甲醛变性电泳检测RNA完整性
一、材料、试剂和仪器1、材料:植物总RNA 5-10μg2、试剂:1)加样运载缓冲液(Loading buffer)50% 甘油1mmol/L EDTA (pH 8.0)0.25%溴酚蓝25%二甲苯氰FF2)10×TAE Buffer3)5×甲醛凝胶电泳缓冲液:0.1mol/L MOPs (pH7.0)40mmol/L乙酸钠5mmol/L DETA(pH8.0)4)甲醛,甲酰胺3、仪器:电泳装置,紫外透射观测仪二、实验程序1、甲醛变性的琼脂糖(Agarose) 凝胶的配制在250mL的锥形瓶中准确称量2g Agarose (Sigama),再加20mL 10×TAE Buffer,144mLDEPC处理过的双蒸水,微波炉中化胶,待冷却至50-60℃加EB至终浓度≤0.5μg/mL。在通风橱中加入36 mL甲醛,放置一段时间以减少甲醛蒸汽。2、RNA的甲醛变性电泳1) 样品制备RNA总量10μg5×甲醛凝胶电泳缓冲液4μl甲醛 3......阅读全文
RNA的变性琼脂糖凝胶电泳实验原理、材料和操作步骤
一、实验目的学习RNA琼脂糖凝胶电泳的使用技术。二、实验原理RNA可以使用非变性或变性凝胶电泳进行检测。在非变性电泳中,可以分离混合物中不同分子量的RNA分子,凡是无法确定分子量。只有在变性情况下,RNA分子完全伸展,其泳动率才与分子量成正比。判断RNA提取物的完整性是进行电泳的主要目的之一。完整的
RNA的变性琼脂糖凝胶电泳实验原理、材料和操作步骤
一、实验目的学习RNA琼脂糖凝胶电泳的使用技术。二、实验原理RNA可以使用非变性或变性凝胶电泳进行检测。在非变性电泳中,可以分离混合物中不同分子量的RNA分子,凡是无法确定分子量。只有在变性情况下,RNA分子完全伸展,其泳动率才与分子量成正比。判断RNA提取物的完整性是进行电泳的主要目的之一。完整的
真核细胞总RNA的分离提取
RNA是基因表达产物,由以下几类分子组成,rRNA(占细胞总RNA的80%~85%)、tRNA和核内小分子RNA(占10~15%)、mRNA(占1~5%)。其中mRNA是分子生物学的主要研究对象,分离制备mRNA是克隆基因,分析基因表达以及建立cDNA文库的首要步骤。真核细胞总RNA分离提取的目的是
按大小分离RNA:在含有甲醛琼脂糖凝胶上进行RNA的电泳
RNA 样品经甲酰胺处理以及经含有甲醛的凝胶电泳分离可能会发生变性,这一方法是从 Lehrachetal. (1977), Goldberg (1980),Seed (1982a)和 Rosen et al, (1990) 修改而来。RNA 在含有 2.2 mol/L 甲醛的凝胶上电泳分离。本实验来
【锐赛小课题】miRNA研究之动物总RNA的提取与电泳
动物总RNA的提取与电泳 I. 实验目的与要求 A. 理解和掌握提取和纯化动物总RNA的技术原理和操作方法。 B. 理解和掌握通过电泳鉴定提取所得的动物总RNA的技术原理和操作方法。 II. 实验原理和背景知识 A. RNA是生命活动中基因表达过程非常重要的生物
miRNA研究之动物总RNA的提取与电泳
动物总RNA的提取与电泳I.实验目的与要求A. 理解和掌握提取和纯化动物总RNA的技术原理和操作方法。B. 理解和掌握通过电泳鉴定提取所得的动物总RNA的技术原理和操作方法。II. 实验原理和背景知识A. RNA是生命活动中基因表达过程非常重要的生物大分子,如mRNA,它携带了DNA的全部编码信息。
从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验
从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验 试剂、试剂盒 变性(甲醛)琼脂糖凝胶 琼脂糖 蒸馏
从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验
