基于PCR的差减cDNA克隆实验
实验方法原理 实验材料 A 和 B 类细胞的双链 cDNA (ds cDNA)试剂、试剂盒 ALuIRsaIATPT4 多聚核苷酸激酶及其缓冲液DNA连接酶和及其缓冲液Taq DNA聚合酶及其缓冲液寡核苷酸引物4dNTP 混合物驱动 dNTP 混合物转化感受态菌株HEPES缓冲液链霉亲和素溶液差减杂交缓冲液聚乙二醇 8000苯酚 氯仿氯仿矿物油乙醇MgCl2NaCl仪器、耗材 放射性标记的差减探针PCR 管微量离心管离子交换PCR离心柱Sephacryl S-300 离心柱离心机热循环仪手提式盖格计数器加热块实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 对每一组 ds cDNA (A 和 B)配制 2 个限制性内切核酸酶消化反应(AluI 和 AluI+Rsal): 30 ng ds cDNA 3 ul 10×AluI 缓冲液 10 U AluI 或 10 U AluI+10 U RsaI加水到 30......阅读全文
基于-PCR-的差减-cDNA-克隆实验
差减克隆是分离和鉴定两个细胞群中差异表达的 mRNA 的有效技术。相比较的细胞类型是[+](或 测 试)细胞和[-](或驱动)细胞,在测试细胞中表达而不在驱动细胞中表达的 mRNA 将被分离出来。必需的差减次数主要取决于 cDNA 的多样性。多样性是指每一个细胞类型中不同的cDNA 或 cDNA 片
基于-PCR-的差减-cDNA-克隆实验
实验方法原理 实验材料 A 和 B 类细胞的双链 cDNA (ds cDNA)试剂、试剂盒 ALuIRsaIATPT4 多聚核苷酸激酶及其缓冲液DNA连接酶和及其缓冲液Taq DNA聚合酶及其缓冲液寡核苷酸引物4dNTP 混合物驱动 dNTP 混合物转化感受态菌株HEPES缓冲液链霉亲和素溶
基于-PCR-的差减-cDNA-克隆实验
实验方法原理 实验材料 A 和 B 类细胞的双链 cDNA (ds cDNA) 试剂、试剂盒
差减-cDNA-文库的建立实验
差减文库包含了存在于一种细胞或组织而不存在于另一种细胞或组织的 mRNA cDNA 克隆。这个 cDNA 文库被用来分离相应于一类 mRNA 的一组 cDNA 克隆,或用 于分离一个特定mRNA 的 cDNA 克隆。这中间筛选 cDNA 克隆的过程是很费劳力的。来源:《精编分子生物学实验指南(第五版
差减-cDNA-文库的建立实验
基本方案 实验方法原理 实验材料 [+] 和 [-]cDNA 文库(ATCC 或 Stra
差减-cDNA-文库的建立实验
实验方法原理 实验材料 [+] 和 [-]cDNA 文库(ATCC 或 Stratagene)试剂、试剂盒 TE 缓冲液EcoRI EDTA蔗糖溶液琼脂糖凝胶TBE 缓冲液乙醇S1 核酸酶S1 核酸酶缓冲液苯酚 氯仿 异丙醇乙酸钠AluIRsaI去离子甲醜胺SDS酵母 tRNA氯仿 异丙醇磷
差减cDNA文库法
差减cDNA文库法[第一条链cDNA合成]1.合成第一条cDNA链时,所有试剂应按下列顺序依次加入:10×第一条链合成缓冲液 5.0μl10mM dNTP Mix(1.4μg/μl) 2.5μl(终浓度1.25mM)Linker prime
差减cDNA文库法3
[大量制备生产单链噬菌体DNA]1.新鲜过夜培养的宿主菌XLI-Blue,以1:20稀释在LB培养液中,在37℃培养扩增2小时。2.加1ml含单链cDNA的上清液。3.再于37℃继续培养2小时。4.然后将全部溶液转到500~1000mlLB中,生长5~6小时。5.9500rpm离心60分钟,除去细菌
差减cDNA文库法1
[第一条链cDNA合成] 1.合成第一条cDNA链时,所有试剂应按下列顺序依次加入: 10×第一条链合成缓冲液5.0μl 10mMdNTPMix(1.4μg/μl)2.5μl(终浓度1.25mM) Linkerprimer(1.4μl,终浓度100μg/μl) DEP
