HLA基因分型方法：PCR－RFLP法
PCR－RFLP法1）提取细胞总DNA方法同前。 2）PCR扩增引物的设计1．引物长度一般为15～30bp，G＋C含量应在45％～55％之间。2．应避免连续出现4个以上的单一碱基。3．不能含有自身互补序列。4．两个引物之间不应有多于4个的互补或同源碱基，不然会形成引物二聚体。5．与非特异扩增序列的同源性应小于70％，或少于连续8个互补碱基。6．扩增HLA-D区基因多态性区段的引物应在该区第二外显子或高变区的边缘。 3）PCR扩增1．每100μl反应体系中分别加入：缓冲液10μl，引物各25pmol，DNA 1～2μg，10μl dNTPs，混合均匀后在95～97℃变性5～10min。2．加Taq DNA聚合酶2U，液体石蜡50μl覆盖放置水分蒸发，将样品置PCR扩增仪中完成扩增反应，变性，退火，延伸温度时间及Mg2＋的浓度随扩增引物及区段的不同而改变。 4）限制性内切酶消化取5μl PCR产物分别用......阅读全文
应用非标记探针法进行基因分型（六）
外显子14：多重探针分析 主要实验的外显子14， 两个野生型的探针同时用于一个反应，用来检测所有已报道的外显子14的突变，同时消除密码子836（p.S836S）多态性（图4；a和b；表3；补充表5；http://jmd.amjpathol.org）。WT14A探针在65℃-76℃
应用非标记探针法进行基因分型（三）
高分辨率熔解 在高分辨率熔解仪器HR-1（爱荷华科技，盐湖城，犹他州）上进行分析，将LightCycle毛细管加入HR-1中，0.3℃/s加热。主要的实验中，RET外显子的扩增及非标记探针熔解数据从60℃到95℃采集。主要实验分析了每个外显子的扩增子及探针数据，除了外显子14。因为所有报道的外显子1
Illumina推出两款基因分型新产品
Illumina公司近日推出了Infinium HumanCore BeadChip系列产品。Infinium HumanCore和Infinium HumanCoreExome BeadChip芯片的内容是与一些顶尖的研究所共同开发，支持经济高效的大规模基因分型和筛选研究。基于Illu
应用非标记探针法进行基因分型（四）
外显子10和11：多重突变热点MEN2A和FMTC的主要突变位于外显子10（密码子609、611、618和620）和11（密码子630和634），且野生型半胱氨酸的密码子DNA序列“TGC”发生单核苷酸改变。外显子10和11报道的序列变化>40（表1）。RET10外显子的主要实验包括两个单独的实验和
应用非标记探针法进行基因分型（一）
RET原癌基因单个碱基的突变可以引发多发性内分泌腺瘤2型。RET突变传统的基因分型方法是外显子测序。一种闭管操作的基因分型方法已经成熟，此方法用的是一种饱和DNA染料，非标记探针及高分辨率熔解扩增子分析。此方法需要两个连续的聚合酶链式反应阶段，主要的和第二次实验。主要的实验共用7个反应和8个非标记探
应用非标记探针法进行基因分型（二）
材料和方法样品 此报道中用到的野生型RET基因的DNA基因组样品或有RET序列变化的样品在以前描述过。RET基因序列变化改变RET蛋白的功能引发MEN2综合症的是突变，然而RET序列改变不会引发MEN2综合症是多态。不能确定意义的稀有的或不会引起MEN2综合症的RET基因序列变化成为“序列
高通量测序基因分型系统规范－即将实施！
国家标准《信息技术 生物特征识别 高通量测序基因分型系统规范》将于2023年12月1日正式实施。 该标准由TC28（全国信息技术标准化技术委员会）归口，TC28SC37（全国信息技术标准化技术委员会生物特征识别分会）执行 ，主管部门为国家标准化管理委员会。 主要起草单位 深圳华大法医科技有限公
应用非标记探针法进行基因分型（七）
一般来说，用特定突变探针产生1/3结果。首先，当突变序列与特定突变探针互补时，突变等位基因的熔解Tm要高于野生型（△Tm为-2℃至-5℃）。第二，当突变在相同位置但是与特定突变探针序列不互补时，突变等位基因被野生型等位基因相似的Tm值及稳定性所遮蔽（野生型等位基因Tm±0.5℃）。在这种情况下，没有
