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如何利用大数据理解体重与基因及环境的联系

基因型的环境交互(genotype by environment interaction, GEI)对研究复杂的生物性状是必不可少的。然而,对人类而言,由于环境数据采集的困难以及环境影响效果弱,难以鉴定GEI效应相关的基因型。近日,来自昆士兰大学的研究人员通过对大量样本的分析推导出基因型和表型之间的联系,从而绕过了采集环境因素的困难。作者通过对英国biobank数据库中无亲缘关系的348501人的5600万个突变的基因组水平的变异数量性状位点(variance quantitative trait locus, vQTL)进行了分析,鉴定出了9个性状的75个vQTLs,而且这些性状与肥胖相关性大。随后,对5个环境因素的GEI分析表明,GEI效应与vQTLs的富集相关性强。 研究人员发现,环境因素可以增强或减弱基因型对体重指数(body mass index, BMI) 的影响。相反,身高则主要由遗传决定,受环境因素影响小......阅读全文

大数据与2016年基金申请,你准备好了吗?

  大数据与精准医疗已成为当今健康产业的热门话题,组学和大数据是当前决定精准医学发展的一个基础。今天我们不谈大数据与精准医学,我们来谈谈大数据与国家自然基金的申请。曾经看到一则帖子,“生当为人杰,死亦写基金”,苍凉……这句话看上去有些浮躁,但申请基金做科研科决不能浮躁。2016年的基金申请将于明年3

遗传发育所开发水稻分子育种整合组学知识库

  10月18日,中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室梁承志研究组开发的分子育种整合组学知识库水稻子库在线发表于学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。文章题目为MBKbase for rice: an integrated omics knowl

一口唾液就能测出孩子天赋?专家 检测尚处于“忽悠”阶段

  “一口唾液,就能测出孩子的天赋。家长可以有的放矢地开发孩子的天赋和潜能,不用尝试那么多的兴趣班来挖掘特长”“准确预测癌症肿瘤,准确率近100%”……  打开搜索引擎,键入“基因检测”,类似的广告语不时可见。基因检测成了可以预测未来发展以及旦夕福祸的利器,然而事实真的如此吗?  天赋基因检测尚处于

加大仪器研发投入 精准医学实现“弯道超车”

  伴随着人类基因组测序技术的革新、生物医学分析技术的进步、以及大数据分析工具的应用,精准医疗的时代已经到来,将为病人提供更精准、高效、安全的诊断及治疗。“目前我国精准医疗计划已经启动实施,包含5大任务、25个方向,预计投入资金16亿元。”在近日由贝壳社等主办的第六届Bio4P精准医疗创新论坛暨20

我的基因我知道:基因检测服务走向大众

  2014年12月12日,美国《科学》杂志集中刊登了八篇鸟类基因组系统演化史项目,该项目是华大基因联合全球200多科学家推动鸟类物种全基因组测序的重要步骤。  华大基因研究员张国捷表示,鸟类基因组研究具有重要意义,有助于弄清禽流感的传播规律和分布等与人类健康息息相关的问题。华大基因承担着国家基因库

基因检测取样方不方便?真的能测性格和天赋吗?

   对于浙江大学遗传与基因组医学中心主任祁鸣来说,基因检测跟平时量体温差不多。由于工作需要,他已经做过近百次基因检测,包括体验美国创业公司23andMe不到100美元的基因检测服务。  眼下,只要他每年支付5美元,23andMe每年都会重新检测他的样本,并提供一份报告,报告里的检测项目不断增加,说

破译中国人基因密码:“中国十万人基因组计划”将4年完成

  我是谁?我从哪里来?我将到哪儿去?这一终极哲学命题,有多种不同的解答视角。从基因角度给出的答案,无疑是非常重要的一种。近一段时间,有关基因领域的新闻将基因检测、基因编辑、癌症的靶向治疗等原本属于生物医学领域的专业话题,一下子变成了公众话题。人们对于基因的好奇在于:基因是如何影响人类的长相、身高、

II型糖尿病研究需要使用的动物模型介绍

今天师兄告诉我,如果我们实验室要研究糖尿病,应该主要研究2型糖尿病,这让我听到之后愣在了那里,原来在研究糖尿病上面我还年轻着呢(暗自说道)。那,2型糖尿病是不是也需要相对应的动物模型来支持研究呢?师兄能帮忙讲讲嘛?(我厚着脸皮问道)。当然了,研究2型糖尿病怎么能少得了其相关的动物模型呢?你上周已经掌

