华人学者发表重要技术突破:将分辨率推向极限
蛋白质大多不是独行侠,它们喜欢形成复合物共同执行任务。跟踪观察这些分子机器的蛋白组分,对于理解生物学过程是至关重要的。获得诺贝尔奖的超高分辨率显微技术可以轻松分辨相距10-20nm的分子或分子复合物,但这些技术还不足以鉴别紧密复合物中的分子特征。 哈佛大学Wyss研究所的尹鹏(Peng Yin)教授领导研究团队在这方面取得了重要的突破。他们用自己开发的离散分子成像DMI(discrete molecular imaging)技术分析紧密复合物的组分,达到了光学显微镜目前最高的分辨率——5nm。这项引人注目的研究于七月四日发表在Nature Nanotechnology杂志上。 尹鹏早年毕业于北京大学,在美国杜克大学取得博士学位,现在任哈佛大学Wyss研究院的教授。他主要从事分子工程、生物学与信息科学等方面的研究,曾荣获2010年美国NIH院长创新奖。近几年尹鹏教授在Nature、Science、Cell等顶级期刊上发表了......阅读全文
蛋白质复合物的组装
正确组装多蛋白复合物很重要,因为组装错误会导致灾难性的后果。为了研究通路组装,研究人员研究了通路中的中间步骤。一种允许这样做的技术是电喷雾质谱法,它可以同时识别不同的中间状态。这导致发现大多数复合物遵循有序的组装路径。在可能发生无序组装的情况下,由于无序组装导致聚集,从有序状态到无序状态的改变导致复
蛋白质复合物的结构
蛋白质复合物的分子结构可以通过实验技术确定,例如X射线晶体学,单颗粒分析或核磁共振。蛋白质-蛋白质对接的理论选择也越来越多。是通常用于识别一个meomplexes方法是免疫沉淀。最近,Raicu及其同事开发了一种确定活细胞中蛋白质复合物的四级结构的方法。该方法基于确定像素级Förster共振能量转移
蛋白质复合物的功能介绍
蛋白质复合物的形成有时起到激活或抑制一个或多个复合物成员的作用,因此,蛋白质复合物的形成可以类似于磷酸化。单个蛋白质可以参与各种不同蛋白质复合物的形成。不同的复合体执行不同的功能,并且相同的复合体可以执行取决于多种因素的非常不同的功能。其中一些因素是:包含复合物时,复合物存在于哪个隔室中复合物存在于
蛋白质复合物的类型介绍
专性vs非专性蛋白质复合物如果蛋白质可以在体内自身(没有任何其他相关的蛋白质)形成稳定的折叠良好的结构,则由这种蛋白质形成的复合物称为“非专性蛋白质复合物”。但是,某些蛋白质不能单独产生稳定的折叠结构,而可以作为稳定复合蛋白质的蛋白质复合物的一部分而被发现。这样的蛋白质复合物被称为“专性蛋白质复合物
蛋白质复合物的特点和功能
蛋白质复合物是一组两个或多个相关联的多肽链。不同的多肽链可以具有不同的功能。这不同于多酶复合物,其中在单个多肽链中发现多个催化结构域。蛋白质复合物是四级结构的 一种形式。蛋白质复合物中的蛋白质通过非共价 蛋白质与蛋白质的相互作用联系在一起,不同的蛋白质复合物随时间推移具有不同程度的稳定性。这些复合物
科学家开发蛋白质复合物原位解析新技术
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500192.shtm作为生命活动的执行者,蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显
《自然》发表研究:人工智能破解蛋白质复合物密码
在蛋白质结构预测上,人工智能革命仍在继续。一年前,软件程序首次成功地模拟了单个蛋白质的3D形状,其精确度与几十年前的实验技术测出的一样准确。今年夏天,研究人员利用人工智能程序编程了一个近乎完整的人类蛋白质结构目录。 现在,美国研究人员更进一步,使用人工智能技术确定了不同蛋白质之间可能的相互作用
德国应用化学:蛋白质复合物原位解析新技术
作为生命活动的执行者,蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和
特殊蛋白质打破生物学核心规则
生物学核心规则是:一个细胞中的信息往往从DNA开始,然后通过核糖核酸(RNA)通路到达蛋白……然而Phys.org报道称,在1月2日发表于《科学》的论文中,研究人员发现了一种打破这种规则的蛋白。当一个细胞在建立蛋白时出现某种错误后,另一个蛋白Rqc2就趁虚而入,在没有DNA或RNA的任何指导下向
