基因芯片实验原理与方法(一)
一、目的本实验的目的是学会cDNA芯片的使用方法。了解各种基因芯片的基本原理和优缺点。基因芯片这一技术方法在1991年的Science杂志上被首次提出,其高通量、并行检测的特点适应了分析人类基因组计划所提供的海量的基因序列信息的需要,可以说,人类基因组计划是基因芯片技术发展的原因,而对深人研究基因突变和基因表达的有效方法的需求又是促进基因芯片技术发展的动力。由于基因芯片高速度、高通量、集约化和低成本的特点,基诞生以来就受到科学界的广泛关注,正如晶体管电路向集成电路发展的经历一样,分子生物学技术的集成化正在使生命科学的研究和应用发生一场革命。根据固定在芯片载体上的核酸分子的不同,基因芯片可以分为cDNA芯片和寡核昔酸芯片等。寡核昔酸芯片主要基于光引导聚合技术,该技术是Affymetrix公司开发的ZL技术,由于其突出的优点,正得到越来越广泛的应用。二、原理基因芯片(Gene Chip,DNA Chip),又称DNA微阵列(DNA ......阅读全文
定量PCR原理、材料与实验方法
一.原理应用定量PCR技术,用一种标准作对照能够估计出一种特异性靶DNA或RNA分子的相对含量。参照物:在定量 PCR 中必须加入参照物,用来作为扩增系统的阳性对照,并作为未知样本定量的标准,且通过竞争性作用校正扩增系统内管间的扩增效率,使其具有可比性。参照物按其性质不同可分为内参照和外参照。内参照
RNA干扰(RNAi)实验原理与方法(2)
dsRNA消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNA序列的步骤,为研究人员节省时间和金钱(注意:通常用RNAse III通常比用Dicer要便宜)。不过这种方法的缺点也很明显,就是有可能引发非特异的基因沉默,特别是同源或者是密切相关的基因。现在多数的研究显示这种情况通常不会造成影响。最
实验室pH测量原理与应用(一)
1、pH测量入门1.1 酸性或碱性为什么我们把醋列为酸类?原因是醋中含有过量的水合氢离子(H3O+),溶液中过量的水合氢离子,会使溶液呈酸性。相反含有过量氢氧根离子(OH–)的溶液,则呈碱性。在纯水体系中水合氢离子和氢氧根离子相互中和。我们称这种溶液的pH 值为中性。H3O+ + OH– ↔ 2 H
基因芯片(gene-chip)的原理
基因芯片(gene chip)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时,通
基因芯片的制备方法
基因芯片的片基主要有硅片、玻璃片、硝酸纤维膜、聚丙烯膜等寡核苷酸芯片以人工合成的寡核苷酸片断作为探针,制备方法主要有原位合成法和合成后点样法。而 cDNA 芯片以长片断的 PCR 产物作为探针,制备方法主要为合成后点样法。(1)原位合成法 制备寡核苷酸芯片原位合成法设备昂贵,技术复杂。(2)合成后
基因芯片技术与检验医学
什么是基因芯片?基因芯片就是利用点样技术、现代探针固相原位合成技术、照相平板印刷技术等微电子技术在有限的空间内,有序的集成一系列的可寻址识别的基因片段,以用于高通量、高速度、低成本的一种分子生物学工具。按照芯片的制作原理,基因芯片可以分为很多类,但目前真正成熟的,得以广泛应用的仍只有使用点样或原
基因芯片的应用与展望
一、基因芯片产生背景人类基因组计划(HGP)是人类为了认识自己而进行的一项最伟大和最具影响的研究计划。 人类基因组测序的“工作草图”即将向全球公布,预计在2003年完成全序列分析。此外,还测定了80万个cDNA片断(ESTs),相当于4-5万个基因,占7-10万个人类总基因的50%左右。目前
凯氏定氮实验的原理与方法
凯氏定氮实验的原理与方法测定原理:待测天然含氮有机物与浓硫酸共热时,被氧化成为二氧化碳和水,而氮转变成氨,氨再与硫酸结合生成硫酸铵。为了加速有机物质的分解反应,在消化时常加入促进剂,硫酸铜可用作催化剂,硫酸钾或硫酸钠可提高消化液的沸点,氧化剂如过氧化氢也能加速反应。操作方法:样品处理 测定某一固体样
植物制片的一般原理与方法
