采用计算方法的组合式蛋白质设计策略实验
采用计算方法的组合式蛋白质设计策略 实验步骤 蛋白质设计中的概率性方法是提供在一个特定的蛋白质结构中对某氨基酸(出现)在一指定位点的概率估计。这里,我们讨论几种估计这些概率的方法并将重点放在直接解出这些概率的基于熵的自洽公式。2.1 关联序列的比对蛋白质结构的序列可变性可用序列和结构数据库来探讨。已知折叠为非常相似结构的序列可以从蛋白质数据库或结构比对数据库中鉴别出来 [48] 。如果一个序列的结构已知,具有足够序列相似性的 [ 如序列同一性(identity) 大于 40% ] 可以认为共享同一结构。对这样结构相似蛋白质的多序列比对可以把氨基酸位点特异的概率简单地估计为比对......阅读全文
上海生科院等设计高效精确基因靶向整合新策略
5月19日,《细胞研究》期刊在线发表了题为《运用CRISPR/Cas9 技术实现以同源臂介导的末端接合为基础的靶向整合》的研究论文,该研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组、基因编辑平台施霖宇团队与苏州非人灵长类研究平台孙强团队合作完成。该研究设
学者采用共沉积法成功设计新型抗油光热蒸发膜
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494357.shtm
广东采用膜内纳米颗粒组装技术设计新型分离膜
近日,广东省科学院生态环境与土壤研究所研究员贺斌团队成功采用膜内纳米颗粒组装技术设计新型分离膜。相关研究发表于《膜科学杂志》(Journal of Membrane Science)。广东省科学院生态环境与土壤研究所博士后马宇及硕士高芳为该论文共同第一作者,贺斌及马宇为通讯作者。作为采用压力驱动的分
Bruker投资PreOmics扩展蛋白质组学研究策略
PreOmics宣布完成B轮融资,以加快蛋白质组学工具和耗材的研发和商业化PreOmics提供独特的技术、先进的自动化解决方案和高性能耗材,用于生物制药和临床研究的无偏深层蛋白质组学中活检、组织、细胞系和血浆样品的均化、富集和样品制备 德国慕尼黑——2022年1月18日——PreOmics G
Cell:设计蛋白质-抵御艾滋病
10年前,一些研究人员着手研究一种有着根本上区别的疫苗研发策略:如何“哄骗”免疫系统制造一类罕见而强大的广泛中和抗体(bNAb),其能消灭几乎每一个艾滋病病毒的变种。如今,3个不同的小组已朝着这个目标迈出了至关重要的步伐。艾滋病病毒之所以能战胜候选疫苗以及人体自身防线,是因为它变异得非常快,从而
AI设计出具非凡结合强度蛋白质
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514540.shtm 一种使用深度学习方法设计出来的新蛋白质。图片来源:华盛顿大学医学院蛋白质设计研究所美国科学家借助机器学习软件,创建出一批具有非凡结合强度的蛋白质分子。这些分子与包括人类激素
上海生科院等设计出高效精确基因靶向整合的新策略
5月19日,《细胞研究》期刊在线发表了题为《运用CRISPR/Cas9 技术实现以同源臂介导的末端接合为基础的靶向整合》的研究论文,该研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组、基因编辑平台施霖宇团队与苏州非人灵长类研究平台孙强团队合作完成。该研究设
便携式气相色谱仪采用什么样的设计理念?
