激活真菌中潜在的“沉默”基因簇获得新颖结构化合物
天然产物是新药开发的重要来源之一,近年来从真菌中发现的新颖天然产物越来越困难,其主要原因是由于传统的提取分离方法导致的重复发现已知化合物,因此,亟需开发出一种新的方法或策略来挖掘新结构天然产物。 近年来基因组测序技术的迅速发展及分子遗传学操作技术的成熟为发掘新的真菌天然产物创造了条件。通过对真菌基因组进行生物信息学分析发现,超过90%次级代谢生物合成的基因簇在常规培养条件下是“沉默”的,表明基因组中隐藏着大量的结构新颖的化合物宝藏。因此,基于海量的真菌基因组数据,如何挖掘发现真菌中新的活性天然产物便成为近年来国内外研究的重点和热点。 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室尹文兵研究组致力于从基因(组)出发挖掘、激活真菌中潜在的“沉默”基因簇,获得了传统手段难以发现的新颖结构化合物。 前期研究发现,真菌次级代谢产物的产生与特定环境因素密切相关,受到复杂的基因调控,发生在多个水平。其中负责真菌次级代谢调控的蛋白,统称为......阅读全文
免疫球蛋白基因簇的基本信息
中文名称免疫球蛋白基因簇英文名称immunoglobulin gene cluster定 义编码免疫球蛋白重链和轻链的一组基因,由不同染色体上独立的多基因家族组成。应用学科免疫学(一级学科),免疫系统(二级学科),免疫分子(三级学科)
蓝色链霉菌中筛选出活性基因簇
荷兰格罗宁根大学的研究人员利用基因挖掘法从蓝色链霉菌中发现了一组活性基因簇,通过该基因簇可制造出无耐药性的新型抗生素,该研究有望为链霉菌的药用开发提供一条新思路。相关研究发表在最新一期《微生物学》杂志上。 链霉菌是生活在土壤中的一种常见细菌,其家族包含多种细菌。不同于其他细
玉米转录因子和籽粒重要转录因子互作协同调控醇溶蛋白
玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有的文献报道,玉米籽粒
玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2-调控醇溶蛋白
玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合
沉默等位基因的定义
中文名称沉默等位基因英文名称silent allele定 义通常不表达,但在肿瘤细胞中呈现转录活性的基因。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
关于RNA沉默的分类介绍
植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类: 以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS); 以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(t
植物基因沉默怎么搞?
“植物的种子时期,大量基因都被沉默,直到植物成年以后才按需活化,”植物生化和光合作用研究所(IBVF)的Myriam Calonje Macaya博士解释道。细胞分裂后,基因沉默状态还会传递给子细胞,从而建立细胞记忆。多梳蛋白家族(Polycomb-group proteins,PcG蛋白)参与
Cell-Rep:KRAS可以被“沉默”
大约三分之一的人类癌症中存在HRAS、KRAS或NRAS原癌基因突变。其中KRAS突变最为常见,其突变导致人类很多致命癌症的发生,包括胰腺癌和肺癌等。一直以来,科研工作者都致力于找到药物能抑制KRAS本身或KRAS信号通路中的关键分子。但到目前来看,这个问题仍没有得到有效地解决。 最近在Cel
科学检测揪出“沉默的杀手”
卵巢癌临床诊断急需一种更好的诊断工具。 过去10年间,我国卵巢癌发病率增长了30%,死亡率增加了18%。由于早期症状不明显,且早期肿瘤在盆腔检查中难以察觉,导致70%~75%的卵巢癌患者在确诊时已属晚期,卵巢癌因此被称为“沉默的杀手”。 更为遗憾的是,最近30年来,卵巢癌患者5年
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 cDNA 序列
Science发现全新基因沉默机制
科学家在研究脆性X综合症的过程中,发现了一种基因沉默的全新机制,文章于二月二十七日发表在Science杂志上。研究显示,阻断这一沉默机制的药物可以防止脆性X综合症的发生。 脆性X综合症是遗传性智力障碍和孤独症最常见的原因,这种疾病在男孩中的发病率更高。二十多年以来人们一直知道,脆性X综合症
基因沉默临床研究获成功
科学家利用纳米技术成功实现临床基因沉默,图为siRNA。 利用小干涉RNA(siRNA)抑制特殊基因表达的治疗潜能已经得到广泛认可。然而,将这项技术成功转化至临床还面临几项挑战,例如实现药物的全身释放。如今,美国科学家在《自然》杂志上报告了利用一个靶向纳米粒子将一个siRNA向癌症
与基因沉默相关特殊基因
奥地利格雷戈尔·门德尔植物分子生物学研究所日前宣布,一个包括该研究所、中国同济大学、美国加利福尼亚大学等机构科学家在内的国际科研小组发现了一种特殊基因,没有它,植物细胞内其他一些基因就只能保持沉默。最新一期英国《自然》杂志网络版发表了这个国际科研小组的论文。这一科研小组发现的特殊基因名为RDM1,它
基因沉默的基本类型
基因沉默,主要有转录前水平的基因沉默(TGS)和转录后水平的基因沉默(PTGS)两类:TGS是指由于DNA修饰或染色体异染色质化等原因使基因不能正常转录;PTGS是启动了细胞质内靶mRNA序列特异性的降解机制。有时转基因会同时导致TGS和PTGS。
