就这样做轻松搞定实时PCR探针设计
除了为克隆基因、预测编码蛋白而需要研究基因的构成外，当前在基因组学上的努力也包括对基因组构成的研究，以分析具有结构和调控因子插入的基因。近源物种分析成为比较基因组学的主要内容，被认为是研究进化、基因功能和人类疾病的重要方法。 利用该方法分析微生物，特别是细菌的基因组，早在 1996 年就已开始识别出细菌中的保守基因和与亚种相关的毒性基因（Fredricks and Reiman 1996)。这方面的进展促生了新的、大规模的检测和识别致病菌的方法。近源种 PCR 可以用来研究进化上相关的种，它们在基因组上有一 些共同的特点，这些保守的区域可被用于在基因组水平识别新种。还可以用该技术在尚未测序的物种的基因组中扩增同源基因。 设计策略 根据多元序列比较和引物设计的一般规律来设计近源种 PCR 引物。通过比较少数几个大的相近序列识别出保守区域，这些区域即是近源种引物的可能结合位点。近源种的比较需要对少数大的相近序列......阅读全文
新型冠状病毒核酸检测原理
检测新型冠状病毒特异序列的方法最常见的是荧光定量PCR（聚合酶链式反应）。因PCR反应模板仅为DNA，因此在进行PCR反应前，应将新型冠状病毒核酸（RNA）逆转录为DNA。在PCR反应体系中，包含一对特异性引物以及一个Taqman探针，该探针为一段特异性寡核苷酸序列，两端分别标记了报告荧光基团和
荧光定量PCR实验指南2
2.3TaqmanMGB探针设计介绍MGB探针的优点：²MGB探针较短(14-20bp)，更容易找到所有排序序列的较短片段的保守区。²短片段探针(14-20bp)加上MGB 后，Tm值将提高10℃，更容易达到荧光探针Tm值的要求。²MGB探针的设计原则²探针的5’端避免出现G，即使探针水解为单个碱基
荧光定量PCR技术的荧光定量PCR的方法
接下来我们就来了解一下荧光定量的主要方法，我们如何选择合适的方法？荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种：荧光探针和荧光染料。而荧光定量 PCR 的方法相应的可分为特异类和非特异类两类，特异性检测方法是在PCR反应中利用标记荧光染料的基因特异寡核苷酸探针来检测产物；而非特异性检测方法是在在PCR反
实时荧光定量PCR原理和实验（二）
归一后的荧光信号再扣除本底，就得到DRn：DRn = Rn,样本- Rn,空白。DRn是最后构建PCR实时扩增曲线的纵坐标。 无论绝对定量还是相对定量，在得到实验结果后，还要考虑数据之间的可比性问题。在实验操作中，取样都是以体积或重量为单位的，但是同样体积或重量的样本所来源的细胞数目并不一样
建立一个实时－PCR－定量分析实验
对于一个新的靶分子建立实时 PCR 定量分析的过程包括：①设计步骤一 PCR 引物和探针的选择；②根据特定分析的要求，选择实时 PCR 的检測方法。使用 SYBRGreen 的实时 PCR 通常被用于优化引物，且被主要用于在研究中检测 PCR 产物 TaqMari 探针和分子信号提供了更好的特异性。
TaqmanPCR技术检测淋病奈瑟菌、沙眼衣原体和解脲尿原体...
