Naturemethods发布单细胞测序新技术
来自瑞典Ludwig癌症研究所及Karolinska研究所的研究人员，在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)杂志上报告了一项获得重大改良的新技术，可以利用它来分析单细胞中的基因表达——这一性能与从基础研究到未来癌症诊断的一切事物均存在关联。 资深作者Rickard Sandberg 说：“在肿瘤和健康组织中有一些细胞的数量稀少，除了单细胞方法没有任何其他的技术能够对它们进行分析。这种方法使得我们能够鉴别各种各样组织中稀少且重要的细胞亚群。我们还能够利用它以从所未有的精确性，梳理分析随着胚胎发育为生物体或是肿瘤获得转移性，细胞从一种状态转换至另一种状态独特基因组的表达情况。” 传统的方法依赖于一次性总体分析数百万个细胞的基因表达，往往会掩盖特异组织中某些特化细胞具有生物学意义的基因表达差异。单细胞分析基因表达克服了这一局限。2012年，Illumina生物公司联合Sandbe......阅读全文
关于细胞受体基因重排分析的介绍
近年来，T细胞受体（T cell receptor, TCR）基因重排分析在淋巴瘤的诊断和分级中应用愈来愈广泛，目前常用的是Southern印记法或PCR法。通过这一方法可以鉴别皮损中增生的细胞是否为克隆性的T细胞，对疾病的良恶性诊断起到重要作用。然而，克隆性T细胞亚群的存在并不是判断疾病良恶性
加速干细胞疗法的基因表达分析技术
最近，美国国立卫生研究院（NIH）的研究人员开发出一种技术，将加快干细胞衍生组织的生产。 这种方法可同时测量多个基因的表达，使科学家们能够根据细胞的功能和发育阶段，快速地描述细胞。该技术将帮助研究人员使用患者的皮肤，再生视网膜色素上皮细胞（RPE，眼睛后面的一种组织，在几种致盲眼疾中受影响）。
细胞质基因的普通遗传现象分析
（一）高等植物叶绿体的遗传有几种高等植物有绿白斑植株，如紫茉莉、藏报春、加荆介等。1901年柯伦斯在紫茉莉中发现有一种花斑植株，着生绿色，白色和花斑三种枝条。在显微镜下观察，绿叶和花斑叶的绿色部分其细胞中均含正常的叶绿体，而白色或花斑叶的白色部分，细胞中缺乏正常的叶绿体，是一些败育的无色颗粒。他分别
只需100个细胞的表观基因组分析
近年来，表观遗传学已经成为了干细胞分化、炎症、癌症等多个领域的研究热点，但它在临床上的潜力还未得到充分挖掘。表观基因组分析可以帮助医生根据患者的自身状态调整治疗方案，最终实现个性化医疗。问题在于，表观基因组分析需要的细胞量很大。举例来说，检测全基因组的蛋白-DNA互作和染色质修饰大约需要一千万细
单个神经细胞基因表达的qPCR综合分析
实验概要本实验对单细胞的敏感性进行了分析，单细胞的基因分析可以为一种细胞类型高水平转换成另一种提供确切的证据。我们所描述的是Biomark Fluidig动态阵列分析单一神经细胞的高通量表达。在一次实验中，用96个qPCR探针（相当于9216次反应）分析高达96孔独立样本。它可以在2-3天之内完
最新测序技术能用单个细胞分析基因组
美国物理学家组织网9月18日报道，最近，来自美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校、克雷格·文特尔研究院和Illumina公司的科学家对现代基因测序算法进行了改良，只需从一个细菌细胞中提取的DNA（脱氧核糖核酸）就可组装成接近完整的基因组，准确率达到90%，而传统的测序方法至少需要10亿个
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集群进
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集
芯片实验室让单细胞基因分析更高效