第一章 植物制片的方法及准备植物制片技术是植物显微技术课的一个重要组成部分,在有关植物形态建成、植物杂交育种、作物病虫害防治、药用植物的培育和鉴别以及林木材性鉴定等多方面的研究和教学工作中,都需要应用显微制片技术,由于各种作物器官的性质差异以及研究目的的不同,就需要不同的制片方法,但因限于学时及篇幅
基因芯片的技术特点和原理
DNA芯片又叫做基因芯片(gene chip)或基因微阵列(microarray),寡核酸芯片,或DNA微阵列,它是通过微阵列技术将高密度DNA片段阵列以一定的排列方式使其附着在玻璃、尼龙等材料上面。由于常用计算机硅芯片作为固相支持物,所以称为DNA芯片。
基因芯片实验操作流程图
芯片实验操作流程包括样本DNA或RNA制备、标记、杂交及洗涤等步骤基因芯片实验操作流程图 1.样本DNA或RNA制备 芯片实验中核酸的抽提没有特殊之处,参照常规的分子生物学实验手册就可以。但对于RNA样本,由于RNA的稳定性很差,在活体内的半衰期也很短,因此取材一定要新鲜,取材后
表达谱基因芯片实验操作流程
一、试剂1. TRIzol2. 异丙醇3. 氯仿4. 75%乙醇(RNase-free)5. Milli-Q水(RNase-free)6. 无水乙醇7. dNTPs8. Cy5-dCTP和Cy3-dCTP9. 杂交试剂110. 标记试剂I11. 杂交试剂212. 标记试剂II13. 反转录酶14.
基因芯片技术的应用实验研究
包括基因表达检测、寻找新基因、杂交测序、基因突变和多态性分析以及基因文库作图以及等方面。1、基因表达检测。人类基因组编码大约10万个不同的基因,仅掌握基因序列信息资料,要理解其基因功能是远远不够的,因此,具有监测大量mRNA(信使RNA,可简单理解为基因表达的中介物)的实验工具很重要。有关对芯片技术
基因芯片的制备、应用与前景
摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国
基因芯片的制备、应用与前景
摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国内
基因芯片的的方法特点
基因芯片(又称DNA芯片)是以基因连锁、限制性长度的多态性及连锁不平衡等基因定位方法为基础,以同源DNA分子杂交为基本工作原理而设计的检测方法。
基因芯片数据的分析方法
研究背景:基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测,探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义,这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据,其分析方法和思路都大同小异,这里分享一个多组实验设
基因芯片数据的分析方法
研究背景:基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测,探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义,这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据,其分析方法和思路都大同小异,这里分享一个多组实验设
MTT法实验原理与MTT溶液的配制方法
通常,此法中的mtt浓度为5mg/ml。因此,可以称取mtt0.5克,溶于100ml的磷酸缓冲液(pbs)或无酚红的培养基中,用0.22μm滤膜过滤以除去溶液里的细菌,放4℃避光保存即可。在配制和保存的过程中,容器最好用铝箔纸包住。需要注意的是,mtt法只能用来检测细胞相对数和相对活力,但不能测定细
MTT法实验原理与MTT-溶液的配制方法
通常,此法中的mtt浓度为5mg/ml。因此,可以称取mtt0.5克,溶于100ml的磷酸缓冲液(pbs)或无酚红的培养基中,用0.22μm滤膜过滤以除去溶液里的细菌,放4℃避光保存即可。在配制和保存的过程中,容器最好用铝箔纸包住。需要注意的是,mtt法只能用来检测细胞相对数和相对活力,但不能测定细
