阐明泛素连接酶RNF220在脊椎动物神经系统发育中的功能
胚胎细胞逐步分化形成有序空间结构的过程称为图式形成（pattern formation）。在多细胞生物中，细胞间信号分子在胚胎的图式形成中起着关键作用。其中有些可扩散性诱导分子形成浓度梯度，浓度依赖性同时决定多种细胞的分化命运，称为“形态发生素”（morphogen）。在脊椎动物腹侧神经管的图式形成中，Shh信号就起着形态发生素的作用。脊椎动物的腹侧神经管依次形成V0-V3四种中间神经元和运动神经元。Shh在神经管最腹侧的基板细胞和神经管下方的脊索中表达，Shh蛋白沿神经管背腹轴形成一个由腹侧到背侧递减的浓度梯度。不同活性的Shh信号可激活或抑制不同转录因子的特异性表达，最终决定不同区域神经细胞的分化命运。在这一过程中，Shh信号的活性主要是由调控转录因子Gli2、Gli3介导的。在低Shh信号条件下，Gli2、Gli3被部分截短，行使转录抑制因子（GliR）的功能；而在Shh信号激活时，Gli的加工被抑制，全长形式的Gl2......阅读全文
泛素化研究取得进展
泛素化是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下，将细胞内的蛋白质分类，从中选出靶蛋白分子，对靶蛋白进行特异性修饰的过程。泛素化在蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解中起重要作用，同时参与细胞周期、增殖、凋亡、分化、转移等几乎一切生命活动的调控。泛素化与肿瘤、心血管等疾病的发病密切相
简述泛素化的类型
E1,E2,E3对底物的泛素化可形成几种不同的泛素化底物。有的底物蛋白只能被单泛素化，如H2B；有的底物蛋白有多个赖氨酸残基，在合适条件下会被多位点单泛素化；还有一些蛋白在单个赖氨酸位点会形成多聚泛素链，这种多聚泛素链可以根据连接泛素链的赖氨酸位点的不同可以分为单一、混合以及树枝状的结构。
泛素化的主要作用
泛素化是指泛素（一类低分子量的蛋白质）分子在一系列特殊的酶作用下，将细胞内的蛋白质分类，从中选出靶蛋白分子，并对靶蛋白进行特异性修饰的过程。这些特殊的酶包括泛素激活酶、结合酶、连结酶和降解酶等。泛素化在蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解中都起着十分重要的作用。同时，它也参与了细胞周期、增殖、凋亡、
同济大学Cell－Res揭示泛素化修饰与肿瘤微环境关联的奥秘
mTORC1作为微环境中营养信号的感应器，它能够感应微环境中的氨基酸、生长因子、葡萄糖、胆固醇等信号，进而调控细胞及机体内几个关键的过程：糖代谢、蛋白质代谢，脂类代谢以及细胞自噬等【1, 2】。但是，当mTORC1信号通路的关键蛋白（mTOR、GATOR、PTEN、TSC、LKB、AMPK等）发
组蛋白甲基化修饰研究再获突破
日前，复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展，相关成果发布在《分子细胞》上，该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。 组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰，参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是
LYTAC－与靶向蛋白降解技术讲解（二）
庞大的蛋白降解家族 当然，“蛋白降解家族”可不止 PROTAC，LYTAC 两个成员，还有很多其他的新兴靶向蛋白技术，如光控靶蛋白降解 (photo-PROTAC)、分子胶 (Molecular Glue)，自噬介导的靶蛋白降解 (AUTAC)、利用 TRIM21 E3 连接酶靶向降解蛋白的 Tri
如何进行蛋白质的泛素化和去泛素化鉴别
主要有四步： 1.泛素的活化：泛素甘氨酸端的羧基连接到泛素活化酶E1的巯基，这个步骤需要以ATP作为能量，最终形成一个泛素和泛素活化酶E1之间的硫酯键。 2.E1将活化后的泛素通过交酯化过程交给泛素结合酶E2。 3.泛素连接酶E3将结合E2的泛素连接到目标蛋白质上并释放E2，形成特定的泛素化的蛋白质
研究开发出泛素剪切技术，提供关于泛素信号转导新见解
