cDNA法推断蛋白质的一级结构实验
一、蛋白质的纯化和肽段氨基酸序列分析 二、引物的设计 三、用 PCR 扩增目的 cDNA 片段 四、cDNA 的克隆及测序 五、cDNA 序列的分析及蛋白质一级结构的确定 实验方法原理 将 SDS-PAGE 上的蛋白质样品从凝胶上分离出来是很困难的，目前流行的方法是将蛋白质电印迹（electrobloting） 至 PVDF 膜上，直接进行序列分析或直接在膜上进行酶解，后者称为原位分析。 实验材料 蛋白质样品 试剂、试剂盒 ......阅读全文
RLMRACE法合成双链cDNA
实验概要掌握合成双链cDNA的RLM-RACE技术，可构建高质量的cDNA文库。主要试剂1. 酶类及分子量标准 1) 高保真酶Easy-A high fidelity cloning enzyme,Merck公司Stratagene系列； 2) Taq DNA Polymerase，上海申
研究提出纯数据驱动的高阶网络结构推断新方法
重构高阶网络的框架图和效果展示 安徽大学供图从网络科学视角对复杂的系统和数据进行建模，已成为一种主流的研究范式。在许多真实的复杂系统中，个体之间不仅存在“成对”的交互模式，还广泛存在超越成对关系的多体交互模式，即高阶交互。因此，研究具有高阶拓扑结构的网络系统（高阶网络）具有重要的科学意义。现有的研究
转移核糖核酸的一级结构介绍
自1965年R．W．霍利等首次测出酵母丙氨酸tRNA的一级结构即核苷酸排列顺序到1983年已有200多个tRNA（包括不同生物来源、不同器官、细胞器的同功受体tRNA以及校正tRNA）的一级结构被阐明。按照A－U、G－C以及G－U碱基配对原则，除个别例外。
基于－PCR－的差减－cDNA－克隆实验
差减克隆是分离和鉴定两个细胞群中差异表达的 mRNA 的有效技术。相比较的细胞类型是［＋］（或 测 试）细胞和［-］（或驱动）细胞，在测试细胞中表达而不在驱动细胞中表达的 mRNA 将被分离出来。必需的差减次数主要取决于 cDNA 的多样性。多样性是指每一个细胞类型中不同的cDNA 或 cDNA 片
基于－PCR－的差减－cDNA－克隆实验
实验方法原理 实验材料 A 和 B 类细胞的双链 cDNA （ds cDNA）试剂、试剂盒 ALuIRsaIATPT4 多聚核苷酸激酶及其缓冲液DNA连接酶和及其缓冲液Taq DNA聚合酶及其缓冲液寡核苷酸引物4dNTP 混合物驱动 dNTP 混合物转化感受态菌株HEPES缓冲液链霉亲和素溶
cDNA的合成实验原理和操作步骤
一、实验目的掌握植物cDNA合成的原理和方法二、实验原理反转录酶主要用于体外cDNA的合成。目前最常用的反转录酶(reverse transcriptase) 有SuperscriptII、M-MLV和AMV等。它们具有依赖于RNA或DNA的DNA聚合酶活性和RNaseH酶活性，可以以RNA分子
基于－PCR－的差减－cDNA－克隆实验
实验方法原理 实验材料 A 和 B 类细胞的双链 cDNA （ds cDNA） 试剂、试剂盒
用于推断蛋白质进化路径的技术被认为是不可靠的
对祖先的视觉色素和它们的突变型的实验性研究对蛋白质进化研究广泛使用的简化假定提出了质疑 发表在11月号的《生物科学》(BioScience)杂志上的一篇论文说，生物学家在过去四分之一世纪里在研究蛋白质分子进化广泛依赖的一个关键假定是“很成问题的”。 美国埃默里大学的视觉研究人员Sho
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；
蛋白质序列分析和结构预测实验
蛋白质序列分析和结构预测实验 实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；（
疏水作用层析法纯化蛋白质实验
实验方法原理 在疏水层析的主要支持介质上含有大小不等的疏水侧链，烷基或芳香基，可是绝大多数情况起作用的是苯基或辛基。当碳氢链长度增加，即变得更疏水时，疏水强的少量蛋白质被吸附。这时疏水相互作用太强，需用极端方法洗脱，可能会导致蛋白质变性。苯基琼脂糖比辛基琼脂糖疏水性低，是疏水纯化中效果不错的常用介质
疏水作用层析法纯化蛋白质实验
疏水作用层析法 实验方法原理 在疏水层析的主要支持介质上含有大小不等的疏水侧链，烷基或芳香基，可是绝大多数情况起作用的是苯基或辛基。当碳氢链长度增加，即变得更
疏水作用层析法纯化蛋白质实验
疏水相互作用层析是以介质疏水基团和蛋白质疏水区域间的亲和作用为基础的。疏水力是浸在一种极性液体（如水）中的非极性物质的排斥力。胞膜蛋白都具有一个明显的疏水区域以锚定在膜上。可溶性蛋白质在外表面上可能存在疏水小区，它促进蛋白复合物的形成，也可能是疏水配基结合部位或活性部位。这些暴露的疏水区对疏水层析纯
蛋白质染色实验——快速银染法
实验材料蛋白质试剂、试剂盒甲醛固定液硫代硫酸钠干胶液甲醇仪器、耗材摇床透析膜实验步骤1. 将凝胶置于塑料容器中，加入50 ml 甲醛固定液，在旋转摇床中缓慢摇动10 min。 2. 倾去固定液，用水冼两次，每次5 min，缓慢摇动。 3. 倾去水，凝胶浸泡在0.2 g/l 硫代硫酸钠溶液中1 m