Taqman-PCR技术检测淋病奈瑟菌、沙眼衣原体和解脲尿原体的意义临床尿道炎患者中，淋病奈瑟菌、沙眼衣原体和解脲尿原体通常为共同感染状态，但常用的检测方法尚不能精确检测和鉴别，开发精确、灵敏、快速、无污染的临床诊断方法已经成为预防性传播疾病的重要措施。随着分子生物学的发展，基于Taqman-PCR
如何做好荧光定量PCR实验？（五）
5、反应体系配制：ð A2010A0101试剂盒：（探针体系）FQ-PCR MasterMix-UNG混合物(2X) 25ul（终浓度为1×）；上游引物（终浓度为50~900nM），下游引物（终浓度为50~900nM）；探针（终浓度为200nM）；待检样品 5ul（终浓度为10~100ng）；无菌
讲解实时荧光定量PCR技术
实时荧光定量PCR (real time fluorogenetic quantitative PCR, FQ-PCR)，是在PCR定性技术基础上发展起来的核酸定量技术。它是一种在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时检测整个PCR过程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。该
实时荧光定量PCR（Quantitative－Realtime－PCR－，qPCR）技术介绍
荧光定量PCR也叫Real-Time PCR，是美国PE（Perkin Elmer）公司1995年研制出来的一种新的核酸定量技术。荧光定量PCR的发展史是一部ABI、罗氏和伯乐等巨头的荡气回肠的斗争史，感兴趣的可以去查查。该技术是目前最成熟，使用最广泛的半定量PCR技术。 荧光染料法（SYBR
定－量－P－C－R
定量PCR 定义 以参照物为标准对PCR终产物进行分析或对PCR过程的进行监测，来评估样本中靶基因的拷贝数，称为定量PCR相对定量→绝对定量， 手工操作→自动化检测， 灵敏度与特异性多有很大的提高。 定量PCR的可行性 定量一般是在PCR扩增的指数期进行的。 特定的待扩增基因片段 起
定－量－P－C－R
定量PCR 定义 以参照物为标准对PCR终产物进行分析或对PCR过程的进行监测，来评估样本中靶基因的拷贝数，称为定量PCR相对定量→绝对定量， 手工操作→自动化检测， 灵敏度与特异性多有很大的提高。 定量PCR的可行性 定量一般是在PCR扩增的指数期进行的。 特定的待扩增基因片段 起始含量越大，则指
普通PCR－梯度PCR－荧光定量PCR仪的区别及运用
PCR：即合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)，利用DNA在体外95℃时解旋（变性），55℃时引物与单链按碱基互补配对的原则结合（退火），再调温度至72℃左右，DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链（延伸）。PCR仪实际就是一个温控设
PCR,RTPCR,实时荧光定量PCR的区别与联系
1、所说的PCR应该就是最常规的PCR，以DNA为模板，通过上下游引物，实现DNA的扩增。2、RT-PCR一般情况下是指反转录PCR（reverse transcription），尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也（realtime fluores-cence quantitative PCR）也
普通PCR－梯度PCR－荧光定量PCR仪的区别及运用
PCR：即合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)，利用DNA在体外95℃时解旋（变性），55℃时引物与单链按碱基互补配对的原则结合（退火），再调温度至72℃左右，DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链（延伸）。PCR仪实际就是一个温控
普通－PCR、实时荧光定量－PCR－和数字－PCR－对比分析
提起 PCR，在生物及其相关行业内可谓如雷贯耳，无人不知无人不晓，其影响之深，应用之广可见一斑。 1985 年，美国 PE-Cetus 公司的 Mullis 等人发明了聚合酶链反应（PCR），实现了在试管中模拟细胞内的 DNA 复制。然而，采用 E-coli DNA 聚合酶进行 PCR，由
PCR,RTPCR,实时荧光定量PCR的区别与联系
1、所说的PCR应该就是最常规的PCR，以DNA为模板，通过上下游引物，实现DNA的扩增。2、RT-PCR一般情况下是指反转录PCR（reverse transcription），尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也（realtime fluores-cence quantitative PCR）也
普通PCR、实时荧光定量PCR、数字PCR技术的功能区别
一、普通PCR技术 KARY MULLIS （1944.12.28-2019.8.7） Kary Mullis于1983年发明了聚合酶链式反应法（polymerase chain reaction ，PCR），据说是载着女友开车的时候，忽然灵光一闪，想到了PCR原理（论开车的好处）
普通－PCR、实时荧光定量－PCR－和数字－PCR－对比分析
