施一公团队再取进展

剪接体通常在外显子上组装,并经历重新排列以跨越相邻的内含子。大多数由内含子定义的剪接体状态已经在结构上得到了表征。然而,一个完全组装的外显子定义的剪接体的结构仍然未知。 2024年4月24日,清华大学/西湖大学施一公及清华大学闫创业共同通讯在Cell Research(IF=44)在线发表题为“Structural insights into human exon-defined spliceosome prior to activation”的研究论文,该研究报告了人类外显子定义的剪接体在四个连续状态下的原子结构:成熟的前-B、晚期前-B、早期B和成熟的B。在先前未知的晚期前-B状态中,U1 snRNP已经释放,但其余的蛋白质仍处于pre-B状态。 令人意外的是,RNA处于B状态,其中U6 snRNA与5'剪接位点形成双链结构,而U5 snRNA识别外显子的3'端。在早期和成熟的B复合物中,B特异性因子......阅读全文

内消旋体的定义

分子内含有不对称性的原子,但因具有对称因素而形成的不旋光性化合物。例如内消旋酒石酸分子内虽然含有两个不对称碳原子C,但由于它们具有对称因素,一半分子的右旋作用被另一半分子的左旋作用在内部所抵消,因此是一个不旋光性化合物。内消旋体和对映体的纯左旋体或右旋体互为非对映体。

抗-体-的-体-内-诱-导-和-检-测

实验步骤基 本 方案 1 蛋白质或多糖抗原体内法诱导抗体的产生材 料人外周血类毒素混合物: 25Lf U/ml 白 喉 类 毒 素(Connaught Laboratories 或 State Laboratoriy Institute of Massachusetts) 与 IOLf U/ml 破

内吞体与自噬体的电镜区别

内吞体与自噬体的电镜区别:这是机体细胞间的作用,起点就不一样,属于细胞水平。

核内纺锤体的概念

中文名称核内纺锤体英文名称intranuclear spindle定  义酵母和原生动物营养阶段进行核内有丝分裂时,在核内形成的纺锤体。纺锤体极端无中心粒,而代之以由电子致密物质构成的纺锤体斑。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞周期与细胞分裂(二级学科)

核内多倍体的概念

具有一个染色体组的细胞和由这样的细胞组成的个体称为单倍体(n),具有两个染色体组的细胞或个体称为二倍体(2n),具有两个以上整套染色体组的细胞或个体则称为多倍体,包括三倍体(3n)、四倍体(4n)等。由相同来源染色体组形成的多倍体称为同源多倍体,由不同来源不同染色体组形成的多倍体称为异源多倍体。此外

外显子应用机理

应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。

什么是外显子?

断裂基因中的编码序列。外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。

外显子混编的功能

即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编而成。这种基因片段可能就是外显子,因此称为外显子混编。

外显子的基因反应

剪接方式并不是唯一的(参看替代剪接),所以外显子只能在成体mRNA中被看出。即使是使用生物信息学方法,要精确预测外显子的位置也是非常困难的,外显子的识别及其拼接都是难题。 真核生物的基因,其线性表达被内含子阻断,这就是所谓的断裂基因(英语splitgene),该现象的发现者RichardJ.Robe

外显子插入的定义

中文名称外显子插入英文名称exon insertion定  义一个或者多个外显子从一个基因参入到另一个基因中去的现象。其结果是使剪接更有多样性,造成可读框移动,出现翻译终止密码子而使蛋白质合成中止或产生新的蛋白质。是进化中出现新事物的一个源泉。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控

外显子跳读的概念

中文名称外显子跳读英文名称exon skipping定  义跳过一个或多个外显子剪接为成熟的mRNA,是mRNA剪接多样性中的一种主要方式。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

外显子重复的定义

中文名称外显子重复英文名称exon duplication定  义(1)一个基因内部产生一个或者多个外显子的复制拷贝。(2)两分子同种前体RNA进行反式剪接时,成熟RNA分子上出现重复的外显子序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

外显子捕获与扩增

            实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ 大肠杆菌 DH5α

什么叫跨外显子

这是针对逆转录pcr而言,所谓的跨外显子就是一个引物(比如上游引物)、出现在两个外显子交界,那么做RT-PCR时,dna 由于2个外显子被内含子隔开,引物就不会起作用了

人体大脑内杏仁体是恐惧“发源地”

