染色质重塑因子PKL在RNA介导的DNA甲基化中的功能
5月31日,《基因组生物学》(Genome Biology)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心张蘅研究组题为The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation patterns at RNA-directed DNA methylation loci 的研究论文。该研究揭示了染色质重塑因子PKL在RNA介导的DNA甲基化过程中的重要调控作用。 在植物中,RNA介导的DNA甲基化(RdDM)是一种重要的建立全新DNA甲基化式样和转录基因沉默的机制,通过小干扰RNA(siRNA)与支架RNA(scaffold RNA)的碱基配对引导DNA甲基转移酶到特定的位点进行全新DNA甲基化。RdDM在外源基因沉默、维持基因组稳定性、生殖细胞DNA甲基化模式建立等生物学过程中起重要作用,解析其分子机理对......阅读全文
染色质重塑因子PKL在RNA介导的DNA甲基化中的功能
5月31日,《基因组生物学》(Genome Biology)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心张蘅研究组题为The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation
dna甲基化与rna甲基化的区别
DNA甲基化和组蛋白修饰的相同点:都有包含甲基化修饰;不同点:修饰对象不同,一个是对DNA修饰,一个是对蛋白:组蛋白修饰。而RNA干扰是对RNA的降解,与前两者差异较大。
microRNA的肿瘤抑制因子角色
美国南加州大学的研究人员报道说,一种新的方法通过活化癌细胞基因组中保护性的microRNA的表达,从而使致癌基因的表达水平显著降低。这篇发表在6月的Cancer Cell杂志上的文章证明已知能调节基因表达的制剂还能够影响调节性的RNA。这种调节性的RNA即为microRNA,它能充当正常细胞中的肿瘤
染色质重塑的概念
染色质重塑chromatin remodeling :基因表达的复制和重组等过程中,染色质的包装状态、核小体中组蛋白以及对应DNA分子会发生改变的分子机理。
免疫系统和表观遗传学调控:一个新的前沿领域
表观遗传学(epigenetics)研究转录前基因在染色质水平的结构修饰对基因功能的影响,这种修饰可通过细胞分裂和增值周期进行传递。表观遗传学已成为生命科学中普遍关注的前沿,在功能基因组时代尤其如此。免疫系统被认为是一个解析表观遗传学调控机制的良好模型,而且免疫细胞伯分化及功能表达和表观遗
关于地西他宾的不良反应和用途介绍
1、不良反应 (1)中性白细胞减少(症)、血小板减少(症)、贫血、呕吐、疲劳、发热、咳嗽、恶心、便秘、腹泻、高血糖、热性的中性白细胞减少(症)。 (2)大剂量可引起神经毒性,表现为嗜睡、失语、偏瘫等,但停药后可恢复正常。 2、用途 是一种表观遗传修饰物,可抑制DNA转甲基酶活性,导致在D
染色质,解锁癌症表观遗传学的钥匙
表观遗传学指基因序列不变化的前提下,基因表达发生了可遗传的变化,包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色质改型调控基因表达的过程,涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。 众多研究已经证明,染色体畸变和染色质异
JBC:染色质重塑与癌症
染色质的结构变化又称为染色质重塑(Chromatin remodeling),染色质重塑调节着基因转录、DNA修复、程序性细胞死亡等多种细胞基础过程。Stowers医学研究所的科学家们在前期研究的基础上深入解析了染色质重构的调控机制。 Stowers 研究所的研究人员进行了一系列生化实
简述染色质重塑的意义
染色质重组过程中,核小体滑动可能是一种重要机制,它不改变核小体结构,但改变核小体与DNA 的结合位置。实验证明,这种滑动能被核小体上游的“十字形”结构阻断。但“滑动”机制并不能解释所有实验现象。人们推测,在重组过程中,还有其他机制如核小体可能与DNA 分离,然后核小体经过重排,结构变化后,与DN
全局DNA甲基化重塑技术帮助检验体外实验模型是否有效
一些神经疾病的发病率正在攀升,特别是那些与衰老有关的疾病,如阿尔兹海默症和帕金森。为了更好地了解这些疾病,评估潜在新疗法,生物学家需要能在实验室进行研究的精确模型。 来自Salk和Stanford的研究人员,与Baylor医学院的合作者证明,用之前发表的方法诱导神经细胞,与大脑中自然发育的神经
研究观测到染色质重塑中DNA的BZ构象转变
近年来,Z型DNA(Z-DNA)的研究引发关注,但是在细胞中对其进行观测还存在困难,主要原因是缺少一种简便可靠的手段对其进行直接观测。最近,中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所研究员黄青课题组与郑州大学张凤秋课题组合作,利用红外光谱技术观测并研究染色质重塑中DNA的B-Z构象转变,相关研究