差减cDNA文库法2
[cDNA末端磷酸化]1.70℃灭活反应后,稍微离心一下,置室温5分钟。2.在反应混合物(10μl)中加入:1μl10×连接缓冲液2μl10mMATP1μl(10μ)DNA激酶 [限制性内切酶消化]以得到粘性末端 1.限制性内切酶消化DNA和载体。 2.在37℃保温1~5小时,然后冷却到
PCR技术在cDNA的克隆方面应用介绍
利用PCR技术,只需增加一步逆转录反应,便可从少数mRNA的构建cDNA文库,以mRNA为模板,以oligo(dT)为引物,在依赖于RNA 的DNA聚合酶催化下体外合成cDNA第一链之后,可通过PCR扩增此链。 如在此链的3'端再加上一段鸟苷酸残基同聚物,则可以使用oligo(dT)和
PK120-cDNA-克隆实验
基本方案 实验方法原理 实验材料 cDNA
PK120-cDNA-克隆实验
实验方法原理 实验材料 cDNA试剂、试剂盒 Ready-To-Go DNA 标记试剂盒人肝脏 λgt11 cDNA 文库人肝脏 λgt10 cDNA 文库杂交溶液SSC 溶液pBluescript II SK 载体仪器、耗材 PCR 扩增仪实验步骤 实验所需「试剂」具体见「其他」1. 杂交反应抽提
PK120-cDNA-克隆实验
实验材料cDNA试剂、试剂盒Ready-To-Go DNA 标记试剂盒人肝脏 λgt11 cDNA 文库人肝脏 λgt10 cDNA 文库杂交溶液SSC 溶液pBluescript II SK 载体仪器、耗材PCR 扩增仪实验步骤实验所需「试剂」具体见「其他」1. 杂交反应抽提出的 50bp 的 P
cDNA克隆的方法
cDNA克隆( cDNA cloing)与RNA互补的双链DNA片段,而且它能携在克隆载体中。通常用于克隆真核生物mRNA的DNA拷贝。由于cDNA持贝是一个成熟的信息分子拷贝,因此,无内含子顺序。如果在其克隆的藏体中连上一个适当的活动子序,它可在任何宿主体内得以迅速表达 。
cDNA克隆的概念
cDNA克隆( cDNA cloing)与RNA互补的双链DNA片段,而且它能携在克隆载体中。通常用于克隆真核生物mRNA的DNA拷贝。由于cDNA持贝是一个成熟的信息分子拷贝,因此,无内含子顺序。如果在其克隆的藏体中连上一个适当的活动子序,它可在任何宿主体内得以迅速表达
cDNA克隆的定义
中文名称cDNA克隆英文名称cDNA cloning定 义从基因的转录产物(如mRNA)开始,逆转录合成互补DNA(cDNA),然后重组入载体,经过复制,筛选得到单一种cDNA分子的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
差异表达-cDNA-的重新扩增、克隆与测序实验
从丙烯酰胺凝胶上切下潜在的差异表达 cDNA 之后,用同一种锚定-任意引物组合重新扩增 cDNA, 反应条件与最初 PCR 相同。重新扩增的产物,可以进行克隆和测序,以供进一步分析。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒琼脂糖凝胶蒸馏水DNA 点样染料甘油蒸馏水溴
差异表达-cDNA-的重新扩增、克隆与测序实验
试剂、试剂盒 琼脂糖凝胶蒸馏水 DNA 点样染料甘油蒸馏水 溴酚蓝 二甲苯腈 FF溴化乙锭溶液任意引物(H-AP)cDNAdNTP 混合液未标记的锚定引物载体特异性引物PCR 缓冲液Tris-HClKClMgCl2明胶 TaqDNA 聚合酶仪器、耗材 电泳装置离心管热循环仪薄壁 PCR 管UV 透射
差异表达-cDNA-的重新扩增、克隆与测序实验
试剂、试剂盒 琼脂糖凝胶 蒸馏水 DNA 点样染料 甘油 蒸馏水 溴酚蓝 二甲苯腈 FF 溴化乙锭
大规模-PCR-制作-cDNA-微阵列实验
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 生物分子 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 凝胶 仪器、耗材
