各种模式生物必需基因在线数据库
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation of life and therefore are likely to be common for all cells. Users can Blast the query sequences against DEG. If the homologous genes are found, it is possible that the queried genes are also essential. Users can Search essential genes by their functions and names. Use......阅读全文
必需氨基酸和非必需氨基酸的区别
一、含义不同:必需氨基酸是指必须由饲料供给的氨基酸,即动物机体内不能合成,或者合成的速度慢、数量少,不能满足动物需要而必须由饲料供给的氨基酸。非必需氨基酸是在动物体内能利用含氮物质和酮酸合成,或可由其他氨基酸转化代替,无需由饲料直接提供既可满足需要的氨基酸。二、成分不同:必需氨基酸对成人来说,这类氨
逐次修正基因组法:有效提高非模式生物蛋白质组鉴定...
逐次修正基因组法:有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略随着高通量测序技术的不断崛起,全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前,主要有两种获得研究物种参考基因组的策略:de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正,mapping是指将所有测序读段通过序列比对定
庞国芳团队建立食品农药残留检测数据库-实现在线监测
【导语】中国工程院院士、中国检验检疫科学研究院研究员庞国芳团队利用液相色谱—四极杆—飞行时间质谱和气相色谱—四极杆—飞行时间质谱研究,开发了世界常用1200多种农药和化学污染物的一级精确质量数据库、二级碎片离子谱图库,建立农药残留侦测结果数据库,实现了农药残留监测技术信息化、监测大数据处理智能化
Nature:鉴定出癌症免疫疗法发挥作用所必需的基因
在一项新的研究中,来自美国国家卫生研究院(NIH)、乔治城大学医学院、纽约大学、纽约基因组中心、宾夕法尼亚大学、布罗德研究所和麻省理工学院的研究人员鉴定出癌症免疫疗法发挥作用所必需的基因,这解决了为何一些肿瘤不对免疫疗法作出反应,或者初始时作出反应但随着肿瘤细胞对免疫疗法产生抵抗力后不再作出反应
科学家发现正常绒毡层和花粉发育必需基因
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454741.shtm 近年来,科学家在赤霉素(GA)信号转导途径的分子机制研究中取得了很大进展。简要来说,GA受体通过识别GA,并通过SCF复合物招募DELLA蛋白进行泛素化,并随后通过26S蛋白酶体
众包个体基因数据库缓慢发展
Yaniv Erlich 计算遗传学家Yaniv Erlich因其建立了世界最大“家谱”而引人注目。而目前,他的DNA.land又引发新一轮个体基因数据库“众包热潮”。 早在2013 年,Erlich 团队就发表了一篇论文,介绍了如何利用公共资源,通过交叉比对的方法确定遗传学研究参与者的个人身
科学家搭建草莓基因组数据库
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属,因芳香多汁、营养丰富受到喜爱,在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体,基因组复杂,杂合度高。 2019年,《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高
基因序列排序与整理、数据库比对与意义
由于定序系统的定序方法都是将体细胞内的基因序列打断成很多段落后,再利用DNA扩增的方式原理,在扩增的同时借由侦测萤光的方式(将不同碱基原料接上萤光讯号,只要这有接讯号的碱基被合成了,即会发出不同强度的萤光讯号)即能得到大量的片段式基因序列。经数字化后的基因序列需经整理将每段落的头尾相接成一个完整的基
科学家构建首个油菜基因转录数据库
近日,中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改良创新团队破译了油菜基因组的全转录信息密码,构建了油菜十万余个基因的转录全景图,使得油菜基因功能研究第一次有了标准的可参考的基因转录数据库,将有力支撑油菜功能基因的相关研究。该项研究成果在线发表在《植物学报(The Plant Jour
大型衰老相关基因表达谱数据库建成
英国《自然·通讯》杂志30日发表的一项研究称,包括人类在内的4个物种的大型衰老相关基因表达谱数据库建成。德国科学家团队分析数据后发现,衰老相关基因的表达变化与退行性慢性病相关基因的表达变化轨迹一致,但与癌症的相反。 对衰老及衰老相关疾病的研究,一直是人类医学的难题。但随着“衰老基因”的确定,衰
全球药典草药基因组数据库已上线
近期,中国中医科学院中药研究所团队建立了全球药典基因组数据库(GPGD)。该数据库是全球首个针对药典收载草药物种的大型基因组学数据库。相关研究成果发表在《Science China-Life Sciences》杂志,标题为“Global Pharmacopoeia Genome Database
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese
基因检测解码“生命说明书”-全球竞跑基因数据库
随着华大基因上市临近,基因检测概念再度被关注。 华大基因CEO尹烨曾在公开场合介绍,给基因学家一滴血,能查到生育、肿瘤、感染,从三检合一到N检合一,液体活检可以做更多的事情。 相比于传统的影像学检测手段只能检测出已经发生且长成一定大小的异物,基因检测技术的优势在于,在更早的发病初始期,从分子
融智生物发布全球首个商用化生物组学微生物质谱数据库
