PNAS:DNA显微镜实现在细胞或组织样本中创建分子图像

近日,瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员与芬兰阿尔托大学的同事们开发了一种新方法,实现了在细胞或组织样本中创建分子图像。这种方法是基于DNA片段的使用,因此被称为DNA显微镜。相关研究发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。https://doi.org/10.1073/pnas.1821178116 该项新方法主要分为两个阶段:第一阶段,研究人员将细胞或组织样本与短链序列的单链DNA混合,选择附着于将要研究的特定分子。如果它涉及将要研究的特定蛋白质,则使用与该特定蛋白质结合的小DNA片段。第二阶段,酶被送入短DNA序列以连接并形成DNA分子。 随后,研究人员对这些新形成的DNA分子进行DNA测序分析,可以准确地看到哪些DNA片段彼此相邻。根据这些信息,就能做出一个类似“拼图”的设计——显示所有的DNA序列相互如何连接。 由于DNA序列与所表示的分子相连,因此可以了解它们的数量有多丰富以及它们在细胞中的位置。......阅读全文

组织库冷冻样本管理流程(六)

附件C.生物样本库编号规则建议标本库编号命名规则:总原则:唯一性,共享性辅原则:在满足总原则基础上,尽量精简。编号长度尽量保持统一。一.组织生物样本采集和常规采集的编号规则组织编号规则。组织编号规则标签类型:BRADY THT-163-499-3-IP 长方形为25.4mm*9.525mm, 圆直径

组织库冷冻样本管理流程(三)

一. 组织库冷冻保存管的常见形态与保存温度。组织:冻存管保存(以内旋冻存管为多),常保存于-80 度/-150 度冰箱或液氮,也有很多单位将部分组织以RNAlater 浸润后保存于-30 度或-80 度条件,此外也有OCT 包埋,蜡块等组织保存形态。在条件允许的情况下,尽量保留T/P/N 三

组织库冷冻样本管理流程(五)

2.卧式冰箱卧式冰箱的标本位置信息也采用类似于立式冰箱的方式,区别是卧式冰箱里的冻存架的高度是用方框内的格子表达的。请参考如下:3. 液氮灌一个标本的位置信息会用AA-BB-CC-DD 表达,AA 是液氮灌在整个冰箱/液氮灌的主界面排列中的编号。BB 是冻存架的编号,可以选择A…..Z 的编号,也可

组织库冷冻样本管理流程(一)

一. 取材和编号/标签部分在本环节进行组织和血液的取材,并制作条形码标签,将样本进行分装。1. 取材单:手术医生根据临床病例情况在术前一日通知样本库次日取样本,同时在医嘱中注明需要抽取血样数量、种类。样本库根据次日样本情况预先准备样本提取单,并预先定义好流水编号。样本提取单上的信息可包含并不仅限于以

石蜡包埋组织样本提取出高质量DNA/RNA的难点和注意事项

从石蜡包埋组织本中提取可用于下游应用的高质量的生物分子是比较困难的,存在的主要难题是DNA的断裂和脱蜡过程中样品的丢失。那么如何从石蜡包埋的组织样本中提取出高质量的DNA/RNA就成了关键问题,这里推荐专用的BIOG石蜡包埋组织DNA抽提试剂盒。BIOG石蜡包埋组织DNA提取试剂盒(BIOG DNA

石蜡包埋组织样本提取出高质量DNA/RNA的难点和注意事项

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Nat-Commun:手机检测致癌突变,测序它也行!

  1月16日,研究人员在《 Nature Communications》上表示,他们开发出了一种移动显微镜,利用手机相机来检测细胞和组织中DNA测序反应生成的荧光产物。这种移动显微镜可以检测到KRAS基因的突变位点,而该突发被发现于超过30%的结直肠癌患者体内。  本文共同作者,瑞典斯德哥尔摩大学

游离核酸微量DNA样本的检测

近年来,DNA分析技术广泛应用于医学、法学、环境等诸多领域,成为科学研究的一大重点。例如产前诊断及法医检测等首先进行微量DNA 提取,然后进行PCR扩增验证,也有一些研究单位会对一些古老样本进行DNA提取,同样做PCR扩增验证。它们的相同之处在于,用于分析的样本DNA含量可能极其有限,稍有遗损就可能

