前剪接体和剪接体的分离及分析实验

实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。 实验材料 PIP 10 载体 核苷酸 焦磷酸酶 RNasin T7 RNA 聚合酶 mRNA 试剂、试剂盒 转录缓冲液 高盐缓冲液 NaAc 乙醇 ......阅读全文

施一公团队新方向:报道首个人源次要剪接体的电镜结构

  北京时间2021年1月29日,西湖大学教授施一公研究组在《科学》发文,首次报道了“神秘”的次要剪接体的高分辨率三维结构。  这也标志着该团队在一个新的研究方向上迈出关键一步。  生物体的遗传信息经过“转录”从DNA传递给RNA,再经过“翻译”从RNA传递给蛋白质,这就是分子生物学的“中心法则”。

《科学》重磅:施一公团队聚焦新方向

 人源次要剪接体的三维结构   北京时间2021年1月29日,西湖大学教授施一公研究组在《科学》发文,首次报道了“神秘”的次要剪接体的高分辨率三维结构。这也标志着该团队在一个新的研究方向上迈出关键一步。 生物体的遗传信息经过“转录”从DNA传递给RNA,再经过“翻译”从RNA传递给

清华大学博士后发表Science-报道人源剪接体催化步骤

  自2015年,清华大学施一公教授研究组首次报道了裂殖酵母剪接体3.6 Å的高分辨率结构之后,这一研究组陆续解析了7个不同状态的剪接体高分辨的三维结构,整个剪接通路,将剪接体介导RNA剪接的过程串联了起来。但是与酵母剪接体相比,以人类为代表的高等生物的剪接体组成、组装和调控更为复杂,其结构研究也因

剪接体靶向治疗诱发三阴性乳腺癌的抗病毒免疫反应

  Cell |   肿瘤转录组中有不受调控的RNA剪接的迹象,例如内含子的异常保留、典型和选择性剪接的变异【1】。很多肿瘤的特性可导致这种失调,包括实体瘤和血液恶性肿瘤中RNA剪接因子的反复突变。非剪接体相关的致癌变异,如转录因子MYC的过度活化也可导致剪接失调,导致癌症细胞对剪接体高度依赖。因此

Nature-|-张祯威等人揭示Prp5校对早期剪接体的分子机制

  内含子 (intron) 是基因中非编码的区域。在转录过程中,DNA上的内含子会被保留在pre-mRNA中。因此在mRNA离开细胞核被翻译之前,内含子会被剪除,而编码蛋白质的区域外显子 (exon) 会被拼接起来。这个过程称为pre-mRNA剪接。pre-mRNA剪接是由一个被称为剪接体 (sp

Science-|-西湖大学万蕊雪施一公团队再取重要进展

  次要剪接体负责U12型内含子的剪接,由5个小核RNAs (snRNAs)组成,其中只有一个与主剪接体共享。  2024年3月14日,西湖大学施一公及万蕊雪共同通讯在Science 在线发表题为“Structural basis of U12-type intron engagement by t

首次发现!西湖大学施一公团队合作最新Nature子刊

  剪接体通过四个连续的阶段进行pre-mRNA剪接:组装、激活、催化和拆卸。剪接体的活化,即催化前剪接体(B复合体)重塑为活化剪接体(Bact复合体)和催化活化剪接体(B*复合体),涉及蛋白质组分的主要通量和结构重排。  2024年7月27日,西湖大学施一公团队在Nature Communicat

2个月内发第三篇顶刊,到底是哪个实验室?

  北京时间2021年1月29日,西湖大学施一公教授研究组在《科学》(Science)发表题为《激活状态的人源次要剪接体的结构》(Structure of the Activated Human Minor Spliceosome)的科研论文,是剪接体结构与机理研究的又一个重大突破。  这已经是两个

施一公组首次报道人源剪切体原子分辨率结构

  2017年5月12日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公研究组于《细胞》(Cell)在线发表了题为《人源剪接体的原子分辨率结构》(An Atomic Structure of the Human Spliceosome)。这是第一个高分辨率的人源剪接体结构,也是首次在近原子分辨率的

