基因芯片实验原理与方法(一)
一、目的本实验的目的是学会cDNA芯片的使用方法。了解各种基因芯片的基本原理和优缺点。基因芯片这一技术方法在1991年的Science杂志上被首次提出,其高通量、并行检测的特点适应了分析人类基因组计划所提供的海量的基因序列信息的需要,可以说,人类基因组计划是基因芯片技术发展的原因,而对深人研究基因突变和基因表达的有效方法的需求又是促进基因芯片技术发展的动力。由于基因芯片高速度、高通量、集约化和低成本的特点,基诞生以来就受到科学界的广泛关注,正如晶体管电路向集成电路发展的经历一样,分子生物学技术的集成化正在使生命科学的研究和应用发生一场革命。根据固定在芯片载体上的核酸分子的不同,基因芯片可以分为cDNA芯片和寡核昔酸芯片等。寡核昔酸芯片主要基于光引导聚合技术,该技术是Affymetrix公司开发的ZL技术,由于其突出的优点,正得到越来越广泛的应用。二、原理基因芯片(Gene Chip,DNA Chip),又称DNA微阵列(DNA ......阅读全文
消毒与灭菌实验的原理
灭菌是指杀灭物体中所有微生物的繁殖体和芽孢的过程。消毒是指用物理、化学或生物的方法杀死病原微生物的过程。 灭菌的原理就是使蛋白质和核酸等生物大分子发生变性,从而达到灭菌的作用,实验室中最常用的就是干热灭菌和湿热灭菌。 干热灭菌是利用高温使微生物细胞内的蛋白质凝固变性而达到灭菌的目的。细胞内的
蛋白质印迹与探测(Western-Blot)实验原理、方法与步骤(1)
【实验原理】Western Blot(蛋白质印迹或免疫印迹)技术,以蛋白质为检测对象,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。实验采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)将样品蛋白质分离,再转移到固相载体(PVDF尼龙膜或NC膜)上;固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且保持电泳分离的多肽类型及其生物学活
蛋白质印迹与探测(Western-Blot)实验原理、方法与步骤(2)
3.免疫探测 包括被转印到膜上的靶抗原与第一抗体(特异抗体)反应、与酶标第二抗体 (抗抗体) 反应,以及用酶相应的底物处理后进行靶蛋白(抗原)信号检测。(1)用0.01mol/L PBS洗膜,5min×3次。(2)加入封闭液(5%脱脂奶粉或2%牛血清白蛋白),浸泡被转印膜,室温或37℃(平缓摇动)反
琼脂糖凝胶电泳之一:实验方法原理
琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。其分析原理与其他支持物电泳的最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。 琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这
基因芯片与RNAseq的比较分析
最近几年二代测序(又叫NGS)很火,而且价格越来越便宜,原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的,好像不少都换用RNA-seq了。那么,到底选择哪种更好呢?今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。 常见误区一: 测序的准确性高,获得的信息更丰富 对,但又不对。
基因芯片与RNAseq的比较分析
基因芯片 vs RNA-seq哪个好 ?最近几年二代测序(又叫NGS)很火,而且价格越来越便宜,原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的,好像不少都换用RNA-seq了。那么,到底选择哪种更好呢?今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。常见误区一:测序的准确性高,获得的信息
基因芯片数据处理流程与分析介绍
当人类基因体定序计划的重要里程碑完成之后,生命科学正式迈入了一个后基因体时代,基因芯片 (microarray) 的出现让研究人员得以宏观的视野来探讨分子机转。不过分析是相当复杂的学问,正因为基因芯片成千上万的信息使得分析数据量庞大,更需要应用到生物统计与生物信息相关软件的协助。要取得一完整的数据结
基因芯片
基因芯片(genechip)(又称DNA芯片、生物芯片)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的
土壤微生物分离与纯化实验原理和方法
一、实验目的了解血球计数板的构造、计数原理和计数方法,掌握显微镜下直接计数的技能。二、实验原理测定微生物细胞数量的方法很多,通常采用的有显微直接计数法和平板计数法。显微计数法适用于各种含单细胞菌体的纯培养悬浮液,如有杂菌或杂质,常不易分辨。菌体较大的酵母菌或霉菌孢子可采用血球计数板,一般细菌则采用彼
离心技术原理与类型(一)
离心是蛋白质、酶、核酸及细胞亚组分分离的最常用的方法之一,也是生化实验室中常用的分离、纯化或澄清的方法。尤其是超速冷冻离心已经成为研究生物大分子实验室中的常用技术方法。离心机(centrifuge)是实施离心技术的装置。离心机的种类很多,按照使用目的,可分为两类,即制备型离心机和分析型离心机。前者主
ELISA原理与分类介绍(一)
ELISA的原理ELISA的基础是抗原或的固相化及抗原或的酶标记。结合在固相载体表面的抗原或仍保持其免疫学活性,酶标记的抗原或抗体既保留其免疫学活性,又保留酶的活性。在测定时,受检标本(测定其中的抗体或抗原)与固相载体表面的抗原或抗体起反应。用洗涤的方法使固相载体上形成的抗原抗体复合物与液体中的其
电气原理图的绘制原则与识别方法(一)
为了表达生产机械电气控制系统的结构、原理等设计意图,便于电气系统的安装、调试、使用和维修,将电气控制系统中各电器元件及其连接线路用一定的图形表达出来,这就是电气控制系统图。用导线将电机、电器、仪表等元器件按一定的要求连接起来,并实现某种特定控制要求的电路。 画电气原理图的一般规律如下:
实验技术与方法大全