试剂、试剂盒 变性(甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇 甲醛MOPS 缓冲液乙二胺四乙酸MOPS乙酸钠酚 氯仿(3:1) 溶液氯仿液体酚Tris-HCl电泳缓冲液仪器、耗材 离心机和转头离心管配胶板微波炉实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂变性(甲醛)琼脂糖凝胶(配制过程见第 18步)
从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验
为了进行 FDD 基因表达的分析,以及使用任何其他基于 RNA 的基因表达技术,在反转录合成单链 cDNA 和后续的 PCR 操作之前,必须除掉污染的基因组 DNA。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒变性(甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇甲醛MOPS
一种快速鉴定RNA-质量的方法
提 要: 目的 建立一种快速鉴定RNA 完整性的方法。方法 在常规琼脂糖凝胶电泳的基础上,结合甲醛变性琼脂糖凝胶电泳加以改进而成。结果 提取的总RNA 用此方法电泳后可得到28S、18S、5. 8S(5S) 三条清晰的rRNA 条带。结论 此方法可以达到对RNA 完整性进行快速鉴定的目的。 随着分子
按大小分离RNA:在含有甲醛的琼脂糖凝胶上进行的RNA电泳
实验方法原理 RNA 样品经甲酰胺处理以及经含有甲醛的凝胶电泳分离可能会发生变性,这一方法是从 Lehrachetal. (1977), Goldberg (1980),Seed (1982a)和 Rosen et al, (1990)
RNA电泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and TransferUsing glyoxal
RNA电泳
· RNA Gel (Crawford Lab)· Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. · Northern
RNA-电泳
①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样
琼脂糖凝胶电泳法检测-DNA-及-RNA-的纯度及浓度
1、DNA 的琼脂糖凝胶电泳检测 (1)配制琼脂糖凝胶 ①称取适量琼脂糖,放入100mL锥形瓶中按胶浓度加入1倍 TAE 或 TBE 缓冲液,于微波炉或水浴中溶解。 ②熔化的琼脂糖冷却至60℃,加入终浓度为0.5μg/mL 的 EB,混匀。 ③将凝胶床水平放置,插入两端的挡板,用滴管吸取
植物组织总RNA的制备:异硫氰酸胍—酚法
异硫氰酸胍—酚法提取RNA的原理如下:GIT与β-巯基乙醇共同作用抑制RNase的活性;GIT与 十二烷基肌氨酸钠 (Sarcosyl)作用使蛋白质变性,从而释放RNA;酸性条件下DNA极少发生解离,同蛋白质一起变性被离心下来,RNA则溶于上清中。该法所提RNA纯度高完整性好较适合纯化mRNA,
异硫氰酸胍酚法植物组织总RNA的制备
异硫氰酸胍—酚法提取RNA的原理如下:GIT与β-巯基乙醇共同作用抑制RNase的活性;GIT与 十二烷基肌氨酸钠 (Sarcosyl)作用使蛋白质变性,从而释放RNA;酸性条件下DNA极少发生解离,同蛋白质一起变性被离心下来,RNA则溶于上清中。该法所提 RNA纯度高完整性好较适合纯化mR
怎么看琼脂电泳完整性
第一,完整性比较好的总RNA琼脂糖凝胶电泳图呈现三条带,也就是电泳图常见的28s 18s 5s核糖体RNA。且它们三条带清晰无严重拖尾。第二,真核生物有4种rRNA,它们分子大小分别是5S、5.8S、18S和28S。RNA电泳中可以依据核糖体RNA的大小大致判断条带的大小,RNA电泳条带上,应是28
怎么看琼脂电泳完整性
第一,完整性比较好的总RNA琼脂糖凝胶电泳图呈现三条带,也就是电泳图常见的28s 18s 5s核糖体RNA。且它们三条带清晰无严重拖尾。第二,真核生物有4种rRNA,它们分子大小分别是5S、5.8S、18S和28S。RNA电泳中可以依据核糖体RNA的大小大致判断条带的大小,RNA电泳条带上,应是28
动物组织细胞总RNA的提取(异硫氰酸胍法和TRIzol法)2