又1篇Science!施一公组发表冷冻电镜新成果

  这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cerevisiae Spliceosome Before Activation)的论文报道了酿酒酵母剪接体处于被激活前阶段的两个完全组装的关键构象——

科学家首次展示RNA剪接分子时钟精确原子模型

   西湖大学生命科学学院施一公教授研究组题为《ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化剪接体激活过程中结构重塑的分子机理》的论文,11月27日在《科学》杂志以长文形式发表。此文报道了酿酒酵母处于激活状态的剪接体2.5埃的高分辨率电镜结构,该结构是目前报道的最高分辨率的剪接体结构,首次展

Cell:施一公组首次报道人源剪切体原子分辨率结构

  2017年5月12日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公研究组于《细胞》(Cell)在线发表了题为《人源剪接体的原子分辨率结构》(An Atomic Structure of the Human Spliceosome)。这是第一个高分辨率的人源剪接体结构,也是首次在近原子分辨率的

年度巨献!施一公团队系统介绍剪切体研究的前世今生

  前体信使RNA的剪接涉及内含子的去除和外显子的连接,是由剪接体介导的。加上过去40年的生化和遗传学研究,自2015年以来,对完整的剪接体进行了原子分辨率的结构研究,导致了对RNA剪接的机械描述,并有了显著的洞察力。剪接体被证明是一种由蛋白质组成的金属蛋白酶.小核RNA(SnRNA)的保守元件与两

施一公团队再取进展

  剪接体通常在外显子上组装,并经历重新排列以跨越相邻的内含子。大多数由内含子定义的剪接体状态已经在结构上得到了表征。然而,一个完全组装的外显子定义的剪接体的结构仍然未知。  2024年4月24日,清华大学/西湖大学施一公及清华大学闫创业共同通讯在Cell Research(IF=44)在线发表题为

一文了解剪切体与疾病的关系

  剪接体(Spliceosomes)是由RNA和蛋白分子组成,大小为60S的多组分复合物,这种机器能进行Pre-mRNA剪接,即把内含子去除并把外显子序列连接成为成熟的mRNA,这是基因表达与调控的重要环节之一。从作用机制上来看,剪接体作为动态分子机器,需要由亚基从头逐步组装组合,来完成每个剪接事

Cell-Reports:揭秘人类细胞自我保护免于损伤的分子机制

  细胞中含有遗传物质的转录本,这些转录本能从细胞核迁移到细胞的其它部分,这种移动能够保护遗传转录本免于被“剪接体”(spliceosomes)所招募,如果这种保护作用并未发生,整个细胞就会处于危险之中,意味着癌症和神经变性疾病会发生;近日,一项刊登在国际杂志Cell Reports上的研究报告中,

施一公连发两篇Cell文章:一步步完成剪接体的拼图

  清华大学施一公教授研究组一直致力于捕捉RNA剪接过程中处于不同动态变化的剪接体结构,从而从分子层面阐释RNA剪接的工作机理。  在11月16日公布的Cell杂志上,这一研究组再次发表研究论文:Structure of the Post-catalytic Spliceosome from Sac

施一公团队破解结构生物学最大难题之一

施一公  北京时间8月21日凌晨,著名的《科学》杂志在线发表了清华大学生命科学学院施一公教授研究组的两篇具有里程碑意义的论文,宣布得到了高分辨率的剪接体三维结构和剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本工作机理,从而将分子生物学的“中心法则”在分子机理的研究上大幅度向前推进。  “这项研究成果的意义很可

大满贯!2019年施一公团队连续发表Cell,Nature,Science文章

  2015年,通过单粒子冷冻电子显微镜(cryo-EM)分析确定剪接体的第一个近原子分辨率结构,报道了来自S. pombe的ILS复合物。从那时起,已经阐明了13种冷冻-EM结构,大部分分辨率在3.3和5.8之间,已经阐明了来自酿酒酵母的组装剪接体的七种不同状态,人类剪接体的7种不同状态的11种这

清华施一公院士Science同期发表两篇新文章

  清华大学的施一公(Yigong Shi)教授是国际著名的结构生物学家,在细胞凋亡、大分子机器、膜蛋白研究领域占据国际领先地位。曾荣获国际赛克勒生物物理学奖、香港求是基金会杰出科学家奖、谈家桢生命科学终身成就奖、瑞典皇家科学院爱明诺夫奖等多个国内外大奖。  2008年施一公放弃国外的优厚条件选择回