人类血小板抗原1～4系统基因分型
关键词： PCR-SSP；人类血小板抗原；基因分型 摘要 目的：建立人类血小板抗原1～4系统序列特异性引物（PCR-SSP）分型方法。方法：合成14条引物，采用PCR-SSP方法对25名健康献血者的HPA-1～4系统进行基因分型；分型结果与采用等位基因特异性寡核苷酸点杂交（PCR-ASO）获得的
人类血小板抗原1～4系统基因分型
迄今，国际上已报道了9个血小板特异性抗原系统，包括人类血小板抗原（HPA）系统1～8以及Naka抗原。这些抗原都是在血小板输注和怀孕介导的同种免疫过程中被发现的。在现代临床输血工作中，为了能给新生儿同种免疫血小板减少症（NAITP）、输血后紫癜（PTP）以及血小板输注无效（PTR）等患者提供正确、及
高通量基因分型检测平台及其应用案例
Agripheno™高通量基因分型检测平台包括高通量Oktopure DNA提取仪、Nexar®模块化内联液体处理与分析系统、Soellex®高通量PCR水浴热循环系统和Araya®内联荧光检测系统。Oktopure DNA提取仪采用磁珠的方法提取DNA，通量达到800个样本/3小时。同时，适用于多
磷酸二酯酶的基因分型
分子克隆技术揭示磷酸二酯酶(phosphodiesterases，PDEs)是一个多基因大家族，开发选择性的磷酸二酯酶抑制剂将为多种疾病的治疗开辟新的思路。PDEs是一个多基因的大家族，它包括11型共30余种具有不同底物专一性、酶动力学特征、调控特点以及细胞与亚细胞分布区域不同的磷酸二酯酶同功酶 P
2bRAD基因分型样品的制备
实验概要本实验介绍了2b-RAD基因分型样品的制备流程。主要试剂ALFI（(Fermentas, cat no. ER1801）T4连接酶（NEB, cat no. M0202）ATP（NEB, cat no. P0756）DNA聚合酶（(NEB, cat no. M0530）dNTP（NEB, c
乙肝病毒基因分型检测技术
检测盲点 “千人一方、万人一药”局面难改变 93.7%的患者长期得不到有效治疗 中华医学会肝病学会等权威肝病机构，在北京、上海、天津、河北、湖南、广东等全国20多个地区开展的一项针对万人乙肝患者治疗效果的调查显示，检测上的局限性是导致乙肝长期治疗效果不好的主要原因。 由于治疗过程中缺乏对乙肝病毒
组织相溶性抗原基因分型中三种DNA快速抽提法比较
血液DNA抽提的质量和速度是影响组织相溶性抗原(HLA)基因分型效果的一个主要因素，目前普遍采用的标准酚-氯仿抽提法，因耗时较长，难以满足临床需求。为此，我们建立了NP-40法及辛酸法，进一步缩短时间，简化了操作步骤。现将NP-40法、辛酸法与标准酚-氯仿抽提法对比研究结果报告如下。一、资料和方法本
研究人员提出基因组结构变异检测和分型新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
MD应用文章下载:SNP基因分型高通量检测方法新思路
MD应用文章下载:SNP基因分型高通量检测方法新思路SNP基因分型高通量检测方法新思路单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90%以
PCR扩增样本DNA的HLA基因片段
一、PCR扩增体系1. 1.0uM 引物2. 300ng待测样本基因组DNA3. 2.0U Taq多聚酶4. 200uM 各种dNTP5. 用1 X PCR缓冲液（10mM Tris-HCl，pH8.3，50mM KCl，1.5mM MgCl2，0.01%明胶）调至总体积100ul，并用50ul矿物
HLAA基因编码功能及结构描述
HLA-A属于HLA I类重链相似度。这一类分子是由重链和轻链（β-2微球蛋白）组成的异二聚体。重链锚定在膜上。I类分子通过呈现内质网腔中的肽在免疫系统中起着中心作用。几乎在所有细胞中都有表达。重链约45kDa，其基因包含8个外显子。外显子1编码先导肽，外显子2和3编码α1和α2结构域，两者结合肽，