大规模-PCR-制作-cDNA-微阵列实验
本方案描述了通过 PCR 扩增产物,来制作 cDNA 微阵列的实验步骤。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒缓冲液、溶液和试剂生物分子酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸凝胶仪器、耗材专用设备实验步骤第 1 阶段:影印铺板与工作库的制备一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂羧苄
cDNA克隆技术的特点
①有些生物,如RNA病毒没有DNA,只能用cDNA克隆;②cDNA克隆易筛选,因为cDNA库中不包含非结构基因的克隆,而且每一cDNA克隆只含一个mRNA的信息;③cDNA能在细菌中表达。cDNA仅代表某一发育阶段表达出来的遗传信息,只有基因文库才包含一个生物的完整遗传信息。
差示反转录PCR实验
mRNA差异显示法 荧光标记法 实验方法原理 几乎所有的真核基因mRNA分子的3’-末端,都带有一个多聚的腺苷酸结构,即通常所说的poly(A)尾巴
差示反转录PCR实验
实验方法原理 几乎所有的真核基因mRNA分子的3’-末端,都带有一个多聚的腺苷酸结构,即通常所说的poly(A)尾巴。因此,在RNA聚合酶的作用下,可按mRNA为模板,以oligo(dT)为引物合成出cDNA拷贝。根据mRNA分子3’-末端序列末端结构的分析可以看到,在这段poly(A)序列起点碱基
SSH抑制性消减杂交文库构建方法介绍
SSH是一项可以快速获取两个不同生物材料中差异表达基因的分子生物学技术,是快速筛选差异表达基因的有效方法,也是寻找新基因的重要手段。该技术尤其适合以genome尚不完全清晰的物种或者以特殊材料为研究对象的科研工作者。是基因芯片技术的有效补充。基本流程:通过差减文库构建,文库验证和筛选(逆向斑点杂交)
大规模-PCR-制作-cDNA-微阵列实验(一)
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂生物分子 酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸凝胶仪器、耗材 专用设备实验步骤 第 1 阶段:影印铺板与工作库的制备一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂羧苄西林(100ug/ml 储存溶液)乙醇(100%)甘油,45%(体积分数)LB 液体培养基。(1L LB 液体培养基含有 10
大规模-PCR-制作-cDNA-微阵列实验(二)
第 3 阶段:克隆的扩增与 PCR 产物的评估一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂DEPC 处理过的 H20TAE 缓冲液,1×(40 mmol/L Tris-乙酸盐,1 mmol/L EDTA,pH 约 8.5)DNA 点样缓冲液(200 g/LFicoll400,0.1mol/LNa2EDTA,pH
功能基因-cDNA-3’末端的克隆
一.原理 (1) 以目的mRNA 为模板,使用Oligo dT-3sites Adaptor Primer 进行反转录反应,合成1st Strand cDNA。 (2) 使用含有KpnI、XbaI、BamH I 酶切位点的上游特异性引物和3sites Adaptor Primer进行PCR反应。 (
功能基因cDNA-5’末端的克隆
一.原理⑴ 5’-RACE法① 以目的mRNA 为模板,使用5’末端P 标记的RT 引物进行反转录反应,合成1ststrand cDNA。② 使用RNase H 分解 Hybrid DNA-RNA中的RNA链。③ 使用T4 RNA Ligase 使单链cDNA进行环化或形成首尾连接物。④ 进行PCR