MTT法实验原理与MTT-溶液的配制方法
原理:活细胞中脱氢酶能将四唑盐还原成不溶于水的蓝紫色产物甲臜,并沉淀在细胞中,而死细胞没有这种功能。DMSO能溶解沉积在细胞中蓝紫色结晶物,溶液颜色深浅与所含的formazan量成正比。再用酶标仪测定OD值。
MTT法实验原理与MTT溶液的配制方法
通常,此法中的mtt浓度为5mg/ml。因此,可以称取mtt0.5克,溶于100ml的磷酸缓冲液(pbs)或无酚红的培养基中,用0.22μm滤膜过滤以除去溶液里的细菌,放4℃避光保存即可。在配制和保存的过程中,容器最好用铝箔纸包住。需要注意的是,mtt法只能用来检测细胞相对数和相对活力,但不能测定细
ELISA实验原理与类型
ELISA的原理ELISA的基础是抗原或抗体的固相化及抗原或抗体的酶标记。结合在固相载体表面的抗原或抗体仍保持其免疫学活性,酶标记的抗原或抗体既保留其免疫学活性,又保留酶的活性。在测定时,受检标本(测定其中的抗体或抗原)与固相载体表面的抗原或抗体起反应。用洗涤的方法使固相载体上形成的抗原抗体复合物与
基因芯片技术简介和应用展望(一)
基因芯片(Gene Chip)通常指DNA芯片,其基本原理是将指大量寡核苷酸分子固定于支持物上,然后与标记的样品进行杂交,通过检测杂交信号的强弱进而判断样品中靶分子的数量。基因芯片的概念现已泛化到生物芯片(biochip)、微阵列(Microarray)、DNA芯片(DNA chip),
如何选择实验抗体(一抗的选择原理及方法)?
检测任何目的靶蛋白都有不止一种抗体可供选择,在同一个抗体公司,可能会有好几种,甚至好几十种;在不同的抗体公司,那就更多了。那怎样在琳琅满目的抗体中,选择自己实验需要的抗体呢?主要考虑如下几种因素:分析自己实验应用的实验方法是哪种?分析自己实验中标本的种属是哪种动物或人的?分析样本中的蛋白质的结构性质
蛋白质印迹的实验原理、方法与步骤
实验概要本实验介绍了蛋白质印迹与探测(Western Blot)实验原理、方法与步骤。实验原理Western Blot(蛋白质印迹或免疫印迹)技术,以蛋白质为检测对象,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。实验采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)将样品蛋白质分离,再转移到固相载体(PVDF尼龙膜或N
凯氏定氮实验的原理与操作方法
测定原理待测天然含氮有机物与浓硫酸共热时,被氧化成为二氧化碳和水,而氮转变成氨,氨再与硫酸结合生成硫酸铵。为了加速有机物质的分解反应,在消化时常加入促进剂,硫酸铜可用作催化剂,硫酸钾或硫酸钠可提高消化液的沸点,氧化剂如过氧化氢也能加速反应。操作方法样品处理 测定某一固体样品中蛋白质的含量都是按1
一文知晓PCR,定量PCR与数字PCR的实验方法与选择(一)
从1985年至今的30多年时间里,PCR分析经历了三代技术的发展。第一代传统PCR技术,采用琼脂糖凝胶电泳的方法对PCR产物进行定性分析。第二代荧光定量PCR技术,通过在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号的积累实时监控PCR进程,最后用Cq值对基因进行定量分析。第三代数字PCR技术,通过将P
种子与幼苗实验(一)
实验材料 蚕豆菜豆豌豆花生蓖麻或油桐种子玉米小麦水稻果实;小麦水稻颖果切片;大豆菜豆花生豌豆蓖麻小麦水稻玉米的幼苗试剂、试剂盒 I-KI溶液1%番红染液仪器、耗材 显微镜解剖镜培养皿刀片镊子解剖针载玻片盖玻片擦镜纸纱布实验步骤 一、种子的结构与类型种子是种子植物的生殖器官,萌发后形成幼苗。1.菜豆、
实验室检验检测工具基因芯片
基因芯片(genechip)(又称DNA芯片、生物芯片)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的