提起 PCR，在生物及其相关行业内可谓如雷贯耳，无人不知无人不晓，其影响之深，应用之广可见一斑。 1985 年，美国 PE-Cetus 公司的 Mullis 等人发明了聚合酶链反应（PCR），实现了在试管中模拟细胞内的 DNA 复制。然而，采用 E-coli DNA 聚合酶进行 PCR，由于
深蓝云qPCR知识小课堂TaqMan探针法的操作
在之前发表的文章《实时荧光定量PCR检测方法，你选对了吗?》中提到，实时荧光定量PCR常用的方法包括了SYBR Green染料法、TaqMan探针法、分子信标、荧光共振能量传递(FRET)和LUX Primers等。那么应用最为广泛的则是SYBR Green染料法和TaqMan探针法，两者各有所
何谓实时荧光聚合酶链反应定量检测？
在普通PCR扩增系统中，加入一个与靶基因序列特异互补的双荧光标记探针。5′端标记荧光发射集团，3′端标记荧光淬灭集团，当探针完整时，后者抑制前者而不发光。有靶基因存在时，在PCR复性阶段，探针与靶基因互补，PCR延伸中，由于Taq酶有5′-3′的外切酶活性，引物沿模板延伸至标记探针结合处，将5′端报
盘点：单核苷酸多态性（SNP）检测方法
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms, SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，包括碱基的颠换、转换、插入和缺失。它是人类可遗传变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90%以上。SNP作为第三代分子标记，被广泛应用于分子
实时荧光定量PCR基本原理
• Taqman 技术：该技术以美国 ABI 公司为代表。 PCR 扩增时，在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针。该探针为一直线型的寡核苷酸，两端分别标记一个荧光报告基团和一个荧光淬灭基团，探针完整时，报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收， PCR 仪检测不到荧光信号； PCR
概述斑疹伤寒病毒的分子生物学诊断方法
1.斑疹伤寒—DNA探针（DNA Probe） DNA探针是用DNA制备的诊断试剂，用于检测或鉴定特定的细菌，方法是用一段已标记的特定的DNA片段（探针）与标本中已变性的细菌DNA杂交，通过测定是否发生杂交反应来达到检测目的，由于此探针是以细菌专有的特异性基因片断制备，故特异性很高。用DNA探针
实时荧光定量PCR原理
所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,zui后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法. 1.在荧光定量PCR技术中,有一个很重要的概念—— Ct值.C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含义是:每个反应管内的荧光信号到
时荧光定量PCR技术
时荧光定量PCR技术即是在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号实时监测整个PCR进程，zui后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。实时荧光定量PCR避免了传统PCR以终产物检测定量产生的偏差，提高实验的重复性。该技术已被广泛用于检测细胞mRNA表达量的变化；比较不同组织的 mRNA
实时荧光定量PCR
Real Time PCR实时荧光定量PCR 其定量的基本原理是在 PCR 反应体系中加入非特异性的荧光染料（如： SYBR GREEN I ）或特异性的荧光探针（如： Taqman 探针），实时检测荧光量的变化，获得不同样品达到一定的荧光信号（阈值）时所需的循环次数： CT 值（ Cycle
间接原位PCR（原位杂交PCR）
与直接原位PCR所不同的是，靶基因在扩增时不进行标记基团的掺入，而是标记一段与扩增片段互补的探针，在扩增结束后，应用此探针进行原位杂交。因此，此处主要介绍原位杂交，其余方法同原位PCR。实验材料组织或细胞样品试剂、试剂盒SSC硫酸葡聚糖甲酰胺脱脂奶粉Denhardt’s 液SDS变性的鲑鱼精DNAR
间接原位PCR（原位杂交PCR）
间接原位PCR（原位杂交PCR） 实验材料 组织或细胞样品 试剂、试剂盒
反向PCR－（inversePCR）实验步骤
nverse-PCR是克隆插入片段侧翼序列非常有效的方法。通常采用的Tail-PCR假阳性太多，而Inverse-PCR一般只要有特异条带，基本上就是目的片段。基本步骤如下：1、反向PCR（Inverse PCR）原理：反向PCR是克隆T-DNA插入位点侧翼DNA序列非常有效的方法。a. 选择合适的
定量PCR实验技术－QPCR
Quantitative PCRJoseph SambrookPeter Maccallum Cancer Institute and The University of Melbourne, AustraliaDavid W. RussellUniversity of Texas Southwes