基于序列保守性和蛋白质相互作用的真核蛋白质亚细胞定位预测
摘要 蛋白质的亚细胞定位是进行蛋白质功能研究的重要信息. 蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中，只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动，有效地发挥功能. 尝试了将保守序列及蛋白质相互作用数据的编码信息结合传统的氨基酸组成编码，采用支持向量机进行蛋白质亚细胞定位预测，在真核生物中5 轮交叉验证精度达到91.8 %，得到了显著的提高.点击这里进入下载页面：进入下载页面......阅读全文
怎么亚细胞定位分析
用报告基因技术呀 比如说最常用的绿色荧光蛋白GFP或者改造过的EGFP等。和目的基因构建成为融合蛋白，转入细胞中以后，用激光扫描共聚焦显微镜就可以观察到基因的亚细胞定位
关于亚细胞定位的基本介绍
亚细胞定位是查找生物大分子在细胞内的具体存在的位置，如在核内、胞质内或者细胞膜上存在。常见的亚细胞定位方法有生物信息学预测法、免疫荧光法、GFP融合蛋白表达法。 不同的细胞器往往具有不同的理化环境，它根据蛋白质的结构及表面理化特征，选择性容纳蛋白。 蛋白质表面直接暴露于细胞器环境中，它由序列
保守序列的基本信息
保守序列（Conserved Sequence）：指在进化过程中基本保持不变的 DNA 分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中的氨基酸片段。
DNA保守序列的结构特点
保守序列（Conserved Sequence）：指在进化过程中基本保持不变的 DNA 分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中的氨基酸片段。
如何做蛋白亚细胞定位实验？
生物功能的区域化是生命的一种基本现象，这种区域化是通过不同层次的系统组成，从器官到特异细胞，再到细胞内部的亚细胞结构，最后到大分子复合物。在细胞水平，蛋白在特定的时间和空间发挥作用，这种区域化的定位为蛋白发挥作用提供特定的化学环境以及所需的互作因子等。蛋白的错误定位容易导致细胞活动的紊乱。因此，了解
绿色荧光蛋白(GFP)标记亚细胞定位
一、原理利用绿色荧光蛋白(GFP)来示踪胞内蛋白的技术。利用GFP融合蛋白技术来进行活细胞定位研究是目前较为通行的一种方法，在光镜水平进行研究，不需要制样，没有非特异性标记的影响。并且GFP的分子量为27kD，经激光扫描共聚集显微镜激光照射后，可产生一种绿色荧光，从而对蛋白质进行精确定位。激光扫描共
亚细胞定位的GFP融合蛋白表达法
GFP是绿色荧光蛋白，在扫描共聚焦显微镜的激光照射下会发出绿色荧光，从而可以精确地定位蛋白质的位置。绿色萤光蛋白（GFP）是一个由约238个氨基酸组成的蛋白质，从蓝光到紫外线都能使其激发，发出绿色荧光。通过基因工程技术，绿色萤光蛋白(GFP)基因能转进不同物种的基因组，在后代中持续表达，并且能根
亚细胞定位的免疫荧光法介绍
1、直接法 将标记的特异性荧光抗体，直接加在抗原标本上，经一定的温度和时间的染色，用水洗去未参加反应的多余荧光抗体，室温下干燥后封片、镜检。 2、间接法 如检查未知抗原，先用已知未标记的特异抗体（第一抗体）与抗原标本进行反应，用水洗去未反应的抗体，再用标记的抗抗体（第二抗体）与抗原标本反应
氨基酸序列测定实验
实验方法原理 实验材料 分离胶和积层胶溶液还原型谷胱甘肽干粉试剂、试剂盒 4 × 凝胶缓冲液10 × 下槽缓冲液10 × 上槽缓冲液甲醇转移缓冲液0.1%（V／V）考马斯亮蓝的 50％甲醇溶液10％（V／V）乙酸的 50％甲醇溶液仪器、耗材 微量注射器或凝胶加样吸头PVDF 膜小型电转装置自动蛋白质
氨基酸序列测定实验