先天免疫相关蛋白质复合物结构与功能研究计划启动
3月27日,蛋白质研究国家重大科学研究计划“先天免疫相关蛋白质复合物结构与功能的研究”项目部署会在北京召开。项目首席科学家清华大学柴继杰教授介绍了项目的总体情况、整体研究目标和课题间的相互衔接和依托关系,并就项目管理、经费使用、课题和单位间的协作互动等提出了具体要求,各课题负责人介绍了课题的准备
生化与细胞所揭示MHF复合物发挥生物学功能的分子机制
2月7日,《细胞》子刊《结构》(Structure)报道了中科院上海生科院生化与细胞所丁建平组、周金秋组关于MHF复合物的最新研究成果。 范可尼贫血症(Fanconi anemia,FA)是一种遗传性血液系统疾病,患者除骨髓造血功能障碍导致全血细胞减少外,还伴有多发性先天畸形,并易患多
中科院大连化物所开发蛋白质复合物原位解析新技术
近日,中科院大连化物所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员团队研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者,蛋白质通
蛋白质药物递送及神经化学生物学应用
蛋白质是生命活动的主要执行者。人类疾病的发生、发展与细胞内蛋白质的表达异常或功能缺失密切相关。因此,活细胞层次递送蛋白质药物对于生命过程的化学干预、疾病诊断和治疗研究具有重要意义。 在国家自然科学基金委、科技部和中国科学院的支持下,化学所活体分析化学实验室汪铭课题组近来围绕蛋白质药物智能递送开
酿酒酵母源Shu复合物在DNA同源重组过程中发挥生物学功能
近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所丁建平研究组的研究成果,以Structural basis for the functional role of the Shu complex in homologous recombination为题,在线发表在《核酸研究》(Nuc
酿酒酵母源Shu复合物在DNA同源重组过程中发挥生物学功能
近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所丁建平研究组的研究成果,以Structural basis for the functional role of the Shu complex in homologous recombination为题,在线发表在《核酸研究》(Nuc
C/D-RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理
上海光源用户研究发现C/D RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理 1月27日,北京生命科学研究所叶克穷实验室在《自然》杂志发表了题为Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA
《细胞生物学》:日探明肌体处理异常蛋白质机制
为早老性痴呆症患者带来曙光 前段时间,美国一项研究显示,目前全球早老性痴呆症患者约有2660万,预计到2050年这一数字将会翻两番,突破1亿,即大约每85个人中就有1人患有该病。其中超过40%为晚期患者,生活不能自理。早老性痴呆症又称阿尔茨海默氏症,患者大脑中的一种淀粉状蛋白出现异常堆积,导致脑细
基因和蛋白质研究为蜘蛛生物学开启新时代
在展示大自然魔鬼般的创造力方面,很难有什么能打败蜘蛛。以隐居的鬼面蜘蛛为例,它们长着很大的尖牙以及凸起且超大的中眼。在整个热带地区,这些八条腿的怪兽挂在树枝上,并在前腿中间撑起一张可伸展的丝网,以便它们能以闪电般的速度将网罩在猎物上。相比之下,艳丽的孔雀蜘蛛到处炫耀彩虹色的腹部以吸引异性,而它
我所发表功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略综述
近日,我所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组(1822组)王方军研究员团队与南方科技大学田瑞军教授团队合作,发表了功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略的综述文章。 功能蛋白复合物的发现和结构—功能表征研究在理解和干预生物学过程中发挥着至关重要的作用。亲和纯化质谱(AP-MS)是发现功
大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展
中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作(Nature Structural & Molecular Biology)基础上,再次与合作者利用结构生物学手段,揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和RNA的
蛋白质糖基化检测实验_生物素亲和素复合物观察糖蛋白
用生物素-亲和素复合物观察选择性标记糖蛋白实验材料蛋白样品试剂、试剂盒醋酸钠丙酮实验步骤一、过碘酸钠氧化糖蛋白样品1. 在 0.1 mol/L 醋酸钠 pH 4.5 缓冲液(50 mmol/L 磷酸钠,pH 7.4 ) 中制备蛋白溶液,在冰上预冷。2. 用水制备新鲜的 0.5 mol/L 过碘酸钠原
关于原子力显微镜对核酸与蛋白质复合物的观测研究介绍
DNA 和蛋白质分子的特定相互作用在分子生物学中起着关键作用。蛋白质与DNA 结合的精确位点图谱和不同细胞状态下结合位点的测定对于了解复杂细胞体系的功能与机理,特别是基因表达的控制都十分关键。原子力显微镜 作为一种高度分辨达0。1 nm,宽度分辨率为2 nm 左右的表面分析技术,已广泛地用于表征
科学家将人工智能技术成功用于蛋白质复合物结构预测
蛋白质作为构成人体组织器官的支架和主要物质,在人体生命活动中起着重要作用。蛋白质的相互作用能产生许多效应,如形成特异底物作用通道、生成新的结合位点、失活、作用底物专一性和动力学变化等,细胞的代谢、信号传导以及基因表达调控都与错综复杂的蛋白质相互作用网络密切相关。 蛋白质的三维空间结构对蛋白质相
基于糖苷键质谱可碎裂交联剂的蛋白质复合物原位解析
近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队,研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者,蛋白质通过相
科学家将人工智能技术成功用于蛋白质复合物结构预测
蛋白质作为构成人体组织器官的支架和主要物质,在人体生命活动中起着重要作用。蛋白质的相互作用能产生许多效应,如形成特异底物作用通道、生成新的结合位点、失活、作用底物专一性和动力学变化等,细胞的代谢、信号传导以及基因表达调控都与错综复杂的蛋白质相互作用网络密切相关。 蛋白质的三维空间结构对蛋白质相
《细胞生物学杂志》:日探明肌体处理异常蛋白质机制
日本研究人员在10月9日出版的美国《细胞生物学杂志》(Journal of Cell Biology)上报告说,他们探明了肌体处理异常蛋白质的机制,这将有助于找到新方法,治疗阿尔茨海默氏症(早老性痴呆症)等由异常蛋白质堆积引发的疾病。 日本奈良尖端科学技术研究生院大学的研究人员木俣行雄等发现,细胞内
Nature颠覆生物学教条:至关重要的新蛋白质家族
哈佛医学院的科学家们发现了几乎所有的细菌利用来构建和维持细胞壁的一个新的蛋白质家族。 研究的领导者David Rudner和Thomas Bernhardt说,发现第二组细胞壁合成者可帮助为开发出急需的疗法以靶向细胞壁作为一种途径来杀死有害细菌铺平道路。 研究结果发布在8与15日的《自然》
分子生物学蛋白质磷酸化分析技术
在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更为复杂。 真核 生 物 细胞蛋白质中主要的磷酸化氨基酸为丝氨
分子生物学蛋白质磷酸化分析技术
在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更为复杂。 真核 生 物 细胞蛋白质中主要的磷酸化氨基酸为丝氨
酶复合物的性质
复合体中第一个酶催化的产物,直接由邻近下一个酶催化,第二个酶催化的产物又为复合体第三酶的底物,如此形成一条结构紧密的“流水生产线”,使催化效率显著提高。 有点区别的多酶体系是这个反应体系,包括所有的酶。