号 各省、自治区、直辖市教育厅(教委)、新疆生产建设兵团教育局,国家民族事务委员会教科司、国务院侨办文教宣传司:   2011年度教育部科学技术研究重点项目评审工作已经结束。经专家评审并公示,共有212个项目获准立项(具体名单见附件)。为做好项目实施工作,现将有关

汉字首登Nature 农科院等完成亚洲栽培稻基因组变异研究

  水稻是全世界最重要的粮食作物之一,对水稻全球品种进行基因组研究,对于挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义,是关系着国家乃至全球粮食安全的重大战略问题。  2011年9月,全球3000份水稻核心种质资源基因组项目(3K Rice Project)正式启动,该项目

Nature Genetics发表重要成果 CRISPR让番茄更快开花结果

  生物通报道:冷泉港实验室(CSHL)的研究团队通过CRISPR基因编辑技术成功使番茄的开花和成熟时间提前了两周多,并且拓展了这种重要农作物的种植范围。这项研究于十二月六日发表在Nature Genetics杂志上。  “我们展示了CRISPR快速提升农作物性状的强大能力,” CSHL副教授Zac

协同创新驱动农业基因组学发展

   “作为生物技术领域最基础的学科,农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新,更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接,才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识,在国家农业科技创新联盟的框架下,建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。  7月24

基因编辑技术 辣味番茄也可以有

  当番茄植株生长出营养丰富的新鲜肉质获得丰收时,在逆境中易产量下降的“农业困难户”辣椒植株也开始防御了。它们会产生辣椒素,这种果实的次级代谢产物赋予辣椒辛辣味,以抵御捕食者。  从进化的角度来看,红辣椒是番茄长期失联的烈性表亲。它们是在1900万年前从一个共同祖先身上分离出来的,仍然拥有一些相同D

泛生子携手赛默飞共建精准医学联合研发中心

  2016年6月28日,北京泛生子基因科技有限公司携手美国赛默飞世尔科技,共同签署战略合作协议,共建精准医学联合研发中心。泛生子是一家专业提供肿瘤基因组学解决方案的创新型生物技术公司,与世界一流的科学服务企业赛默飞的深入合作,将有效提升泛生子的科学研发实力,促进临床转化,服务中国精准医疗市场。(北

清华百人计划发表植物病毒研究新成果

  病毒能够干扰和侵占宿主机械,并规避防御反应,创造一个合适的细胞环境用以成功传染。这通常是通过病毒蛋白和宿主因子之间的相互作用而完成的。双生病毒(Geminiviruses)是一组感染植物的DNA病毒,其中一些包含一个卫星分子(betasatellite),称为DNAβ。6月17日,来自清华大学、

8月Nature杂志不得不看的重磅级亮点研究

  时间总是匆匆易逝,转眼间8月份即将结束了,在即将过去的8月里Nature杂志又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与大家一起学习。  【1】Nature:科学家成功逆转大脑干细胞的衰老过程 有望开发返老还童新方法  doi:10.1038/s41586-019-1484-9  近日,一

人体肠道细菌基因组集研究成果

2019年2月5日上午,深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集(Culturable GenomeReference, CGR)研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组,为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据,同时

Illumina预计Q4收入9.5亿美元 全年约32.4亿美元 同比下降9%

  分析测试百科网讯 近日,Illumina首席执行官Francis deSouza出席了JP摩根虚拟医疗大会,讨论了泛癌IVD分析、CDx合作,Illumina官员预计第四季度总收入为9.5亿美元,同比持平;2020年总收入约32.4亿美元,同比下降9%;预计2021年全年总收入在37.9亿美元到

2019中国生命科学领域CNS盘点:曹雪涛 颜宁 施一公上榜

  截至2019年12月23日,中国学者在Cell,Nature及Science在线发表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已经全部更新),iNature团队对于这些文章做了系统的总结:  按杂志来划分:Cell 发表了31篇,Nature 发表了44篇,Scie

我国科学家首提“人类泛基因组”

人类基因组存在着种群特异甚至个体独有的DNA序列和功能基因   经过不懈研究和攻关,我国科研人员在人类基因组研究中获得新的重大进展――发现人类基因组中存在着种群特异甚至个体独有的DNA序列和功能基因。科研人员还首次提出了“人类泛基因组”的概念。   由深圳华大基因研究院领衔,华南理工大学参与的研

Cell:广泛靶向代谢组技术揭示番茄代谢育种与驯化历史

  继广泛靶向代谢组技术成果在NG、NC、PNAS发表后,2018年1月11日,《Cell》在线发表了题为“Rewiring of the fruit metabolome in tomato breeding”的研究论文。论文的通讯作者为迈维代谢首席科学家华中农业大学罗杰教授与中国农业科学院深圳农

10月30日《自然》杂志精选

   哺乳动物类群的早期分化  Haramiyids 是极为古老的化石哺乳动物,直到最近人们也只是从牙齿知道它们,被认为与已经灭绝但却极为成功的、类似啮齿类的多尖齿兽相关。头骨和骨架的发现只是让人们更加糊涂——一篇论文证实了它们与多尖齿兽之间的联系,而另一篇论文则质疑这种联系。现在,Jin Meng

中国农大王涛团队:质谱助力探索豆科植物结瘤固氮秘密

  分析测试百科网讯 今年2月,国际植物科学期刊《Plant Physiology》上在线发表了一篇题为“The MtDMI2-MtPUB2 negative feedback loop plays a role in nodulation homeostasis”的学术论文,中国农业大学农业生物技

泛冠状病毒药物开发的基础知识

  高致病性冠状病毒感染成了这十年来广受关注公共卫生问题。严重急性呼吸综合征(SARS,2002-2004),中东呼吸综合征(MERs,2012-至今),2019-nCov(COVID-19),每一个对人类健康,经济发展都带了巨大的冲击。   病毒通过接触,飞沫,气溶胶等形式,引起广泛传播,引起高

