纳米孔测序!耗资1.8亿美元的DNA“条形码”旨在发现新物种
几百年以来,生物学家都在以一种极其缓慢的速度探索新物种,描述其定义特征。如今,伴随着新一代测序技术的突破,生物学家已经可以在几个小时内确定一份样本是否为新物种,并且这一成本将有望降至几美分。这是一场由短链DNA驱动的科技革命,这段DNA我们称之为DNA“条形码(barcode)”。它们的多样性足以为我们提供物种的区分标记,并且能够与快速、廉价的便携式DNA测序仪相结合。 加拿大圭尔夫大学的Paul Hebert表示:“生物多样性科学正在进入一个黄金时代。”6月16日,Paul Hebert的研究小组将启动一项耗资1.8亿美元的全球性项目,以鉴定200多万种新的多细胞生物。此外,其他独立团队也在实验室中采用了这种方法对新物种样本进行梳理,有的甚至直接在野外使用。图:科学家利用便携式基因测序仪进行物种研究 来自意大利维罗纳大学的基因组学家Massimo Delledonne最近在婆罗洲的一个森林里进行了DNA条形码研究,并很......阅读全文
170万!复旦大学纳米孔测序仪招标项目
项目概况 复旦大学纳米孔测序仪 招标项目的潜在投标人应在复旦大学采购与招标管理系统(网址为:https://czzx.fudan.edu.cn)获取招标文件,并于2023年12月21日 09点30分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:1069-234Z20234618
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
新华社布鲁塞尔5月9日电(记者潘革平)比利时校际微电子中心(IMEC)9日发表公报说,该中心成功开发出一种能直接读取单分子DNA(脱氧核糖核酸)碱基的新型光学纳米孔器件,有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍,新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术,能以超高分辨率,实现无标记检测DN
科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来,直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在,氨基酸序列破译结果并非完全正确,甚至与真实序列有很大差异。近期,荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法,该技术能够读取蛋白质信息内容,
英一公司称研发出纳米孔基因测序技术
早上起来刷个牙,就能顺便检测自己有没有患癌症或者老年痴呆的危险。这种便利方式离我们不远了。英国一家公司首席技术官克莱夫·布朗24日在一次医学会议上说,借助纳米孔基因测序技术,有望很快实现测序仪微型化,从而使它们“无处不在”,持续监测我们的健康状况。 纳米孔基因测序技术采用微
一种全新的高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来,直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在,氨基酸序列破译结果并非完全正确,甚至与真实序列有很大差异。近期,荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法,该技术能够读取蛋白质信息内容,
哪些因素影响纳米孔测序仪的重复性?
掌上测序仪好不好?用过才知道。最近,五个试用了Oxford Nanopore MinION测序仪的实验室评估了仪器的重复性,并在开发标准操作和参考数据。这些实验室属于MinION分析和参考联盟(MARC),该联盟由MinION早期试用计划的参与者组成。目前,第一阶段的结果已经发表在开放获取期刊
科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来,直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在,氨基酸序列破译结果并非完全正确,甚至与真实序列有很大差异。近期,荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法,该技术能够读取蛋白质信息内容,
纳米孔测序联合光学测绘揭示转基因植物细节
索尔克的研究人员利用最新的DNA测序技术,在分子水平上研究植物插入新基因后会发生什么。 索尔克的研究人员绘制了具有最高分辨率的转基因植物系基因组和表观基因组图,为了精确地揭示插入一段外源DNA后,在分子水平上会发生什么。他们的研究结果发表在2019年1月15日的PLOS Genetics,阐明
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