RNA介导的基因沉默实验
实验材料 pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒 dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材 PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤 一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 c
评论:药监部门不能沉默
国家监管部门的权威与公信,是构成民众安全感的一道底线。如果,药监部门的检测结果都自相矛盾,那民众心里怎么会有“底”呢? 据《经济参考报》报道,2月29日和3月5日,国家食品药品监督管理局(以下简称国家药监局)先后通报检出铅、砷超标的13家“不合格”螺旋藻生产企业和内容物欺诈的8家鱼油生产企业名
沉默等位基因的定义
中文名称沉默等位基因英文名称silent allele定 义通常不表达,但在肿瘤细胞中呈现转录活性的基因。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
沉默子的功能特点
在遗传学中,沉默子是一段能够结合转录调节因子的DNA序列,这种转录因子称为阻遏蛋白。与增强子对DNA转录的加强作用相反,沉默子会抑制DNA的转录过程。DNA上的基因是信使RNA合成的模板,而信使RNA最终被翻译成蛋白质。当沉默子存在时,阻遏蛋白结合到沉默子DNA序列上,会阻碍RNA聚合酶转录DNA序
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体 DNA 模板 试剂、试剂盒d
关于基因表达的转录调控介绍
基因表达的转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。 通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白
基因表达的转录调控的介绍
可分为三种主要途径: 1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用); 2)调控转录因子与转录机制相互作用; 3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。 通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合
CFHR2基因编码功能及结构描述
该基因属于补体因子H相关基因家族(CFHR),与1号染色体上的补体因子H基因簇合在一起,参与补体的调控CFHR基因突变与致密沉积病和非典型溶血性尿毒综合征有关另外,已经发现该基因的剪接转录变体。[由RefSeq提供,2015年8月]This gene belongs to a family of c
CFHR2基因突变与药物因子介绍
该基因属于补体因子H相关基因家族(CFHR),与1号染色体上的补体因子H基因簇合在一起,参与补体的调控CFHR基因突变与致密沉积病和非典型溶血性尿毒综合征有关另外,已经发现该基因的剪接转录变体。[由RefSeq提供,2015年8月]This gene belongs to a family of c
科学家揭示水稻花粉育性的新调控因子
近日,中科院植物研究所研究员王台团队与合作者揭示了一个新的水稻花粉育性的主调控因子,相关研究成果发表于《植物学期刊》。 作物花粉不育种质材料是杂种优势利用的基础。花粉有结构复杂的细胞壁,花粉壁赋予了花粉抗生物和非生物逆境的能力,也参与了花粉与柱头细胞的互作与信息交流,是决定花粉活性和功能的
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究(三)
5. PHB与HIRA复合体共同作用控制着IDH的表达研究者随后探究了PHB,HIRA对IDH-a-KG代谢通路的影响。研究发现,PHB,HIRA缺失导致了IDH表达显著减低,并伴随着细胞内α酮戊二酸的显著降低。而α酮戊二酸对于hESC干性的自我维持具有重要的作用。6. PHB和HIRA共同调控H3
健康所研究揭示microRNA参与狼疮炎症因子调控的机制
人类疾病往往是由于一些基因表达调控紊乱引起的。MicroRNA(miRNA)是近年来广为关注的重要的基因表达调控因子,在人类疾病的发生发展中起着重要作用。沈南教授领导的研究组整合上海交通大学附属仁济医院风湿科的临床优势和中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所的基础研究力量,近年
研究揭示番茄拮抗因子调控花序分枝数的分子机制
近日,《植物细胞》(The Plant Cell)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所品质分子改良课题组的研究论文。该研究发现花序分枝正调控因子STM3与负调控因子J2在花序分生组织和花分生组织中共同发挥作用,调控花序分枝数。番茄花序分枝。中国农科院供图据介绍,花序分枝数量决定果实数目,同时影响果
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究(二)
3. PHB与HIRA复合体相互作用为了研究清楚PHB在hESC中如何发挥作用,研究者采用IP和MS的技术发现除了线粒体的一些相关蛋白外,HIRA也与PHB相互作用。进一步研究发现,PHB结构域介导了PHB与HIRA的结合。由于HIRA复合体的成员还有UBN1和CABIN1,研究者继续研究了PHB