基本方案 测定通过 SDS-PAGE 转移到 PVDF 膜上样品的氨基酸序列 辅助方案 准备SDS-PAGE蛋白质样品 实验方法原理
什么是氨基酸序列？
氨基酸序列是氨基酸相互连接形成肽链（或多肽）的顺序。如果肽链是一个蛋白质，氨基酸序列就经常被叫做蛋白质主要结构。根据氨基酸的结构和它们连接在一起的方式，氨基酸序列只能按照一个方向读取，并且以特定形式形成肽。 氨基酸有100多种不同类型，其中20种常用于生产蛋白质。所有氨基酸都具有一个常规结构，
亚细胞（细胞器）构造的组成与功能
分离与纯化对象之一：“亚细胞（细胞器）”的构造与功能 上世纪20年代以Svedberg为首的欧洲科学家艰难研制的超速离心机原型主要目的是想分离和纯化病毒、细胞和亚细胞构造（细胞器），然而50年代中期开始生产的*代及以后的各代超速离心机，在很长一段时期内（50年代—80年代）主要用于分离和纯化
Science：首次揭示蛋白组亚细胞结构定位地图
对于人细胞中的蛋白是如何在细胞中定位的首次分析于5月11日在线发表在Science上，这项研究，揭示了在给定的一个细胞中，大部分的人类蛋白被发现存在一个以上的定位位置。 基于瑞典的Cell Atlas计划，研究人员检查了对应大部分蛋白编码基因的人类蛋白组的空间分布，空前地详细描述了蛋白在多个细
亚氨基酸是不是氨基酸？
形态类似于氨基酸(amino acid)的分子中不是含有氨基（—NH2），而是含有亚氨基(-NH-)和羧基，这样的的化合物称为亚氨基酸（imino acid)，也叫亚氨酸，比如脯氨酸和羟脯氨酸。
氨基酸序列的测定方法
有两种方法，一是直接测序列法，常用Edman降解法，在弱碱性条件下多肽连N端氨基酸（阿尔发）与PITC反应，标记为苯氨基硫代甲酰蛋白质。肽链中的第一个肽键变弱，在无水酸的存在下发发生降解，第一个氨基酸（AA1）经过分子重排成为PTH-AA1结合层析技术即可确定氨基酸的性质。C端氨基酸残基分析，可用；
氨基酸序列的测定方法
有两种方法，一是直接测序列法，常用Edman降解法，在弱碱性条件下多肽连N端氨基酸（阿尔发）与PITC反应，标记为苯氨基硫代甲酰蛋白质。肽链中的第一个肽键变弱，在无水酸的存在下发发生降解，第一个氨基酸（AA1）经过分子重排成为PTH-AA1结合层析技术即可确定氨基酸的性质。C端氨基酸残基分析，可用；
亚细胞（细胞器）构造的组成与功能（四）
三．内质网:(endoplasmic reticulum) 粗面内质网：最重要的功能是合成输出蛋白（或称分泌蛋白：包括各种肽类、激素、酶类和抗体） 滑面内质网：多方面功能，不同细胞中功能不同。 Ⅰ.脂质和固醇的合成； Ⅱ.蛋白质及脂类的
亚细胞（细胞器）构造的组成与功能（二）
二种内质网可互相连接，一定条件下可转换，但构成成分及酶系差别很大。 △ 高尔基复合体：一般位于核附近 组成：扁平囊泡、大囊泡（又称分泌泡或浓缩泡）、小囊泡 △ 线粒体： 结构： 线粒体外膜。外室、基粒（可溶性ATP）、核糖体、内膜、脊。又分为板状脊与管状脊二种结构形式
亚细胞（细胞器）构造的组成与功能（三）
△ 微体： microbody (peroxisome) 在植物种子内称为乙醛酸循环体（glyoxysome）0.5um，单位膜内包有中等致密颗粒，常见于肝、肾上皮细胞、支气管无纤毛上皮细胞中。种类：● 有核样微体● 有边缘板或哑铃样微体 ● 无核样微样△ 中心粒： centrosome
亚细胞（细胞器）构造的组成与功能（一）
上世纪20年代以Svedberg为首的欧洲科学家艰难研制的超速离心机原型主要目的是想分离和纯化病毒、细胞和亚细胞构造（细胞器），然而50年代中期开始生产的第一代及以后的各代超速离心机，在很长一段时期内（50年代—80年代）主要用于分离和纯化生物大分子、细胞、细胞器、病毒、血液组份等生物体。但从90年