澳大利亚的研究人员是世界上最早接触到一种了解复杂变化的新方法的人之一，这些变化控制着蛋白在健康和疾病中如何在我们的细胞中发挥功能。 这种称为泛素剪切（ubiquitin clipping）的新型蛋白质组学技术允许人们构建蛋白如何被一种称为泛素化的过程修饰的高分辨率图谱。这种技术为理解泛素化在细
如何进行蛋白质的泛素化和去泛素化鉴别
主要有四步： 1.泛素的活化：泛素甘氨酸端的羧基连接到泛素活化酶E1的巯基，这个步骤需要以ATP作为能量，最终形成一个泛素和泛素活化酶E1之间的硫酯键。 2.E1将活化后的泛素通过交酯化过程交给泛素结合酶E2。 3.泛素连接酶E3将结合E2的泛素连接到目标蛋白质上并释放E2，形成特定的泛素化的蛋白质
研究发现泛素信号调节细胞自噬、感应泛素胁迫新机制
5月5日，学术期刊《细胞研究》（Cell Research）正式发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所胡荣贵研究组的最新研究成果Ubiquitylation of p62/Sequestosome1 Activates Its Autophagy Receptor Func
我国学者在新型泛素化反应分子机制研究领域取得进展
图. SdeA及其与泛素复合物的结构。a）SdeA的结构域组成；b） SdeA整体结构的两个视角；c） SdeA mART结构域与泛素结合的结构；d） SdeA与泛素结合结构细节。 在国家自然科学基金项目（项目编号：31670766、21532004、2147500
PNAS：PTPA－/－PP2A复合物可作为UBE3A相关疾病治疗干预靶点
基因UBE3A编码E3泛素连接酶UBE3A，其将多聚泛蛋白链与其底物中的特定赖氨酸残基结合，调节这些蛋白质的表达和功能。UBE3A母系遗传等位基因的缺失或功能丧失突变导致Angelman综合征（AS），一种以严重发育迟缓，智力残疾，运动功能障碍和癫痫发作为特征的神经发育障碍。另一方面，UBE3A
植物所发现蛋白质SUMO化修饰调控植物的光形态建成
光形态建成是指植物发育过程中感受到光的存在之后所启动的一系列生物学变化过程。COP1作为一种泛素E3连接酶，在光形态建成的负调控中扮演核心角色。在黑暗下，COP1聚集在细胞核中并介导光形态建成的多个正向调节因子的泛素化修饰及降解；见光后，COP1活性降低，从而保证正常的光形态建成。然而，COP1
研究揭示真核细胞自噬调控新机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508113.shtm近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员张小飞团队揭示了E3泛素连接酶MARCH7通过泛素化修饰ATG14抑制自噬，导致蛋白聚集体通过自噬途径降解受阻的机制。相关成果发表于Cel
上海生科院揭示人类自闭症发生新机制及潜在治疗靶点
近日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所胡荣贵研究组的最新研究成果，以Excessive UBE3A Dosage Impairs Retinoic Acid Signaling and Synaptic Plasticity in Autism Spectrum Disor
研究揭示水稻E3泛素连接酶通过二元调控类受体激酶稳态塑造水稻高产理想穗型的分子机制
近日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心与西北农林科技大学合作，揭示了水稻E3泛素连接酶家族SINARs通过二元调控类受体激酶OsER1稳态塑造水稻高产理想穗型的分子机制，并通过特异性敲除该家族中一类特殊的兼具拮抗功能的关键节点基因SINAR1和SINAR6，打破了水稻产量性状之间的偶联性，为作物高
药界新宠：LYTAC－与靶向蛋白降解技术（二）
■ 分子胶 (Molecular Glue)：分子胶是一类诱导或稳定蛋白之间相互作用的小分子化合物，通过结合 E3 泛素连接酶并修饰其分子表面，诱导新的蛋白质间相互作用 (正常情况下两者原先没有相互作用)，并在连接酶的作用下，导致蛋白降解 。沙利度胺 (Thalidomide) 及类似物泊马度胺 (
研究揭示1433蛋白调控水稻抗病性免疫新机制
近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队揭示了一个依赖磷酸化和泛素化修饰介导的14-3-3蛋白级联免疫信号通路，阐明了水稻将细胞膜表面的病原识别信号传递至细胞核，从而抵御稻瘟菌侵染的分子机制。相关研究成果发表于《自然-通讯》。水稻是全球最重要的粮食作物之一，由稻瘟菌侵染引
