Nature单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
哺乳动物的造血与免疫系统发育是在胚胎发育过程中由多个组织以复杂的协同作用所驱动的【1】。尽管研究界对于人体中这一过程所涉及的功能主体和时间序列都有了较为准确的认识，例如造血干细胞是先从受孕后2至3周的胚胎外卵黄囊（yolk sac）中，以及从3至4周的胚胎主动脉-性腺-中肾区域（aorta-gonad-mesonephros, AGM）内迁移出，主要在胚胎肝中形成血细胞，并使得胚肝成为第二个妊娠期（三个月为一周期）的期中前最主要的造血器官【2】；然而，由于伦理因素等限制导致了用于研究的人胚胎组织器官的缺乏，且小鼠与人之间具有相当程度的胚胎发育模式差异【3】，胚胎早期造血和免疫系统发育的详细过程仍未能获得完全解析。由于人胚胎造血过程和先天性免疫缺陷及儿童白血病等疾病存在直接关联，对这一生理过程的分子机制进行深入研究具有显著的临床意义。 2019年10月10日，来自英国Newcastle University和Wellcome......阅读全文
Nature单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
哺乳动物的造血与免疫系统发育是在胚胎发育过程中由多个组织以复杂的协同作用所驱动的【1】。尽管研究界对于人体中这一过程所涉及的功能主体和时间序列都有了较为准确的认识，例如造血干细胞是先从受孕后2至3周的胚胎外卵黄囊（yolk sac）中，以及从3至4周的胚胎主动脉-性腺-中肾区域（aorta-go
单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
2019年10月10日，来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次报道了由胎肝驱动的人胚胎
单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
2019年10月10日，来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次报道了由胎肝驱动的人胚胎
用单细胞测序绘制人胚胎脊髓发育“时间表”
中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员戴建武再生医学团队与南京鼓楼医院教授胡娅莉团队合作，首次通过单细胞转录组技术对早中孕期的人胚胎脊髓进行单细胞测序分析，为了解人类脊髓发育、研究脊髓再生修复、探索体外脊髓制造策略中种子细胞的选择提供了理论支持。相关研究近期发表于EMBO Reports
利用单细胞测序,科学家解析人胚胎脊髓发育过程
脊髓是外周系统与大脑间信号传递的桥梁。脊髓背角介导着外周感受信号，而腹侧对于运动功能的执行至关重要，同时也是低级反射的中枢。作为一种高度有序的中枢组织，脊髓由多种不同的细胞类型有序发育形成。虽然脊髓的发育在啮齿类动物中已进行了一系列的研究，但对人类脊髓发育过程了解较少。 中国科学院遗传与发育生
迄今最完整胚胎发育单细胞图谱发布
科技日报北京8月4日电 （实习记者张佳欣）科学家以果蝇为模型生物，构建了迄今为止最完整、最详细的动物胚胎发育单细胞图谱。这一发表在最新一期《科学》杂志上的成果，利用了来自100多万个各个发育阶段的胚胎细胞数据，代表了多个层面的重大进步，有助于科学家探索突变如何导致不同的发育缺陷，以及了解人类基
单细胞测序新突破:－北大绘制出人类胚胎基因调控图谱
北京大学第三医院的汤富酬研究员等采用先进的单细胞RNA测序技术，绘制出人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组图谱，有望在干细胞领域改善人类辅助生殖技术，以及预测潜在遗传病产生的健康影响。研究成果发表在8月11日《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular
Nature重磅！利用单细胞RNA测序构建人类肝脏细胞图谱
肝脏是人体最大、功能最多的器官之一，在人体的新陈代谢及免疫过程中发挥着关键作用。更值得关注的是，肝脏还是人体唯一一种仅需原体积的25%，就能够完全再生的内脏器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在内的各类肝病是当今世界最大的健康问题之一，也是导致死亡的主要原因。 尽管肝脏对人类健康极为重要，但健康
Nature重磅！利用单细胞RNA测序构建人类肝脏细胞图谱
肝脏是人体最大、功能最多的器官之一，在人体的新陈代谢及免疫过程中发挥着关键作用。更值得关注的是，肝脏还是人体唯一一种仅需原体积的25%，就能够完全再生的内脏器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在内的各类肝病是当今世界最大的健康问题之一，也是导致死亡的主要原因。 尽管肝脏对人类健康极为重要，但健康
Nature诞生全球首张人类发育中的肝细胞图谱
北京时间10月10日，发表在《Nature》上的一篇新研究中，一个科学家团队第一次绘制出人类发育中的肝细胞图谱，为了解胎儿血液和免疫系统的发育过程提供了重要线索。该图谱描绘了怀孕早期和中期之间发育中肝细胞的变化，包括来自肝脏的干细胞如何如何“播种”其他组织，以支持生长所需的高氧需求。该研究由英国
《科学》：科学家构建了迄今最完整胚胎发育单细胞图谱
科学家以果蝇为模型生物，构建了迄今为止最完整、最详细的动物胚胎发育单细胞图谱。这一发表在最新一期《科学》杂志上的成果，利用了来自100多万个各个发育阶段的胚胎细胞数据，代表了多个层面的重大进步，有助于科学家探索突变如何导致不同的发育缺陷，以及了解人类基因组中与大多数疾病相关突变的庞大非编码部分。
暨南大学报道－造血干细胞发育单细胞lncRNA动态表达图谱
来自暨南大学基础医学院兰雨课题组、中国医学科学院基础医学研究所余佳课题组、军事医学科学院附属医院（现为解放军总医院第五医学中心）刘兵课题组合作发表研究论文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Re
Nature：单细胞测序（上）
Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年，冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织，一并将这些DNA进行测序，生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序
Nature：单细胞测序（下）
随着技术的飞速发展，成本大大降低，使得基因组测序成为常规技术。然而，大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序，它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。 该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序，研究小
人类发育中肝脏的细胞图谱揭秘人类胎儿肝脏造血
在一项新的研究中,英国研究人员在世界上首次构建出人类发育中肝脏的细胞图谱,它提供了关于胎儿中血液和免疫系统如何产生的重要见解。这种图谱描绘了在妊娠的头三个月和第二个三个月之间的发育中肝脏的细胞景观变化,包括来自肝脏的干细胞如何播种到其他组织,以支持生长所需的高氧气需求。相关研究结果近期发表在Na
单细胞测序技术应用于发育生物学研究登顶三大学术杂志
2019年即将结束，在这一年中，单细胞测序的火热充分展示了该技术在科学研究领域的重要。发育生物学作为生命基本过程研究的基础学科，单细胞测序技术是该领域研究突飞猛进的助推器。在这300多个日夜里，科学研究成果殿堂《Cell》、《Nature》、《Science》上有哪些发育生物学的成果跟单细胞技术
单细胞测序技术应用于发育生物学研究登顶三大学术杂志
2019年即将结束，在这一年中，单细胞测序的火热充分展示了该技术在科学研究领域的重要。发育生物学作为生命基本过程研究的基础学科，单细胞测序技术是该领域研究突飞猛进的助推器。在这300多个日夜里，科学研究成果殿堂《Cell》、《Nature》、《Science》上有哪些发育生物学的成果跟单细胞技术
“巨噬细胞”的前世今生
边志磊博士后（左）、兰雨研究员（中）和刘兵研究员观察细胞并讨论。 巨噬细胞是人体免疫系统的重要组成细胞，它可以吞噬细胞残片、垃圾，消化病原体，发挥“清道夫”的作用，还能像“哨兵”一样提醒其它免疫细胞“有敌入侵，准备战斗”，在免疫细胞与病原体激战时，它也常常冲在最前面。 随着研究深入，科学家们发现
Nature胚胎发育研究：重建人体发育时间
京都大学（Kyoto University）的研究人员利用诱导多能干细胞（iPSC）重构了人体“分节时钟segmentation clock”，这是胚胎发育研究的重点。 这一成果公布在4月1日的Nature杂志上 从受精卵的第一个部分开始，一个复杂的蛋白质和基因网络相互作用，构建形成了我们器
构建人类卵黄囊细胞图谱揭示卵黄囊具有多种器官功能
在一项新的研究中，来自英国惠康桑格研究所、纽卡斯尔大学和剑桥干细胞研究所等研究机构的研究人员构建人类早期发育期间的卵黄囊细胞图谱，发现卵黄囊具有多种器官功能---它像肝脏一样排出毒素和制造凝血因子，此外还能产生一种刺激红细胞生成的通常由成人肾脏产生的关键激素----促红细胞生成素（erythro
Nature：7万个单细胞测序，绘制人类妊娠早期的胎盘图谱
11月15日，来自英国剑桥桑格研究所（Wellcome Sanger Institute）的研究人员在Nature上以长文形式发表了题为Single-cell reconstruction of the early maternal–fetal interface in humans的研究成果，
2018单细胞测序盘点：北大汤富酬教授连发11篇论文
单细胞RNA测序技术随着近几年的迅速发展，已在多个领域，从早期胚胎发育到组织和器官发育、以及免疫学和肿瘤学开花结果。 2018年，这一领域国内外成果不断，比如北京大学的汤富酬课题组就接连发表了11篇文章，获得了单细胞测序领域的接连重要成果。 3月，这一研究组与中国科学院生物物理研究所王晓群课
单细胞精度解析人类T淋巴细胞起源及胸腺器官发生
T淋巴细胞是宿主适应性免疫系统中最重要的免疫细胞之一，在抵抗病原入侵、维持机体稳态以及抗肿瘤等方面起到不可或缺的作用【1,2】。胸腺是T淋巴细胞发育的必需场所【3】。胎肝或骨髓来源的胸腺定植祖细胞（thymus seeding progenitor, TSP）迁移定植到胸腺后，即为早期胸腺祖细胞
《细胞》：单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了来自一个成人男子91个
单细胞核RNA测序技术建立了种子早期胚乳发育的转录图谱
种子是裸子植物和被子植物特有的繁殖体，是胚珠经过受精以后形成的结构，在植物生命周期中处于关键位置。种子主要由种皮、胚和胚乳组成。其中胚乳是大多数开花植物双受精后产生的组织，一般为三倍体（每个细胞核有三套染色体），胚乳中含有丰富的营养物质，是人类消耗热量的主要来源。 基因组印迹是一种表观遗传基因
PNAS：单细胞测序绘制大脑的细胞图谱
斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其同事本周在《美国科学院院刊》（PNAS）上发表文章，介绍了人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果。 研究小组对近500个成人或胎儿脑细胞进行了单细胞RNA测序。利用这种方法，他们能够鉴定出大脑中所有主要的细胞类型，并确定神经元的亚型。他们还观察了
汤富酬－乔杰再发文：绘制人类心脏高精度发育细胞图谱
人类胚胎发育是一个极其复杂的过程，从一个单细胞的受精卵开始，首先经过着床前胚胎发育产生胚内和胚外组织，再到着床后原肠胚阶段三个胚层的特化，进而到器官发生、分化、成熟，及至新生命的诞生。整个两百八十天的胚胎发育过程从一个单细胞受精卵增殖发育形成含有上万亿个细胞的婴儿，期间基因表达受到严密、精准的调
Nature－methods发布单细胞测序新技术
来自瑞典Ludwig癌症研究所及Karolinska研究所的研究人员，在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)杂志上报告了一项获得重大改良的新技术，可以利用它来分析单细胞中的基因表达——这一性能与从基础研究到未来癌症诊断的一切事物均存在关联。 资深作者Ri
Nature新技术：CRISPR+单细胞测序=？
CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因组编辑技术是生物研究和新型靶向药物研发的有力工具。比如利用CRISPR筛选基因（pooled CRISPR screens），可以通过CRISPR gRNAs靶向成百上千个不同的基因，同时编辑许多细胞，然后实验筛选编辑细胞，gRNA可以帮助确定哪些基因对于生物
回顾：单细胞转录组技术发展之十年历程
俗话说，十年是个风水岭，单细胞转录组技术发展至今十年间，在促进对生物学和疾病的认识上发挥出的巨大潜力有目共睹。那么，十年间单细胞转录组是如何发展至今的？又取得了哪些新的进展呢？今天，让我们跟随Sarah Aldridge和Sarah Teichmann两位大神，一起来回顾单细胞转录组学技术十年发