各种模式生物必需基因在线数据库
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation of life and therefore are likely to be common for all cells. Users can Blast the query sequences against DEG. If the homologous genes are found, it is possible that the queried genes are also essential. Users can Search essential genes by their functions and names. Use......阅读全文
基因插入位点和模式实验（一）
实验材料 dCTP试剂、试剂盒 乙醇次氯酸钠β-葡萄糖醛酸酶基因活性测定液溴化乙锭仪器、耗材 培养室MS 培养基实验步骤 一、转基因插入位点的数目第一代（ T0）转基因植株外源基因的插入位点数目，一般都是通过遗传方法进行鉴定。虽然遗传分析可以在任何世代进行，但是一般选择转基因植株自交，或与野
人工气候箱满足各种生物保鲜保存的需要
人工气候箱是细胞组织生长培育、种子发芽、载培育苗、昆虫小动物的饲养、微生物抗生物的培养保存木材、建材的性能试验的设备，人工气候箱特别适用于生物工程、医学研究、农业科学、水产、畜牧等领域从事生产和科研作恒温、恒湿、光照实验培养的装置。人工气候箱采用的微电脑技术可编程控方蔼蔼桑叶肥这过对多种参数(包括温
各种微生物样品采集后应这样储存
各种微生物样品采集后应这样储存 样品储存的外界条件应满足使样品内现有的微生物的数量和种类引起变化的可能性降至追低。 建议各类样品的储存温度如下： （1）固体样品：样品周围温度为18℃~27℃。 （2）冷冻或深度冷冻样品：样品周围温度为-15℃以下，追好是-18℃以下。冷冻
MBR膜生物反应器处理各种废水
膜生物反应器(MBR)是一种由膜分离单元与生物处理单元相结合的新型水处理技术。MBR 膜的研究对象从生活污水扩展到制药废水、医疗废水及啤酒废水等高浓度有机废水、难降解工业废水。 随着人口的增加、城市化进程的加快，工农业生产在不断地发展，污水排放量在日益增加，水体污染成为人们日益关注的话
Science子刊：基因FABP7是人类正常睡眠所必需的
在一项新的研究中，来自美国华盛顿州立大学的研究人员发现一种特定的基因如何参与三种不同的动物（包括人类）经历的睡眠质量。这种基因和它的功能为科学家们探究睡眠如何发挥作用和动物为何迫切地需要睡眠开辟一种新的途径。相关研究结果发表在2017年4月5日的Science Advances期刊上，论文标题为
分子生物学常用数据库汇总及推荐
分子生物学主要研究具体生物大分子在某一生物学行为过程中的表达变化、功能和作用方式；主要涉及基因的表达调控、蛋白相互作用、信号分子间的交互对话等。分子生物学实验常需要我们在具体实验前对所关注的基因的一些基本信息、可能受哪些因素调控、与哪些分子可能存在潜在的相互作用，可能参与哪些生物学行为等进行一些初步
齐磊博士Cell发布CRISPRi研究新成果
来自斯坦福大学、加州大学旧金山分校的研究人员报告称，他们利用CRISPR干扰（CRISPRi）技术，对枯草杆菌的必需基因进行了全面的功能分析。这项研究发布在5月26日的《细胞》（Cell）杂志上。 斯坦福大学的齐磊（Lei S. Qi）博士、Kerwyn Casey Huang博士，以及加州大
齐磊博士Cell发布CRISPRi研究新成果
来自斯坦福大学、加州大学旧金山分校的研究人员报告称，他们利用CRISPR干扰（CRISPRi）技术，对枯草杆菌的必需基因进行了全面的功能分析。这项研究发布在5月26日的《细胞》（Cell）杂志上。 斯坦福大学的齐磊（Lei S. Qi）博士、Kerwyn Casey Huang博士，以及加州大
北京基因组所数据资源建设取得进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队研究论文在线发表于《核酸研究》期刊。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式，整体发布我国生命组学数据资源建设情况，标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展，也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。 生命与健
北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库
DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记，在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用，不同物种所采用的机制亦各不相同。因而，整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析，可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异，并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。
北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表，并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas
北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表，并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas
SNP基因分型（SNP－genotyping）的几个常用数据库
做SNP genotyping应该常看的几个database：1. NCBI dbSNP从这里出发可以连到下面几个网站。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=snp2. International HapMap ProjectThe Int
水质在线生物毒性测定仪简介
水质在线生物毒性测定仪是一种先进自动化在线式水质毒性测定仪，能在30分钟内快速检测出水中急性毒物的总和，及时进行突发水污染事故的预警。 水质在线生物毒性测定仪是利用发光菌作为生物检测器，通过测定光损失来判定水中污染物的毒性大小，能对超过2000种不同类型的化学物质（重金属、农药等）产生敏感反应
在线生物毒性分析仪功能特点