研究人员发现内质网分子伴侣调控埃博拉病毒复制新机制
近日，中国农业科学院哈尔滨兽医研究所与国外高校合作，阐明了内质网分子伴侣通过内质网膜上的E3泛素连接酶RNF185调控埃博拉病毒囊膜糖蛋白合成的新机制，该研究成果发表在《自然通讯（Nature Communications）》上,并作为亮点文章推荐。 囊膜糖蛋白GP是埃博拉病毒感染和致病的关键
研究人员发现内质网分子伴侣调控埃博拉病毒复制新机制
近日，中国农业科学院哈尔滨兽医研究所与国外高校合作，阐明了内质网分子伴侣通过内质网膜上的E3泛素连接酶RNF185调控埃博拉病毒囊膜糖蛋白合成的新机制，该研究成果发表在《自然通讯（Nature Communications）》上,并作为亮点文章推荐。 囊膜糖蛋白GP是埃博拉病毒感染和致病的关键
诺华、礼来青睐，这家蛋白降解疗法初创公司有何不同？
今日，Amphista Therapeutics公司宣布完成数额为5300万美元的B轮融资。本轮融资由Forbion和Gilde Healthcare公司领投，其它投资者包括诺华风投基金（Novartis Venture Fund）和礼来公司（Eli Lilly and Company）。获得的
植物广谱抗病，这种机制已被查明
近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队基于转录组测序、酵母双杂交文库筛选和蛋白质组数据分析，获得了一个调控水稻条纹病毒侵染的新型C4HC3类型E3泛素连接酶，揭示了泛素连接酶介导的广谱抗病分子机制。相关研究结果在线发表在《植物细胞》（The Plant Cell）上。水
DNA连接酶的缺点
无3’→5’阅读校正功能，在PCR扩增过程可引起错配，30次循环错配率约0.25%。措施：选择高保真Taq酶，如Pfu。原因：Pfu具有3’→5’外切酶活性。注意：Pfu扩增产物为平末端。
DNA连接酶的特性
良好的热稳定性；70℃ 2h，残留90%活性；93℃ 2h，残留60%活性；94℃ 2h，残留40%活性。5’→3’聚合酶活性，对dATP有优先聚合活性；5’→3’外切酶活性；无3’→5’外切酶活性。
DNA连接酶的性质
大肠杆菌的DNA连接酶是一条分子量为75Ku的多肽链。对胰蛋白酶敏感，可被其水解。水解后形成的小片段仍具有部份活性，可以催化酶与NAD(而不是ATP)反应形成酶-AMP中间物，但不能继续将AMP转移到DNA上促进磷酸二酯键的形成。DNA连接酶在大肠杆菌细胞中约有300个分子，和DNA聚合酶Ⅰ的分子数
DNA－连接酶的性质
大肠杆菌的DNA连接酶是一条分子量为75Ku的多肽链。对胰蛋白酶敏感，可被其水解。水解后形成的小片段仍具有部份活性，可以催化酶与NAD(而不是ATP)反应形成酶-AMP中间物，但不能继续将AMP转移到DNA上促进磷酸二酯键的形成。DNA连接酶在大肠杆菌细胞中约有300个分子，和DNA聚合酶Ⅰ的分子数
DNA－连接酶的用途
DNA连接酶主要用于基因工程，将由限制性核酸内切酶“剪”出的粘性末端重新组合，故也称“基因针线”。人教版高中生物选修3中提到的E·coliDNA连接酶，来源于大肠杆菌，可用于连接粘性末端；T4DNA连接酶，来源于T4噬菌体，可用于连接粘性末端和平末端，但连接效率低。
DNA连接酶的用途
聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)。Taq酶扩增的PCR产物，3’末端总是带有1个非模板依赖型的突出碱基，而这个碱基几乎总是A，因为Taq酶对dATP具有优先聚合活性，故可用T载体克隆。
DNA连接酶及其应用
（一）DNA连接酶的发现环形DNA分子的发现使科学家相信一定有一种能连接这种切口的酶存在。首个DNA连接酶(ligase)——大肠杆菌DNA连接酶，是1967年发现的，是大肠杆菌基因编码。1970年，发现了T4DNA连接酶，由大肠杆菌T4噬菌体基因编码的。（二） DNA连接酶作用特点1. 连接的两条
何谓连接酶链反应？
连接酶链反应(ligase chain reaction, LCR)属于一种探针扩增技术，是依赖靶核苷酸序列的寡核苷酸探针的连接技术。这种方法应用4种寡核苷酸探针(即两对互补的引物)，当它们在体外结合到靶序列上以后，用耐热DNA连接酶将它们连接起来。两条探针被连接上以后又可以作为新的模板。由于使