蛋白质工程的结构、功能的设计和预测

根据对天然蛋白质结构与功能分析建立起来的数据库里的数据,可以预测一定氨基酸序列肽链空间结构和生物功能;反之也可以根据特定的生物功能,设计蛋白质的氨基酸序列和空间结构。通过基因重组等实验可以直接考察分析结构与功能之间的关系;也可以通过分子动力学、分子热力学等,根据能量最低、同一位置不能同时存在两个原子等基本原则分析计算蛋白质分子的立体结构和生物功能。虽然这方面的工作尚在起步阶段,但可预见将来能建立一套完整的理论来解释结构与功能之间的关系,用以设计、预测蛋白质的结构和功能。......阅读全文

蛋白质工程的结构、功能的设计和预测

  根据对天然蛋白质结构与功能分析建立起来的数据库里的数据,可以预测一定氨基酸序列肽链空间结构和生物功能;反之也可以根据特定的生物功能,设计蛋白质的氨基酸序列和空间结构。通过基因重组等实验可以直接考察分析结构与功能之间的关系;也可以通过分子动力学、分子热力学等,根据能量最低、同一位置不能同时存在两个

直播预告-|-蛋白质结构与功能预测及设计

  直播时间:2024年8月22日(周四)19:00——21:40 直播平台:科学网APP(科学网微博直播间链接)https://weibo.com/l/wblive/p/show/1022:2321325069047447289984科学网微博科学网视频号 【直播简介】8月22日(周四)晚19:0

关于蛋白质工程的结构分析

  蛋白质工程的核心内容之一就是收集大量的蛋白质分子结构的信息,以便建立结构与功能之间关系的数据库,为蛋白质结构与功能之间关系的理论研究奠定基础。三维空间结构的测定是验证蛋白质设计的假设即证明是新结构改变了原有生物功能的必需手段。晶体学的技术在确定蛋白质结构方面有了很大发展,但是最明显的不足是需要分

研究人员预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标识别机制

  中国科大刘海燕教授、陈泉教授课题组与复旦大学王文宁教授合作,采用蛋白质结构预测、序列设计等计算手段与蛋白质互补分析和深度突变扫描、X射线晶体学、NMR等实验结合的方法,揭示了固有无序的4.1G蛋白C端结构域识别其固有无序靶标的结构机制。相关研究成果以“Combined prediction an

囊胚的结构和功能

囊胚(blastula)指的是内部产生囊胚液、囊胚腔的胚胎,囊胚中所有细胞都没有开始分化,这个阶段之后胚胎开始出现分化。经过卵裂,受精卵被分割成很多小细胞,这些由小细胞组成的中空球形体称为囊胚。卵裂结束,囊胚细胞要经过一系列复杂的运动,导致细胞空间相互关系的改变。

氢键的结构和功能

氢原子与电负性大的原子X以共价键结合,若与电负性大、半径小的原子Y(O F N等)接近,在X与Y之间以氢为媒介,生成X-H…Y形式的一种特殊的分子间或分子内相互作用,称为氢键。[X与Y可以是同一种类分子,如水分子之间的氢键;也可以是不同种类分子,如一水合氨分子(NH3·H2O)之间的氢键]。

嘌呤的结构和功能

嘌呤(Purine),分子式C5H4N4,是一种杂环芳香有机化合物,是新陈代谢过程中的一种代谢物。

骨髓的结构和功能

骨髓(bone marrow)存在于骨松质腔隙和长骨骨髓腔内,由多种类型的细胞和网状结缔组织构成,根据其结构不同分为红骨髓(red bone mar-row)和黄骨髓(yellow bone marrow)。为柔软富有血液的组织。

细胞的结构和功能

细胞的结构和功能如下:细胞的结构主要有细胞膜、细胞质和细胞核三个部分。在电子显微镜下观察细胞,可以区分为膜相结构和非膜相结构。细胞膜是细胞表面的一层薄膜,它的厚度大约是7.5纳米,细胞膜的化学成分主要是类脂、蛋白质和一定量的糖类。细胞膜在电镜下,可以看到它的结构分为三层,内外两层深暗,中间的一层浅淡

线粒体的结构和功能

线粒体(mitochondrion) ——主要协助细胞呼吸,并且产生细胞使用能量最直接的形式,三磷酸腺苷。特别的是线粒体有自己的遗传分子,与细胞核的遗传物质不同,只遗传到这个细胞器的子代细胞器,而不是子代细胞,能够让线粒体自我分裂增殖,制造本身需要的一些蛋白质,但是仍有一些调节控制的过程受到细胞核的

溶酶体的功能和结构

  溶酶体含有多种酶,使细胞能够分解它吞噬的各种生物分子,包括肽、核酸、碳水化合物和脂质(溶酶体脂肪酶)。负责这种水解的酶需要在酸性环境才能获得最佳活性。  溶酶体除了能够分解聚合物之外,还能够与其他细胞器融合,消化大型结构或细胞碎片;通过与吞噬体的合作,它们能够进行自噬,清除受损的结构。同样,它们

液泡的结构和功能

液泡(液泡) ——是另一种囊状的单层膜细胞器,在细胞中扮演不同角色,形状可大可小。通常植物的液泡较大。在原生动物,例如草履虫,液泡扮演伸缩泡的功能,将过多的水分收集并排出体外;大多数植物细胞液泡在细胞成熟后,占有大部分的细胞体积,可以储存水分、存放色素,有些种类植物的液泡更能够协助光合作用的进行,另

《自然》封面:新方法根据结构预测功能

来自美国加州大学旧金山分校药理化学系,得克萨斯农工大学(Texas A&M University),Albert Einstein 医学院的研究人员利用一种变通的分子对接方法(一种用来寻找潜在药物的计算机辅助的模拟方法),设计出一种根据结构来预测某种具有未知活性的酶的功能的方法。如果这一新方法也适用