最近，加拿大英属哥伦比亚大学与英属哥伦比亚癌症研究所、转化与应用基因组学中心合作，开发出一种硅酮材料的芯片实验室技术，能让每个细胞像弹球机里的球一样各就各位，然后进行基因检测。这种“单细胞基因分析”技术使基因检测更加灵敏迅速，有助于肿瘤分析和临床疾病的诊断。本周出版的《美国国家科学院院
单细胞基因表达分析解密血液早期发育调控网络
近日，著名国际期刊nature biotechnology发表了英国科学家的一项最新研究成果，他们应用单细胞基因表达分析与计算方法描述了血液发育的转录调控网络。这项研究为分析器官发育的调控网络提供了一种可行的方法。 研究人员指出，重建调控器官发育的分子途经受限于缺少对胚胎祖细胞进行研究的方法，
芯片实验室让单细胞基因分析更高效
本报讯据美国物理学家组织网近日报道，最近，加拿大英属哥伦比亚大学与英属哥伦比亚癌症研究所、转化与应用基因组学中心合作，开发出一种硅酮材料的芯片实验室技术，能让每个细胞像弹球机里的球一样各就各位，然后进行基因检测。这种“单细胞基因分析”技术使基因检测更加灵敏迅速，有助于肿瘤分析和临床疾病的诊断。本周出
单细胞基因表达分析的最新进展
将细胞培养板上的细胞放在显微镜下观察。表面上，它们都一样。实际上，它们一点都不相同。无论是DNA或RNA的水平，还是蛋白质或代谢物的水平，这些细胞相差甚远，而这些差异可能对细胞行为产生深远的影响。 多年来，研究人员一直缺乏工具，来高效拷问这些差异，不过今非昔比。有了新一代DNA测序仪和质谱仪，
基因及基因产物分析
基因突变引起的单基因病往往表现在酶和蛋白质的质和量的改变或缺如。因此，酶和蛋白质的定性定量分析是诊断单基因病或分子代谢病的主要方法。根据分子代谢病的临床特点可以从三个层次检测和分析。 1．代谢产物的检测酶缺陷导致一系列生化代谢紊乱，从而使代谢中间产物、底物、终产物旁路代谢产物发生变化。因此，检
细胞化学词汇细胞癌基因
中文名称：细胞癌基因存在位置：正常的细胞基因组激活前作用：促进正常细胞生长增殖分化和发育激活后作用：使细胞发生恶性转化定义：存在于正常的细胞基因组中，与病毒癌基因有同源序列，具有促进正常细胞生长、增殖、分化和发育等生理功能。细胞癌基因：存在于正常的细胞基因组中，与病毒癌基因有同源序列，具有促进正常细
Nature单细胞测序分析：超过25万个细胞中数千个基因
来自Sanger研究所，EMBL欧洲生物信息学研究所完成了一项大规模单细胞基因组测序研究：通过对六种哺乳动物物种中超过25万个细胞的基因进行测序，描绘了免疫反应中的基因如何在细胞和物种之间产生不同的活性。 这一研究成果公布在10月24日的Nature杂志上，这项研究以前所未有的细节展示了细胞在
Cell子刊：单倍体干细胞加速基因功能分析
科学家们开发了全面鉴定基因功能的快速方法，这一技术能够大大增进我们对许多疾病的理解，例如心脏病、肝脏疾病和癌症等。 该方法利用只含一组染色体的干细胞，为研究人员揭示了干细胞分化时发生的遗传学改变。研究指出，该方法还可以用来研究许多其他的生物学过程。 胚胎干细胞通过特定的基因作用路径，
单细胞基因组测序：从实验到分析，步步解析
随着生命科学研究的微观化，基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域（如肿瘤异质性、早期胚胎发育等）。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序，解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题，为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。【应用概览】从20
人血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因组转录组分析