HLAA基因编码功能及结构描述
HLA-A属于HLA I类重链相似度。这一类分子是由重链和轻链（β-2微球蛋白）组成的异二聚体。重链锚定在膜上。I类分子通过呈现内质网腔中的肽在免疫系统中起着中心作用。几乎在所有细胞中都有表达。重链约45kDa，其基因包含8个外显子。外显子1编码先导肽，外显子2和3编码α1和α2结构域，两者结合肽，
HLAA基因的结构特点和作用
HLA-A属于HLA I类重链相似度。这一类分子是由重链和轻链（β-2微球蛋白）组成的异二聚体。重链锚定在膜上。I类分子通过呈现内质网腔中的肽在免疫系统中起着中心作用。几乎在所有细胞中都有表达。重链约45kDa，其基因包含8个外显子。外显子1编码先导肽，外显子2和3编码α1和α2结构域，两者结合肽，
单精子分型实验——－－精子分型数据分析
实验步骤一、须考虑的样本含量0.5 cM 的遗传学距离转变为 0.005 的重组率，表明要发生 5 起重组事件，平均需要观察 1000 例 scoreable 减数分裂。根据泊松分布（假定重组事件间相互独立、互不干扰），那么在上述事例中，有约 56% 的可能性观察到至少 5 起重组事件，有约 88%
Nature－Methods提出癌症分型新方法
肿瘤几乎从来就没有共享过完全相同的遗传突变，这一事实使得人们为更好地将癌症类型分门别类、以及开发出更有效的靶向性治疗所付诸的科学努力面临困难重重。 在发表于9月15日《自然方法》(Nature Methods)杂志上的这篇新研究论文中，来自加州大学圣地亚哥分校研究人员提出了一种称作为基
单核苷酸多态性的基因分型
SNPs 的二态性，也有利于对其进行基因分型。对SNP进行基因分型包括三方面的内容：(1)鉴别基因型所采用的化学反应，常用的技术手段包括：DNA分子杂交、引物延伸、等位基因特异的寡核苷酸连接反应、侧翼探针切割反应以及基于这些方法的变通技术；(2)完成这些化学反应所采用的模式，包括液相反应、固相支持物
载脂蛋白e基因分型的检查过程
应用碘化钠法提取模板DNA，聚合酶链反应(PCR)特异性扩增Apo E基因含112 位和158 位氨基酸的基因序列，扩增产物用限制内切酶Hha I酶切，聚丙烯酰胺凝胶电泳后，观察酶切位点的限制性片段长度多态性(RFIP)图谱。 ApoE表型检测即可以以VLDL为样品，又可以直接以血清(或血浆)
载脂蛋白e基因分型的临床意义
异常结果：光镜、电镜检查发现ApoE缺乏鼠的视网膜内、外核层细胞数量明显降低，外核层细胞核染色质浓缩，核周空泡形成，玻璃膜增厚，弹力层不连续甚至结构不清，从而发生AMD的眼底损害。 需要检查的人群：该试验不是用于筛查普通人群的，它是在非常特殊情况下使用并提供医生额外的信息。
载脂蛋白e基因分型的正常值
载脂蛋白E主要存在于CM、VLDL、IDL和部分HDL中， 正常人血浆ApoE浓度为0.03-0.05g/L。Apo E的浓度与血浆甘油三酯含量呈正相关。
载脂蛋白e基因分型的注意事项
不合宜人群：在血脂正常的人群。 检查前禁忌：保持情绪稳定，切忌急躁、激动或闷闷不乐。 检查时要求：谨遵医嘱，配合医生。
基因分型能否指导个体化抗凝用药？
临床中华法林的剂量很难掌握，不同的患者所需剂量可能相差十倍以上。过量有致命性出血风险，而剂量太低则有血栓栓塞风险，因此选择适宜的初始剂量非常关键。目前临床上多通过检测凝血酶原时间，依据国际标准化比值（INR）指导个体化用药。个体对药物的反应差异主要源于外界环境因素改变和机体自身的遗传因素。既往
载脂蛋白e基因分型的临床意义
异常结果：光镜、电镜检查发现ApoE缺乏鼠的视网膜内、外核层细胞数量明显降低，外核层细胞核染色质浓缩，核周空泡形成，玻璃膜增厚，弹力层不连续甚至结构不清，从而发生AMD的眼底损害。 需要检查的人群：该试验不是用于筛查普通人群的，它是在非常特殊情况下使用并提供医生额外的信息。