科学家发现RNA甲基化识别蛋白YTHDF1的重要功能
10月25日，《自然-通讯》（Nature Communications）以YTHDF1 links hypoxia adaptation and non-small cell lung cancer progression 为题，在线发表了中国科学院昆明动物研究所陈勇彬学科组的最新研究成果。该研究揭示了YTHDF1在低氧适应和非小细胞肺癌发生发展中的重要功能和分子调控机理。 陈勇彬学科组前期与昆明动物所吴东东学科组合作，利用进化生物学的方法，筛选得到一系列青藏高原家养哺乳动物低氧适应的关键新分子，并发现许多已报道的肿瘤明星基因在高原家养哺乳动物中受到正选择，提示低氧适应新基因在低氧实体瘤中具有潜在重要功能。研究发现，YTHDF1作为m6A修饰后的RNA结合蛋白家族成员之一，在高原家养哺乳动物中低表达，而在正常肺上皮细胞中抑制其表达可以抵抗低氧诱导的细胞凋亡。深入研究发现，YTHDF1在非小细胞肺癌肿瘤组织和细胞系中均高表......阅读全文
20分文章中的RNA甲基化，热度与实力并存
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》（影响因子：23.3
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶...1
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品，已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者，云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商，首发推出了非编码RNA甲基化测序研究，首发推出了超微量RNA
华中农大科研团队开发出新型植物RNA甲基化编辑工具
9月4日，华中农业大学棉花遗传改良团队在《先进科学》杂志在线发表了其最新研究成果，该团队开发出基于CRISPR/dCas13(Rx)的新型植物RNA甲基化编辑工具。以往对植物中m6A功能分析研究，多数是利用遗传扰动如敲除、超表达方式进行。然而，直接增加或删除m6A系统的任何关键组分会导致植物中m6A
20分文章中的RNA甲基化，热度与实力并存
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》（影响因子：23
华中农大科研团队开发出新型植物RNA甲基化编辑工具
9月4日，华中农业大学棉花遗传改良团队在《先进科学》杂志在线发表了其最新研究成果，该团队开发出基于CRISPR/dCas13(Rx)的新型植物RNA甲基化编辑工具。 以往对植物中m6A功能分析研究，多数是利用遗传扰动如敲除、超表达方式进行。然而，直接增加或删除m6A系统的任何关键组分会导致植物
Genome－research：不同RNA－m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读 近年来，RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰，也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期，来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RES
研究揭示RNA甲基化调控斑马鱼母源mRNA稳定性机制
斑马鱼母源-合子转换 (maternal-to-zygotic transition, MZT)过程伴随着母源RNA和蛋白质的降解以及合子基因组的激活(maternal-to-zygotic transition, ZGA)。已有研究表明多种关键因素通过母源和合子途径促进母源mRNA降解，其中包
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月，中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组，与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究，发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
Genome－research：不同RNA－m5C甲基化修饰存在巨大差异
近年来，RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰，也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期，来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEARCH（
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用
最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况，发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇，已经追平2019年整年度发表篇数，可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。 图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况（ data from PubMe
2019年，大牛们都在研究什么？—m6A文章盘点
19年悄悄的已经将近过半，但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇，Nature，Cell子刊均有相关文章发表；造血干细胞分化，癌细胞上皮间质转化，树突细胞活化，心肌细胞肥厚，内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成
天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验
细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 mRNA 的相互作用调控基因的表达。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞
天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验
实验方法原理 细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 mRNA 的相互作用调控基因的表达。实验材料 mRNA寡核苷酸试剂、
天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验
实验方法原理 细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 m
学者首次发现植物环状RNA编码蛋白
华南农业大学植物保护学院周国辉教授/杨新副研究员团队在国家自然科学基金等项目的资助下，首次发现植物环状RNA编码多肽的功能，并揭示该多肽赋予水稻对多种病原物的广谱抗性。2月25日，相关成果发表于《新植物学家》（New Phytologist）。水稻条纹花叶病毒的感染促进水稻植株中circ-WRKY9
RIP技术（RNA结合蛋白免疫沉淀）