基因检测过去、未来与问题

  10月11日,美国国立卫生研究院美国国家人类基因组研究所所长Eric D. Green,美国加州首席科学官Edward M. Rubin以及美国华盛顿华盛顿华盛顿大学华盛顿大学医学与基因组科学荣誉教授Maynard V. Olson在Nature联合发表了一篇预测性文章,题为The future

Illumina子公司Helix将打造DNA定制化王国

  乔布斯在2011年死于胰腺癌之前,曾花10万美金来给自己的DNA做了一次测序。这一做法在当时昂贵又罕见,谁想到在乔帮主离世5年之后,一模一样的基因测序已经降到了几千美金,甚至更低的价格,进入百万民众的视野。  让DNA测序发生革命性改变的公司,毫无疑问是基因测序巨头Illumina。这个价值20

腾讯WE大会:Nothing but the Future

  11月8日下午,腾讯2014 WE大会在京举行。12位科技精英从全球各地汇聚到一起,围绕“Nothing but the Future”这个主题,从各自领域出发,描绘了一幅幅关于人类未来生活的蓝图。  产品是什么样子?能感知脑电波,自动推送精准服务。  交互是怎样?空气交互,无需各种平板、眼镜.

“禁果效应”来解答:为什么家长喂得越多,孩子越瘦

  21世纪以来,人们的物质水平得到了极大的提高,独生子女的增多,也导致了家长和长辈对于孩子的过分溺爱。近年来,青少年肥胖问题越来越严重,而肥胖也导致一些慢性病发病率明显增高。因此,研究人员一直在寻找可以解释为什么越来越多的儿童发展为超重的环境因素。Doi.org/10.1371/journal.p

实验小鼠运输指南(一)

大家好,我是一只来自邦耀实验室SPF级动物房的基因编辑小鼠,听实验室的哥哥姐姐们说现在外面已经30多度的高温了,在外面呆几分钟就能汗流浃背。虽然我没有汗腺,但是光想象一下就觉得鼠生艰难啊…不过上完最后一节课就要放暑假,去一个新的环境、参与完成一项伟大的实验了~但是我们中有的是短途货车出行,有的是长途

悦糖: 基于精准医学和大数据技术制定个性化解决方案

  在糖尿病领域的激烈厮杀中,悦糖是一家具有明显差异化的自我健康管理平台。  相比同类竞品,有三大显著区别:一,国内首款融入精准医学的健康应用;二,面向糖前和早期糖尿病人;三,独创“糖点”值食物标注体系。  首创上述独特理念的人来自悦糖的研发团队:杨玉峰和她的伙伴们。杨玉峰是北京悦优博迈科技有限公司

『珍藏版』瘦素的那些事儿

  1950年,Ingalls发现了一种“肥胖基因”(ob),它的突变可以导致肥胖和糖尿病。Kennedy和Hervey分别于1956年和1958年发现了脂肪分泌的一种“饱感因子”,它能通过下丘脑控制动物摄食量,调节体重。历经几十年的研究与发展,科学家通过定位克隆技术得到 ob 基因。ob 基因编码

《科学新闻》:基因体检,昂贵的鸡肋

  基因体检并不比传统的体检更优越,改变自己的生活方式和环境要比做基因体检重要得多  打着科学旗号开展基因体检业务的美国公司,正受到来自科学家的质疑。  美国国会日前开始对从事基因体检服务的商业公司进行调查。包括23andMe、Navigenics、Pathway Genomics等业界知

一文了解我国肠道微生物行业的产业现状

   人体是由自身细胞及共生的大量微生物细胞所共同组成的复杂共生生命体。人体肠道微生物数量庞大、种类繁多,被称为“第二基因组”。在人体微生物组学中,96-99%的微生物聚集在胃肠道,肠道微生物与机体健康有着极为密切的联系。  本文,我们整理了肠道微生物行业的产业现状,包括肠道微生物的应用场景、产业化

亿康基因CEO陆思嘉:单细胞测序技术开创精准医疗新篇章

  单细胞测序是生命科学研究的极致所在   亿康基因总经理兼联合创始人   MALBAC®发明人,共发表SCI首轮论文数十篇    测序中国对话了生殖健康领域著名企业亿康基因总经理兼联合创始人陆思嘉博士。陆思嘉博士是MALBAC®单细胞全基因组扩增技术的发明人,这一技术目前在辅助生殖、产前

亿康基因CEO陆思嘉单细胞测序技术开创精准医疗新篇章

  单细胞测序是生命科学研究的极致所在   亿康基因总经理兼联合创始人   MALBAC®发明人,共发表SCI首轮论文数十篇    测序中国对话了生殖健康领域著名企业亿康基因总经理兼联合创始人陆思嘉博士。陆思嘉博士是MALBAC®单细胞全基因组扩增技术的发明人,这一技术目前在辅助生殖、产前

