siRNA数据库与设计工具
siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ™ Validated and Pre-designed siRNAs to >34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database have been designed for maximum potency and specificity using a well-tested, proprietary algorithm . And silencing results are guaranteed.siRNA Target FinderFind siRNA target sites in your mRNA of interest using the published recommendations of Tuschl and colleagues ......阅读全文
siRNA数据库与设计工具
siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ™ Validated and Pre-designed siRNAs to >34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database
siRNA的设计方法
关于设计siRNA以及siRNA设计对siRNA功能的影响，至今还没有可靠的规律。虽然我们可以通过对mRNA实验分析准确的找到一段基因的全部siRNA最佳作用位置，但这个过程十分耗时且昂贵，不推荐常规实验使用。一种做法是每个目标序列设计3-4对siRNAs，实验选择较有效的siRNA。方法一、根据T
siRNA－的设计方法
关于设计siRNA以及siRNA设计对siRNA功能的影响，至今还没有可靠的规律。虽然我们可以通过对mRNA实验分析准确的找到一段基因的全部siRNA最佳作用位置，但这个过程十分耗时且昂贵，不推荐常规实验使用。一种做法是每个目标序列设计3－4对siRNAs，实验选择较有效的siRNA。 目前
siRNA－Oligo设计原则
1． 希望软件可以在 web 上使用。 即用户可以访问我们的网站， 输入基因代码， 即可自行在网上设计 siRNA Oligo 。2． 可参照的软件形式： 见如下网站：www.dharmacon.comwww.ambion.comwww.qiagen.com3． 希望能就每一个所指定的基因找到至少四
siRNA的设计方法
关于设计siRNA以及siRNA设计对siRNA功能的影响，至今还没有可靠的规律。虽然我们可以通过对mRNA实验分析准确的找到一段基因的全部siRNA最佳作用位置，但这个过程十分耗时且昂贵，不推荐常规实验使用。一种做法是每个目标序列设计3-4对siRNAs，实验选择较有效的 siRNA。方法一、
RNAi片段siRNA设计原则
RNAi target selection rules:Targeted regions on the cDNA sequence of a targeted gene should be located 50-100 nt downstream of the start codon (ATG).S
射频/微波CAE工具与设计匹配
计算机辅助工程（CAE）软件工具需要花点时间才能熟练使用，但通过预测不同工作条件对电路或系统的影响，这些软件工具能够在产品设计周期中节省大量时间。这些工具在射频/微波设计领域中已经不是什么新生事物了，但它们有助于高效且极具性价比地满足用户的设计要求。了解目前可用的各类CAE软件工具是发挥这些工具最大
关于小干扰RNA的siRNA设计介绍
最初，siRNA序列的选择是基于实验经验而获得的（Elbashir et al. 2001，2002）。最近，生物信息学工具被用来设计siRNA（表18-1），目前多个数据库收录了经过实验确证的siRNA和shRNA。值得推荐的是，在设计新的siRNA之前可以通过搜索已有的siRNA数据库和科研
Sigma推出qPCR引物设计工具
Sigma-Aldrich公司的生命科学部门近日宣布推出增强版的OligoArchitect™，这一免费的在线工具可自动设计实时定量PCR分析的引物和探针。由行业标准的Beacon Designer™平台所支持，OligoArchitect成为一种可靠、方便的工具，与Sigma qPCR产品
国际联合团队发布了“微拟球藻设计与合成数据库”
工业产油微藻能够规模化地利用光能将二氧化碳和水转化为油脂，因此是人类社会粮食、营养和燃料可持续供应的潜在解决方案之一。作为一种模式工业产油微藻，微拟球藻不仅在藻类养殖产业中有广泛应用，而且已经成为一个备受重视的藻类系统生物学与合成生物学研究体系。 为促进全球微拟球藻研究群体的资源共享和通力合
siRNA与shRAN有什么区别
siRNA是小干扰rna；shRNA是小发卡rna，一段rna单链，形成茎环结构部分双链的小rnasiRNA可以是天然产生也可以是人工导入的，shRNA一般都是指人工的shRNA多是用dna载体构建，在宿主内自行转录成shRNA，再加工成像siRNA一样的小RNA，目的为了模仿细胞内天然miRNA前
常用引物设计工具大集合
Oligo 6作为目前最好、最为专业的引物设计软件，Oligo 的功能很强大，他主要功能有：普通引物对的搜索、测序引物的设计、杂交探针的设计以及评估「引物对」质量的功能。如何使用Oligo6 请参看：「两分钟教你学会 Oligo 7」BLASTBLAST（Basic Local Alignment
华人学者推出CRISPR新设计工具
细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR/Cas适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。 2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统发展成了强大的
有源滤波器设计工具比较（一）
使用供应商提供的多反馈（MFB）低通有源滤波器工具到底有什么好处？让我们深入探讨来获得答案。在此在线设计工具精确度的探索中，市场上4种供应商工具针对相对简单的二阶低通滤波器给出的RC值，是以MFB拓扑实现的。本文将使用这些值进行仿真，以对所得滤波器形状与理想目标进行比较，得出每个方案的拟合误
有源滤波器设计工具比较（三）
