RNA介导的基因沉默实验

实验材料 pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒 dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材 PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤 一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 cDNA 序列或预测的基因序列设计引物,用反转录-PCR ( RT- PCR) 方法扩增 cDNA 上的一部分序列。如果没有目的基因的基因组序列,可以用其他物种中基因的序列去搜索已知序列的 cDNA。如果目的基因是多基因家族的成员,就需要与家族成员进行多重比较以指导 PCR 引物的设计。要扩增的基因区域以及它与其他基因的相似性决定了该 RNAi 载体靶向单个 mRNA 还是多个相关基因的转录产物。( 2 ) 扩增编码区和非编码区(UTR ) 都能获得好的沉默效果。由于沉默机制依靠序列同源性,因此相关的 mRNA ......阅读全文

RNA介导的基因沉默实验

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RNA介导的基因沉默实验

实验材料 pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒 dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材 PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤 一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 c

RNA介导的基因沉默实验

实验材料pGEM-T 载体                                                                  DNA 模板                                                          试剂、试剂盒d

前核糖体-RNA-(prerRNA)-介导技术

2022年1月4日,西湖大学俞晓春团队在Cell Research 在线发表题为“Pre-ribosomal RNA reorganizes DNA damage repair factors in nucleus during meiotic prophase and DNA damage res

纳米介导双链RNA可防治番茄潜叶蛾

近日,针对新发重大入侵害虫番茄潜叶蛾,中国农业科学院植物保护研究所农业入侵生物预防与监控创新团队研发了纳米介导双链RNA的应用体系,为后续利用RNA干扰技术防治番茄潜叶蛾奠定了基础。纳米载体递送dsRNA防控番茄潜叶蛾示意图。中国农科院供图番茄潜叶蛾是世界检疫性害虫,主要以幼虫潜食危害番茄、马铃薯等

曹雪涛阐明新型长非编码RNA介导固有免疫的反馈调节机制

  宿主的固有免疫系统通过模式识别受体(pattern recognition receptors,PRRs)感应入侵病原体激活免疫应答从而达到清除病原体的目的。针对于RNA病毒的入侵,RIG-I(retinoic acid-inducible gene-I)受体识别胞质病毒RNA并产生I型干扰素(

上海生科院发现小分子RNA靶基因介导植物抗热途径新机制

  4月11日,中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所何玉科研究组在Plant Cell 杂志上在线发表题为HEAT-INDUCED TAS1 TARGET1 Mediates Thermotolerance via HEAT STRESS TRANSCRIPTION FACTOR

光活化的核苷酸类似物介导的RNA蛋白的交联实验

光化学交联技术是研究核搪核蛋内复合物中 RNA 与蛋白的相互作用的有效手段。 其基本原理是未经任何化学修饰的 RNA -蛋白天然复合物在短波长紫外线(254 nm ) 照射时,RNA 中的核苷酸和蛋白质中的氨基酸会产生光化学反应,转变为活性状态,进而形成分子间共价交联。本实验来源「RNA 实验指导手

补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间作用实验

基于补骨脂素光化学反应的 RNA-蛋白分子复合物分析法,能够在数据相对缺乏的情况下分析生理条件下的 RNA-蛋白复合物的拓扑构象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验材料蛋白酶K试剂、试剂盒变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙

我国学者研制CRISPRCas13a介导的精确定点RNA编辑人工机器

   国际学术期刊《Nucleic Acids Research》在线发表了中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所李轩研究组合作完成的题为“Implementation of the CRISPR-Cas13a system in fission yeast and its repurp

染色质重塑因子PKL在RNA介导的DNA甲基化中的功能

  5月31日,《基因组生物学》(Genome Biology)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心张蘅研究组题为The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation

补骨脂素介导光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用

            实验材料 蛋白酶K 试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液 非变性胶电泳缓冲液 结合缓冲液

研究提出核酸内切酶DIS3介导的环形RNA降解机制

  2月17日,《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组与复旦大学杨力研究组合作完成的关于内源环形RNA降解的最新研究成果。该研究解析了生理条件下环形RNA被核酸内切酶DIS3监控降解的新机制,实现了对环形RNA“生老病死”过程中特异调控及

光活化的核苷酸类似物介导的RNA蛋白的交联实验

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光活化的核苷酸类似物介导的RNA蛋白的交联实验

实验方法原理 光化学交联技术是研究核搪核蛋内复合物中 RNA 与蛋白的相互作用的有效手段。 其基本原理是未经任何化学修饰的 RNA -蛋白天然复合物在短波长紫外线(254 nm ) 照射时,RNA 中的核苷酸和蛋白质中的氨基酸会产生光化学反应,转变为活性状态,进而形成分子间共价交联。实验材料

补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作...