DNA-结构模体的结构和功能

中文名称结构模体英文名称structural motif定  义核酸或蛋白质分子上的亚序列或亚结构。通常具有某种功能。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)

盘绕螺旋结构的设计和优化技巧实验

盘绕螺旋结构的设计和优化技巧             实验步骤 本节讨论盘绕螺旋特异性设计所涉及的几个不同方面。我们的目标是在核心处和

盘绕螺旋结构的设计和优化技巧实验

虽然表观上简单,盘绕螺旋(coiled coil ) 模体是高度专一的,并在理解三级结构及其形成方面具有重要意义。最常观察到的盘绕螺旋形态——平行二聚态,其一般的结构类型仍有待全面的描述。尽管如此,其结构已呈现出在某些特定位置需要某些特定类型氨基酸的严格规则。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德

蛋白质工程的筛选和选择技术

一旦蛋白质经历了定向进化,定量设计或半定量设计,就必须筛选突变体蛋白的文库,以确定哪些突变体显示出增强的特性。噬菌体展示方法是筛选蛋白质的一种选择。该方法涉及将编码变体多肽的基因与噬菌体外壳蛋白基因融合。通过在体外与固定的靶标结合来选择在噬菌体表面表达的蛋白质变体。然后在细菌中扩增具有选定蛋白质变体

“功能导向晶态材料的结构设计和可控制备”项目进展情况

“功能导向晶态材料的结构设计和可控制备”项目年度进展交流会召开   3月1至2日,国家自然科学基金重大研究计划“功能导向晶态材料的结构设计和可控制备”项目年度进展交流会在福州召开。该重大研究计划指导专家组,国家基金委副主任姚建年、何鸣鸿,化学科学部、工程与材料科学部、信息科学部等学科

蛋白质序列分析和结构预测

【实验目的】   1、掌握蛋白质序列检索的操作方法;  2、熟悉蛋白质基本性质分析;  3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测;  4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】   1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素(ad

蛋白质序列分析和结构预测

【实验目的】1、掌握蛋白质序列检索的操作方法;2、熟悉蛋白质基本性质分析;3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测;4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (adiponectin)

蝶酸的结构和功能

中文名称蝶酸英文名称pteroic acid定  义叶酸结构的一部分,由蝶呤与对氨基苯甲酸相连而成。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),激素与维生素(二级学科)

RGD序列的结构和功能

RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成,存在于多种细胞外基质中,可与11种整合素特异性结合,能有效地促进细胞对生物材料的粘附。

卫星DNA的结构和功能

卫星DNA(satelliteDNA)是一类高度重复序列DNA。在介质氯化铯中作密度梯度离心(离心速度可以高达每分钟几万转)时,DNA分子将按其大小分布在离心管内不同密度的氯化铯介质中,小的分子处于上层,大的分子处于下层。从离心管外看,不同层面的DNA形成了不同的条带。根据荧光强度的分析,可以看到在

“无用”DNA的结构和功能

中文名称“无用”DNA英文名称junk DNA定  义基因组中不负责编码蛋白质和RNA,因而被认为不具有任何功能的DNA。也被认为是一种分子寄生物,是经过许多世代而插播在基因组中的序列。存在于真核基因组中的大量重复序列即属于其列。但近年来的研究已发现越来越多的“无用”DNA是具有各种不同的功能。应用

巨噬细胞的结构和功能

巨噬细胞(英语:Macrophages,缩写为mø)是一种位于组织内的白血球,源自单核细胞,而单核细胞又来源于骨髓中的前体细胞。巨噬细胞和单核细胞皆为吞噬细胞,在脊椎动物体内参与非特异性防卫(先天性免疫)和特异性防卫(细胞免疫)。它们的主要功能是以固定细胞或游离细胞的形式对细胞残片及病原体进行噬菌作

​结构基因的定义和功能

结构基因是编码蛋白质或RNA的基因。细菌的结构基因一般成簇排列,多个结构基因受单一启动子共同控制,使整套基因或都表达或者都不表达。结构基因编码大量功能各异的蛋白质,其中有组成细胞和组织器官基本成分的结构蛋白、有催化活性的酶和各种调节蛋白等。

阿糖胞苷的结构和功能作用

阿糖胞苷是一种有机化合物,化学式为C9H13N3O5,临床上主要作为细胞S增殖期的嘧啶类抗代谢药物,通过抑制细胞DNA的合成干扰细胞的增殖。

脱皮激素的结构和功能

“蜕皮激素”又称“脱皮激素”,化学式为是C27H44O7,从鸭跖草科植物珍珠露水草Cyanotis arachnoidea C. B. Clarke 根部提取得到的一种活性物质。根据纯度不同分为白色、灰白色、淡黄色或淡棕色结晶性粉末。

氢化可的松的结构和功能

氢化可的松,又称皮质醇,是从肾上腺皮质中提取出的是对糖类代谢具有最强作用的肾上腺皮质激素,即属于糖皮质激素的一种。皮质醇有时用来专指基本的“应激激素”。皮质醇是通过肾上腺皮质线粒体中的11β-羟化酶的作用,由11-脱氧皮质醇生成。皮质醇也可通过11-β-羟类固醇脱氢酶的作用变成皮质素。

腺苷的结构和功能特点

腺苷,是指由腺嘌呤的N-9与D-核糖的C-1通过β糖苷键连接而成的化合物,化学式为C10H13N5O4,其磷酸酯为腺苷酸。腺苷是一种遍布人体细胞的内源性核苷,可直接进入心肌经磷酸化生成腺苷酸,参与心肌能量代谢,同时还参与扩张冠脉血管,增加血流量。