噪声增益（NG）峰值和环路增益（LG）分析MFB拓扑固有的噪声增益频率响应随着频率的变化达到峰值。峰值的产生归因于期望的频率响应极点和噪声增益零点——它们被控制产生或多或少的带内峰值，同时仍能提供期望的闭环响应形状。图1电路的MFB噪声增益由公式1给出，公式的分子（用于求解传递函数零点）是尽
有源滤波器设计工具比较（二）
这些标称响应形状与目标接近但不完全一致。RC器件容差的影响使已经偏移标称结果的预期响应形状进一步扩大。灰色LMP7711的RC值是经过GBW调整的，在图中看起来拟合最差，与Q的拟合也最差，但是它的RMS拟合误差最小，并且与fo和所得的f－3dB拟合最好。显然，如果标称响应已经相对于目标偏移了
有源滤波器设计工具比较（四）
较新的工具（ADI、Webench和Intersil）可将R值调整到符合运放固有输入噪声指标的范围。然而，区分积分噪声的主要机制是噪声增益零点的布局。Intersil工具可增加Qz并降低噪声增益峰值，其它3种工具如何对待此策略尚不清楚。工具开发和设计建议：考虑到本文提及的指标，在选择放大器时
Lumerical发布INTERCONNECT集成光子线路设计工具
Lumerical 发布INTERCONNECT一款强力、可自定义和灵活的集成光子线路设计工具 2012年2月29日加拿大不列颠哥伦比亚省温哥华电— 全球领先的纳米光学设计软件供应商Lumerical Solutions公司 (http://w
siRNA表达框架制备siRNA的方法介绍
siRNA表达框架（siRNA expression cassettes，SECs）是一种由PCR得到的siRNA表达模版，包括一个RNA pol Ⅲ启动子，一段发夹结构siRNA，一个RNA pol Ⅲ终止位点，能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。和siRNA表达载体不同的是，SECs
miRNA、siRNA、dsRNA与shRNA－表示什么意思？
siRNA，shRNA，dsRNA，miRNA间的区别RNA干扰（RNAi），即用20多个核苷酸组成的短的双链RNA（siRNA）代替传统反义核酸进行转录后基因沉默，已经迅速而广泛地应用到基因功能，基因表达调控机制研究等热门领域，并为基因治疗开辟了新的途径。近两年来，这方面的科学论文及报道爆炸性增长
土壤水分测试仪系统数据库设计
随着农业科学技术的不断向前发展，做好不同农业种植制度的土壤水分特性和动态变 化的研究，对农作物合理土壤水分管理、水资源利用率的提高和农业科研与服务系统信息化有着重要意义。为了更好地管理数据采集器（ datalogger）所得数据，在取样间隔为10min的原始数据基础上iu，运用Visual Fox
清华汪小我等人开发CRISPR－sgRNA设计工具
CRISPR/Cas9系统，是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术，包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA（sgRNA）。然而，这仍然是具有挑战性的，因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑，但是目前还没有设计出用于基因调控
siRNA表达载体制备siRNA的方法介绍
多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶Ⅲ启动子（pol Ⅲ）中的一种，操纵一段小的发夹RNA（short hairpin RNA，shRNA）在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol Ⅲ启动子是由于它可以在哺乳动物细胞中表
siRNA表达框架
siRNA表达框架(siRNA expression cassettes，SECs)是一种由PCR得到的siRNA表达模版，能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。这个方法最早是由Castanotto和其同事采用，包括一个RNA polⅢ启动子，一段发夹结构siRNA，一个RNA pol I
siRNA－Design－Guidelines
Using siRNA for gene silencing is a rapidly evolving tool in molecular biology. There are several methods for preparing siRNA, such as chemical synthe
siRNA的转染
将制备好的siRNA，siRNA表达载体或表达框架转导至真核细胞中的方法主要有以下几种： 1.磷酸钙共沉淀将氯化钙，RNA(或DNA)和磷酸缓冲液混合，沉淀形成包含DNA且极小的不溶的磷酸钙颗粒。磷酸钙-DNA复合物粘附到细胞膜并通过胞饮进入目的细胞的细胞质。沉淀物的大小和质量对于磷酸钙转染的成功至
siRNA制备方法
体外制备1.化学合成许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高，定制周期长，特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高，为一个基因合成3―4对siRNAs 的成本就更高了，比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。最适用于：已经找到最有效的si
siRNA表达载体
多数的siRNA表达载体依赖RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种，操纵一段45—50nt的发夹结构RNA（small hairpin RNA, shRNA）在哺乳动物细胞中的表达,shRNA在细胞内会自动被加工成为siRNA，从而引发基因沉默或者表达抑制。这一类启动子包括大家熟悉的人
siRNA－转染程序
A．siRNA转染的方法 哺乳动物转染的常见方法有：磷酸钙共沉淀、电穿孔法、DEAE-葡聚糖和polybrene、机械法（例如,显微注射和基因枪）、阳离子脂质体试剂，其中阳离子脂质体试剂转染法是目前最常用的转染方法。应用脂质体型转染试剂进行转染需要注重的几个方面：1. 转染试剂的用
siRNA的转染
将制备好的siRNA，siRNA表达载体或表达框架转导至真核细胞中的方法主要有以下几种： 1.磷酸钙共沉淀 将氯化钙，RNA(或DNA )和磷酸缓冲液混合，沉淀形成包含DNA 且极小的不溶的磷酸钙颗粒。磷酸钙-DNA 复合物粘附到细胞膜并通过胞饮进入目的细胞的细胞质。沉淀物的大小和质量对于磷酸钙转