(二)TRIzol试剂提取RNA1.取新鲜动物组织0.1~0.2g置于组织匀浆器中,加入预冷的Trizol液 1ml 于玻璃匀浆器中,在冰浴中迅速匀浆15~30s,以充分研碎组织。然后将细胞悬浮液吸入另一1.5ml Ep管中,于室温下静置5min。2.加入200μl氯仿,剧烈振摇15s混匀后,室温静
分子杂交技术Northern杂交的简介
Northern杂交与Southern杂交很相似。主要区别是被检测对象为RNA,其电泳在变性条件下进行,以去除RNA中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离。变性电泳主要有3种:乙二醛变性电泳、甲醛变性电泳和羟甲基汞变性电泳。电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern转移相同的方法将RNA转移到硝
如何利用非变性电泳检测蛋白多聚体
把你现在纯化的蛋白跑个非还原SDS-PAGE与之前同时含有单体和二聚体的样品一起跑,看看跟那条条带相近应该就知道是什么形式了呵!或者把纯化出来的蛋白打个质谱,这样得出的分子量应该更直接证明存在形式。如果跑非变性电泳,可以跑个不同浓度的连续非变性胶,迁移率与胶的浓度有个对应关系,根据那个也可以计算出分
RNA凝胶电泳试验基本原理
RNA可以使用非变性或变性凝胶电泳进行检测。在非变性电泳中,可以分离混合物中不同分子量的RNA分子,凡是无法确定分子量。只有在变性情况下,RNA分子完全伸展,其泳动率才与分子量成正比。 判断RNA提取物的完整性是进行电泳的主要目的之一。完整的未降解的RNA制品的电泳图谱应可清晰看到18s rR
核酸电泳(RNA电泳与DNA电泳)
(一)DNA的凝胶电泳:凝胶电泳是分子克隆的中心技术之一。琼脂糖凝胶用于分离大于200~1000bp的片段;操作简单、快速,且分离范围广,分辨率高。2.聚丙烯酰胺凝胶用于分离5-500bp的片段; 效果好、分辨率极高,相差1bp的DNA片断就能分开,能容纳相对大量的DNA ,用于核苷酸多态性的分析。
变性梯度凝胶电泳
实验材料 DNA样品试剂、试剂盒 尿素去离子甲酰胺丙烯酰胺甲叉双丙烯酰胺琼脂糖 仪器、耗材 PCR扩增仪变性梯度凝胶电泳仪凝胶成像及分析系统紫外透射仪高速离心机电泳仪电泳槽微量加样器Tip头Tip头盒Eppendorf管Eppendorf管架
非变性胶蛋白电泳
Section 2.1Nondenaturing Polyacrylamide Gel Electrophoresis of ProteinsJohn M. Walker1. IntroductionSDS-PAGE (Section 2.2) is probably the most commo
变性梯度凝胶电泳
变性梯度凝胶电泳(DGGE) 实验方法原理 1. 变性梯度凝胶电泳(DGGE)是一种根据DNA片段的熔解性质而使之分离的凝胶系统。核酸的双螺旋结构在一定条
变性梯度凝胶电泳
变性梯度凝胶电泳(DGGE)是一种根据DNA片段的熔解性质而使之分离的凝胶系统。(1)将凝胶设置在双重变性条件下,可以检测DNA分子中的任何一种单碱基的替代、移码突变以及少于10个碱基的缺失突变,被广泛应用于基因突变检测及相关研究。(2) 用于癌症和遗传病的筛查及诊断,而且,在癌症(残存性病灶、突变
RNA电泳条带中的-28s-18s-5s分别代表什么
RNA电泳条带中的 28s 18s 5s分别代表RNA电泳中核糖体RNA的大小。Northern blot中最为常用的电泳胶是含有甲醛的琼脂糖凝胶,甲醛可以减少RNA的二级结构,电泳完成后的胶可经过EB染色后在紫外下检测RNA的质量。对小分子的RNA 或者microRNA一般采用聚丙烯酰胺变性胶电泳
甲醛洋菜胶体电泳
甲醛洋菜胶体电泳 (formaldehyde-agarose gel electrophoresis)甲醛是一种常用的RNA 变性剂。在进行甲醛洋菜胶体电泳分析时,必须先配制含有甲醛的洋菜胶体,RNA 也必须先以甲醛及formamide 进行变性处理,以确保其二度结构充分被打开。由于甲醛可能是一种致