  美国一些研究人员发现,人体大脑内杏仁体是恐惧“发源地”。在这一大脑区域中做文章或许有助于治疗创伤后应激障碍。 不害怕   美国艾奥瓦大学神经学和心理学教授丹尼尔·特拉内尔及其研究团队就大脑杏仁体如何主导恐惧展开研究后撰写论文,发表于《当代生物学》(Current Biology)。   “

骨内牙种植体动态疲劳试验标准

适用范围:本标准规定了绷膜型单桩骨内牙种植体及其预成修复瓤的疲劳试验方法.该方法zui适于比较不同设计、不同尺寸的骨内牙种植体。    虽然本标准模拟骨内牙种植体的主体和预成修复组件在“zui坏情况”条件下的功能载荷,但不适用于预测骨内牙种植体或修复体的体内性能,尤其不适用于多桩种植体修复的情况。基

外显子捕获与扩增(二)

材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)酶及缓冲液胰酶-EDTA 溶液核酸与寡核苷酸DNA用于转染的质粒 DNA 制备见本方案阶段 1, 步骤 10~12。用作对照的质粒载体(步骤 3)培养基含 10% 热灭活胎牛血清的 Dulbecco's modified

外显子捕获与扩增2

阶段 3:mRNA 的提取材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。DEPC 处理水乙醇NaCl(5mol/L)酚酚:氯仿无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)SDS(5%m/V)TMK 缓冲液10 mmol/LTris-HCl(pH7.5)10 mmol/LKCl1 mmol/LMgCl2Triton X

外显子捕获的操作步骤

(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。(2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成

关于外显子捕获的简介

  外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接

外显子捕获与扩增(三)

凝胶琼脂糖凝胶(1.5%m/V), 用 TBE 配制核酸与寡核苷酸寡核苷酸引物 [20 mmol/L,TE(pH8.0) 配制]分别提取自转染有对照载体和重组载体的 COS-7 细胞的 RNA(阶段 3)。培养基含 50ug/ml 氨苄青霉素的 LB 琼脂平板专用设备自动微量加样器所用的加样器尖头微

外显子的操作步骤介绍

  ⑴基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕捉序列”下游的克隆位点上。  ⑵将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviralpackagingcellline)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成为反转

外显子捕获的操作步骤

(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。(2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成

全外显子怎么看

全外显子利用序列捕获技术高通量测序的方法查看。全外显子基因技术利用序列捕获技术高通量测序的方法可将全基因组中所有外显子区域DNA序列测序,可用于研究已知基因的单核苷酸多态性位点、插入缺失位点等。简言之,外显子就是指真核细胞的基因在表达过程中能编码蛋白质的核苷酸序列,全外显子基因检测建议到正规医院,专

外显子捕获与扩增(一)

实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3COS-7 细胞载体 pBluescriptⅡ大肠杆菌 DH5α试剂、试剂盒 pSPL3 多克隆位点图谱限制性内切核酸酶PvuⅡT4DNA 连接酶LB 琼脂平板黏粒载体TESOC 培养基琼脂糖凝胶LB 肉汤培养基PBS胰酶-EDTA 溶液D

外显子捕获与扩增1

本方案以哺乳动物穿梭载体 pSPL3 为例,描述了外显子扩增的方法,内容分为以下五个阶段。阶段 1: 文库的构建; 阶段 2: 电穿孔法将文库转染 COS-7 细胞; 阶段 3:mRNA 的提取; 阶段 4: 反转录 PCR; 阶段 5: 克隆分析。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:

关于外显子混编的介绍

  当两个转座子被同一转座酶识别而整合到染色体的临近位置时,则它们之间的DNA将变得易于被转座酶作用而转座。如果它们之间的DNA中含有外显子,则该外显子将被切离,并可能插入另一基因之中。这种效应称为外显子混编。  即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编

关于全外显子测序技术

在过去10年里,随着高通量测序技术的出现与发展,科研与临床医学领域的遗传学检测范围不断扩大,检测速度不断加快。时至今天,DNA测序技术不仅推进了遗传学研究,也被用于各种遗传疾病的检查。特别是利用全外显子组测序(whole exomesequencing,WES)与全基因组测序(wholegenome

PNAS:外显子变异检测——全基因组测序比全外显子测序更强大

  目前,全外显子测序和全基因组测序技术在遗传分析和发现导致疾病发生的潜在基因突变方面应用越来越广泛,随着测序技术的不断迭代更新,越来越成熟,昂贵的价格会逐渐降低,那么在排除价格因素之后,全外显子测序和全基因组测序在检测外显子突变方面究竟谁更加强大呢?来自美国的科学家对这一问题进行了相关研究,其研究

关于外显子的应用机理介绍

  应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。