1、稳定、可靠：为适应复杂多变的环境，仪器采用电气部分和水力管路部分完全隔离的设计方式，保证了仪器数据分析的可靠性可安全性。2、便于安装：在线生物毒性分析仪独有的设计方式使得安装更为简便，安装时只需连接药剂、样品、废液管路和电源线，仪器就可以开始工作。3、样品稀释： 样品经过自动稀释后仍可以分析，自
在线实时微生物监测系统优势
OWBA 工作组相信，制药公司可以从在线实时微生物监测系统中获益，包括：♥减少采样人工、常规测试和材料，降低成本♥更少的样品处理、更高的灵敏度♥通过实时监控，实现更好的过程控制和产品安全性♥实时放行生产用水、中间体和过程缓冲液/溶液，实现自动化控制♥通过验证系统性能，减少蒸汽消毒频率
《中国生物物种名录2023版》在线发布
在国际生物多样性日到来之际，《中国生物物种名录2023版》正式在线发布（http://www.sp2000.org.cn），全球用户可以自由下载使用。发布会由中国科学院生物多样性委员会联合中国科学院动物研究所、中国科学院植物研究所和中国科学院微生物研究所共同主办，中国科学院战略性先导科技专项（A类）
超4000种－融智生物发布商用化生物组学微生物质谱数据库
近日，融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上，基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异，对核糖体蛋白组的质谱测试，可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TO
修正基因组法有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略
随着高通量测序技术的不断崛起，全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前，主要有两种获得研究物种参考基因组的策略：de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正，mapping是指将所有测序读段通过序列比对定位到参考基因组上。De novo 基因组拼接是利用短
高内涵在模式生物中的应用（一）
生命科学研究离不开各式各样的模式生物，模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点，在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题，对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有真菌中的酵母，低等无脊椎动物中的线虫，昆虫纲的果蝇，鱼纲的斑
高内涵在模式生物中的应用（二）
高内涵系统不仅仅适用于各种各样的细胞模型，对各种小型的模式生物也非常友好，通过将这些模式生物放在微孔板中，我们就可以用高内涵系统来拍摄和分析它们。本期，我们将继续介绍高内涵与这些模式生物的故事。 拟南芥 拟南芥为两年生草本，一般可长到7-40厘米，是植物学最为常见的模式生物。其幼苗、根、茎、叶、原生
高内涵在模式生物中的应用（一）
生命科学研究离不开各式各样的模式生物，模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点，在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题，对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有真菌中的酵母，低等无脊椎动物中的线虫，昆虫纲的果蝇，鱼纲的斑
生物安全柜气流模式检测注意点
安全柜结构和气道密闭性同样是关系着安全柜是否安全的重要方面。我国YY 0569-2011柜标准规定二级A2、B1、B2 型安全柜的工作区均应采用四面(左右两侧、后部、底部)双层结构，所有级别安全柜的污染部位应均处于负压状态或被负压通道和通风系统包围。 这样在安全柜里进行试验操作时，样品所释放的
生物膜系统的各种生物膜在功能上的联系
科学家在研究分泌蛋白的合成和分泌时，曾经做过这样一个实验：他们在豚鼠的胰脏腺泡细胞中注射3H标记的亮氨酸，3min后，被标记的氨基酸出现在附着有核糖体的内质网中，17min后，出现在高尔基体中，117min后，出现在靠近细胞膜内侧的运输蛋白质的小泡中，以及释放到细胞外的分泌物中(如图)。这个实验
谷歌将提供基因数据在线服务
近日，谷歌公司宣布将开始提供由生物医学研究机构 Broad 研究所开发的DNA 分析软件的云服务版本。 Broad 研究所是由来自哈佛大学、麻省理工学院和哈佛大学附属医院的科学家组成的。该机构的基因组分析工具包GATK，可用于分析基因组测序数据，并已被研究人员和企业下载20000 次。谷
北京基因组所生命组学数据资源建设获进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表。该研究成
关于水质在线生物毒性测定仪生物原理的介绍
生物原理 水质在线生物毒性测定仪利用一种发光菌进行毒性测定。这种菌发出的光是它呼吸的副产物。当发光菌与水样混合后，样品中的毒性物质会损害发光菌的新陈代谢。发光菌发光强度的减弱与样品中毒性物质的浓度成正比。 水质在线生物毒性测定仪利用干冻的发光菌和专用的实验缓冲液来进行自动分析。测定前干冻发光
BioTechniques：大数据的可视化工具
如今，面对海量的生物数据集，人们往往感到束手无策。然而，这些TB级的数据有望带来新的假说、新的药物靶点，以及对生物系统的更彻底了解。数据可视化在其中扮演着至关重要的作用。在这一期的《BioTechniques》杂志上，Sarah Webb博士探讨了数据可视化的挑战和能力。 大数据是一个美好的概
生物信息学数据库和软件的搜索实验
实验方法原理熟练掌握上网搜索生物信息学数据库和软件的方法及技能。实验材料电脑实验步骤一、搜索生物信息学数据库或者软件数据库是生物信息学的主要内容，各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。核酸序列数据库有GenBank， EMBL， DDB等，蛋白质序列数据库有SWISS-PROT， PIR，OWL，
北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库
多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术，其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境，从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日，中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作，证实界面极化