用新－RACE－法扩増－cDNA－的－5末端
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 仪器、耗材 特殊设备
用新－RACE－法扩増－cDNA－的－5末端
这一实验方案分为 6 个阶段。第 1 阶段：降解 RNA 的去磷酸化; 第 2 阶段：完整 RNA 去帽; 第 3 阶段：RNA 寡核苷酸的制备; 第 4 阶段：RNA 寡核苷酸与细胞 RNA 的连接; 第 5 阶段：反转录; 第 6 阶段：扩增。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康
反转录合成单链－cDNA－实验
cDNA 合成反应的体积，依赖于所用的锚定-任意引物组合的数目。下面提供的方案，适用于 24 个引物组合和两个样品。对于更多的样品和/或更多的引物组合，调整相应主体混合液的体积。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒RNART主体混合液仪器、耗材薄壁PCR管离心管
反转录合成单链－cDNA－实验
试剂、试剂盒 RNART主体混合液仪器、耗材 薄壁PCR管离心管热循环仪实验步骤 一、材料1.核酸和寡核苷酸来自方案2的RNA为每个单独的H-T11M引物，分别配制RT主体混合液蒸馏水 28.2ul5XRT缓冲液
反转录合成单链－cDNA－实验
试剂、试剂盒 RNA RT主体混合液 仪器、耗材 薄壁PCR管 离心管 热循环仪
蛋白质三级结构预测－线索化法
线索化模型产生的背景及发展上面已经提到，两个自然进化的蛋白质如果具有30%的等同序列，则它们是同源的蛋白质，具有基本相同的三维结构。那么，其余的是否就不是同源的呢？实际并非如此。在最新的蛋白质数据库PDB中，有上千对蛋白质具有同源的空间结构，但它们的序列等同部分小于25%，即远程同源。许多结构相似的
离子交换层析法蛋白质的纯化实验
实验方法原理 可进行离子交换的蛋白质在实验条件下必须有单一电荷。溶液中单一电荷的蛋白质可被离子交换树脂上的小离子置换（指与蛋白质末端离子的交换）；固定在树脂上。通过提高溶液中相反离子浓度或降低蛋白质所带电荷数等方法可将蛋白质从树脂上洗脱下来。利用此法，可根据不同蛋白质电荷性质不同而将其分离开来。若已
滤胶过滤层析法蛋白质的纯化实验
实验方法原理 凝胶过滤层析是根据蛋白质分子大小不同而达到分离效果的，凝胶过滤填料中含有大量微孔，只允许缓冲液及小分子量蛋白质通过，而大分子蛋白质及一些蛋白复合物则被阻挡在外。因此，高分子量的蛋白质在填料颗粒间隙中流动，比低分于量蛋白更早地被洗脱下来。最大的蛋白质分子最早流出柱子，因为它们在到达柱底前
离子交换层析法蛋白质的纯化实验
离子交换层析在纯化蛋白质的层析手段中使用最为广泛。它对蛋白质的分辨率高，操作简易，重复性好，成本低。按照离子交换原理，蛋白质可从大量缓冲性溶液中被分离，所以此方法尤适于蛋白质粗提物的初始纯化。在分离蛋白质时，速度往往是很重要的。 如蛋白酶的初始分离和不稳定蛋白质的纯化。离子交換层析提供了很多加速分离
滤胶过滤层析法蛋白质的纯化实验
凝胶过滤层析法 实验方法原理 凝胶过滤层析是根据蛋白质分子大小不同而达到分离效果的，凝胶过滤填料中含有大量微孔，只允许缓冲液及小分子量蛋白质通过，而大分子蛋白
离子交换层析法蛋白质的纯化实验
离子交换层析法 实验方法原理 可进行离子交换的蛋白质在实验条件下必须有单一电荷。溶液中单一电荷的蛋白质可被离子交换树脂上的小离子置换（指与蛋白质末端离子的交换
染料配基层析法纯化蛋白质实验——染料配基法
染料配基层析不是真正意义的亲和层析，因为它们并不是与它们结合的蛋白质的天然配基。然而染料柱能很好地结合蛋白质，并能导致满意地纯化蛋白质。事实上，有时这种结合甚至比正常的配基更紧。染料配基柱通常是廉价和稳定的，并且具有较高的蛋白质结合容量。所以染料配基层析能作为蛋白质纯化中有价值的步骤之一。来源：《蛋
用经典－RACE－扩增－cDNA－的5’末端实验
这一实验方案分为 3 个阶段。 第 1 阶段：反转录产生 cDNA 模板 ；第 2 阶段：在第一链 cDNA 产物末端加 poly(A) 尾 ；第 3 阶段：扩增。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒GSP-RT 引物poly(A)+RNA 或总 RNA反转录缓
用经典－RACE－扩增－cDNA－的5’末端实验
试剂、试剂盒 GSP-RT 引物poly(A)+RNA 或总 RNA反转录缓冲液 RNA 酶 HRNasinSuperScriptII 逆转录酶dNTP 溶液DTTTECoCl2dATP 溶液脱氧核苷酸末端转移酶加尾缓冲液 HerculesHot-Start 聚合酶HerculesHot
用经典－RACE－扩增－cDNA－的5’末端实验
试剂、试剂盒 GSP-RT 引物 poly(A)+RNA 或总 RNA 反转录缓冲液 RNA 酶 H RNasin SuperScriptI