比利时校际微电子中心(IMEC)9日发表公报说,该中心成功开发出一种能直接读取单分子DNA(脱氧核糖核酸)碱基的新型光学纳米孔器件,有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍,新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术,能以超高分辨率,实现无标记检测DNA中的遗传编码以及表观遗传变异。研究近期发
第三代高通量测序技术简介——纳米孔
第一代Sanger法为DNA测序打开了大门,但它高昂的费用限制了在大规模测序工程上的使用。当今发展迅猛的第二代高通量测序设备,包括Illumina的Solexa、Roche 454系列以及ABI的SOLiD系统等,使测序费用大幅降低到60-1美元/megabase。 它们共同的缺点是
三代测序的前奏:Illumina再诉牛津纳米孔
Illumina今天正式宣布起诉Oxford Nanopore,诉讼涉及后者在纳米孔测序相关领域涉嫌侵犯Illumina两项ZL。 Illumina同时向美国国际贸易委员会和美国南加州地方法院提出此次诉讼,起诉Oxford Nanopore侵犯其美国ZL局第8673550号和9170230号Z
武大联合团队开发纳米孔靶向测序-快速“捕获”新冠病毒
武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法(NTS),能大幅提升病毒阳性检出率,并能实现当天同时检测新冠和其他10大类、40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。 3月7日,该团队在预印版平台medRxiv发表题为《纳米孔靶向测序精准全面检测新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究论文。 既往
nanoporetech-使用纳米孔测序技术的微生物学
完整的细菌,真菌和病毒(DNA或RNA)基因组,可进行长时间的纳米孔测序。通过快速的病原体检测方法(无论是在实验室还是在野外),从环境或单一生物样品中鉴定并鉴定微生物。如果需要,还应附有抗菌素耐药性分析。使用直接RNA或cDNA方法对全长转录本进行测序,以进行准确的基因表达和转录本亚型分析。 通过长
首次!纳米孔测序让流感病毒终于“无所遁形”|-Nature
4月12日,这项研究的领导者、美国疾病控制和预防中心(CDC)的微生物学家John Barnes在给bioRxiv服务器(生命科学领域专有的预印本文献库)的预印本(a preprint posted)中介绍了这项工作,他说:“我们第一次可以真正开始观察基因组在其原始状态的本质,这确实开始开辟了很
2016国家自然科学基金:纳米孔测序技术
来自国家自然科学基金委员会的消息,8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学基金项目400项、青年科学基金项目16112项、地区科学基金项目2872项、海外及港澳学者合作研究基
拉曼光谱应用:新型光学纳米孔器件有望用于快捷测序
比利时校际微电子中心(IMEC)9日发表公报说,该中心成功开发出一种能直接读取单分子DNA(脱氧核糖核酸)碱基的新型光学纳米孔器件,有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍,新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术,能以超高分辨率,实现无标记检测DNA中的遗传编码以及表观遗传变异。研究近期发
纳米孔测序重大升级,超高准确度,向临床诊断迈进!
近年来,第三代基因测序技术发展迅速,在基因组学研究以及临床疾病诊断领域备受青睐。该领域上游企业英国Oxford Nanopore Technologies(以下简称“ONT”)因其测序技术在样本处理以及成本等方面占据较大优势,而受到国内基因测序服务企业的钟爱。相较于二代测序,三代测序技术拥有单分子无
中国科学家提出纳米孔糖测序技术路线图
基于在纳米孔糖测序这一前沿方向的率先探索和重要进展,中国科学院上海药物研究所研究员高召兵、副研究员夏冰清团队应邀对纳米孔糖测序的发展和应用前景进行展望,给出了纳米孔糖测序仪器的设计方案,并首次系统性提出了可能的纳米孔糖测序路线。相关综述发表于《化学科学》。糖类结构的精准解析是研究糖类在生命过程中的作
利用纳米孔测序技术揭示基因表达的染色质调控基础
作为染色质的基本单元,核小体由大约147 bp的DNA和组蛋白八聚体(H2A, H2B, H3和H4)组成。核小体的动态定位和折叠组织会产生两种不同的染色质状态:“开放”(open)和“闭合”(closed)。核小体的定位和染色质状态的动态变化对以DNA为模板的生物学过程(比如,转录、DNA复制
国产纳米孔测序仪市场化加速,这家企业做对了什么?