关于染色质重塑的过程介绍
在核小体重塑过程中,重塑因子复合物的作用非常重要。这些复合物都具有ATP酶活性。SWI/SNF复合物和ISW I 复合物家族是最先从酵母和果蝇体内发现的两种。SWI/SNF中的组分BRG1、hBRM 和ISW I相关复合物中的组分Hsnf2L、Hsnf2h 具有ATP 酶活性。人的SWI/SNF
关于染色质重塑的基本介绍
染色质重塑chromatin remodeling :基因表达的复制和重组等过程中,染色质的包装状态、核小体中组蛋白以及对应DNA分子会发生改变的分子机理。 DNA 复制、转录、修复、重组在染色质水平发生,这些过程中,染色质重塑可导致核小体位置和结构的变化,引起染色质变化。ATP 依赖的染
清华大学Cell子刊发表表观遗传学新成果
组蛋白修饰和DNA甲基化是重要的表观遗传学修饰,决定着基因组的表观遗传学景观。组蛋白修饰和DNA甲基化能共同起作用调控基因的表达,但人们并不清楚它们在作用机制和功能上的具体关联。 清华大学和洛克菲勒大学的研究团队发现,改变DNA甲基转移酶的组蛋白识别区域会影响表观遗传学景观和小鼠的胚胎干细胞。
Cell发布表观遗传重要成果
为了将两米长的DNA分子装入到只有几千分之一毫米大小的细胞核中,DNA长片段必须强力地紧密压缩。表观遗传学标记维持着这些称作异染色体的部分。来自马克思普朗克免疫生物学和表观遗传学研究所的科学家们现在进一步发现了异染色质形成必需的两种机制。相关论文发布在近期的《细胞》(Cell)杂志上。 由
研究发现植物DNA主动去甲基化新机制
近期《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation i
中心法则的蛋白质扩充原则
翻译后修饰对于大部份的蛋白质来说,这是蛋白质生物合成的最后步骤。蛋白质的翻译后修饰会附上其他的生物化学官能团、改变氨基酸的化学性质,或是造成结构的改变来扩阔蛋白质的功能。酶可以从蛋白质的N末端移除氨基酸,或从中间将肽链剪开。举例来说,胰岛素是肽的激素,它会在建立双硫键后被剪开两次,并在链的中间移走多
朱健康院士团队揭示植物DNA主动去甲基化的完整调控途径
近日,PNAS杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为“Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation in Arabidops
Cell:染色质重塑抹去痛苦记忆
据统计,近八百万美国人受到创伤后应激障碍PTSD的困扰。这种疾病主要由战争或暴力袭击等创伤性事件引起,患者表现出极度的焦虑。 许多PTSD患者在接受着心理治疗,心理医生让患者在安全的环境中重新体验创伤性回忆,以帮助他们克服恐惧。然而,这样的记忆往往根深蒂固,心理疗法有时无法起作用,特别是对
朱健康研究团队发现植物DNA主动去甲基化新机制
7月30日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylati
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
云序生物为你解密ATACseq研究方案
ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那ATAC-seq技术到底什么呢?ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某
PLoS-Genet:何新建等模式植物拟南芥研究获进展
2014年1月22日,北京生命科学研究所何新建实验室在《PLOS Genetics》杂志在线发表题为“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
华南植物园关于植物DNA甲基化的调控研究获进展
DNA甲基化是表观遗传修饰的重要组成部分,可以通过改变染色质的结构、DNA的稳定性以及DNA和蛋白质的结合程度调控基因表达。在植物DNA甲基化的建立和维持过程中,植物特有的RNA聚合酶V(Pol V)通过转录出的非编码RNA招募一系列下游因子以实现对DNA的甲基化。目前,以Pol V为核心的DN
Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATRX
该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR
ATRX基因的结构特点和作用
该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR
DNA损伤修复信号通路ATRX基因的临床解释
该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR
RNA甲基化研究
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子: