消减cDNA或基因组DNA文库的制备实验

试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 放射性化合物 酚 仪器、耗材 热循环仪 水浴箱 琼脂糖凝胶电泳所需的试剂与设备 实验步骤 第1阶段:RNA和DNA的分离一次双向消减,需要总量为2ug的基因组DNA或cDNA。大多数分离RNA和基因组DNA的方法都适用于本实验(Sambrooketal.1989;Chomczynskiand Sacchi 1987;Farrell199......阅读全文

cDNA能存放多久

不要反复冻融就没有太大影响,可以放在-70度长期保存。

cDNA的筛选2

(三)免疫筛选制备Sepharose偶联细菌裂解液1.各用一个E.coli温度敏感溶源菌株(BTA 282(λgt11amp3)或BNN 97)单菌落接种于2×7.5ml培养基并于32℃生长过夜。2.过夜培养物用LB培养基稀释100倍,于32℃生长至OD600值为0.5。3.于45℃温育15min诱

cDNA的筛选1

(一)λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1.用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基(Y1088用于噬菌斑杂交,Y1090用于免疫筛选),于37℃振荡培养过夜。2.将过夜培养物以3000×g离心5min。3.分别用2ml λ-dil(10 mmol/L tris-Cl,

Differential-cDNA-Screening-Procedures

Differential cDNA Screening ProceduresThe protocols listed refer to cDNA library construction and preliminary differential screening procedures. They

cDNA的筛选3

免疫学染色1.为了洗去顶层琼脂上的残余物和细胞碎片,将硝酸纤维素滤膜一次最多5张转移放在摇床上的盘子(10×10cm)内,用25ml TBS室温洗涤10 min 2次。2.然后滤膜用25ml封闭缓冲液(每张90mm直径的滤膜至少15ml)于室温温育 30min,以封闭滤膜上的非特异性结合位点。不断晃

cDNA能存放多久

不要反复冻融就没有太大影响,可以放在-70度长期保存。

cDNA-文库的构建

            实验材料 λ噬菌体臂 大肠杆菌菌株 用于λ噬菌体的包装抽提物 试剂、试剂盒 放线菌素 D

cDNA克隆的定义

中文名称cDNA克隆英文名称cDNA cloning定  义从基因的转录产物(如mRNA)开始,逆转录合成互补DNA(cDNA),然后重组入载体,经过复制,筛选得到单一种cDNA分子的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

cDNA浓度的测定

理论上讲,等质量是必要的。但是就反转录结果而言,里面的成分太多,测量浓度的误差比较大。我们实验室一般都是测量RNA的浓度,然后取等量RNA、过量oligodT做充分反转录,再取等量反转录体系做PCR。另外,我看你用条带定量?这样很不准确,因为你也不知道PCR多少循环后达到饱和。比方说,组间差8倍,差

cDNA合成技术1

Promega公司的RibocloneR M-MLV(H- ) cDNA合成系统采用M-MLV反转录酶的RNase H缺失突变株取代AMV反转录酶,使合成的cDNA更长。该系统的第一链合成使用M-MLV反转录酶,cDNA第二链合成采用置换合成法,采用 RNaseH和DNA聚合酶Ⅰ进行置换合成

cDNA-文库的构建

此经典方案建立在 Gubler-Hoffman 法(Gulber-Hoffman 1983) 之上,分为六个阶段。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。实验材料λ噬菌体臂大肠杆菌菌株用于λ噬菌体的包装抽提物试剂、试剂盒放线菌素 D二硫苏糖醇EDTATris-ClMgCl2反转录酶

cDNA合成技术3

2. 电泳分析(1) 用50mM NaCl, 1mM EDTA制备1.4%的碱性琼脂糖电泳, 并置碱性电泳缓冲液中30分钟。(2) 取样品液, 用TE调整体积, 使第一链和第二链产率测定液的体积相同,加入等体积的2×样品缓冲液(20mmol/L NaOH, 20%甘油,0.025%溴粉兰)。(3)

cDNA浓度的测定

理论上讲,等质量是必要的。但是就反转录结果而言,里面的成分太多,测量浓度的误差比较大。我们实验室一般都是测量RNA的浓度,然后取等量RNA、过量oligodT做充分反转录,再取等量反转录体系做PCR。另外,我看你用条带定量?这样很不准确,因为你也不知道PCR多少循环后达到饱和。比方说,组间差8倍,差

cDNA文库组标准流程五:cDNA双链和载体的连接

1.连接:根据载体和cDNA的电泳定量结果,每个样品设置3个比例的连接,即:insert/vector=1/3  incert/vector=1/1   insert/vector=3/1按以下体系依次加入:      ddH2O                      xulT4 ligase

锚定酶消化cDNA实验

试剂、试剂盒 溶液与缓冲液引物仪器、耗材 试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤 实验方案 A1.通过加入下列物质来消化双链 cDNA2.在 37°C 下消化 lh。3.65°C 孵育 20 min 热失活限制性酶。4.等体积 PCI 抽提后乙醇沉淀(实验方案 A, 第

cDNA-文库的构建2

阶段 3:cDNA 的甲基化材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿10XEcoRⅠ 缓冲液1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液(选用)如希望,可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)NaCl(5mol/L)

Experimental-Protocol-for-cDNA-Library-Construction

Experimental Protocol for cDNA Library ConstructionIdentify appropriate celltype over-expressing corresponding gene.Find out if transcription can be s

cDNA文库的构建1

分为六个阶段:阶段1:反转录酶催化合成cDNA第一链阶段2:cDNA第二链的合成阶段3:cDNA的甲基化阶段4:接头或衔接子的连接阶段5:Sepharose CL-4B凝胶过滤法分离cDNA阶段6:cDNA与λ噬菌体臂的连接 [阶段1:反转录酶催化合成cDNA第一链] 1.在置于冰上的无菌微

cDNA文库的物化方法

  基因工程初始阶段所用的方法,已不用。利用核酸双螺旋之间存在着碱基G C,A T配对特性,分离目的基因。  例如:海胆rDNA分子内其G C含量可以达63%(其稳定性高,溶解温度高),通过热变性和S1酶解处理可得到提纯50倍的rDNA,最后经氯化铯平衡梯度离心,得到相对分子量为1.9X107Dal

cDNA-文库的构建(三)

阶段 3:cDNA 的甲基化材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿10XEcoRⅠ 缓冲液1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液(选用)如希望,可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)NaCl(5mol/L)

cDNA-文库的构建(四)

方法cDNA 末端的削平1.cDNA样品(来自步骤 11)于 68°C 加热5 min。这一步骤是使cDNA分子的单链突出端可能形成的双链结构发生变性。2. 将cDNA溶液冷却至37°C并加入下列试剂:5xT4噬菌体DNA聚合酶修复缓冲液                              

锚定酶消化cDNA实验

            试剂、试剂盒 溶液与缓冲液 引物 仪器、耗材 试剂盒 MPC-E PCR仪

cDNA-扩增和影印实验

实验材料保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列试剂、试剂盒LB 培养基超级肉汤培养基乙醇裂解液RNA 酶溶液缓冲液乙醇 乙酸溶液丁二酸酐1-甲基-2-吡咯烷酮硼酸钠仪器、耗材离心机96 孔热循环仪水浴锅微量滴定板清洗仪实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 将密

制备cDNA的基本介绍

  制备互补DNA,往往需要先分离从目的基因转录来的mRNA.如果该基因编码的蛋白质是细胞中的主要蛋白质,则此基因的产物是总mRNA的主要组成部分 [2] 。就胰岛B细胞而论,此细胞含有高水平胰岛素前体mRNA,后者有时可以沉淀正在翻译的mRNA的核糖核蛋白体,如果用特异抗体结合所表达的蛋白质(抗原

cDNA文库的构建2

10. Sephadex G-50用含有10 mmol/L NaCl的TE(pH7.6)溶液进行平衡,然后通过离子柱层析将未掺入的dNTP和 cDNA分开。11. 加入0.1倍体积的3mol/L乙酸钠(pH5.2)和2倍体积的乙醇,沉淀柱层析洗脱下来的cDNA,将样品置于冰上至少15分钟,然后在微量

cDNA-探针的制备方法

首先需分离纯化相应mRNA,这从含有大量mRNA的组织、细胞中比较容易做到,如从造血细胞中制备α或β珠蛋白mRNA。有了mRNA作模板后,在逆转录酶的作用下,就可以合成与之互补的DNA(即cDNA),cDNA与待测基因的编码区有完全相同的碱基顺序,但内含子已在加工过程中切除。

锚定酶消化cDNA实验

试剂、试剂盒溶液与缓冲液引物仪器、耗材试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤实验方案 A1.通过加入下列物质来消化双链 cDNA2.在 37°C 下消化 lh。3.65°C 孵育 20 min 热失活限制性酶。4.等体积 PCI 抽提后乙醇沉淀(实验方案 A, 第 2 步

cDNA-扩增和影印实验

            实验方法原理 实验材料 保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列 试剂、试剂盒

cDNA-文库的构建(二)

7. 尽可能快地进行 cDNA 合成的下一步骤阶段 2:cDNA 第二链的合成材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿EDTA(0.5mol/LpH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)(NH4)2SO4(1mol/L)将 1.3 g 固体硫酸铵溶解于终体积为 10 ml 的水中,溶液经滤膜过滤

cDNA文库的构建3

接头-衔接子与cDNA的连接8.将下列试剂加入到已削成平末端的DNA中:10×T4噬菌体DNA聚合酶修复缓冲液 2μl800~1000 ng 的磷酸化接头或衔接子 2μlT4噬菌体DNA连接酶(105 Weiss单位/ml) 1μl10 mmol/L ATP 2μl混匀后,在16℃温育8~12h。9