科研新突破登Nature子刊,泛生子再掀癌症基因的“面纱”

  泛生子致力于从癌症基因开始寻根溯源,揭示肿瘤产生的根源及其赖以发展的关键机制,通过临床转化为癌症患者带来希望。   近日,由美国杜克大学讲席教授、泛生子联合创始人兼首席科学家阎海教授领衔的泛生子团队,联同杜克大学及约翰霍普金斯大学研究人员完成的最新成果,在线发表于国际权威学术期刊《Nature

华大基因助力丹麦国家精准医学发展

  2017年7月26日,来自华大基因、哥本哈根大学、奥胡斯大学和丹麦科技大学等机构的研究人员,在各方紧密合作下,共同完成了丹麦人泛基因组项目,其最新研究成果发表在国际著名杂志Nature主刊上。  丹麦人泛基因组项目起始于2012年初,旨在建立基于丹麦人的基因组序列与变异图谱,为丹麦国家基因组二期

强!中国学者用最短时间突破100篇CNS生命科学领域成果

  截止2020月7月27日,中国学者在Cell,Nature 及Science 发表了共计102项生命科学的研究成果,其中新冠肺炎领域占了近一半(共43篇)。iNature系统总结了这些研究成果:   按杂志来划分:Cell 发表了30篇,Nature 发表了45篇,

我国科学家建立植物负义链 RNA 病毒反向遗传学体系

  近日,美国《国家科学院院刊》在线发表了南京农业大学植物病毒学实验室教授陶小荣团队的最新研究成果。他们成功拯救出番茄斑萎病毒,在全球首次建立植物多分体负义链 RNA 病毒的反向遗传学体系,攻克了植物多分体负义链 RNA 病毒研究中的 “卡脖子” 难题。  论文通讯作者陶小荣介绍,负义链 RNA 病

阎海教授获颁杜克大学医学院杰出教授奖

  近日,杜克大学医学院授予泛生子首席科学家阎海教授杰出教授奖,表彰其对IDH1/2 基因、ATRX基因及TERT 启动子突变的里程碑式发现,这些发现成为胶质瘤分子分型的重要依据,对提供更准确的诊断和预后信息,推动实现个体化治疗和定制化临床实验,重新认识胶质瘤的发生发展具有重要意义。同时如其他做出非

本周Science期刊发布 检测CRISPR脱靶效应新方法---DISCOVER-Seq

  本周又有一期新的Science期刊(2019年4月19日)发布,它有哪些精彩研究呢?让小编一一道来。图片来自Science期刊。  1.Science:开发出一种检测CRISPR脱靶效应的新方法---DISCOVER-Seq  doi:10.1126/science.aav9023; doi:1

PacBio完成大型基因组测序项目

  什么叫PacBio技术应用到大型基因组测序项目中会大打折扣,在哪个环节大打折扣?提出这个问题的读者几乎都是抱有同样的心态,尽管大多数读者都基本认同了,如果为了得到Finishing Genome,那么PacBio无论技术和成本,理论上都是最低的,但即使这样,客观成本还是高的吓人,而假如将就D

北大尹玉新Cell Res发表新成果

  最近,北京大学系统生物医学研究所尹玉新课题组在Nature子刊《Cell Research》发表题为“PTEN regulates RPA1 and protects DNA replication forks”的研究成果,发现肿瘤抑制因子PTEN对于DNA复制叉的保护是必不可少的,PTEN的缺

中国转基因作物发展路线

  目前,中国农业面临着三方面的重大挑战。首先耕地锐减,人均耕地面积不足世界平均水平的40%。其次,水资源匮乏,人均水资源占有率只有世界平均水平的25%左右。再次,病虫害、旱涝等自然灾害频发,环境恶化。   发展转基因技术可以有效地缓解或解决这些问题。第一,转基因农作物品种能够显著提高农作物产量,

《Nature》12月最受关注的十篇论文

  英国著名杂志《Nature》周刊是世界上最早的国际性科技期刊,自从1869年创刊以来,始终如一地报道和评论全球科技领域里最重要的突破。其办刊宗旨是“将科学发现的重要结果介绍给公众,让公众尽早知道全世界自然知识的每一分支中取得的所有进展”。近期《Nature》下载论文最多的十篇文章(2012年11

《Nature》11月最受关注的十篇论文

  英国著名杂志《Nature》周刊是世界上最早的国际性科技期刊,自从1869年创刊以来,始终如一地报道和评论全球科技领域里最重要的突破。其办刊宗旨是“将科学发现的重要结果介绍给公众,让公众尽早知道全世界自然知识的每一分支中取得的所有进展”。近期《Nature》下载论文最多的十篇文章(2012年10

生化与细胞所等研究发现小鼠PIWI/piRNA代谢调控机制

  国际知名学术期刊Developmental Cell于1月13日发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所刘默芳组、王恩多组关于piRNA在精子发生后期触发小鼠PIWI(MIWI)蛋白经 APC/C-泛素途径降解的最新研究成果。该工作与李劲松研究员、上海计划生育研究所施惠娟研究员、美国路

番茄驯化位点一个重复片段中和番茄育种障碍的隐秘变异

  第三代测序技术崛起了,伴随而来的三代变异检测技术也成为发现大片段结构变异的新宠儿,从2016年医学研究人员首次用 PacBio 测序技术找到致病性结构变异成功诊断罕见疾病,到2018年中信湘雅生殖与遗传专科医院的研究人员采用 Nanopore 测序技术精确诊断出一段长达 7Kb 的缺失突变并明确