清华施一公院士Science同期发表两篇新文章

  清华大学的施一公(Yigong Shi)教授是国际著名的结构生物学家,在细胞凋亡、大分子机器、膜蛋白研究领域占据国际领先地位。曾荣获国际赛克勒生物物理学奖、香港求是基金会杰出科 学家奖、谈家桢生命科学终身成就奖、瑞典皇家科学院爱明诺夫奖等多个国内外大奖。2008年施一公放弃国外的优厚条件选择回国

Nature新文章:生命起源于“RNA世界”

  来自芝加哥大学的科学家们在《自然》(Nature)杂志上报告称,RNA是控制基因表达的分子机器——剪接体的重要功能元件。这一研究发现确立了是RNA,而非蛋白质,负责催化了这一基础生物学过程,丰富了地球上的生命起源于仅以RNA为基础的世界这一假说。   研究的共同通讯作者、芝加哥大学分子遗传学和

里程碑:清华大学在分子生物学领域获突破

 据清华新闻网报道,日前,的《科学》杂志在线发表了清华大学生命科学学院施一公教授研究组的两篇具有里程碑意义的论文,宣布得到了高分辨率的剪接体三维结构和剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本工作机理,从而将分子生物学的“中心法则”在分子机理的研究上大幅度向前推进。   这两篇文章的题目分别为“3.6埃的

施一公研究组:剪接体SF3b复合物结合药物的电镜结构

  近日,来自施一公研究组的博士后Lorenzo Finci与来自美国的制药公司H3 Biomedicine合作在(Genes & Development)杂志在线发表了题为“The cryo-EM structure of the SF3b spliceosome complex bound to

29岁美女科学家发6篇Science论文获百万大奖,决定不出国

10月31日消息,据报道,2022达摩院青橙奖名单公布,首次有4位女青年科学家获奖,每人奖金为一百万元。西湖大学生命科学学院副研究员白蕊,位于获奖名单之中。据报道,29岁的西湖大学女科学家白蕊是完全由本土培养的青年学者,她从7年前开始跟随施一公院士扎入RNA剪接体研究,经过多年努力,她参与并主导完成

研究人员揭示RNA剪接在阿尔茨海默症中的作用

  2019年10月8日,美国贝勒医学院Joshua Shulman教授课题组在Cell Reports发表题为Tau-mediated Disruption of the Spliceosome Triggers Cryptic RNA-splicing and Neurodegeneration

内含子的类型介绍

根据剪接过程为自发还是要经过剪接体的加工,人们将内含子分为自剪接和剪接体内含子。自剪接内含子:在1981年由汤玛斯·切希发现的自剪接内含子中,又分为:Ⅰ型内含子与Ⅱ型内含子。剪接体内含子:这类内含子的剪除要有剪接体的帮助。一段序列在剪接中是内含子还是外显子,取决于其自身。GT-AG-内含子:最常见的

自剪接

自剪接(self-splicing)出现在稀少的内含子组成核酸酶,核酸酶在只有RNA的情况下代替了剪接体的功能。自剪接的内含子有两种,称为I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接,但不需要任何蛋白质。这种相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老,且

清华施一公院士发表2016开年Science文章

  来自清华大学生命科学学院、中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称,他们获得了分辨率为3.8埃的U4/U6.U5 三小核核糖核蛋白复合物(U4/U6.U5 tri-snRNP)三维结构,由此提供有关剪接体(spliceosome)组装和催化的新见解。研究结果发布在1月7日的《科学》(Scienc

清华施一公院士Science同日发表两篇文章

   7月21日,清华大学的施一公(Yigong Shi)院士课题组再度在剪接体研究中取得重大突破,两篇姊妹研究论文同期发表在《科学》(Science)杂志。  在去年8月20日的Science杂志上,施一公团队也同期发表了两篇姊妹研究论文。在第一篇文章中研究人员报道称,采用单颗粒冷冻电子显微镜获得