便携式气相色谱仪采用标准小柱箱设计,可使用长至60米的毛细柱来分析样品,其分离条件及效果和实验室标准型气相色谱仪相同,可容易得到相同的分析方法及灵敏度。便携式气相色谱仪的革新之处在于所有的微处理器都被安全地密封安装。具有数字化样品处理程序,使得温度与气体压力的控制比以前具有更加严格的标准。仪器的外
组合式振荡培养箱的介绍
组合式振荡培养箱1、工作室采用不锈钢镜面板加工,便于清洁; zui 大三层叠加组合方式,占用空间小,可有效利用实 验室空间;每层独立控制,可设定不同温度及转 速。2、上下翻转式开门方式,抽拉式托盘,方便装卸摇 瓶。3、内胆底部四周设计有防水挡板,防止液体流入下
简述蛋白质结构在药物设计中的应用
从基因组数据到新药物的过程分为2个部分:一是选择目标蛋白,二是选择合适的药物,药物分子必需与目标蛋白质分子紧密结合、容易合成且没有毒副作用。传统的药物设计通过筛选大量的天然化合物、已知的底物或配基的类似物(anaIogs)以及生物化学研究来确定前导物(Iead compounds),较少依赖目标
蛋白质设计的概述和历史记录
在合理的蛋白质设计的目标是预测氨基酸 序列,将折叠到一个特定的蛋白质结构。尽管可能的蛋白质序列数量众多,并随蛋白质链的大小呈指数增长,但其中只有一个子集可以可靠且快速地折叠为一种天然状态。蛋白质设计涉及鉴定该子集中的新序列。蛋白质的天然状态是链的构象自由能最小值。因此,蛋白质设计就是寻找具有所选结构
蛋白质工程的结构、功能的设计和预测
根据对天然蛋白质结构与功能分析建立起来的数据库里的数据,可以预测一定氨基酸序列肽链空间结构和生物功能;反之也可以根据特定的生物功能,设计蛋白质的氨基酸序列和空间结构。通过基因重组等实验可以直接考察分析结构与功能之间的关系;也可以通过分子动力学、分子热力学等,根据能量最低、同一位置不能同时存在两个
科研人员采用基于限域热转化策略合成单原子催化剂
碳载单原子催化剂近期在多相催化领域受到关注,因为碳载体独特的物理化学性质能够实现单原子的高效负载,并且杂原子的掺杂可以修饰单原子的配位环境,从而调节反应活性。然而最大限度地提高单原子利用率具有挑战性,因为合成过程中大量单原子被嵌入到碳基底或微孔孔道中,在催化过程中由于传质限制而失去作用。因此设计
我国学者采用混合组装策略和软件技术大幅降低测序深度
近日,中国科学院昆明动物研究所张亚平院士和马占山研究员领导的团队发布了以“10x Genomics测序”辅助“三代测序”的混合组装策略和软件技术。研究人员采用美国加州大学Jain等人2018年发表在 Nature Biotechnology(doi: 10.1038/nbt.4060.)的人类基
德国应用化学:有机室温磷光材料通用设计策略研究
华东理工大学费林加诺贝尔奖科学家联合研究中心田禾院士和马骧教授团队设计了一种利用离子型聚合物外部重原子效应和刚性离子键网络的掺杂纯有机室温磷光(RTP)体系,构建了能直接从传统荧光染料出发,不经化学修饰设计磷光材料的普适策略。该成果近日发表于《德国应用化学》。 室温磷光是一种不同于荧光的发光
科学家提出高效单原子催化剂设计新策略
近日,中国科学技术大学合肥微尺度物质科学国家研究中心教授曾杰团队,通过精准的单原子锚定位点设计,制备出一种可以高效催化电化学阳极反应的单原子催化剂。相关成果分别发表于《自然—通讯》《美国化学会志》,并被选为《美国化学会志》封面论文。 研究人员采用电化学沉积技术,选择性地将铱单原子锚定在羟基氧化
研究提出高比能二次电池仿生设计策略
近日,西安交通大学宋江选教授团队针对高比能电极材料硅负极在电化学过程中物质交换引发结构畸变,导致服役寿命与高比能之间呈现出反向制约关系,提出高比能二次电池仿生设计策略,构建了兼具“高强韧-快导锂”的仿贝壳结构硅电极,相关研究成果发表在《纳米快报》和《先进功能材料》上。该研究设计了仿神经网络功能粘合剂
学者综述杂化共价有机框架材料设计策略及前景
12月8日,记者从中国科学院广州能源研究所获悉,该所废弃物处理与资源化利用研究团队系统阐述了杂化共价有机框架材料(H-COFs)的设计策略,并展望了其在关键金属回收、清洁水生产及可持续能源发展等领域的应用前景。相关综述文章发表于《配位化学评论》(Coordination Chemistry Re
科学家提出设计抗冲击性仿贝壳结构新策略
记者21日从中国科学技术大学了解到,该校倪勇教授、何陵辉教授研究团队发现仿贝壳结构在较高冲击速度下会丧失优异的抗冲击耗能机制,其性能弱于普通层状复合结构;基于此现象,他们提出一种利用不同结构来匹配冲击速率变化的混合结构抗冲击设计策略,为抗冲击性能优化的微结构仿生设计提供了新的思路。相关成果日前发表在
