单核测序方法精确捕获潜在“致病”的人类大脑细胞类型

细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。根据加州大学旧金山分校(UCSF)对人死后脑组织的研究,发现特定脑细胞中基因活性的变化与自闭症患儿的严重程度有关。作者认为,通过了解细胞基因表达的具体变化对疾病的症状的贡献,改变大脑回路的功能,为治疗提供了重要基础。 近年来,科学家们已经了解到自闭症谱系障碍(ASDs)通常是由发育中的大脑自我连接的遗传指令变化引起的,始于怀孕中期,一直持续到幼儿时期。对自闭症患者来说,这些错乱的指令所产生的成熟大脑回路是如何不同的,或者这些变化是如何导致社交沟通困难、受限的重复性行为以及定义这种紊乱的其他症状,目前还不太清楚。新研究的作者说,这是目前没有药物能逆转或治疗这些症状的原因之一。 “确定在怀孕或子宫内发生的基因变化对了解自闭症的原因很重要,但这些见解不太可能......阅读全文

PNAS:单细胞测序绘制大脑的细胞图谱

  斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其同事本周在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表文章,介绍了人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果。  研究小组对近500个成人或胎儿脑细胞进行了单细胞RNA测序。利用这种方法,他们能够鉴定出大脑中所有主要的细胞类型,并确定神经元的亚型。他们还观察了

单核测序方法精确捕获潜在“致病”的人类大脑细胞类型

  细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。根据加州大学旧金山分校(UCSF)对人死后脑组织的研究,发现特定脑细胞中基因活性的变化与自闭症患儿的严重程度有关。作者认为,

基于单细胞RNA测序绘制人类大脑高分辨率免疫细胞图谱

  近日,在德国弗赖堡大学医学中心科学家的指导下,一个联合研究团队利用单细胞RNA测序技术绘制了首个人类大脑高分辨率免疫细胞图谱!有史以来第一次证明大脑中的小胶质细胞(即吞噬细胞)具有相同的核心特征,并会根据大脑功能需求进行适应性表达,揭示了小胶质细胞的时间和空间异质性。2月14日,相关研究成果发表

单细胞测序需要准备什么再去测序

DNA测序的测序原理: DNA测序是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。

大脑细胞也要“试镜”

   几十年来,神经学家一直在想,大脑如何能在不需要成长或扩大的情况下,继续学习新技能。有证据表明,脑细胞(神经元、突触和神经胶质细胞)的数量在人们学习之初会增加,但许多最终会被修剪掉,或者被分配到其他角色中去。不过,德国和瑞典联合研究团队近日在《认知科学趋势》上报告了一个新观点:大脑的膨胀或者收缩

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。

单细胞测序方法汇总

单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且-前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

Nature:单细胞测序(下)

  随着技术的飞速发展,成本大大降低,使得基因组测序成为常规技术。然而,大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序,它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。   该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序,研究小

Nature:单细胞测序(上)

  Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年,冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织,一并将这些DNA进行测序,生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

单细胞测序方法介绍

单细胞RNA测序(scRNA-seq)作为一种全基因组测序的方式,在单细胞层面广泛用于确定细胞类型和细胞变异的鉴定。Namocell单细胞分离仪可以通过细胞标记CD27以及一种细胞活性的染料,来分选出单个活的B细胞。通过分析分离后的单细胞基因表达情况,对比静息记忆B细胞,可以从单细胞层面研究基因表达

什么是单细胞测序?

单细胞测序是一种能够在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行分析的技术。通过单细胞测序,可以:揭示细胞的异质性:了解即使是看似相同的细胞群体中,每个细胞在基因表达、染色质可及性等方面的独特特征。发现新的细胞类型和状态:识别出传统方法难以区分的稀有细胞类型以及细胞在不同生理或病理条件下的特殊

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

干细胞再生让大脑“年轻”

  科学家曾认为哺乳动物在进入成年期时所有神经元都已形成,直到上世纪60年代才发现,成年人大脑的某些部位依旧会产生新的神经元,而上世纪90年代的研究则进一步证实了这些神经元的来源和功能。近期,研究人员在小鼠中发现神经祖细胞的单一谱系参与了胚胎期、出生后早期和成年期海马区的神经发生,并且这些细胞在小鼠

干细胞再生让大脑“年轻”

  科学家曾认为哺乳动物在进入成年期时所有神经元都已形成,直到上世纪60年代才发现,成年人大脑的某些部位依旧会产生新的神经元,而上世纪90年代的研究则进一步证实了这些神经元的来源和功能。近期,研究人员在小鼠中发现神经祖细胞的单一谱系参与了胚胎期、出生后早期和成年期海马区的神经发生,并且这些细胞在小鼠

促进睡眠的大脑细胞

  近日,约翰霍普金斯大学的研究人员在小鼠大脑发现了一类神经元,它能关闭促觉醒神经元(wake-promoting neurons),可能在促进睡眠过程中扮演着重要角色。研究人员表示,新发现的脑细胞位于下丘脑未定带(zona incerta),或能为治疗睡眠障碍,如失眠和嗜睡症提供新的药物靶点。  

老鼠大脑惊现“速度”细胞

  诺贝尔奖得主May-Britt Moser 和她的一个实验对象 图片来源:Kavli Institute/NTNU  一种寻找多时的神经系统“速度计”在老鼠中现身:一组当老鼠快速移动时会迅速放电,当它们慢吞吞行进时放电速度变慢的专用神经元。  这些细胞能帮助人们了解自己身处何地以及曾到过哪里。它

时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异

时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别:空间信息获取普通单细胞测序技术:通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术:能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术:难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作

时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别

时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别:空间信息获取传统单细胞测序:通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息,只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序:能够在测定单细胞基因表达等信息的同时,明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序:难以直观地揭示基于

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱

  来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个

时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术有何不同?

时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术主要有以下几个方面的不同:空间信息获取传统单细胞测序技术通常无法提供细胞在组织中的空间位置信息,只是对分离的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序技术能够在获取单个细胞基因表达等信息的同时,明确细胞在组织中的具体位置。细胞间相互作用研究传统技术难以直接揭示细

单细胞测序的临床应用

近期精准医学的进展集中在发展基于基因组学的诊断和治疗。这些方法通常包括从患者的组织样本中生成DNA或RNA序列信息,并分析它以确定可用于诊断、预后或通知临床管理的特定特征。‘bulk’一词指的是从大量细胞中集体生成基因组数据的方法,或者在无细胞DNA的情况下,来自许多细胞的基因组材料。因此,这些基因

研究发现胶质细胞影响大脑老化

  老年大脑和年轻大脑之间的差异并不在于神经元的数量,而在于一种被称作胶质细胞的支持细胞的存在和功能。在近日刊登于《细胞—通讯》期刊的一项研究中,研究人员分析了年龄在16~106岁的480人死后的大脑样本,发现一个人的胶质细胞的状态在多年内能保持一致性,以至于能被用来预测人的年龄。这项研究为更好地理