加大仪器研发投入 精准医学实现“弯道超车”

  我国属于出生缺陷高发国,出生缺陷总发生率达4%-6%,每年大约有80万-120万缺陷患儿出生,每年仅因神经管畸形造成的经济损失就达2亿元。  “精准医学的干预有望降低高危目标新生儿死亡率。如新生儿单基因疾病单例模式全外显子测序(singletonWES)作为一线分子检测技术,已经开始应用于新生儿

MC4R——肥胖基因,肥胖患者的噩梦之一

   近年来,我国成人肥胖率呈迅速增长的态势,肥胖流行趋势日益严峻,而肥胖流行的严重后果也逐步成为我国日益加重的社会负担。肥胖不仅仅与饮食及运动相关,基因在肥胖进程中也发挥了重要作用,肥胖基因谱的问世更襄助于相关基因更为深入的研究。  近日,剑桥大学的研究人员发现核心肥胖基因之一——MC4R 竟然存

生命大数据──样本数字化多组学层次的生命健康大数据

  2015 年初,奥巴马提出精准医学计划,意在大规模测定癌症病人的全基因组,获得大数据,挖掘癌症驱动基因,实现个性化精准用药,解决癌症对人类的威胁。2016 年初,拜登的癌症登月计划(Cancer Moonshot 2020)使精准医学计划正式落地。精准医学很快红遍全球,在世界各地、在国内也迅速催

小鼠中的黄金矿脉-RenMabTM小鼠

  前几天有“砖家”同学写了两篇《鼠年说鼠》(一)和(二)。为了留作永久的学习材料,小编在经过原作者同意后,现进行转载。本文将两部分内容融在一起,并对(一)和 (二)顺序进行了调换。   抗体药发现的两大矿场   抗体药主要有两个大矿场,一个是依赖于体外展示技术的全合成/半合成/天然抗体

科技部发布科技基础资源调查专项项目指南

科技部关于发布科技基础资源调查专项2018年度项目指南的通知国科发基〔2017〕380号国务院各有关部门科技主管司局,各有关单位:  根据中央财政科技计划(专项、基金等)管理改革的总体要求,科技部、财政部按照需求导向和分类整合的原则,在原“科技基础性工作专项”基础上,重新整合设立“科技基础资源调查”

研究揭示降糖药二甲双胍的疗效与患者个体差异间的关系

   来自一项关于服用二甲双胍的患者的大型国际研究的第一个成果揭示了患者之间的遗传差异,也许可以解释为什么某些患者对药物的反应比其他人要好。二甲双胍是世界上治疗2型糖尿病的最常用药物。该研究结果最终可能帮助医生预测哪些患者需要比其他人更高的剂量才能产生同样的效果,或者需要完全不同的处方药。  此外,

研究发现适度的体重增加可以引起人体的系统性变化

  据外媒报道,近日一项涉及数十亿测量的大量数据提供了一个人体在增重期间经历的变化的详细信息。这项由斯坦福大学科学家小组领导的研究将各种不同的生物分析技术结合起来,发现人体的体重变化会影响人体微生物、免疫系统及心血管系统等各个方面。   这项研究的共同资深作者迈克尔·斯奈德(Michael Sny

哈佛大学研究:40%疾病由遗传引发 25%由环境造成

   据英国《每日邮报》1月14日报道,美国哈佛大学的科学家们通过对4500万美国人进行长达24年的跟踪调查,研究哪些疾病是由基因引起的,而哪些疾病更容易受到环境的影响,是迄今为止同类研究中规模最大的研究。  据其最新发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)期刊上的研究结果显示,在调查

“数字化”自我引领健康管理风潮

  “数字化”自我引领健康管理风潮  随着健康服务业和互联网的融合逐步深化,智能健康管理逐渐成为全球热门趋势。面向患者、医生、医院等的创新互联网模式正不断涌现,医疗健康领域的互联网产品也应运而生。今年以来,三星、苹果、谷歌等相继推出了S Health、HealthKit以及Google Fit,旨在

重磅!首个北京鸭三维基因组研究登顶Nature子刊

  相关研究成果An intercross population study reveals genes associated with body size and plumage color in ducks于7月17日在自然子刊《Nature Communications》在线发表,并被列为该期

转基因农作物安全性典型争议事件溯源

  转基因农作物被培育成功以来,科学家们通过实验检验其安全性的工作就从未停止。然而,由于研究中存在的各种缺陷或失误,影响了实验结果的准确性,并进而引发公众对转基因农作物安全性的疑虑。   作为高技术实验品的转基因农作物,在其迈向公众日常生活的途中,因与人类休戚相关的安全性问题在全球范围内广受争议而