稳定输出,样本DNA提取案例分享

最近实验室的师兄师姐们反馈,试用了MP的两款柱膜法新品试剂盒(SPINeasy DNA Kit for Soil和SPINeasy DNA Kit for Feces)都得到比较理想的实验数据,问了一圈身边的科研小伙伴们,认为操作简便,提取DNA纯度高、收率好的试剂盒为优先考虑购买的上上之选

分子细胞卓越中心开发出活细胞DNA成像新工具

  7月4日,《自然-方法》(Nature Methods)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组关于CRISPR-dCas12a应用于DNA活细胞标记的研究成果(CRISPR array-mediated imaging of non-repetitive and multipl

原位鉴定细胞或组织内生物大分子

原位鉴定细胞或组织内生物大分子、观察细胞及亚细胞形态结构:检测核酸、检测蛋白质细胞定位、检测细胞凋亡、细胞器的观察及测定、检测细胞融合、观察细胞骨架、检测细胞间缝隙连接通讯、检测细胞内脂肪;

新DNA显微镜“从内到外”绘制生命3D图

  美国芝加哥大学的科学家开发出一种名为体积DNA显微镜的革命性成像技术。该技术可“从内到外”绘制生命3D图,科学家通过标记和追踪分子间的相互作用,构建出复杂的遗传物质3D图,进而提供前所未有的生物体内视图。相关研究成果发表在新一期《自然·生物技术》杂志上。一种新的3D基因成像法可能为癌症、免疫和发

DNA“分子机器人”能为靶细胞贴标签

  美国哥伦比亚大学医学院与特种外科医院的研究人员合作,用DNA分子创建了一支细胞“机器人舰队”,这些纳米尺度的“分子机器人”可以对特定的人类细胞进行导向目标追踪并做上标记,以便进行药物治疗或者将其摧毁。发表在7月28日《自然·纳米技术》网络版上的论文对这一系统进行了详细介绍。   按照设计,这些

显微镜样本尺寸如何呢?

您的样本尺寸如何呢?显微镜样本尺寸包括:长度、宽度和高度。鉴于组织切片等样本仅在 X、Y 轴上成像,还有些应用领域需要在 Z 轴上获取图像。要实现活细胞的三维成像,建议配备电动物镜转换器,其能够引导样本逐步穿过焦点。成像软件应能够重建单幅图像,以实现三维观察。 针对活细胞,必须考虑尺寸、时间。在这种

处理植物组织样本只需四步

   植物组织的提取,不管是根茎组织还是叶片组织还是果实组织,都应该采用鲜重的计重方式,一般要遵循以下原则:    1.称取的组织重量不能低于50mg。    2.匀浆的比例按照10%,即1g组织加9ml的匀浆液,匀浆液一般选取PBS(PH=7.2-7.4)    3.组织在匀浆器匀浆过程中,匀浆液

新鲜实体组织样本的制备(机械法)

剪碎法网搓法研磨法实验方法原理机械法分散实体组织。用手术剪刀剪碎组织、用锋利的解剖刀剁碎组织或用匀浆器制成组织匀浆,再用细注射针头抽吸细胞或用 300 日尼龙网滤出单细胞悬液;采用网搓法也能获得大量细胞。机械法易造成细胞碎片和细胞团块,所以常与其他方法配合使用。实验材料组织          

组织样本暂存20度能放多久

1个月。组织样本暂存-20度能放1个月,2-8度下可以保存一周时间,-20度可以保存1个月。-80度可以保存1年以上。-196度可以保存10年以上。组织(tissue)在多细胞生物,通常是指构成它的细胞分化,机能上出现专职分工,因而它不是细胞的单一的集合体,而是具有某种机能和构造的有机的细胞群,是一

华人学者发表重要技术突破:将分辨率推向极限

  蛋白质大多不是独行侠,它们喜欢形成复合物共同执行任务。跟踪观察这些分子机器的蛋白组分,对于理解生物学过程是至关重要的。获得诺贝尔奖的超高分辨率显微技术可以轻松分辨相距10-20nm的分子或分子复合物,但这些技术还不足以鉴别紧密复合物中的分子特征。  哈佛大学Wyss研究所的尹鹏(Peng Yin

图像分析显微镜的功能特点

中文名称图像分析显微镜英文名称quantitative image analysis microscope定  义利用扫描原理和光度测量法进行图像分析的显微镜。应用学科机械工程(一级学科),光学仪器(二级学科),显微镜-显微镜名称(三级学科)