亚细胞定位用荧光显微镜能看到吗
目前进行亚细胞定位研究，提取拟南芥(Arabidopsis thaliana)(Arabidopsis thaliana)叶肉原生质体进行PEG转化。研究目标采用GFP/YFP融合蛋白，但是在LSM710观察时，叶绿体有很明显的背景，尽管有些细胞是明显看到了GFP荧光，远远强于叶绿体背景，但是拍的照
氨基酸的组成
氨基酸分子中含有氨基和羧基两种官能团。 与羟基酸类似，氨基酸可按照氨基连在碳链上的不同位置而分为α-，β-，γ-，w-...氨基酸，但经蛋白质水解后得到的氨基酸都是α-氨基酸，而且仅有二十二种，包括甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸（蛋氨酸）、脯氨酸、色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半
RGD序列的主要组成成分
RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成，存在于多种细胞外基质中，可与11种整合素特异性结合，能有效地促进细胞对生物材料的粘附。
侧翼序列的主要组成
侧翼序列包括前导区、尾部区、调控区,调控区又包括启动子、增强子、终止子等:1、前导区和尾部区 此二区被转录并参与成熟mRNA的组成,但不被翻译,前者位于转录起始点和第一外显子之间,相当于mRNA5’端的非翻译区(5’UT);后者位于最末外显子和终止子之间,相当于mRNA3’端非翻译区(3'U
概述KCNN3基因背景知识
一、KCNN基因分类 KCNN基因分为四类：KCNN1、KCNN2、KCNN3、KCNN4，它们分别又称为KCa2.1，KCa2.2，KCa2.3，KCa3.1。 二、KCNN基因分布 KCNN多分布于大脑皮质，海马，腹侧背盖，隔区，视上束核，黑质，丘脑，底丘脑，尾状核，杏仁核，基底节，僵
氨基酸序列测定实验——辅助方案
实验材料蛋白质样品试剂、试剂盒1 mol／L NaHCO3 （可选）100％ 冰冷乙醇(不含变性剂 USP 级)样品缓冲液 0.1％ （V／V）焦宁 Y 染料仪器、耗材超滤浓缩器／Speedvac蒸发器拉细的巴斯德吸管／凝胶加样吸头1.5 ml 微量离心管离心机实验步骤1. 必要时，用1 mol/L
关于SH2功能域的结构特点介绍
PTKs src家族包括p59lck和p59fyn，这两个分子的氨基端有三个同源的区域。其中一区域对于豆蔻酸的附着是必需的，豆蔻酸可以通过疏水的相互作用和/或同一种胞浆膜蛋白结合的方式使得激酶定位于质膜上，这种胞浆膜结合蛋白实际上是豆蔻酸化多肽特异性受体。第二区域称为src同源区3（src ho
SH2功能域的结构特点
PTKs src家族包括p59lck和p59fyn，这两个分子的氨基端有三个同源的区域。其中一区域对于豆蔻酸的附着是必需的，豆蔻酸可以通过疏水的相互作用和/或同一种胞浆膜蛋白结合的方式使得激酶定位于质膜上，这种胞浆膜结合蛋白实际上是豆蔻酸化多肽特异性受体。第二区域称为src同源区3（src homo
成体干细胞的非定位性介绍
虽然胚胎干细胞能分化成各种细胞类型，但这种分化是“非定位性”的。当前尚不能控制胚胎干细胞在特定的部位分化成相应的细胞，当前的做法容易导致畸胎瘤。在应用胚胎干细胞治疗前，必须先进行初步的细胞诱导分化，以防止畸胎瘤的发生。应用胚胎干细胞时，也必须确认胚胎干细胞供者没有诸如（肌）营养失调症之类的遗传性疾病
倒置相差荧光显微镜可以做亚细胞定位嘛
可以。根据查询中国知网可知，倒置相差荧光显微镜可以做亚细胞定位。倒置相差显微镜，是将相差显微镜和倒置显微镜相结合的产物，倒置相差显微镜既具有倒置显微镜的倒置观察方式，同时又具有与相差显微镜相一致的成像原理。