在临床和研究环境中，血液都是对人类进行分子分析的主要来源，并且是许多治疗策略的目标，这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划（www.proteinatlas.org）是一个开放式数据库，旨在通过整合各种组学技术（包括基于抗体的成像）来绘制所有人类蛋白的图谱。在
基因编辑细胞疗法
17日，Sangamo Therapeutics公司宣布，欧洲药品管理局（EMA）孤儿药委员会（COMP）公布了详细资料，支持授予其在研体外基因编辑细胞疗法BIVV003孤儿药资格，治疗镰刀型细胞贫血病（SCD）。
非同位素分析基因活性实验——冻融裂解细胞荧光素酶分析
实验材料哺乳动物细胞试剂、试剂盒PBS仪器、耗材培养皿细胞刮子离心机实验步骤1. 用PBS分别洗3个60 mm 培养皿中的转染了荧光素酶质粒的细胞。 2. 每只培养皿中加1 ml 提取缓冲液，立即用橡胶刮子刮下细抱，移至1.5 ml 微量离心管中。离心15~30 s，弃上清。3. 在细胞沉淀中
基因活性的同位素分析实验——原位裂解细胞的CAT分析法
实验材料转染细胞试剂、试剂盒Triton裂解液仪器、耗材培养皿培养箱实验步骤1. 60 mm 培养皿中转染了CAT表达质粒的细胞，用2 ml PBS洗1次。每培养皿加入2 ml 低渗缓冲液，在室温下温育2~5 min。2. 吸去低渗缓冲液，加入400 μl Triton裂解液。用橡胶刮子将细胞刮
基因组分析或助力基底细胞癌疗法的开发
名为基底细胞癌（BCC）的皮肤癌是最常见的一种癌症，90%的个体都有可能会在某一天发生，尤其是因为年龄原因及暴露于紫外线下；这种癌症很少致命，截至目前为止科学家们也对其研究较少；近日刊登在Nature Genetics的一项报告中，来自日内瓦大学的研究者就对基底细胞癌患者机体的癌细胞进行了DNA
体细胞重组定位法对基因结构进行分析的方法原理
原理相同于基因纯合化的定位方法。由于体细胞交换发生得较少，所以常用 X射线处理杂合体使之发生更多的体细胞交换。
血细胞分析红细胞的分析介绍
红细胞也称红血球，在常规化验英文常缩写成RBC，是血液中数量最多的一种血细胞，同时也是脊椎动物体内通过血液运送氧气的最主要的媒介，同时还具有免疫功能。成熟的红细胞是无核的，这意味着它们失去了DNA。红细胞也没有线粒体，它们通过葡萄糖合成能量。 形状呈双凹圆盘状，中央较薄。周缘较厚，故在血涂片标
血细胞分析红细胞
红细胞也称红血球，在常规化验英文常缩写成RBC，是血液中数量最多的一种血细胞，同时也是脊椎动物体内通过血液运送氧气的最主要的媒介，同时还具有免疫功能。成熟的红细胞是无核的，这意味着它们失去了DNA。红细胞也没有线粒体，它们通过葡萄糖合成能量。 形状呈双凹圆盘状，中央较薄。周缘较厚，故在血涂片标
血细胞分析白细胞
白细胞有五种，按照体积从小到大是：淋巴细胞（人体自身产生的抗体），嗜碱粒细胞，中性粒细胞，单核细胞和嗜酸细胞。 白细胞计数增多见于急性感染、尿毒症、严重烧伤急性出血、组织损伤、大手术后白血病等。 白细胞计数减少见于伤寒及副伤寒、疟疾、再生障碍性贫血急性粒细胞缺乏症、脾功能亢进，X线放射性核素
《细胞》：单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了来自一个成人男子91个
“基因剪刀”让皮肤细胞“变身”干细胞
美国科学家用“基因剪刀”编辑实验鼠细胞的基因组，成功使皮肤细胞转变成干细胞，为培育诱导多能干细胞开辟了新路。 诱导多能干细胞是对成熟细胞“重编程”得到的，像胚胎干细胞一样具备分化成多种细胞的潜力，可用于修复受损的组织和器官。“基因剪刀”指CRISPR基因编辑技术，用它能像在电脑上编辑文章一样，
“基因剪刀”让皮肤细胞“变身”干细胞
美国科学家用“基因剪刀”编辑实验鼠细胞的基因组，成功使皮肤细胞转变成干细胞，为培育诱导多能干细胞开辟了新路。诱导多能干细胞是对成熟细胞“重编程”得到的，像胚胎干细胞一样具备分化成多种细胞的潜力，可用于修复受损的组织和器官。 “基因剪刀”指CRISPR基因编辑技术，用它能像在电脑上编辑文章一