补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用实验实验材料 蛋白酶K试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙二胺过硫酸铵AMV 反转录酶及反应缓冲液磷酸钠8-羟基补骨脂素13-二碘丙烷碳酸钾丙酮石油醚乙酸乙酯硫酸钠硅胶三氟乙

科学家完成CRISPRCas13a介导的精确定点RNA编辑的人工机器

  5月31日,国际学术期刊Nucleic Acids Research 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所李轩研究组合作完成的题为Implementation of the CRISPR-Cas13a system in fission yeast and its r

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互...

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用实验实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。实验材料 RNA试剂、试

补体介导的细胞毒实验——补体介导法

细胞毒实验可应用于:(1)检查细胞膜抗原;(2)鉴定抗体的特异性。实验方法原理带有特异抗原的靶细胞(如正常细胞、肿瘤细胞、病毒感染细胞)与相应抗体结合后,在补体的参与下,引起靶细胞膜损伤,导致细胞膜的通透性增加、细胞死亡。染料(例如:伊红-Y、台盼蓝)可通过细胞膜进入细胞内使细胞着色,故可用于指示死

METTL16介导通过阻碍对剪接位点的识别从而抑制RNA剪接

  RNA m6A修饰是目前RNA表观遗传领域研究的热点,对于m6A的甲基化酶和去甲基化酶,相信大家也是耳熟能详。事实上,大名鼎鼎的METTL3仅能结合约22%的m6A位点,这提示还有其他m6A甲基化酶。确实,在METTL3之后,METTL16也被鉴定为m6A甲基化酶,但是它的底物远不如METTL3

亚甲基蓝介导光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用

亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA相互作用

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病毒介导基因转移

病毒介导基因转移:前述的化学和物理方法都是通过传染方式基因转移。病毒介导基因转移(viral mediatedgene transfer)是通过转换方式完成基因转移,即以病毒为载体(vector),将外源目的基因通过基因重组技术,将其组装于病毒上,让这种重组病毒去感染受体宿主细胞,这种病毒称为病毒运

脂质体介导的真核细胞转染实验——质体介导短暂表达

用脂质体将DNA导人各种真核细胞的效率比其他转染方法更高,重复性更好。实验材料哺乳动物细胞试剂、试剂盒质粒DNA完全培养基氯化铯DMEM仪器、耗材培养皿培养箱聚苯乙烯管实验步骤1.  按5×105细胞/孔的量在六孔板中接种指数期生长的细胞,在37℃ 5%CO2培养箱中 培养过夜,直至细胞80%汇片。

科学家开发逆转座子基因工程新技术 实现全RNA介导的基因精准写入

  基因组DNA是生命的蓝图,对基因组DNA实现任意尺度的精准操作代表对生命蓝图进行修改绘制的底层能力,是基因工程技术发展的核心。以CRISPR基因编辑技术为代表的技术进步实现了基因组单碱基和短序列尺度的精准编辑,基本解决了基因组精准编辑的挑战。然而,如何针对应用场景的需求,实现大片段DNA在基因组

农杆菌介导法概述

  农杆菌介导法起初只被用于双子叶植物中,农杆菌的介导转化在一些单子叶植物(尤其是水稻)中也得到了广泛应用。此外,生物技术学家还可以通过发根农杆菌转化,在液体培养基中培养高密度的根,作为一种在转基因植物中获得大量蛋白质的方法。  农杆菌Ti质粒的T-DNA可高效率地整合到植物受体细胞的染色体上并得到

农杆菌介导法简介

  农杆菌是普遍存在于土壤中的一种革兰氏阴性细菌,它能在自然条件下趋化性地感染大多数双子叶植物的受伤部位 [1] ,并诱导产生冠瘿瘤或发状根。根癌农杆菌和发根农杆菌中细胞中分别含有Ti质粒和Ri质粒,其上有一段T-DNA,农杆菌通过侵染植物伤口进入细胞后,可将T-DNA插入到植物基因组中。因此,农杆

农杆菌介导水稻转化

实验概要本实验介绍了农杆菌介导的水稻转化。主要试剂GUS染色液:100 mmol/L NaPO4 (pH7.0);0.1% Triton X-100;10 mmol/L EDTA;0.5 mmol/L亚铁氰化钾头抱霉素,乙醇,次氯酸钠溶液主要设备高速离心机,培养箱,人工气候室实验材料水稻种子实验步骤

细胞介导免疫的定义

细胞免疫又称细胞介导免疫。狭义的细胞免疫仅指T细胞介导的免疫应答,即T细胞受到抗原刺激后,分化、增殖、转化为致敏T细胞,对抗原的直接杀伤作用及致敏T细胞所释放的细胞因子的协同杀伤作用。广义的细胞免疫还应该包括原始的吞噬作用以及NK细胞介导的细胞毒作用。细胞免疫是清除细胞内寄生微生物的最为有效的防御反

抗体介导的调理作用

  ADCC,antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity 抗体依赖的细胞介导的细胞毒性作用。简而言之,就是有些杀伤性细胞在抗体的作用下产生的细胞杀伤作用。其中最主要发挥作用的细胞是NK细胞,它的表面有抗体Fc段受体,在与抗体Fc段结合的情况下可以直接杀