新研究为“阿片减量”镇痛策略提供可操作药物设计模板
中国科学院上海药物研究所研究员徐华强团队、高召兵团队,上海交通大学研究员庄友文团队、教授张健团队,联合美国北卡罗莱纳大学教堂山分校教授布赖恩·L·罗斯团队等多家单位,通过结构导向成功设计研发出新型阿片受体变构调节先导分子MPAM-15,为“阿片减量”的镇痛策略提供了更清晰的理论基础与更可操作的药物设
研究提出“由外向内”单原子催化剂设计策略
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员王晓东、研究员林坚团队与福州大学教授林森团队合作,在单原子催化剂外围结构调控及其作用机制的研究方面取得新进展。相关成果发表在《德国应用化学》及《配位化学综述》上。 单原子催化概念自提出以来,已成为多相催化领域研究热点之一。本工作团队提出“由外向内”的单原
化学类实验室的设计
实验室是存在一定危险系数的空间,实验操作使用一些酸、碱、有机溶剂等试剂药品;试管、烧瓶、烧杯、冷凝管等玻璃器皿;原子吸收、气相色谱、液相色谱、紫外分光光度计等精密仪器以及烘箱、马弗炉等高温设备。实验室规划设计是必须以“实用、安全”为出发点,综合考虑各种仪器设备安全操作要求,配置相应实验设备。 ⑴普
上海正设计新型食品行业监管方案-采用积分管理
市食药监管局昨天透露,上海正在考虑借鉴新加坡等国家食品安全监管经验,将一种类似于交通违章扣分的管理方法引入食品行业监管。目前相关方案正在设计中,年内有望向社会公开征求建议,一旦通过,本市餐饮行业将成为首个试点。 去年,有部分市政协委员向食药监管部门提出建议,将食品生产经营者视作"驾驶员",
蛋白质序列分析及结构预测策略包括哪些步骤
序列分析通常就是指同源性分析、保守位点分析,motif分析和功能预测等,结构预测通常又包括二级结构三级结构甚至四级结构,二级结构目前预测还是比较准确的,三级结构最简单的可以直接将蛋白序列提交swissmodel在线进行预测,也可以采用一些其他软件,如modeller和一些商业软件,主要原理是同源
研究采用电子密度调控策略提升磁性催化剂的肿瘤治疗效果
近日,中国科学院合肥物质科学研究院强磁场科学中心研究员王辉与张欣课题组合作,依托稳态强磁场实验装置电子顺磁共振测量技术,研发出新型碳包覆铁酸镍纳米催化剂(NFN@C),并发现NFN@C在抗肿瘤治疗方面的潜力。相关研究成果发表在《先进功能材料》(Advanced Functional Material
研究采用电子密度调控策略提升磁性催化剂的肿瘤治疗效果
近日,中国科学院合肥物质科学研究院强磁场科学中心研究员王辉与张欣课题组合作,依托稳态强磁场实验装置电子顺磁共振测量技术,研发出新型碳包覆铁酸镍纳米催化剂(NFN@C),并发现NFN@C在抗肿瘤治疗方面的潜力。相关研究成果发表在《先进功能材料》(Advanced Functional Material
Science:重磅!突破性的HIV疫苗设计策略崭露头角
在一项新的研究中,来自美国斯克里普斯研究所等研究机构的研究人员成功地对一种先进的HIV疫苗策略进行了原理验证,这种方法也可能有效地保护人们免受其他他致命性传染病的侵害。相关研究结果近期发表在Science期刊上,论文标题为“A generalized HIV vaccine design str
柔性钙钛矿太阳能电池的器件设计及发展策略
近日,香港理工大学的郑子剑教授课题组综述了这几年柔性钙钛矿太阳能电池的研究进展,着重总结了它的器件设计及发展策略。图片来源网络 文章中,首先强调了钙钛矿太阳能电池适合进行柔性制备的物理及加工基础,详细分析了其低温溶液加工特性,优异的光伏及力学性质。随后,作者剖析了构筑柔性器件的各功能层,包括
福州大学《先进功能材料》:新型骨粘合剂的设计策略
骨具有层级结构和精确的无机-有机界面,是一种不断进行自我修复以维持其承重特征的动态组织。但当骨折或骨缺损时,需要手术干预来固定破裂的组织并促进愈合,传统的使用金属板和螺钉的方法虽然得到广泛应用,但通常会遭受疾病的困扰。 随着科学技术的发展,基于水凝胶的骨粘剂正逐渐引起人们的关注,有望彻底改变骨
组合式震荡培养摇床结构特点
1、双层结构,占地面积小、使用空间大。2、PID微电脑智能控温仪,控温。3、三维一体的偏三轮驱动,运转平滑、稳定、耐久、可靠。4、内衬采用镜面不锈钢,防腐蚀;外壳采用静电喷塑。5、静音风扇设计和强制对流方式确保了良好的恒温效果。6、中空钢化玻璃门,方便随时在不开门情况下在各个角度观察箱体内部情况。7