RIP技术（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA结合蛋白免疫沉淀），是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，是了解转录后调控网络动态过程的有力工具，能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合
2019年，大牛们都在研究什么？—m6A文章盘点
19年悄悄的已经将近过半，但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇，Nature，Cell子刊均有相关文章发表；造血干细胞分化，癌细胞上皮间质转化，树突细胞活化，心肌细胞肥厚，内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成
SMAD2/3与TGFβ影响转录因子发生m6ARNA甲基化调控干细胞发育
文章导读： 胚胎干细胞作为一种全能性细胞，通过增殖和分化，产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明，胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化，大多与细胞增殖[1-2]，免疫应答[4]关系密切。然而，对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天，分享一
蛋白质DNA相互作用的甲基化和尿嘧啶干扰分析法—甲基化
实验方法原理在甲基化干扰实验中，探针通过将鸟嘌呤N-7及腺嘌呤N-3位用硫酸二甲酯 (DMS)进行甲基化而产生。这些甲基化的碱基可被哌啶特异性切割。实验材料含有蛋白质结合位点的DNA片段试剂、试剂盒TE 缓冲液 pH 7.5 〜8.0硫酸二甲酯（DMS)DMS反应缓冲液DMS终止缓冲液10 mg m
两篇PNAS：蛋白纳米孔检测DNA甲基化
两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序，成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 基因组所蕴含的编码信息，包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中，动态的DNA甲基化模式，是基因表达的重要调控者，与细胞分化、胚胎发育和癌症
科学家揭示RNA甲基化调控实体瘤膀胱癌发生机制
m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一，但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。 中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究，发现m5C通过细胞
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（四）
1）m6A修饰PCR芯片 new！云序生物提供m6A修饰PCR芯片检测，高效一次性检测m6A相关的Writer，Eraser，Reader的表达情况，m6A PCR 芯片基因列表（34 个基因）-human如图： 2）RNA修饰PCR芯片 new！云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测，高效一次
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（一）
导读最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况，发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇，已经追平2019年整年度发表篇数，可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。 图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况（ data from PubMed）那么您
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（二）
为了进一步说明Mettl3在CRC糖酵解过程中促进肿瘤发展的作用，作者通过RNA-seq(云序可提供此服务)分析比较Mettl3 KO和野生型的细胞（WT HCT116 CRC）基因表达情况。通过GO和KEGG分析，WT HCT116主要富集与葡萄糖代谢相关的信号通路，而Mettl3 K
精氨酸甲基化在RNA剪接和翻译全局调控中的关键作用
7月15日，中国科学院上海营养与健康研究所研究员王泽峰课题组在Science Bulletin上发表了题为A systematic survey of PRMT interactomes reveals the key roles of arginine methylation in the g
染色质重塑因子PKL在RNA介导的DNA甲基化中的功能
5月31日，《基因组生物学》（Genome Biology）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心张蘅研究组题为The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation
m6A－RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机
导读近年来，m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰，而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展，近期Hepat
研究揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物细胞微环境维持机制
近期，中国科学院西北生态环境资源研究院西北高原生物研究所研究员杨其恩课题组以小鼠为模型，揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物精原干细胞微环境维持的新机制。 成体干细胞命运决定受到特殊微环境调控，在大多数组织中，微环境的形成和维持机制并不明确。精原干细胞是一类经典的成体干细胞，是哺乳动物精子发生的基
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（三）
（5）酶METTL3作用分子机制研究已表明Mettl3是一种甲基化转移酶，可以调控靶分子的甲基化水平，那么是如何调节糖代谢过程呢？现有实验已表明Mettl3敲除或过表达不仅影响HK2和SLC2A1的甲基化水平，还调节HK2和SLC2A1的表达水平，这暗示着靶分子甲基化水平影响其表达，而双荧光素酶实验
Cell－Research－肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制
肠道菌群微生物组学是近年来研究热点，肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用，在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明，肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现，特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发