“目前,已有超过100个机构使用齐碳QNome测序平台。” 在6月28日举行的新品发布会上,齐碳科技联合创始人谢丹博士回顾了公司商业化探索的第一项成绩单。QNome-3841是齐碳科技研发的国内首款商业化纳米孔测序仪,在2021年12月正式面市,随后被迅速应用到疾病控制与预防、病原体研究、动物疫病防
INCSeq:提高纳米孔测序准确性的新方法
新加坡基因组研究院(GIS)的研究人员开发了一种方法,称为INC-Seq,能够提高牛津纳米孔技术公司掌上测序仪MinIon的测序准确性。目前他们正努力改进该方法,将它应用到复杂样本的16S测序、RNA测序以及基因组复杂区域测序等中。 研究人员在近日发表于《Giga Science》的文章中描述
牛津纳米孔收购加拿大Northern-Nanopore-扩张固态纳米孔领域
近日,牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore)表示收购加拿大生物技术初创公司Northern Nanopore Instruments(NNi),这家公司开发了一种固态纳米孔制造技术。 本次收购没有披露财务条款。 据Oxford Nanopore介绍,NNi专门从事低成本、精确的
固态纳米孔:下一代DNA测序技术原理、工艺与挑战
科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的《科技文献
纳米孔测序企业「今是科技」完成近亿元B++轮融资
3月3日消息,近日,国内纳米孔测序技术领军企业今是科技宣布完成近亿元B++轮融资。本轮融资由国生资本(成都天府国际生物城投资公司)领投,川创投跟投,募集资金将用于加速全球首个“单碱基纳米孔测序”(SNS)技术平台的商业化落地,推动其在临床诊断、科研服务及公共卫生领域的规模化应用。 今是科技成立
基于纳米孔的第三代测序技术:每个人支付得起的基因测序
典型的纳米孔测序过程示意图 最近的一项研究发现,在低NaCl浓度下长链DNA更利于纳米孔测序,这为纳米孔测序技术的发展提供了线索。 这篇名为“链长对DNA构象及摩擦行为的影响”的研究论文发表于《中国科学:技术科学》英文版2013年第12期,从摩擦学角度初步探讨了不同链长DNA在纳米孔测序
可控介电击穿纳米孔制备与纳米孔捕获机制研究取得进展
固态纳米孔作为单分子检测领域的变革性工具,凭借无标记、实时分析的核心优势,为DNA、RNA及蛋白质等生物分子的精准表征提供了全新途径,在生命科学基础研究与临床诊断领域具有重大应用潜力。在固态纳米孔可控制备领域,传统可控介电击穿技术因存在制备随机性强、精度调控难等问题,限制了其产业化应用。针对这一瓶颈
中国首发纳米孔RNA直接测序揭示其在全长转录本中的作用
近日发表在RNA Biology上的研究中,来自中国科学院北京生命科学研究院、动物研究所及中国科学院大学等多家单位的科学家们首次通过5’-Cap捕获法对蝗虫的 RNA直接测序,揭示了Piwi 外显子化模式的广泛建立以及蝗虫转录组中的转座子(TEs)对RNA剪接的重要作用。 转座子(TEs)在后
英研发第三代基因测序技术-用纳米孔单分子读取
基于纳米孔的单分子读取技术,英国牛津纳米孔公司成功研发出第三代基因测序技术。该测序技术读取数据更快、有望大大降低测序成本,改变个人医疗的前景。 当前,基因测序工作费时且昂贵,测序时,分子必须进行多次复制(这一步被称为扩增),同时进行荧光示踪标记,这一过程会带来错误,因此,一个基因要被测序多
DNA测序新突破:新纳米孔通过电流变化检测DNA序列
在个体化医疗前景的诱惑下,研究人员将研发出更有效的基因测序新方法视为首要任务。如今,宾夕法尼亚大学物理学家利用固态的纳米孔区分单链DNA分子,这一有前景的技术,在DNA穿过纳米孔时,通过检测电流变化进而读取DNA序列。相关研究发表在《ACS Nano》期刊上。 领导这项研究的是艺术与科学学院物
纳米孔测序!耗资1.8亿美元的DNA“条形码”旨在发现新物种
几百年以来,生物学家都在以一种极其缓慢的速度探索新物种,描述其定义特征。如今,伴随着新一代测序技术的突破,生物学家已经可以在几个小时内确定一份样本是否为新物种,并且这一成本将有望降至几美分。这是一场由短链DNA驱动的科技革命,这段DNA我们称之为DNA“条形码(barcode)”。它们的多样性足