目前最好的实验方法站点之一: http://www.protocol-online.org 有近三百种经典实验方法的生物学网站: http://iprotocol.mit.edu/ 目前最完美的生物技术收集网站之一: http://www.bioprotocol.com:包括动植物、果蝇、分子生物、
实验数据与处理方法
实验数据为美国加州圣地亚哥北部岛屿某海军飞机场的AVIRIS高光谱影像数据,如图8.2所示。该数据光谱范围是0.4~1.8μm,像元分辨率为3.5m,共有137个波段,有效波段126个。该影像区域内人工建筑占主导地位,相对比较规整。实验的编程环境为Matlab2010,进行高光谱影像的SVM分类时,
实验室水分测定方法常压干燥法特点与原理
⑴特点:此法应用最广泛,操作以及设备都简单,而且有相当高的精确度。⑵原理:食品中水分一般指在大气压下,100℃左右加热所失去的物质。但实际上在此温度下所失去的是挥发性物质的总量,而不完全是水。
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究(一)
郝麟1) 朱平1)* 于晓梅2) 张大成2) 赵新生3) 欧阳贱华3 (1)北京大学第一医院 北京 100034; 2)北京大学微电子学研究所 北京100871; 3)北京大学化学与分子工程学院 北京100871) 目的: 我们设计一种含有大量微反应池的PCR基因芯片,能对基因的重
基因芯片技术及其研究现状和应用前景(一)
摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术
染色体核型分析与基因芯片的区别
检测条件不同 核型分析需要新鲜的“活细胞”,需要细胞培养,若细胞培养失败,则检测失败,并且细胞生长周期比较长,因此核型分析的报告周期比较长。 基因芯片检测对象为DNA,不需要细胞培养,成功率高,报告周期短。 检测分辨率不同 芯片依赖其密布的探针,检测染色体上对应位点的信号,来判断同一染色
染色体核型分析与基因芯片的区别
检测条件不同 核型分析需要新鲜的“活细胞”,需要细胞培养,若细胞培养失败,则检测失败,并且细胞生长周期比较长,因此核型分析的报告周期比较长。 基因芯片检测对象为DNA,不需要细胞培养,成功率高,报告周期短。 检测分辨率不同 芯片依赖其密布的探针,检测染色体上对应位点的信号,来判断同一染色
转膜实验原理与操作步骤
转膜是把DNA从琼脂糖凝胶中转移到固相支持物(一般是尼龙膜)上固定,是进行各种后续研究(如 RFLP 分析,阳性克隆的筛选验证等所有涉及分子杂交的研究)的前提。 实验目的: 掌握 Southern blotting 的原理及操作步骤 实验原理: 1. 转膜的方式: 向上的毛细管
RTPCR原理与实验技术
一、知识背景:1. 基因表达:DNA——RNA——Protein单拷贝基因表达存在逐步放大机制,如一个蚕丝心蛋白基因——104个丝心蛋白mRNA(每个mRNA存活4d,可以合成105个丝心蛋白)——共合成109个丝心蛋白 。因此单拷贝基因的mRNA表达水平对于其功能水平的调控是非常重要的。2. PC
RTPCR实验原理与步骤
【实验原理】RT-PCR 是以RNA 为模板经逆转录反应(Reverse Transcription,RT)产生cDNA 第一链,再以cDNA 为模板进行PCR 扩增以检测目的基因的表达情况。【实验仪器】1. 恒温金属浴2. PCR 扩增仪【试剂及配制】RNA PCR Kit (AMV) Ver 3
基因芯片制作时的点样方法有哪些
点样方法: 点样分子可以是核酸也可以是寡核酸。一些研究者采用人工点样的方法将寡核苷酸分子点样于化学处理后的载玻片上,经一定的化学方法处理非干燥后,寡核苷酸分子即固定于载玻片上,制备好的DNA芯片可置于缓冲液中保存。
基因芯片制作时的点样方法有哪些
点样方法: 点样分子可以是核酸也可以是寡核酸。一些研究者采用人工点样的方法将寡核苷酸分子点样于化学处理后的载玻片上,经一定的化学方法处理非干燥后,寡核苷酸分子即固定于载玻片上,制备好的DNA芯片可置于缓冲液中保存。
热处理原理与常见种类(一)
热处理是指材料在固态下,通过加热、保温和冷却的手段,以获得预期组织和性能的一种金属热加工工艺。 一、热处理 1、正火:将钢材或钢件加热到临界点AC3或ACM以上的适当温度保持一定时间后在空气中冷却,得到珠光体类组织的热处理工艺。 2、退火:将亚共析钢工件加热至AC3以上20—40度
Southern-Blot实验原理及方法
实验原理:Southern Blot是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,
噬菌体转导实验原理、材料和实验步骤(一)
一、实验目的 以局限性转导为例来说明转导的基本原理,进一步验证 DNA是遗传物质,并初步掌握转导实验的基本方法。 二、实验原理与意义 转导是以噬菌体为媒介将一个细胞的遗传物质转移给另一个细胞的过程。随着分子遗传学的发展,转导已成为基因精细结构分析的常用方法。 转导实验中常用的是λ噬菌
基因芯片概念
基因芯片(又称 DNA 芯片、生物芯片)技术就是顺应这一科学发展要求的产物,它的出现为解决此类问题提供了光辉的前景。该技术系指将大量(通常每平方厘米点阵密度高于 400 )探针分子固定于支持物上后与标记的样品分子进行杂交,通过检测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息。通俗地说,
基因芯片-简介
随着人类基因组(测序)计划( Human genome project )的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而 , 怎样去研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共
基因芯片简介
随着人类基因组(测序)计划(Human genome project)的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而,怎样去研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共同的课题。为此,建立