图像分析显微镜的功能介绍

中文名称图像分析显微镜英文名称quantitative image analysis microscope定  义利用扫描原理和光度测量法进行图像分析的显微镜。应用学科机械工程(一级学科),光学仪器(二级学科),显微镜-显微镜名称(三级学科)

科学家绘制脑癌组织详细图像

  近日,美国布列根和妇女医院联合麻省理工学院的科研团队,使用一种名为“去拥挤扩张病理学”(dExPath)的新型显微技术,获得了脑癌组织的详细图像。这对侵袭性神经系统疾病的诊断和治疗具有潜在意义。相关成果发表于《科学-转化医学》。  科研团队开发的去拥挤扩张病理学技术,将组织嵌入凝胶,用特殊化学处

你的智能手机能帮助诊断癌症-D3系统可提供快速检查

  通过计量与细胞结合的肿瘤标记靶向微珠的数量,D3系统能像传统病理检查一样,区分活检样本的风险高低。  最近,美国麻省总医院(MGH)研究人员开发出一种新的诊断平台,能利用智能手机对肿瘤及其他疾病做出快速、精确的分子诊断,为缺乏先进医疗技术的地区带来好处。相关论文在线发表在美国《国家科学院院刊》上

激光扫描共聚焦显微镜的应用

  应用功能  激光扫描共聚焦显微镜(Confocal laser scanning microscope,CLSM)是近代最先进的细胞生物医学分析仪器之一。它是在荧光显微镜成像的基础上加装激光扫描装置,使用紫外光或可见光激光荧光探针,利用计算机进行图像处理,不仅可观察固定的细胞、组织切片,还可对活

再创纪录!AI系统可诊断近100种脑癌

今日,《自然》杂志再出人工智能重磅成果。来自美国、德国、意大利等100多个实验室的近150位科学家通力合作,联合在顶级期刊《自然》发表了这篇文章,他们开发了一个超级AI系统,该系统基于肿瘤组织DNA的甲基化数据,可以准确区分近100种不同的中枢神经系统肿瘤。更厉害的是,这个AI系统还能自学成才,发现

细胞检测技术的流程分享

细胞检测技术的流程会因具体的检测方法和目的而有所不同,但通常包括以下几个主要步骤:样本采集根据检测的需求,从患者(如血液、组织、脑脊液等)或细胞培养体系中收集细胞样本。样本预处理对于血液样本,可能需要进行红细胞裂解以富集白细胞。组织样本通常需要进行消化处理,将细胞分散。细胞培养样本可能需要离心收集细

DNA分子杂交原理

DNA分子杂交的原理是,具有互补碱基序列的DNA分子,可以通过碱基对之间形成氢键等,形成稳定的双链区.如果两DNA有一段相同碱基的话,就能形成氢键,且形成稳定的双链区

PCR扩增样本DNA的HLA基因片段

一、PCR扩增体系1. 1.0uM 引物2. 300ng待测样本基因组DNA3. 2.0U Taq多聚酶4. 200uM 各种dNTP5. 用1 X PCR缓冲液(10mM Tris-HCl,pH8.3,50mM KCl,1.5mM MgCl2,0.01%明胶)调至总体积100ul,并用50ul矿物

ELISA常见样本的处理方法—细胞样本

ELISA(酶联免疫吸附剂测定)是一种快速、灵敏、准确可靠的一种定量分析方法,样本的处理对于ELISA实验的成功有着举足轻重的作用。 利用ELISA进行检测的样本类型包括常见的血液(血清、血浆),组织匀浆、细胞裂解液、细胞培养上清以及不常见的皮肤组织、尿液、粪便、肺泡灌洗液、唾液、脑脊液、胸腹水、前

激光扫描共聚焦显微镜技术的主要应用范围

  激光扫描共聚焦显微镜(Confocal laser scanning microscope,CLSM)是近代最先进的细胞生物医学分析仪器之一。目前,激光扫描共聚焦显微技术已用于细胞形态定位、立体结构重组、动态变化过程等研究,并提供定量荧光测定、定量图像分析等实用研究手段,结合其他相关生物技术,在

卡三科技创业公司研发新型极速3D显微镜

  这种新一代显微镜可通过使用平面激光束基本上实时展现微小物品(在1毫米和2厘米之间)的三维图像,因此可以实时跟踪动物的发展变化。例如:“我们可以观测斑马鱼心脏如何跳动并通过三位图像进行重建。这个技术可以进行很多心血管疾病方面的研究,并更好的了解心脏的运作。”卡三生物工程和航天工程学院教师,4DNa