近日,融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上,基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异,对核糖体蛋白组的质谱测试,可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TO
华人博士第一作者最新《Nature》文章-提出癌症新概念
科学家们发现了一种可以用于识别缺乏特异性关键抑癌基因这类癌症的靶标的新方法,他们利用这种方法针对最常见的一种前列腺癌进行了分析,找到了一个遗传位点。这种方法也可以确定其它类型的癌症,如乳腺癌,脑癌和结肠癌的精确治疗靶点。赵笛(Di Zhao,音译)博士 这一研究成果在线公布在2月6日的Natu
非必需氨基酸和必需氨基酸的影响关系
体内需要,但体内能自己合成的氨基酸.这类氨基酸不必由食物供给.在蛋白质中常见的20种氨基酸中,除了8种必需氨基酸,其余的12种都是非必需氨基酸.非必需氨基酸的供给对于必需氨基酸的需要量是有影响的.非必需氨基酸并非机体不需要的氨基酸,它们都是蛋白质的构成材料,并且,非必需氨基酸的供给对于必需氨基酸
硝化细菌——在线生物毒性预警
近年来,硝化细菌已逐渐成为水产养殖界的热门话题,它在水产养殖中的重要性开始引起广泛的注意。可以说,迄今为止,在大规模、集约化的水产养殖模式中,如果没有硝化细菌参与其中的净水作用,想获得成功的养殖,是相当困难的。鱼、虾等水产动物吃、喝、排泄、生活、休息都是在水体中进行的,那么,如何管理水体的水质以便适
线虫基因组中存在DNA甲基化现象
2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DN
吉大和华大基因联合发现线虫基因组中存在DNA甲基化现象
2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DNA甲基化
生物天然气产业模式颇具前景
9月23日,以绿色化工与生态文明为主题的2013中国化工学会年会在南京国际展览中心开幕。年会上,专家院士高屋建瓴,为石油和化学工业的绿色可持续发展指路。800余名化工科技工作者汇聚一堂,投身到化工产业转型升级的主战场,用他们在专业技术领域的深厚造诣为石油和化学工业实现创新驱动升级转型提供智力支持
高内涵在模式生物中的应用
生命科学研究离不开各式各样的模式生物,模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点,在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题,对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有真菌中的酵母,低等无脊椎动物中的线虫,昆虫纲的果蝇,鱼纲的斑
生物亲和色谱仪分离模式解析
生物亲和色谱仪是利用蛋白质或生物大分子等样品与固定相上生物活性配位体之间的特异亲和力进行分离的。一、固定相:将具有生物活性的配位体以共价键结合到不溶性固体基质上制得。二、生物活性配位体:1、酶:底物及其类似物。2、辅酶:类固醇等。3、抗体:植物激素等。4、激素:糖和多糖等。5、抗生素:核苷酸等。三、
高内涵在模式生物中的应用
生命科学研究离不开各式各样的模式生物,模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点,在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题,对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有真菌中的酵母,低等无脊椎动物中的线虫,昆虫纲的果蝇,鱼纲的斑
生物亲和色谱仪分离模式解析
生物亲和色谱仪是利用蛋白质或生物大分子等样品与固定相上生物活性配位体之间的特异亲和力进行分离的。一、固定相:将具有生物活性的配位体以共价键结合到不溶性固体基质上制得。二、生物活性配位体:1、酶:底物及其类似物。2、辅酶:类固醇等。3、抗体:植物激素等。4、激素:糖和多糖等。5、抗生素:核苷酸等。三、
新研究实现脊椎动物基因组复制的可视化分析
近日,中山大学海洋科学学院副教授卢建国团队成功构建脊椎动物基因组复制数据库DupScan和一站式分析平台,实现了脊椎动物基因组复制的的可视化分析。相关研究发表于Nucleic Acids Research。卢建国副教授为该论文第一作者和通讯作者,硕士研究生黄沛霖为第二作者,南开大学计算机学院刘健教授
我国建成全球第四个综合基因组权威数据库
近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”(北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化)的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》
MBR膜生物反应器处理各种废水
膜生物反应器(MBR)是一种由膜分离单元与生物处理单元相结合的新型水处理技术。MBR 膜的研究对象从生活污水扩展到制药废水、医疗废水及啤酒废水等高浓度有机废水、难降解工业废水。 随着人口的增加、城市化进程的加快,工农业生产在不断地发展,污水排放量在日益增加,水体污染成为人们日益关注的话
各种微生物样品采集后应这样储存
各种微生物样品采集后应这样储存 样品储存的外界条件应满足使样品内现有的微生物的数量和种类引起变化的可能性降至追低。 建议各类样品的储存温度如下: (1)固体样品:样品周围温度为18℃~27℃。 (2)冷冻或深度冷冻样品:样品周围温度为-15℃以下,追好是-18℃以下。冷冻
人工气候箱满足各种生物保鲜保存的需要
人工气候箱是细胞组织生长培育、种子发芽、载培育苗、昆虫小动物的饲养、微生物抗生物的培养保存木材、建材的性能试验的设备,人工气候箱特别适用于生物工程、医学研究、农业科学、水产、畜牧等领域从事生产和科研作恒温、恒湿、光照实验培养的装置。人工气候箱采用的微电脑技术可编程控方蔼蔼桑叶肥这过对多种参数(包括温